MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 50353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006576	A	6	6	27583	27588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_006576	TGGC	2	8	27613	27620	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
503	NC_006576	AGGC	2	8	27631	27638	25 %	0 %	50 %	25 %	56750035
504	NC_006576	TGGG	2	8	27699	27706	0 %	25 %	75 %	0 %	56750035
505	NC_006576	TCA	2	6	27777	27782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750035
506	NC_006576	GAC	2	6	27839	27844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750035
507	NC_006576	CCA	2	6	27864	27869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750035
508	NC_006576	GGCGC	2	10	27926	27935	0 %	0 %	60 %	40 %	56750035
509	NC_006576	ACC	2	6	27943	27948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750035
510	NC_006576	GTT	2	6	27990	27995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750035
511	NC_006576	GCA	2	6	28062	28067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750035
512	NC_006576	CCAT	2	8	28081	28088	25 %	25 %	0 %	50 %	56750035
513	NC_006576	CAC	2	6	28214	28219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750036
514	NC_006576	CAAC	2	8	28268	28275	50 %	0 %	0 %	50 %	56750036
515	NC_006576	CAG	2	6	28277	28282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750036
516	NC_006576	CTG	2	6	28297	28302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750036
517	NC_006576	GAA	2	6	28337	28342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750036
518	NC_006576	GCG	2	6	28437	28442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750036
519	NC_006576	GCT	2	6	28569	28574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750036
520	NC_006576	GGTCG	2	10	28579	28588	0 %	20 %	60 %	20 %	56750036
521	NC_006576	TGCGG	2	10	28637	28646	0 %	20 %	60 %	20 %	56750036
522	NC_006576	GAC	2	6	28667	28672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750036
523	NC_006576	CAC	2	6	28700	28705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750036
524	NC_006576	TTGC	2	8	28747	28754	0 %	50 %	25 %	25 %	56750036
525	NC_006576	GCG	2	6	28767	28772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750036
526	NC_006576	AGT	2	6	29005	29010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750036
527	NC_006576	TGC	2	6	29021	29026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750036
528	NC_006576	ATG	2	6	29211	29216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750036
529	NC_006576	CCG	2	6	29272	29277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750036
530	NC_006576	CTG	2	6	29417	29422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750036
531	NC_006576	CGG	2	6	29743	29748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750036
532	NC_006576	CTC	2	6	29768	29773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750036
533	NC_006576	CAG	2	6	29792	29797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750036
534	NC_006576	GTA	2	6	29822	29827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750036
535	NC_006576	CGG	2	6	29834	29839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750036
536	NC_006576	GGC	2	6	29897	29902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750036
537	NC_006576	CCA	2	6	29917	29922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750036
538	NC_006576	TGA	2	6	29968	29973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750036
539	NC_006576	CCGCC	2	10	29981	29990	0 %	0 %	20 %	80 %	56750036
540	NC_006576	CAT	2	6	30071	30076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750036
541	NC_006576	AGC	2	6	30371	30376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750036
542	NC_006576	TGCT	2	8	30566	30573	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
543	NC_006576	GAG	2	6	30592	30597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_006576	AGTT	2	8	30805	30812	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
545	NC_006576	CCTTT	2	10	30840	30849	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
546	NC_006576	ATC	2	6	30968	30973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_006576	ACG	2	6	30995	31000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_006576	TGG	2	6	31105	31110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750037
549	NC_006576	TCT	2	6	31135	31140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750037
550	NC_006576	ATC	2	6	31227	31232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750037
551	NC_006576	A	7	7	31305	31311	100 %	0 %	0 %	0 %	56750037
552	NC_006576	TGC	2	6	31313	31318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750037
553	NC_006576	T	6	6	31328	31333	0 %	100 %	0 %	0 %	56750037
554	NC_006576	GTT	2	6	31338	31343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750037
555	NC_006576	TGG	2	6	31355	31360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750037
556	NC_006576	TAC	2	6	31390	31395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750037
557	NC_006576	ATG	2	6	31497	31502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750037
558	NC_006576	T	6	6	31554	31559	0 %	100 %	0 %	0 %	56750037
559	NC_006576	CGC	2	6	31597	31602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750037
560	NC_006576	GCA	2	6	31713	31718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750037
561	NC_006576	TCT	2	6	31753	31758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750037
562	NC_006576	TCAT	2	8	31810	31817	25 %	50 %	0 %	25 %	56750037
563	NC_006576	CAGA	2	8	31859	31866	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
564	NC_006576	TTA	2	6	31906	31911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_006576	AAT	2	6	31917	31922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_006576	A	6	6	32016	32021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_006576	TG	3	6	32105	32110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_006576	CAA	2	6	32144	32149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_006576	AT	3	6	32171	32176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_006576	AGC	2	6	32181	32186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_006576	ATCA	2	8	32314	32321	50 %	25 %	0 %	25 %	56750038
572	NC_006576	TCA	2	6	32339	32344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750038
573	NC_006576	GGA	3	9	32359	32367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750038
574	NC_006576	AAG	2	6	32398	32403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750038
575	NC_006576	AGG	2	6	32553	32558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750038
576	NC_006576	GCT	2	6	32578	32583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750038
577	NC_006576	GGGAT	2	10	32627	32636	20 %	20 %	60 %	0 %	56750038
578	NC_006576	TAC	2	6	32677	32682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750038
579	NC_006576	CAGT	2	8	32771	32778	25 %	25 %	25 %	25 %	56750038
580	NC_006576	AAGGAC	2	12	32816	32827	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	56750038
581	NC_006576	TGG	2	6	33072	33077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750038
582	NC_006576	CTGTT	2	10	33083	33092	0 %	60 %	20 %	20 %	56750038
583	NC_006576	TGG	3	9	33104	33112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750038
584	NC_006576	CCG	2	6	33134	33139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750038
585	NC_006576	CTG	3	9	33142	33150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750038
586	NC_006576	GAC	2	6	33228	33233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750038
587	NC_006576	TGG	2	6	33239	33244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750038
588	NC_006576	A	6	6	33278	33283	100 %	0 %	0 %	0 %	56750038
589	NC_006576	ATG	2	6	33373	33378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750038
590	NC_006576	TGG	2	6	33484	33489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750038
591	NC_006576	CCTG	2	8	33504	33511	0 %	25 %	25 %	50 %	56750038
592	NC_006576	TTC	2	6	33644	33649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750038
593	NC_006576	AGT	2	6	33670	33675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750038
594	NC_006576	ACA	2	6	33733	33738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750038
595	NC_006576	CAG	2	6	33795	33800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750038
596	NC_006576	CTT	2	6	33801	33806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750038
597	NC_006576	TGC	2	6	33816	33821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750038
598	NC_006576	TAGC	2	8	33925	33932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
599	NC_006576	AAC	2	6	33941	33946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_006576	GCG	2	6	34119	34124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750039
601	NC_006576	TTG	2	6	34213	34218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750039
602	NC_006576	CAA	2	6	34259	34264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750039
603	NC_006576	CGG	2	6	34278	34283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750039
604	NC_006576	CTTT	2	8	34348	34355	0 %	75 %	0 %	25 %	56750039
605	NC_006576	GCT	2	6	34356	34361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750039
606	NC_006576	ACA	2	6	34373	34378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750039
607	NC_006576	ATG	2	6	34488	34493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750039
608	NC_006576	AAT	2	6	34539	34544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56750039
609	NC_006576	AAT	2	6	34590	34595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56750039
610	NC_006576	CTC	2	6	34614	34619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750039
611	NC_006576	TTG	2	6	34801	34806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_006576	AAC	2	6	34874	34879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750040
613	NC_006576	CAG	2	6	34888	34893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750040
614	NC_006576	TGAG	2	8	34937	34944	25 %	25 %	50 %	0 %	56750040
615	NC_006576	GGC	2	6	34981	34986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750040
616	NC_006576	ATT	2	6	34997	35002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56750040
617	NC_006576	G	6	6	35039	35044	0 %	0 %	100 %	0 %	56750040
618	NC_006576	GGT	2	6	35056	35061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750040
619	NC_006576	GCCAA	2	10	35072	35081	40 %	0 %	20 %	40 %	56750040
620	NC_006576	TAC	2	6	35188	35193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750040
621	NC_006576	ACA	2	6	35204	35209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750040
622	NC_006576	GCT	2	6	35322	35327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750040
623	NC_006576	TGCC	2	8	35501	35508	0 %	25 %	25 %	50 %	56750040
624	NC_006576	CA	3	6	35517	35522	50 %	0 %	0 %	50 %	56750040
625	NC_006576	TGA	2	6	35526	35531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750040
626	NC_006576	GCT	2	6	35610	35615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750040
627	NC_006576	AACGA	2	10	35626	35635	60 %	0 %	20 %	20 %	56750040
628	NC_006576	GCA	2	6	35654	35659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750040
629	NC_006576	TCA	2	6	35691	35696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750040
630	NC_006576	GCG	2	6	35752	35757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750040
631	NC_006576	CTG	2	6	35831	35836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750040
632	NC_006576	GCA	2	6	35874	35879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750040
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756	NC_006576	GC	3	6	42367	42372	0 %	0 %	50 %	50 %	56750043
757	NC_006576	CTGA	2	8	42424	42431	25 %	25 %	25 %	25 %	56750043
758	NC_006576	GCA	2	6	42510	42515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750043
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1000	NC_006576	TTCA	2	8	54138	54145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

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