MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_006511	CGG	2	6	163158	163163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412409
3502	NC_006511	ATT	2	6	163248	163253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412409
3503	NC_006511	AAG	2	6	163340	163345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412409
3504	NC_006511	CCG	2	6	163396	163401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412409
3505	NC_006511	ATT	2	6	163414	163419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412409
3506	NC_006511	TTA	2	6	163477	163482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412410
3507	NC_006511	GCCG	2	8	163522	163529	0 %	0 %	50 %	50 %	56412410
3508	NC_006511	CAG	2	6	163666	163671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412410
3509	NC_006511	GCA	2	6	163802	163807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412410
3510	NC_006511	TCT	2	6	163811	163816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412410
3511	NC_006511	CGA	2	6	163866	163871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412410
3512	NC_006511	TCT	2	6	164066	164071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412410
3513	NC_006511	TCG	2	6	164229	164234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412410
3514	NC_006511	CGA	2	6	164252	164257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412410
3515	NC_006511	CATA	2	8	164301	164308	50 %	25 %	0 %	25 %	56412410
3516	NC_006511	GTC	2	6	164374	164379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412410
3517	NC_006511	GGCT	2	8	164560	164567	0 %	25 %	50 %	25 %	56412411
3518	NC_006511	TAA	2	6	164568	164573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412411
3519	NC_006511	ATG	2	6	164580	164585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412411
3520	NC_006511	GCG	2	6	164645	164650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412411
3521	NC_006511	GGA	2	6	164698	164703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412411
3522	NC_006511	TTG	2	6	164720	164725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412411
3523	NC_006511	ACC	2	6	164732	164737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412411
3524	NC_006511	TGA	2	6	164806	164811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412411
3525	NC_006511	CGG	2	6	164880	164885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412411
3526	NC_006511	AACG	2	8	164984	164991	50 %	0 %	25 %	25 %	56412411
3527	NC_006511	CGC	2	6	165111	165116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412411
3528	NC_006511	TCA	2	6	165132	165137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412411
3529	NC_006511	TC	3	6	165265	165270	0 %	50 %	0 %	50 %	56412411
3530	NC_006511	CGC	2	6	165271	165276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412411
3531	NC_006511	GAG	2	6	165359	165364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412411
3532	NC_006511	CTGC	2	8	165368	165375	0 %	25 %	25 %	50 %	56412411
3533	NC_006511	TAT	2	6	165395	165400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412411
3534	NC_006511	CG	3	6	165407	165412	0 %	0 %	50 %	50 %	56412411
3535	NC_006511	TATT	2	8	165435	165442	25 %	75 %	0 %	0 %	56412411
3536	NC_006511	ATT	2	6	165444	165449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412411
3537	NC_006511	GTC	2	6	165511	165516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412412
3538	NC_006511	CGC	2	6	165531	165536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412412
3539	NC_006511	CGG	2	6	165558	165563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412412
3540	NC_006511	C	6	6	165627	165632	0 %	0 %	0 %	100 %	56412412
3541	NC_006511	GAC	2	6	165634	165639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412412
3542	NC_006511	ACG	2	6	165665	165670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412412
3543	NC_006511	GCA	2	6	165834	165839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412413
3544	NC_006511	CGT	2	6	165846	165851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412413
3545	NC_006511	GATCA	2	10	165913	165922	40 %	20 %	20 %	20 %	56412413
3546	NC_006511	TGT	2	6	165998	166003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412413
3547	NC_006511	GCC	2	6	166048	166053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412413
3548	NC_006511	GCT	2	6	166104	166109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412413
3549	NC_006511	CCG	2	6	166143	166148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412413
3550	NC_006511	CTG	2	6	166156	166161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412413
3551	NC_006511	GCT	2	6	166224	166229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412413
3552	NC_006511	CAG	2	6	166246	166251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412413
3553	NC_006511	A	6	6	166307	166312	100 %	0 %	0 %	0 %	56412413
3554	NC_006511	TCT	2	6	166395	166400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412413
3555	NC_006511	TTA	2	6	166531	166536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412414
3556	NC_006511	GC	3	6	166563	166568	0 %	0 %	50 %	50 %	56412414
3557	NC_006511	CG	3	6	166610	166615	0 %	0 %	50 %	50 %	56412414
3558	NC_006511	CAT	2	6	166619	166624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412414
3559	NC_006511	ACC	2	6	166669	166674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412414
3560	NC_006511	CAG	2	6	166713	166718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412414
3561	NC_006511	TGT	2	6	166762	166767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412414
3562	NC_006511	CTG	2	6	166776	166781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412414
3563	NC_006511	TTC	2	6	166818	166823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412414
3564	NC_006511	A	6	6	166832	166837	100 %	0 %	0 %	0 %	56412414
3565	NC_006511	CGG	2	6	166874	166879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412414
3566	NC_006511	GGGC	2	8	166919	166926	0 %	0 %	75 %	25 %	56412414
3567	NC_006511	GC	3	6	166947	166952	0 %	0 %	50 %	50 %	56412414
3568	NC_006511	ATA	2	6	166954	166959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412414
3569	NC_006511	CCG	2	6	167029	167034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412414
3570	NC_006511	CTA	2	6	167140	167145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_006511	A	7	7	167177	167183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_006511	GAA	2	6	167292	167297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412415
3573	NC_006511	CTG	2	6	167500	167505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412415
3574	NC_006511	GAA	2	6	167526	167531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412415
3575	NC_006511	A	6	6	167614	167619	100 %	0 %	0 %	0 %	56412415
3576	NC_006511	TCG	2	6	167704	167709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412415
3577	NC_006511	ACG	2	6	167841	167846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412415
3578	NC_006511	CGG	2	6	167881	167886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412415
3579	NC_006511	GGC	2	6	167919	167924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412415
3580	NC_006511	GGC	2	6	167940	167945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412415
3581	NC_006511	CGG	3	9	167978	167986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412415
3582	NC_006511	AG	3	6	168029	168034	50 %	0 %	50 %	0 %	56412415
3583	NC_006511	CGG	2	6	168035	168040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412415
3584	NC_006511	AGA	2	6	168050	168055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412415
3585	NC_006511	CGG	2	6	168119	168124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412415
3586	NC_006511	CG	3	6	168138	168143	0 %	0 %	50 %	50 %	56412415
3587	NC_006511	CCGC	2	8	168193	168200	0 %	0 %	25 %	75 %	56412415
3588	NC_006511	CAC	2	6	168272	168277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412415
3589	NC_006511	CTGG	2	8	168331	168338	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3590	NC_006511	ATCCC	2	10	168359	168368	20 %	20 %	0 %	60 %	56412416
3591	NC_006511	CCA	3	9	168410	168418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412416
3592	NC_006511	TGA	2	6	168440	168445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412416
3593	NC_006511	GCCAGC	2	12	168484	168495	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56412416
3594	NC_006511	GCA	2	6	168527	168532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412416
3595	NC_006511	T	6	6	168604	168609	0 %	100 %	0 %	0 %	56412416
3596	NC_006511	GAA	2	6	168716	168721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412416
3597	NC_006511	CTT	2	6	168781	168786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412416
3598	NC_006511	AGA	2	6	168817	168822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412416
3599	NC_006511	CGCTGC	2	12	168823	168834	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56412416
3600	NC_006511	CTG	2	6	168862	168867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412416
3601	NC_006511	ATA	2	6	168940	168945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412416
3602	NC_006511	CG	3	6	168947	168952	0 %	0 %	50 %	50 %	56412416
3603	NC_006511	AGA	2	6	168955	168960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412416
3604	NC_006511	GGC	2	6	168990	168995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412416
3605	NC_006511	GCA	2	6	169016	169021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412416
3606	NC_006511	GGC	2	6	169038	169043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412416
3607	NC_006511	AAT	2	6	169053	169058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412416
3608	NC_006511	TAGCG	2	10	169066	169075	20 %	20 %	40 %	20 %	56412416
3609	NC_006511	AGC	2	6	169133	169138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412416
3610	NC_006511	ATC	2	6	169174	169179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412416
3611	NC_006511	GCG	2	6	169190	169195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412416
3612	NC_006511	ATGA	2	8	169344	169351	50 %	25 %	25 %	0 %	56412416
3613	NC_006511	TGA	2	6	169363	169368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412416
3614	NC_006511	CTT	2	6	169388	169393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412416
3615	NC_006511	GCG	2	6	169402	169407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412416
3616	NC_006511	TGA	2	6	169460	169465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412416
3617	NC_006511	TGCCAG	2	12	169531	169542	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56412416
3618	NC_006511	CTG	2	6	169654	169659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412417
3619	NC_006511	TGCC	2	8	169789	169796	0 %	25 %	25 %	50 %	56412417
3620	NC_006511	GC	3	6	169806	169811	0 %	0 %	50 %	50 %	56412417
3621	NC_006511	ACC	2	6	169898	169903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412417
3622	NC_006511	ATC	2	6	169922	169927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412417
3623	NC_006511	TGC	2	6	169946	169951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412417
3624	NC_006511	TGG	2	6	169971	169976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412417
3625	NC_006511	GCC	2	6	170018	170023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412417
3626	NC_006511	ATG	3	9	170069	170077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412417
3627	NC_006511	GC	4	8	170097	170104	0 %	0 %	50 %	50 %	56412417
3628	NC_006511	GGAT	2	8	170135	170142	25 %	25 %	50 %	0 %	56412417
3629	NC_006511	GC	3	6	170229	170234	0 %	0 %	50 %	50 %	56412417
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3635	NC_006511	CA	3	6	170777	170782	50 %	0 %	0 %	50 %	56412417
3636	NC_006511	TGA	2	6	170894	170899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412417
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3640	NC_006511	ATG	2	6	171062	171067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412418
3641	NC_006511	TGA	2	6	171105	171110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412418
3642	NC_006511	TGA	2	6	171147	171152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412418
3643	NC_006511	CGCAT	2	10	171178	171187	20 %	20 %	20 %	40 %	56412418
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3646	NC_006511	GAT	2	6	171325	171330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412418
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3648	NC_006511	ACG	2	6	171538	171543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3649	NC_006511	GA	3	6	171619	171624	50 %	0 %	50 %	0 %	56412419
3650	NC_006511	GC	3	6	171629	171634	0 %	0 %	50 %	50 %	56412419
3651	NC_006511	GC	3	6	171650	171655	0 %	0 %	50 %	50 %	56412419
3652	NC_006511	ATA	2	6	171799	171804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412419
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3654	NC_006511	GAT	2	6	171971	171976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412419
3655	NC_006511	GCC	3	9	171981	171989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412419
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3657	NC_006511	GCG	2	6	172086	172091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412419
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3659	NC_006511	TTGG	2	8	172191	172198	0 %	50 %	50 %	0 %	56412419
3660	NC_006511	CAT	2	6	172241	172246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412419
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3662	NC_006511	CGG	2	6	172418	172423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412419
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3666	NC_006511	CAC	2	6	172561	172566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3667	NC_006511	GTTG	2	8	172600	172607	0 %	50 %	50 %	0 %	56412420
3668	NC_006511	TGG	2	6	172675	172680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412420
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3678	NC_006511	TCG	2	6	173124	173129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412420
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3680	NC_006511	ATC	2	6	173217	173222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412421
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3688	NC_006511	TGGC	2	8	173663	173670	0 %	25 %	50 %	25 %	56412421
3689	NC_006511	GC	3	6	173669	173674	0 %	0 %	50 %	50 %	56412421
3690	NC_006511	CGC	2	6	173682	173687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412421
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3693	NC_006511	GGCG	2	8	173752	173759	0 %	0 %	75 %	25 %	56412421
3694	NC_006511	GC	3	6	173876	173881	0 %	0 %	50 %	50 %	56412421
3695	NC_006511	GCG	2	6	173915	173920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412421
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3698	NC_006511	ATT	2	6	173960	173965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412421
3699	NC_006511	TGT	2	6	173999	174004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3700	NC_006511	GGC	2	6	174106	174111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412422
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3702	NC_006511	TGG	2	6	174299	174304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412422
3703	NC_006511	TCG	2	6	174352	174357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412422
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3736	NC_006511	AACA	2	8	176351	176358	75 %	0 %	0 %	25 %	56412423
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3739	NC_006511	TC	3	6	176416	176421	0 %	50 %	0 %	50 %	56412423
3740	NC_006511	GAT	2	6	176465	176470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3741	NC_006511	ATT	2	6	176478	176483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3742	NC_006511	CGC	2	6	176517	176522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3743	NC_006511	T	6	6	176636	176641	0 %	100 %	0 %	0 %	56412424
3744	NC_006511	AGC	2	6	176671	176676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412424
3745	NC_006511	TCA	2	6	176717	176722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412424
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3885	NC_006511	GCA	3	9	182700	182708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412427
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3891	NC_006511	GCG	3	9	183027	183035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412427
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3954	NC_006511	ATA	2	6	185921	185926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3982	NC_006511	T	6	6	186944	186949	0 %	100 %	0 %	0 %	56412430
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3987	NC_006511	CG	3	6	187118	187123	0 %	0 %	50 %	50 %	56412431
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3991	NC_006511	GGCG	2	8	187290	187297	0 %	0 %	75 %	25 %	56412431
3992	NC_006511	TC	3	6	187301	187306	0 %	50 %	0 %	50 %	56412431
3993	NC_006511	TGC	2	6	187307	187312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412431
3994	NC_006511	TGC	2	6	187325	187330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412431
3995	NC_006511	TGC	3	9	187358	187366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412431
3996	NC_006511	GTG	2	6	187367	187372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412431
3997	NC_006511	CTG	2	6	187387	187392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412431
3998	NC_006511	CGC	2	6	187393	187398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412431
3999	NC_006511	CGA	2	6	187403	187408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412431
4000	NC_006511	CTG	2	6	187409	187414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412431

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