MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_006511	TG	3	6	117193	117198	0 %	50 %	50 %	0 %	56412370
2502	NC_006511	GCG	2	6	117254	117259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412370
2503	NC_006511	GCC	2	6	117300	117305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412370
2504	NC_006511	GTC	2	6	117339	117344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_006511	GGA	2	6	117393	117398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_006511	TGT	3	9	117405	117413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459642540
2507	NC_006511	CG	3	6	117445	117450	0 %	0 %	50 %	50 %	459642540
2508	NC_006511	CGC	2	6	117524	117529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459642540
2509	NC_006511	GCC	2	6	117557	117562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459642540
2510	NC_006511	CG	3	6	117575	117580	0 %	0 %	50 %	50 %	459642540
2511	NC_006511	TGT	2	6	117588	117593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459642540
2512	NC_006511	CG	3	6	117691	117696	0 %	0 %	50 %	50 %	459642540
2513	NC_006511	CTGA	2	8	117707	117714	25 %	25 %	25 %	25 %	459642540
2514	NC_006511	ATG	2	6	117765	117770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459642540
2515	NC_006511	ATGA	2	8	117804	117811	50 %	25 %	25 %	0 %	459642540
2516	NC_006511	GTTC	2	8	117812	117819	0 %	50 %	25 %	25 %	459642540
2517	NC_006511	ATG	2	6	117903	117908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_006511	TA	3	6	117913	117918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_006511	CAG	2	6	117919	117924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_006511	TTTA	2	8	117961	117968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_006511	A	6	6	118076	118081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_006511	T	6	6	118088	118093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_006511	GTTT	2	8	118094	118101	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_006511	TAAT	2	8	118102	118109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_006511	ATA	2	6	118159	118164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_006511	TAAA	2	8	118185	118192	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_006511	TCG	2	6	118212	118217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_006511	CT	3	6	118222	118227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2529	NC_006511	TAATT	2	10	118231	118240	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_006511	ATTTT	2	10	118257	118266	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_006511	CGGGTG	2	12	118273	118284	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2532	NC_006511	T	6	6	118419	118424	0 %	100 %	0 %	0 %	56412372
2533	NC_006511	ACAGA	2	10	118440	118449	60 %	0 %	20 %	20 %	56412372
2534	NC_006511	ATT	2	6	118464	118469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412372
2535	NC_006511	T	7	7	118484	118490	0 %	100 %	0 %	0 %	56412372
2536	NC_006511	ATT	2	6	118533	118538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412372
2537	NC_006511	CAA	2	6	118570	118575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412372
2538	NC_006511	TTC	2	6	118590	118595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412372
2539	NC_006511	GGAA	2	8	118604	118611	50 %	0 %	50 %	0 %	56412372
2540	NC_006511	ATA	2	6	118633	118638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412372
2541	NC_006511	AT	3	6	118691	118696	50 %	50 %	0 %	0 %	56412372
2542	NC_006511	TCA	2	6	118709	118714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412372
2543	NC_006511	C	6	6	118720	118725	0 %	0 %	0 %	100 %	56412372
2544	NC_006511	CAG	2	6	118799	118804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412373
2545	NC_006511	TGC	2	6	118809	118814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412373
2546	NC_006511	GCG	2	6	118828	118833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412373
2547	NC_006511	GGC	2	6	118840	118845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412373
2548	NC_006511	AGA	2	6	118846	118851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412373
2549	NC_006511	CTT	2	6	118867	118872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412373
2550	NC_006511	GCG	2	6	118962	118967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412373
2551	NC_006511	CAA	2	6	118993	118998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412373
2552	NC_006511	GTGG	2	8	119090	119097	0 %	25 %	75 %	0 %	56412373
2553	NC_006511	GT	3	6	119157	119162	0 %	50 %	50 %	0 %	56412373
2554	NC_006511	GCC	2	6	119168	119173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412373
2555	NC_006511	GAC	2	6	119220	119225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412373
2556	NC_006511	ACC	3	9	119268	119276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412373
2557	NC_006511	CGC	2	6	119332	119337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412373
2558	NC_006511	TCT	2	6	119433	119438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412373
2559	NC_006511	CAGCG	2	10	119615	119624	20 %	0 %	40 %	40 %	56412374
2560	NC_006511	ATCA	2	8	119656	119663	50 %	25 %	0 %	25 %	56412374
2561	NC_006511	GC	3	6	119742	119747	0 %	0 %	50 %	50 %	56412374
2562	NC_006511	GCCA	2	8	119749	119756	25 %	0 %	25 %	50 %	56412374
2563	NC_006511	GCG	2	6	119838	119843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412374
2564	NC_006511	CAG	2	6	119869	119874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412374
2565	NC_006511	CGA	2	6	119907	119912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412374
2566	NC_006511	GCCGG	2	10	119915	119924	0 %	0 %	60 %	40 %	56412374
2567	NC_006511	GCC	2	6	119962	119967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412374
2568	NC_006511	AC	3	6	120022	120027	50 %	0 %	0 %	50 %	56412374
2569	NC_006511	CGAGC	2	10	120040	120049	20 %	0 %	40 %	40 %	56412374
2570	NC_006511	TCC	2	6	120086	120091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56412374
2571	NC_006511	GCC	2	6	120103	120108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412374
2572	NC_006511	GCG	2	6	120149	120154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412374
2573	NC_006511	CTG	2	6	120190	120195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412374
2574	NC_006511	GTT	2	6	120225	120230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412374
2575	NC_006511	AGT	3	9	120253	120261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412374
2576	NC_006511	GCC	2	6	120274	120279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412374
2577	NC_006511	GC	3	6	120313	120318	0 %	0 %	50 %	50 %	56412374
2578	NC_006511	GGCG	2	8	120361	120368	0 %	0 %	75 %	25 %	56412374
2579	NC_006511	GCT	2	6	120379	120384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412374
2580	NC_006511	TCGCCG	2	12	120413	120424	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56412374
2581	NC_006511	CAC	2	6	120433	120438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412374
2582	NC_006511	ATTTG	2	10	120483	120492	20 %	60 %	20 %	0 %	56412374
2583	NC_006511	GTCA	2	8	120511	120518	25 %	25 %	25 %	25 %	56412374
2584	NC_006511	GAC	2	6	120646	120651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412374
2585	NC_006511	TGC	2	6	120656	120661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412374
2586	NC_006511	CG	3	6	120671	120676	0 %	0 %	50 %	50 %	56412374
2587	NC_006511	GCC	2	6	120697	120702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412374
2588	NC_006511	GGTTCA	2	12	120714	120725	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56412374
2589	NC_006511	GCG	2	6	120758	120763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412374
2590	NC_006511	AGT	2	6	120785	120790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412374
2591	NC_006511	ACC	2	6	120854	120859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412374
2592	NC_006511	GCTG	2	8	121038	121045	0 %	25 %	50 %	25 %	56412374
2593	NC_006511	TGT	2	6	121161	121166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412375
2594	NC_006511	CTG	2	6	121184	121189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412375
2595	NC_006511	GCG	2	6	121193	121198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412375
2596	NC_006511	GGC	2	6	121277	121282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412375
2597	NC_006511	CGG	2	6	121312	121317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412375
2598	NC_006511	GCG	2	6	121326	121331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412375
2599	NC_006511	CGA	2	6	121357	121362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412375
2600	NC_006511	GCA	2	6	121388	121393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412375
2601	NC_006511	GCC	2	6	121427	121432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412375
2602	NC_006511	GC	5	10	121488	121497	0 %	0 %	50 %	50 %	56412375
2603	NC_006511	CAC	2	6	121625	121630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412375
2604	NC_006511	GCT	2	6	121687	121692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412375
2605	NC_006511	CTGG	2	8	121694	121701	0 %	25 %	50 %	25 %	56412375
2606	NC_006511	TGC	2	6	121728	121733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412375
2607	NC_006511	GTT	2	6	121741	121746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412375
2608	NC_006511	CAC	2	6	121832	121837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412375
2609	NC_006511	CGC	2	6	121993	121998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412375
2610	NC_006511	CAC	2	6	122006	122011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412375
2611	NC_006511	CGG	2	6	122071	122076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412375
2612	NC_006511	TCA	2	6	122133	122138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412375
2613	NC_006511	AAG	2	6	122139	122144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412375
2614	NC_006511	GGC	2	6	122151	122156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412375
2615	NC_006511	CGG	2	6	122211	122216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412375
2616	NC_006511	GTG	2	6	122232	122237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412375
2617	NC_006511	AGC	2	6	122244	122249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412375
2618	NC_006511	CA	3	6	122263	122268	50 %	0 %	0 %	50 %	56412375
2619	NC_006511	CGG	2	6	122284	122289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412375
2620	NC_006511	GCC	2	6	122360	122365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412375
2621	NC_006511	AGT	2	6	122377	122382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412375
2622	NC_006511	TCG	2	6	122418	122423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412375
2623	NC_006511	CTT	2	6	122425	122430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412375
2624	NC_006511	CGG	2	6	122434	122439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412375
2625	NC_006511	GCG	2	6	122583	122588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412375
2626	NC_006511	CG	3	6	122641	122646	0 %	0 %	50 %	50 %	56412375
2627	NC_006511	GAT	2	6	122647	122652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412375
2628	NC_006511	GTT	2	6	122663	122668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412375
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2631	NC_006511	TCG	2	6	122730	122735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412375
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2635	NC_006511	AG	3	6	122847	122852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2636	NC_006511	CAGG	2	8	122869	122876	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2637	NC_006511	AATGCT	2	12	122899	122910	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2638	NC_006511	TCA	2	6	123051	123056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2640	NC_006511	TCT	2	6	123116	123121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2641	NC_006511	G	6	6	123131	123136	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2642	NC_006511	T	7	7	123245	123251	0 %	100 %	0 %	0 %	56412376
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2750	NC_006511	CAGCCC	2	12	127674	127685	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	56412380
2751	NC_006511	CGG	2	6	127761	127766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412380
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2998	NC_006511	T	8	8	139707	139714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2999	NC_006511	AAAGC	2	10	139910	139919	60 %	0 %	20 %	20 %	56412390
3000	NC_006511	GCT	2	6	140119	140124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412390

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