MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_006511	GCC	2	6	92619	92624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412351
2003	NC_006511	GTT	2	6	92646	92651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412351
2004	NC_006511	CTAT	2	8	92723	92730	25 %	50 %	0 %	25 %	56412351
2005	NC_006511	TCG	2	6	92747	92752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412351
2006	NC_006511	T	6	6	92812	92817	0 %	100 %	0 %	0 %	56412351
2007	NC_006511	ATG	2	6	92893	92898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412351
2008	NC_006511	GCT	2	6	92913	92918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412351
2009	NC_006511	CAT	2	6	92940	92945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412351
2010	NC_006511	GTG	2	6	92953	92958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412351
2011	NC_006511	CTT	2	6	92976	92981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412351
2012	NC_006511	CGG	2	6	92985	92990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412351
2013	NC_006511	TCA	2	6	93062	93067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412351
2014	NC_006511	TTA	2	6	93119	93124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412351
2015	NC_006511	TAA	2	6	93138	93143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412351
2016	NC_006511	AAC	2	6	93345	93350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_006511	GCA	2	6	93404	93409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412352
2018	NC_006511	CGC	2	6	93532	93537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412352
2019	NC_006511	GAGC	2	8	93583	93590	25 %	0 %	50 %	25 %	56412352
2020	NC_006511	TAAT	2	8	93595	93602	50 %	50 %	0 %	0 %	56412352
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2025	NC_006511	A	7	7	93813	93819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2035	NC_006511	GC	4	8	94351	94358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2036	NC_006511	TGCC	2	8	94373	94380	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2037	NC_006511	A	6	6	94398	94403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_006511	CT	3	6	94470	94475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2039	NC_006511	TAT	2	6	94476	94481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2043	NC_006511	GCG	2	6	94784	94789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412354
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2049	NC_006511	ACTC	2	8	95031	95038	25 %	25 %	0 %	50 %	56412355
2050	NC_006511	ATT	2	6	95063	95068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412355
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2055	NC_006511	TAT	2	6	95223	95228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2058	NC_006511	TAA	2	6	95467	95472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_006511	T	8	8	95477	95484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2061	NC_006511	A	7	7	95518	95524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_006511	AAT	2	6	95540	95545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_006511	TTAT	2	8	95563	95570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_006511	AT	3	6	95573	95578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2065	NC_006511	TAA	2	6	95661	95666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2094	NC_006511	A	6	6	97211	97216	100 %	0 %	0 %	0 %	56412356
2095	NC_006511	GAT	2	6	97284	97289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412356
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2102	NC_006511	CAA	2	6	97713	97718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2107	NC_006511	GCC	2	6	97938	97943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2111	NC_006511	A	6	6	98124	98129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2112	NC_006511	ATC	2	6	98133	98138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2113	NC_006511	ATT	2	6	98159	98164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2115	NC_006511	CAGG	2	8	98216	98223	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2116	NC_006511	GCC	2	6	98288	98293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2117	NC_006511	CG	4	8	98310	98317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2118	NC_006511	GCA	2	6	98332	98337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2119	NC_006511	CCT	2	6	98360	98365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2120	NC_006511	ATGG	2	8	98378	98385	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2124	NC_006511	TGCAC	2	10	98584	98593	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2125	NC_006511	GAC	2	6	98607	98612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2127	NC_006511	AGG	2	6	98662	98667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2133	NC_006511	GC	3	6	98919	98924	0 %	0 %	50 %	50 %	56412357
2134	NC_006511	GGC	3	9	98935	98943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412357
2135	NC_006511	TGG	2	6	98954	98959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412357
2136	NC_006511	GCG	2	6	98963	98968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412357
2137	NC_006511	AATG	2	8	99072	99079	50 %	25 %	25 %	0 %	56412357
2138	NC_006511	TGG	2	6	99158	99163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412357
2139	NC_006511	GAT	2	6	99165	99170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412357
2140	NC_006511	GCT	2	6	99174	99179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412357
2141	NC_006511	GCC	2	6	99181	99186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412357
2142	NC_006511	GCG	2	6	99188	99193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412357
2143	NC_006511	CCA	2	6	99197	99202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412357
2144	NC_006511	TGG	2	6	99254	99259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412357
2145	NC_006511	GCGCT	2	10	99289	99298	0 %	20 %	40 %	40 %	56412357
2146	NC_006511	CG	3	6	99303	99308	0 %	0 %	50 %	50 %	56412357
2147	NC_006511	GGCG	2	8	99414	99421	0 %	0 %	75 %	25 %	56412357
2148	NC_006511	CTG	2	6	99424	99429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412357
2149	NC_006511	TGC	2	6	99485	99490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412357
2150	NC_006511	GATT	2	8	99522	99529	25 %	50 %	25 %	0 %	56412357
2151	NC_006511	CTG	2	6	99562	99567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412357
2152	NC_006511	TTG	2	6	99568	99573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412357
2153	NC_006511	TGT	2	6	99602	99607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412357
2154	NC_006511	TTA	2	6	99664	99669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412357
2155	NC_006511	GGCGC	2	10	99703	99712	0 %	0 %	60 %	40 %	56412357
2156	NC_006511	GGC	2	6	99777	99782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412357
2157	NC_006511	TGC	2	6	99800	99805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412357
2158	NC_006511	GC	3	6	99838	99843	0 %	0 %	50 %	50 %	56412357
2159	NC_006511	CGA	2	6	99858	99863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412357
2160	NC_006511	AGC	2	6	99866	99871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412357
2161	NC_006511	CTG	3	9	99922	99930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412357
2162	NC_006511	TGG	2	6	99947	99952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412357
2163	NC_006511	T	6	6	100007	100012	0 %	100 %	0 %	0 %	56412357
2164	NC_006511	GCGAC	2	10	100016	100025	20 %	0 %	40 %	40 %	56412357
2165	NC_006511	GCG	2	6	100054	100059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412357
2166	NC_006511	CGCCCG	2	12	100155	100166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412357
2167	NC_006511	GC	3	6	100235	100240	0 %	0 %	50 %	50 %	56412357
2168	NC_006511	GCTGGG	2	12	100269	100280	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	56412357
2169	NC_006511	GC	3	6	100299	100304	0 %	0 %	50 %	50 %	56412357
2170	NC_006511	TGG	2	6	100334	100339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412357
2171	NC_006511	CGC	3	9	100377	100385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412357
2172	NC_006511	ATT	2	6	100417	100422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412357
2173	NC_006511	GCC	2	6	100501	100506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412357
2174	NC_006511	A	6	6	100540	100545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2175	NC_006511	ACT	2	6	100588	100593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2176	NC_006511	CAG	2	6	100631	100636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2177	NC_006511	CGA	2	6	100674	100679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2178	NC_006511	GGC	2	6	100702	100707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2179	NC_006511	T	8	8	100710	100717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2180	NC_006511	TAAT	2	8	100729	100736	50 %	50 %	0 %	0 %	56412358
2181	NC_006511	GCG	2	6	100750	100755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412358
2182	NC_006511	CCTG	2	8	100803	100810	0 %	25 %	25 %	50 %	56412358
2183	NC_006511	TAAA	2	8	100841	100848	75 %	25 %	0 %	0 %	56412358
2184	NC_006511	GTC	2	6	100852	100857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412358
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2186	NC_006511	CGA	2	6	100938	100943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412358
2187	NC_006511	GCG	2	6	100988	100993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412358
2188	NC_006511	GGC	2	6	101017	101022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412358
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2190	NC_006511	GGC	2	6	101231	101236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2191	NC_006511	CTTCGC	2	12	101334	101345	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	56412359
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2193	NC_006511	TCCCTT	2	12	101463	101474	0 %	50 %	0 %	50 %	56412359
2194	NC_006511	GCG	2	6	101550	101555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412359
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2200	NC_006511	TCG	2	6	102125	102130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412359
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2205	NC_006511	CG	3	6	102634	102639	0 %	0 %	50 %	50 %	56412361
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2214	NC_006511	TCATGG	2	12	103095	103106	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56412361
2215	NC_006511	CTG	2	6	103111	103116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412361
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2220	NC_006511	CCGA	2	8	103527	103534	25 %	0 %	25 %	50 %	56412362
2221	NC_006511	CAG	2	6	103628	103633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412362
2222	NC_006511	TCG	2	6	103672	103677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412362
2223	NC_006511	ATG	2	6	103687	103692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412362
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2225	NC_006511	TTC	2	6	103896	103901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412362
2226	NC_006511	CAT	2	6	103911	103916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412362
2227	NC_006511	T	6	6	103923	103928	0 %	100 %	0 %	0 %	56412362
2228	NC_006511	CGT	2	6	103982	103987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412362
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2230	NC_006511	GC	4	8	104120	104127	0 %	0 %	50 %	50 %	56412362
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2232	NC_006511	GGC	2	6	104223	104228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412362
2233	NC_006511	GC	3	6	104243	104248	0 %	0 %	50 %	50 %	56412362
2234	NC_006511	GAC	2	6	104259	104264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412362
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2236	NC_006511	GAC	2	6	104298	104303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412362
2237	NC_006511	CGG	2	6	104321	104326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412362
2238	NC_006511	AAC	2	6	104343	104348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412362
2239	NC_006511	GC	3	6	104397	104402	0 %	0 %	50 %	50 %	56412363
2240	NC_006511	CGC	2	6	104420	104425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412363
2241	NC_006511	TTC	2	6	104426	104431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412363
2242	NC_006511	TCA	2	6	104446	104451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412363
2243	NC_006511	GC	3	6	104551	104556	0 %	0 %	50 %	50 %	56412363
2244	NC_006511	CCCAA	2	10	104623	104632	40 %	0 %	0 %	60 %	56412363
2245	NC_006511	CGC	2	6	104678	104683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412363
2246	NC_006511	TTC	2	6	104726	104731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412363
2247	NC_006511	GC	3	6	104741	104746	0 %	0 %	50 %	50 %	56412363
2248	NC_006511	CTG	2	6	104747	104752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412363
2249	NC_006511	TTC	2	6	104898	104903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412363
2250	NC_006511	CTG	2	6	104981	104986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412363
2251	NC_006511	CTT	2	6	105037	105042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412363
2252	NC_006511	CAA	2	6	105043	105048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412363
2253	NC_006511	CGT	2	6	105070	105075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412363
2254	NC_006511	CTT	2	6	105184	105189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412363
2255	NC_006511	CGA	2	6	105210	105215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412363
2256	NC_006511	GTT	2	6	105221	105226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412363
2257	NC_006511	ATC	2	6	105243	105248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412363
2258	NC_006511	TTGTT	2	10	105330	105339	0 %	80 %	20 %	0 %	56412363
2259	NC_006511	TCT	2	6	105394	105399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412363
2260	NC_006511	CGT	2	6	105463	105468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412363
2261	NC_006511	GCT	2	6	105475	105480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412363
2262	NC_006511	CCTG	2	8	105483	105490	0 %	25 %	25 %	50 %	56412363
2263	NC_006511	TGAC	2	8	105505	105512	25 %	25 %	25 %	25 %	56412363
2264	NC_006511	ACG	2	6	105543	105548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412363
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2271	NC_006511	GTT	2	6	105828	105833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412364
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2332	NC_006511	AATG	2	8	109169	109176	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2373	NC_006511	T	6	6	110953	110958	0 %	100 %	0 %	0 %	56412367
2374	NC_006511	GAC	2	6	111010	111015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412367
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2377	NC_006511	TCT	2	6	111138	111143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412367
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2380	NC_006511	TTCGCG	2	12	111218	111229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412367
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