MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_006511	CGG	2	6	909183	909188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19502	NC_006511	CGT	2	6	909214	909219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19503	NC_006511	A	6	6	909319	909324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19504	NC_006511	AGCG	2	8	909331	909338	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19505	NC_006511	AAAGA	2	10	909355	909364	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19506	NC_006511	TGGA	2	8	909443	909450	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19507	NC_006511	CGC	2	6	909471	909476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19508	NC_006511	TCA	2	6	909477	909482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19509	NC_006511	TC	3	6	909575	909580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19510	NC_006511	TA	3	6	909727	909732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19511	NC_006511	GCA	2	6	909758	909763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413037
19512	NC_006511	CAGG	2	8	909777	909784	25 %	0 %	50 %	25 %	56413037
19513	NC_006511	TGGT	2	8	909815	909822	0 %	50 %	50 %	0 %	56413037
19514	NC_006511	AC	3	6	909831	909836	50 %	0 %	0 %	50 %	56413037
19515	NC_006511	AAC	2	6	909854	909859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56413037
19516	NC_006511	TGA	2	6	909860	909865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413037
19517	NC_006511	GTGG	2	8	909867	909874	0 %	25 %	75 %	0 %	56413037
19518	NC_006511	GTG	2	6	909964	909969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413037
19519	NC_006511	GGC	2	6	910033	910038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413037
19520	NC_006511	CTG	2	6	910049	910054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413037
19521	NC_006511	CG	3	6	910056	910061	0 %	0 %	50 %	50 %	56413037
19522	NC_006511	T	6	6	910099	910104	0 %	100 %	0 %	0 %	56413037
19523	NC_006511	CGGA	2	8	910257	910264	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19524	NC_006511	TCCG	2	8	910273	910280	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19525	NC_006511	T	6	6	910319	910324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19526	NC_006511	GCGT	2	8	910347	910354	0 %	25 %	50 %	25 %	56413038
19527	NC_006511	GTG	2	6	910505	910510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413038
19528	NC_006511	GCG	2	6	910586	910591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413038
19529	NC_006511	TGG	2	6	910599	910604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413038
19530	NC_006511	TGGTG	2	10	910641	910650	0 %	40 %	60 %	0 %	56413038
19531	NC_006511	GGCT	2	8	910673	910680	0 %	25 %	50 %	25 %	56413038
19532	NC_006511	A	6	6	910691	910696	100 %	0 %	0 %	0 %	56413038
19533	NC_006511	GTT	2	6	910733	910738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413038
19534	NC_006511	TGGCG	2	10	910775	910784	0 %	20 %	60 %	20 %	56413038
19535	NC_006511	TGT	2	6	910815	910820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413038
19536	NC_006511	GC	3	6	910840	910845	0 %	0 %	50 %	50 %	56413038
19537	NC_006511	GTC	2	6	910976	910981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413038
19538	NC_006511	CGCC	2	8	911001	911008	0 %	0 %	25 %	75 %	56413038
19539	NC_006511	CG	3	6	911112	911117	0 %	0 %	50 %	50 %	56413038
19540	NC_006511	CA	3	6	911144	911149	50 %	0 %	0 %	50 %	56413038
19541	NC_006511	CAG	2	6	911162	911167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413038
19542	NC_006511	GCA	2	6	911173	911178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413038
19543	NC_006511	GTT	2	6	911203	911208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413038
19544	NC_006511	TGC	2	6	911260	911265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413038
19545	NC_006511	AGC	2	6	911289	911294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413038
19546	NC_006511	TGAA	2	8	911421	911428	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19547	NC_006511	TGC	2	6	911434	911439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19548	NC_006511	GGC	2	6	911561	911566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19549	NC_006511	CGAATC	2	12	911618	911629	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19550	NC_006511	AAC	2	6	911657	911662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56413039
19551	NC_006511	CTT	2	6	911668	911673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56413039
19552	NC_006511	GAA	2	6	911747	911752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413039
19553	NC_006511	TGC	3	9	911776	911784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413039
19554	NC_006511	ATC	2	6	911841	911846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413039
19555	NC_006511	TGA	2	6	911879	911884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413039
19556	NC_006511	CAT	2	6	911888	911893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413039
19557	NC_006511	AAT	2	6	911983	911988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413039
19558	NC_006511	TGT	2	6	912061	912066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413040
19559	NC_006511	T	6	6	912087	912092	0 %	100 %	0 %	0 %	56413040
19560	NC_006511	CAC	2	6	912153	912158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56413040
19561	NC_006511	CTGG	2	8	912249	912256	0 %	25 %	50 %	25 %	56413040
19562	NC_006511	GCC	2	6	912274	912279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413040
19563	NC_006511	CTG	2	6	912336	912341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413040
19564	NC_006511	CTG	2	6	912369	912374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413040
19565	NC_006511	GGT	2	6	912386	912391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413040
19566	NC_006511	TGCG	2	8	912397	912404	0 %	25 %	50 %	25 %	56413040
19567	NC_006511	GGC	2	6	912442	912447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413040
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19569	NC_006511	TGA	2	6	912502	912507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413040
19570	NC_006511	TGG	2	6	912554	912559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413040
19571	NC_006511	GAT	2	6	912581	912586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413040
19572	NC_006511	CCG	2	6	912599	912604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413040
19573	NC_006511	TGC	2	6	912623	912628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413040
19574	NC_006511	CCA	2	6	912725	912730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56413040
19575	NC_006511	CGG	2	6	912762	912767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413040
19576	NC_006511	ATCC	2	8	912835	912842	25 %	25 %	0 %	50 %	56413040
19577	NC_006511	GC	3	6	912916	912921	0 %	0 %	50 %	50 %	56413040
19578	NC_006511	TTA	2	6	912942	912947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19579	NC_006511	CGT	2	6	912966	912971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19580	NC_006511	TGA	2	6	913064	913069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413041
19581	NC_006511	TCA	2	6	913132	913137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413041
19582	NC_006511	CCG	2	6	913172	913177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413041
19583	NC_006511	GC	4	8	913183	913190	0 %	0 %	50 %	50 %	56413041
19584	NC_006511	TCC	2	6	913233	913238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56413041
19585	NC_006511	ATA	2	6	913246	913251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413041
19586	NC_006511	TGG	2	6	913262	913267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413041
19587	NC_006511	GAC	2	6	913354	913359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413041
19588	NC_006511	ATT	2	6	913389	913394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413041
19589	NC_006511	TAA	2	6	913395	913400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413041
19590	NC_006511	GCG	2	6	913415	913420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413041
19591	NC_006511	CAT	2	6	913485	913490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413041
19592	NC_006511	GCG	2	6	913502	913507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413041
19593	NC_006511	GCT	2	6	913557	913562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413041
19594	NC_006511	ACA	2	6	913578	913583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56413041
19595	NC_006511	CGC	2	6	913631	913636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413041
19596	NC_006511	TAA	2	6	913693	913698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413041
19597	NC_006511	A	6	6	913902	913907	100 %	0 %	0 %	0 %	56413041
19598	NC_006511	CCG	2	6	913912	913917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413041
19599	NC_006511	ACCC	2	8	913932	913939	25 %	0 %	0 %	75 %	56413041
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19603	NC_006511	CAG	2	6	914136	914141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413041
19604	NC_006511	ATT	2	6	914179	914184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413041
19605	NC_006511	ATT	2	6	914243	914248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413042
19606	NC_006511	TAA	2	6	914260	914265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413042
19607	NC_006511	TCG	2	6	914356	914361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413042
19608	NC_006511	CAG	2	6	914459	914464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413042
19609	NC_006511	CTGG	2	8	914600	914607	0 %	25 %	50 %	25 %	56413042
19610	NC_006511	GGT	2	6	914658	914663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413043
19611	NC_006511	CAT	2	6	914670	914675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413043
19612	NC_006511	CGG	2	6	914717	914722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413043
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19614	NC_006511	CTT	2	6	914880	914885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56413043
19615	NC_006511	AAAT	2	8	914886	914893	75 %	25 %	0 %	0 %	56413043
19616	NC_006511	CCA	2	6	914995	915000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56413044
19617	NC_006511	CAG	2	6	915050	915055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413044
19618	NC_006511	CGCC	2	8	915115	915122	0 %	0 %	25 %	75 %	56413044
19619	NC_006511	ACC	2	6	915123	915128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56413044
19620	NC_006511	CCG	2	6	915141	915146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413044
19621	NC_006511	GCG	2	6	915207	915212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413044
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19623	NC_006511	CGA	2	6	915241	915246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413044
19624	NC_006511	CGA	2	6	915334	915339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413044
19625	NC_006511	CTG	2	6	915377	915382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413044
19626	NC_006511	CGC	2	6	915397	915402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413044
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19629	NC_006511	CTT	2	6	915750	915755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56413045
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19631	NC_006511	TCG	2	6	915842	915847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413045
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19655	NC_006511	CG	4	8	916641	916648	0 %	0 %	50 %	50 %	56413045
19656	NC_006511	CGC	2	6	916674	916679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413045
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19664	NC_006511	CGC	2	6	917103	917108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413046
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19741	NC_006511	CGGCG	2	10	920019	920028	0 %	0 %	60 %	40 %	56413048
19742	NC_006511	CGAT	2	8	920120	920127	25 %	25 %	25 %	25 %	56413048
19743	NC_006511	GCT	2	6	920155	920160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413048
19744	NC_006511	GCT	2	6	920184	920189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413048
19745	NC_006511	A	6	6	920220	920225	100 %	0 %	0 %	0 %	56413048
19746	NC_006511	TGC	2	6	920228	920233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413048
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19749	NC_006511	GGGT	2	8	920339	920346	0 %	25 %	75 %	0 %	56413048
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19757	NC_006511	GCA	2	6	920919	920924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413050
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19774	NC_006511	TCG	2	6	921778	921783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413051
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19776	NC_006511	CTG	2	6	921946	921951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413052
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19834	NC_006511	CGA	2	6	924605	924610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413055
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19837	NC_006511	TG	3	6	924683	924688	0 %	50 %	50 %	0 %	56413055
19838	NC_006511	TGA	2	6	924738	924743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413055
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19842	NC_006511	TAC	2	6	924846	924851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19844	NC_006511	TCAC	2	8	924938	924945	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19845	NC_006511	GCC	2	6	924948	924953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19846	NC_006511	TCG	2	6	924987	924992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413056
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19849	NC_006511	TCG	2	6	925080	925085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413056
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19853	NC_006511	GTC	2	6	925316	925321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413056
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19859	NC_006511	CAG	2	6	925714	925719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413057
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19991	NC_006511	AACA	2	8	932674	932681	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19992	NC_006511	GTGGAT	2	12	932682	932693	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
19993	NC_006511	CGG	2	6	932728	932733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19994	NC_006511	GAT	2	6	932793	932798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19995	NC_006511	TTA	2	6	932813	932818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19996	NC_006511	GAT	2	6	932906	932911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19997	NC_006511	CTGG	2	8	932912	932919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19998	NC_006511	CGC	2	6	932942	932947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19999	NC_006511	GGC	2	6	932954	932959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20000	NC_006511	GCGG	2	8	932984	932991	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

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