MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_006511	GC	3	6	885659	885664	0 %	0 %	50 %	50 %	56413020
19002	NC_006511	CGG	2	6	885782	885787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413020
19003	NC_006511	CG	3	6	885820	885825	0 %	0 %	50 %	50 %	56413020
19004	NC_006511	CGC	2	6	885876	885881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413020
19005	NC_006511	TGA	2	6	885885	885890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413020
19006	NC_006511	AGA	2	6	885968	885973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413020
19007	NC_006511	TGA	2	6	886044	886049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413020
19008	NC_006511	CAG	2	6	886054	886059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413020
19009	NC_006511	TGT	2	6	886071	886076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413020
19010	NC_006511	CTA	2	6	886131	886136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413020
19011	NC_006511	CGC	2	6	886149	886154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413020
19012	NC_006511	ACT	2	6	886190	886195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413020
19013	NC_006511	AAG	2	6	886226	886231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413020
19014	NC_006511	AAT	2	6	886256	886261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413020
19015	NC_006511	T	8	8	886299	886306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19016	NC_006511	TAA	2	6	886350	886355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19017	NC_006511	TA	3	6	886410	886415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19018	NC_006511	CAT	2	6	886458	886463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19019	NC_006511	AAT	2	6	886493	886498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413021
19020	NC_006511	ATG	2	6	886564	886569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413021
19021	NC_006511	TGG	2	6	886570	886575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413021
19022	NC_006511	TTG	2	6	886630	886635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413021
19023	NC_006511	TGA	2	6	886831	886836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413021
19024	NC_006511	TTA	2	6	886837	886842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413021
19025	NC_006511	CGG	2	6	886867	886872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413021
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19027	NC_006511	TCCC	2	8	886958	886965	0 %	25 %	0 %	75 %	56413021
19028	NC_006511	GC	3	6	886991	886996	0 %	0 %	50 %	50 %	56413021
19029	NC_006511	ATT	2	6	887178	887183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413021
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19032	NC_006511	TAA	2	6	887303	887308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413021
19033	NC_006511	TAT	2	6	887309	887314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413021
19034	NC_006511	GTG	2	6	887388	887393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413021
19035	NC_006511	TCA	2	6	887491	887496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413021
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19037	NC_006511	CTTT	2	8	887524	887531	0 %	75 %	0 %	25 %	56413021
19038	NC_006511	CAG	2	6	887568	887573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413021
19039	NC_006511	ATT	2	6	887583	887588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413021
19040	NC_006511	GGC	2	6	887600	887605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413021
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19043	NC_006511	AAT	2	6	887712	887717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19044	NC_006511	AT	3	6	887746	887751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19045	NC_006511	T	7	7	887786	887792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19046	NC_006511	GATT	2	8	887856	887863	25 %	50 %	25 %	0 %	56413022
19047	NC_006511	ATT	2	6	887905	887910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413022
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19049	NC_006511	TGA	2	6	887951	887956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413022
19050	NC_006511	ATT	2	6	887986	887991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413022
19051	NC_006511	GCT	2	6	888095	888100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413022
19052	NC_006511	AT	3	6	888255	888260	50 %	50 %	0 %	0 %	56413022
19053	NC_006511	GAA	2	6	888406	888411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413022
19054	NC_006511	GAT	2	6	888519	888524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413022
19055	NC_006511	CTG	2	6	888586	888591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413022
19056	NC_006511	TGA	2	6	888644	888649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413022
19057	NC_006511	GCTG	2	8	888702	888709	0 %	25 %	50 %	25 %	56413022
19058	NC_006511	GAT	2	6	888723	888728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413022
19059	NC_006511	CTT	2	6	888791	888796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19060	NC_006511	TGG	2	6	888804	888809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19061	NC_006511	A	6	6	888838	888843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19062	NC_006511	T	7	7	888859	888865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19063	NC_006511	TGA	2	6	888874	888879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413023
19064	NC_006511	GGT	2	6	888903	888908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413023
19065	NC_006511	GATCCT	2	12	888917	888928	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56413023
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19069	NC_006511	CGG	2	6	889097	889102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413023
19070	NC_006511	GCT	2	6	889121	889126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413023
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19075	NC_006511	CGTG	2	8	889311	889318	0 %	25 %	50 %	25 %	56413023
19076	NC_006511	AGA	2	6	889319	889324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413023
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19078	NC_006511	T	6	6	889439	889444	0 %	100 %	0 %	0 %	56413023
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19082	NC_006511	GC	3	6	889567	889572	0 %	0 %	50 %	50 %	56413024
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19085	NC_006511	ACGC	2	8	889697	889704	25 %	0 %	25 %	50 %	56413024
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19090	NC_006511	CGA	2	6	889870	889875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413024
19091	NC_006511	TGCAC	2	10	889879	889888	20 %	20 %	20 %	40 %	56413024
19092	NC_006511	AG	3	6	889970	889975	50 %	0 %	50 %	0 %	56413024
19093	NC_006511	GGC	2	6	889982	889987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413024
19094	NC_006511	GTC	2	6	889988	889993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413024
19095	NC_006511	CCGC	2	8	890007	890014	0 %	0 %	25 %	75 %	56413024
19096	NC_006511	CG	3	6	890047	890052	0 %	0 %	50 %	50 %	56413024
19097	NC_006511	CAC	2	6	890198	890203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56413024
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19101	NC_006511	GGC	2	6	890332	890337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413025
19102	NC_006511	ATC	2	6	890341	890346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413025
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19105	NC_006511	GTT	2	6	890505	890510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413025
19106	NC_006511	TTG	2	6	890558	890563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413025
19107	NC_006511	GC	3	6	890607	890612	0 %	0 %	50 %	50 %	56413025
19108	NC_006511	CAC	2	6	890635	890640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56413025
19109	NC_006511	CCG	2	6	890655	890660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413025
19110	NC_006511	TCT	2	6	890711	890716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56413025
19111	NC_006511	ACGC	2	8	890722	890729	25 %	0 %	25 %	50 %	56413025
19112	NC_006511	CGC	3	9	890727	890735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413025
19113	NC_006511	GCA	2	6	890832	890837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413025
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19117	NC_006511	AAT	2	6	890962	890967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413025
19118	NC_006511	CGC	2	6	891006	891011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413026
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19120	NC_006511	CCG	2	6	891062	891067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413026
19121	NC_006511	GCGGCA	2	12	891218	891229	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	56413026
19122	NC_006511	CAG	2	6	891273	891278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413026
19123	NC_006511	CGC	2	6	891284	891289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413026
19124	NC_006511	CGA	2	6	891304	891309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413026
19125	NC_006511	CAG	2	6	891312	891317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413026
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19127	NC_006511	ACC	2	6	891475	891480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56413026
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19129	NC_006511	CGG	2	6	891503	891508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413026
19130	NC_006511	GAC	2	6	891549	891554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413026
19131	NC_006511	TCA	2	6	891557	891562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413026
19132	NC_006511	GCGTA	2	10	891614	891623	20 %	20 %	40 %	20 %	56413027
19133	NC_006511	AAAC	2	8	891638	891645	75 %	0 %	0 %	25 %	56413027
19134	NC_006511	GGT	2	6	891655	891660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413027
19135	NC_006511	AG	3	6	891710	891715	50 %	0 %	50 %	0 %	56413027
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19137	NC_006511	GGTA	2	8	891766	891773	25 %	25 %	50 %	0 %	56413027
19138	NC_006511	GAC	2	6	891799	891804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413027
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19140	NC_006511	GC	3	6	891824	891829	0 %	0 %	50 %	50 %	56413027
19141	NC_006511	CATC	2	8	891838	891845	25 %	25 %	0 %	50 %	56413027
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19143	NC_006511	GTG	2	6	891938	891943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413027
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19147	NC_006511	AAG	2	6	892026	892031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413027
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19152	NC_006511	TCA	2	6	892362	892367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413027
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19154	NC_006511	ATC	2	6	892470	892475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413027
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19158	NC_006511	GCT	2	6	892768	892773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413028
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19162	NC_006511	CCAG	2	8	893094	893101	25 %	0 %	25 %	50 %	56413028
19163	NC_006511	TCG	2	6	893141	893146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413028
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19167	NC_006511	TGGC	2	8	893515	893522	0 %	25 %	50 %	25 %	56413028
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19170	NC_006511	CGG	2	6	893621	893626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413028
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19188	NC_006511	GAGCC	2	10	894596	894605	20 %	0 %	40 %	40 %	56413029
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19191	NC_006511	CTGG	2	8	894665	894672	0 %	25 %	50 %	25 %	56413029
19192	NC_006511	TCG	2	6	894757	894762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413029
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19194	NC_006511	CGG	3	9	894776	894784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413029
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19199	NC_006511	CAT	2	6	895113	895118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413030
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19219	NC_006511	A	8	8	896053	896060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19222	NC_006511	CA	3	6	896134	896139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19223	NC_006511	GAT	2	6	896160	896165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19224	NC_006511	TGA	2	6	896168	896173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19225	NC_006511	T	6	6	896275	896280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19226	NC_006511	GTCA	2	8	896305	896312	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19227	NC_006511	CGG	2	6	896313	896318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19228	NC_006511	GGTT	2	8	896392	896399	0 %	50 %	50 %	0 %	56413031
19229	NC_006511	GCA	2	6	896450	896455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413031
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19231	NC_006511	CTG	2	6	896560	896565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413031
19232	NC_006511	CG	3	6	896595	896600	0 %	0 %	50 %	50 %	56413031
19233	NC_006511	TAT	2	6	896682	896687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413031
19234	NC_006511	GTG	2	6	896728	896733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413031
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19236	NC_006511	G	6	6	896980	896985	0 %	0 %	100 %	0 %	56413031
19237	NC_006511	AT	3	6	896996	897001	50 %	50 %	0 %	0 %	56413031
19238	NC_006511	GCC	2	6	897066	897071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413031
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19240	NC_006511	GAGT	2	8	897184	897191	25 %	25 %	50 %	0 %	56413031
19241	NC_006511	CAG	2	6	897199	897204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19242	NC_006511	CTG	2	6	897244	897249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413032
19243	NC_006511	ATT	2	6	897259	897264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413032
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19245	NC_006511	CGG	2	6	897296	897301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413032
19246	NC_006511	ATT	2	6	897312	897317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413032
19247	NC_006511	CG	4	8	897400	897407	0 %	0 %	50 %	50 %	56413032
19248	NC_006511	GAAC	2	8	897510	897517	50 %	0 %	25 %	25 %	56413032
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19264	NC_006511	T	6	6	898174	898179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19265	NC_006511	CGC	2	6	898229	898234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19266	NC_006511	A	6	6	898239	898244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19267	NC_006511	T	7	7	898279	898285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19268	NC_006511	CAT	2	6	898296	898301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19335	NC_006511	TGATTT	2	12	901587	901598	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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19337	NC_006511	GGAT	2	8	901746	901753	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19338	NC_006511	CGG	2	6	901945	901950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19340	NC_006511	CGTC	2	8	902046	902053	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19341	NC_006511	G	6	6	902115	902120	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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19347	NC_006511	CTG	2	6	902278	902283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19348	NC_006511	GCG	2	6	902291	902296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19349	NC_006511	GA	3	6	902334	902339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19350	NC_006511	TC	3	6	902358	902363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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19355	NC_006511	GTT	2	6	902692	902697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19356	NC_006511	GCT	2	6	902733	902738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19358	NC_006511	TGG	2	6	902789	902794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19359	NC_006511	A	7	7	902797	902803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19360	NC_006511	G	8	8	902854	902861	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19361	NC_006511	ATT	2	6	903016	903021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19362	NC_006511	ATCC	2	8	903039	903046	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19363	NC_006511	TGA	2	6	903133	903138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19364	NC_006511	AG	3	6	903166	903171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19365	NC_006511	T	6	6	903197	903202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19366	NC_006511	TGT	2	6	903205	903210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19367	NC_006511	TGT	3	9	903227	903235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19368	NC_006511	GTA	2	6	903236	903241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19369	NC_006511	TTCA	2	8	903261	903268	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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19371	NC_006511	TTTGAA	2	12	903376	903387	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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19499	NC_006511	TTG	2	6	909104	909109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19500	NC_006511	AC	3	6	909148	909153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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