MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_006511	TGA	2	6	864313	864318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413003
18502	NC_006511	G	7	7	864327	864333	0 %	0 %	100 %	0 %	56413003
18503	NC_006511	CAT	2	6	864350	864355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413003
18504	NC_006511	GATG	2	8	864361	864368	25 %	25 %	50 %	0 %	56413003
18505	NC_006511	TTC	2	6	864386	864391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56413003
18506	NC_006511	AT	4	8	864393	864400	50 %	50 %	0 %	0 %	56413003
18507	NC_006511	TGA	2	6	864417	864422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413003
18508	NC_006511	ATG	2	6	864446	864451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413003
18509	NC_006511	TC	3	6	864457	864462	0 %	50 %	0 %	50 %	56413003
18510	NC_006511	ATA	2	6	864502	864507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413003
18511	NC_006511	CTGG	2	8	864536	864543	0 %	25 %	50 %	25 %	56413004
18512	NC_006511	GAA	2	6	864566	864571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413004
18513	NC_006511	AAAACC	2	12	864580	864591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56413004
18514	NC_006511	TGG	2	6	864604	864609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413004
18515	NC_006511	TAT	2	6	864667	864672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413004
18516	NC_006511	CTG	2	6	864673	864678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413004
18517	NC_006511	ACT	2	6	864717	864722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413004
18518	NC_006511	TTC	2	6	864826	864831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56413004
18519	NC_006511	TGG	2	6	864838	864843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413004
18520	NC_006511	CCA	2	6	864989	864994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56413004
18521	NC_006511	TGG	2	6	865078	865083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413004
18522	NC_006511	CAA	2	6	865131	865136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56413004
18523	NC_006511	AGTA	2	8	865290	865297	50 %	25 %	25 %	0 %	56413004
18524	NC_006511	GAT	2	6	865298	865303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413005
18525	NC_006511	CTGA	2	8	865383	865390	25 %	25 %	25 %	25 %	56413005
18526	NC_006511	CAGCC	2	10	865561	865570	20 %	0 %	20 %	60 %	56413005
18527	NC_006511	CAA	2	6	865612	865617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56413005
18528	NC_006511	GAAC	2	8	865739	865746	50 %	0 %	25 %	25 %	56413005
18529	NC_006511	TTC	2	6	865821	865826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56413005
18530	NC_006511	CAG	2	6	865953	865958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413005
18531	NC_006511	TTA	2	6	865960	865965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413005
18532	NC_006511	GCA	2	6	865994	865999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413005
18533	NC_006511	TGG	2	6	866029	866034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413005
18534	NC_006511	TGA	2	6	866093	866098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413005
18535	NC_006511	TTG	2	6	866122	866127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413005
18536	NC_006511	TGA	2	6	866150	866155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413005
18537	NC_006511	ATC	2	6	866182	866187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413005
18538	NC_006511	ACT	2	6	866367	866372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413005
18539	NC_006511	TC	3	6	866433	866438	0 %	50 %	0 %	50 %	56413006
18540	NC_006511	TTG	2	6	866484	866489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413006
18541	NC_006511	CCT	2	6	866507	866512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56413006
18542	NC_006511	GATG	2	8	866567	866574	25 %	25 %	50 %	0 %	56413006
18543	NC_006511	ACT	2	6	866579	866584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413006
18544	NC_006511	ATG	2	6	866595	866600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413006
18545	NC_006511	A	6	6	866609	866614	100 %	0 %	0 %	0 %	56413006
18546	NC_006511	ACTG	2	8	866683	866690	25 %	25 %	25 %	25 %	56413006
18547	NC_006511	TGA	2	6	866734	866739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413006
18548	NC_006511	TTA	2	6	866742	866747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413006
18549	NC_006511	GCT	2	6	866753	866758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413006
18550	NC_006511	ATA	2	6	866835	866840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413006
18551	NC_006511	CT	3	6	866848	866853	0 %	50 %	0 %	50 %	56413006
18552	NC_006511	TCG	2	6	866935	866940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413006
18553	NC_006511	TTGA	2	8	866966	866973	25 %	50 %	25 %	0 %	56413006
18554	NC_006511	CTG	2	6	866977	866982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413006
18555	NC_006511	GAC	2	6	866995	867000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413006
18556	NC_006511	GGTA	2	8	867016	867023	25 %	25 %	50 %	0 %	56413006
18557	NC_006511	GAA	2	6	867115	867120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413006
18558	NC_006511	ATT	2	6	867122	867127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413006
18559	NC_006511	GCAG	2	8	867286	867293	25 %	0 %	50 %	25 %	56413006
18560	NC_006511	AGC	2	6	867336	867341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413006
18561	NC_006511	ATCC	2	8	867426	867433	25 %	25 %	0 %	50 %	56413006
18562	NC_006511	GAAA	2	8	867457	867464	75 %	0 %	25 %	0 %	56413006
18563	NC_006511	TGA	2	6	867502	867507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413006
18564	NC_006511	ACCG	2	8	867605	867612	25 %	0 %	25 %	50 %	56413006
18565	NC_006511	G	10	10	867726	867735	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18566	NC_006511	TAA	2	6	867764	867769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413007
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18570	NC_006511	A	6	6	867908	867913	100 %	0 %	0 %	0 %	56413007
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18573	NC_006511	ATCT	2	8	868029	868036	25 %	50 %	0 %	25 %	56413007
18574	NC_006511	CCA	2	6	868078	868083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56413007
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18588	NC_006511	TTG	2	6	868550	868555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413007
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18610	NC_006511	TTG	2	6	869502	869507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413008
18611	NC_006511	A	7	7	869516	869522	100 %	0 %	0 %	0 %	56413008
18612	NC_006511	ATG	2	6	869602	869607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413008
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18876	NC_006511	AGC	2	6	879713	879718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413016
18877	NC_006511	TGC	2	6	879866	879871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413016
18878	NC_006511	CCGTT	2	10	879878	879887	0 %	40 %	20 %	40 %	56413016
18879	NC_006511	GGC	2	6	879944	879949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413016
18880	NC_006511	GAT	2	6	879953	879958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413016
18881	NC_006511	GGT	2	6	879995	880000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413016
18882	NC_006511	AGA	2	6	880028	880033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413016
18883	NC_006511	GGA	2	6	880107	880112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56413016
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18885	NC_006511	AAT	2	6	880290	880295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413016
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18887	NC_006511	ATAAA	2	10	880320	880329	80 %	20 %	0 %	0 %	56413016
18888	NC_006511	TTC	2	6	880336	880341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56413017
18889	NC_006511	TGGC	2	8	880351	880358	0 %	25 %	50 %	25 %	56413017
18890	NC_006511	ATC	2	6	880396	880401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413017
18891	NC_006511	TGC	2	6	880438	880443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413017
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18893	NC_006511	GACA	2	8	880503	880510	50 %	0 %	25 %	25 %	56413017
18894	NC_006511	AAC	2	6	880528	880533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56413017
18895	NC_006511	ATA	2	6	880558	880563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413017
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18897	NC_006511	TGC	2	6	880667	880672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413017
18898	NC_006511	GAA	2	6	880725	880730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413017
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18900	NC_006511	AT	3	6	880796	880801	50 %	50 %	0 %	0 %	56413017
18901	NC_006511	TCG	2	6	880802	880807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413017
18902	NC_006511	AGA	2	6	881045	881050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413017
18903	NC_006511	CA	4	8	881097	881104	50 %	0 %	0 %	50 %	56413017
18904	NC_006511	GTG	2	6	881112	881117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413017
18905	NC_006511	GCTG	2	8	881130	881137	0 %	25 %	50 %	25 %	56413017
18906	NC_006511	AT	3	6	881170	881175	50 %	50 %	0 %	0 %	56413017
18907	NC_006511	ATC	2	6	881185	881190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413017
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18911	NC_006511	A	7	7	881352	881358	100 %	0 %	0 %	0 %	56413017
18912	NC_006511	ATT	2	6	881365	881370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413017
18913	NC_006511	ACA	2	6	881399	881404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56413017
18914	NC_006511	AAG	2	6	881407	881412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413017
18915	NC_006511	TGAT	2	8	881440	881447	25 %	50 %	25 %	0 %	56413017
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18917	NC_006511	TAT	2	6	881542	881547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413017
18918	NC_006511	GAT	2	6	881703	881708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413017
18919	NC_006511	ATT	2	6	881709	881714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413017
18920	NC_006511	AAC	2	6	881722	881727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56413017
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18922	NC_006511	ATTC	2	8	881785	881792	25 %	50 %	0 %	25 %	56413018
18923	NC_006511	TGC	2	6	881859	881864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413018
18924	NC_006511	TTG	2	6	881879	881884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413018
18925	NC_006511	AGT	2	6	881944	881949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413018
18926	NC_006511	TGC	3	9	881970	881978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413018
18927	NC_006511	T	6	6	882005	882010	0 %	100 %	0 %	0 %	56413018
18928	NC_006511	ATG	2	6	882149	882154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413018
18929	NC_006511	GCT	2	6	882226	882231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413018
18930	NC_006511	TA	3	6	882238	882243	50 %	50 %	0 %	0 %	56413018
18931	NC_006511	TTTA	2	8	882339	882346	25 %	75 %	0 %	0 %	56413018
18932	NC_006511	TGA	2	6	882516	882521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413018
18933	NC_006511	AT	3	6	882545	882550	50 %	50 %	0 %	0 %	56413018
18934	NC_006511	TAT	2	6	882557	882562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413018
18935	NC_006511	TCT	2	6	882622	882627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56413018
18936	NC_006511	T	6	6	882634	882639	0 %	100 %	0 %	0 %	56413018
18937	NC_006511	T	6	6	882744	882749	0 %	100 %	0 %	0 %	56413018
18938	NC_006511	AAT	2	6	882822	882827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413018
18939	NC_006511	GCT	2	6	882828	882833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413018
18940	NC_006511	GATG	2	8	883051	883058	25 %	25 %	50 %	0 %	56413018
18941	NC_006511	GC	3	6	883071	883076	0 %	0 %	50 %	50 %	56413018
18942	NC_006511	GCT	2	6	883100	883105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413018
18943	NC_006511	TTA	2	6	883120	883125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413018
18944	NC_006511	A	6	6	883168	883173	100 %	0 %	0 %	0 %	56413018
18945	NC_006511	TATTT	2	10	883219	883228	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18946	NC_006511	ATA	2	6	883264	883269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413019
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18948	NC_006511	T	7	7	883303	883309	0 %	100 %	0 %	0 %	56413019
18949	NC_006511	GATTT	2	10	883320	883329	20 %	60 %	20 %	0 %	56413019
18950	NC_006511	T	8	8	883327	883334	0 %	100 %	0 %	0 %	56413019
18951	NC_006511	TATTT	2	10	883368	883377	20 %	80 %	0 %	0 %	56413019
18952	NC_006511	TTA	2	6	883426	883431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413019
18953	NC_006511	ATTTT	2	10	883435	883444	20 %	80 %	0 %	0 %	56413019
18954	NC_006511	AGT	2	6	883448	883453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413019
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18956	NC_006511	ATTTG	2	10	883556	883565	20 %	60 %	20 %	0 %	56413019
18957	NC_006511	TTG	2	6	883616	883621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413019
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18959	NC_006511	GAA	2	6	883694	883699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413019
18960	NC_006511	A	7	7	883698	883704	100 %	0 %	0 %	0 %	56413019
18961	NC_006511	ATC	2	6	883707	883712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413019
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18966	NC_006511	AAAT	2	8	883819	883826	75 %	25 %	0 %	0 %	56413019
18967	NC_006511	CAT	2	6	883956	883961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413019
18968	NC_006511	TA	3	6	884005	884010	50 %	50 %	0 %	0 %	56413019
18969	NC_006511	GTTAT	2	10	884043	884052	20 %	60 %	20 %	0 %	56413019
18970	NC_006511	GTC	2	6	884081	884086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413019
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18975	NC_006511	TGA	2	6	884402	884407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413019
18976	NC_006511	TGA	2	6	884495	884500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413019
18977	NC_006511	ATT	3	9	884506	884514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413019
18978	NC_006511	AGTG	2	8	884549	884556	25 %	25 %	50 %	0 %	56413019
18979	NC_006511	ATG	2	6	884563	884568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413019
18980	NC_006511	GTT	2	6	884661	884666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413019
18981	NC_006511	GCG	2	6	884669	884674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413019
18982	NC_006511	AAT	3	9	884709	884717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18983	NC_006511	CGT	2	6	884874	884879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413020
18984	NC_006511	GAA	2	6	884971	884976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413020
18985	NC_006511	TTA	2	6	885012	885017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413020
18986	NC_006511	TTG	2	6	885032	885037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413020
18987	NC_006511	TCG	2	6	885054	885059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413020
18988	NC_006511	ATT	2	6	885142	885147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413020
18989	NC_006511	CTT	2	6	885162	885167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56413020
18990	NC_006511	GGT	2	6	885238	885243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413020
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18992	NC_006511	TGG	2	6	885305	885310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413020
18993	NC_006511	TGC	2	6	885330	885335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413020
18994	NC_006511	AGA	2	6	885342	885347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413020
18995	NC_006511	CGTG	2	8	885356	885363	0 %	25 %	50 %	25 %	56413020
18996	NC_006511	GGC	2	6	885469	885474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413020
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18998	NC_006511	TGA	2	6	885615	885620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413020
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