MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_006511	GGCG	2	8	724021	724028	0 %	0 %	75 %	25 %	56412882
15502	NC_006511	GC	3	6	724049	724054	0 %	0 %	50 %	50 %	56412882
15503	NC_006511	CG	3	6	724116	724121	0 %	0 %	50 %	50 %	56412882
15504	NC_006511	GCC	2	6	724214	724219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412882
15505	NC_006511	CTG	2	6	724241	724246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412882
15506	NC_006511	AGC	2	6	724287	724292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412882
15507	NC_006511	CGG	2	6	724308	724313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412882
15508	NC_006511	GC	3	6	724321	724326	0 %	0 %	50 %	50 %	56412882
15509	NC_006511	GCG	2	6	724430	724435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412882
15510	NC_006511	GCG	2	6	724463	724468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412882
15511	NC_006511	TCG	2	6	724470	724475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412882
15512	NC_006511	CG	3	6	724571	724576	0 %	0 %	50 %	50 %	56412882
15513	NC_006511	AGC	2	6	724606	724611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412882
15514	NC_006511	TTA	2	6	724613	724618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412882
15515	NC_006511	ACG	2	6	724635	724640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412882
15516	NC_006511	AGC	2	6	724641	724646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412882
15517	NC_006511	CTG	2	6	724703	724708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412882
15518	NC_006511	CGC	2	6	724717	724722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412882
15519	NC_006511	GCT	2	6	724726	724731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412882
15520	NC_006511	TGA	2	6	724747	724752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412882
15521	NC_006511	TGA	2	6	724917	724922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412882
15522	NC_006511	GTG	2	6	724925	724930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412882
15523	NC_006511	GAA	2	6	724942	724947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412882
15524	NC_006511	GCGAT	2	10	725010	725019	20 %	20 %	40 %	20 %	56412882
15525	NC_006511	CGC	2	6	725020	725025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412882
15526	NC_006511	CCA	2	6	725063	725068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412883
15527	NC_006511	CGG	2	6	725159	725164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412883
15528	NC_006511	CGG	2	6	725220	725225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412883
15529	NC_006511	GGT	2	6	725298	725303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412883
15530	NC_006511	GCTG	2	8	725426	725433	0 %	25 %	50 %	25 %	56412883
15531	NC_006511	TAG	2	6	725547	725552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412883
15532	NC_006511	CGC	2	6	725608	725613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412883
15533	NC_006511	TGAT	2	8	725660	725667	25 %	50 %	25 %	0 %	56412883
15534	NC_006511	GCG	2	6	725668	725673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412883
15535	NC_006511	GC	3	6	725729	725734	0 %	0 %	50 %	50 %	56412883
15536	NC_006511	ACC	2	6	725769	725774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412883
15537	NC_006511	GATT	2	8	725825	725832	25 %	50 %	25 %	0 %	56412883
15538	NC_006511	CTG	2	6	725839	725844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412883
15539	NC_006511	CGG	2	6	725882	725887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412883
15540	NC_006511	ATG	2	6	725950	725955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412883
15541	NC_006511	CAG	2	6	725986	725991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15542	NC_006511	GCT	2	6	726010	726015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412884
15543	NC_006511	GCG	3	9	726074	726082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412884
15544	NC_006511	ATG	2	6	726117	726122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412884
15545	NC_006511	CTG	2	6	726273	726278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412884
15546	NC_006511	GCT	2	6	726281	726286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412884
15547	NC_006511	GCG	2	6	726290	726295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412884
15548	NC_006511	GCG	2	6	726297	726302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412884
15549	NC_006511	GGC	2	6	726361	726366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412884
15550	NC_006511	A	6	6	726389	726394	100 %	0 %	0 %	0 %	56412884
15551	NC_006511	TGG	2	6	726401	726406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412884
15552	NC_006511	CG	3	6	726420	726425	0 %	0 %	50 %	50 %	56412884
15553	NC_006511	GGC	2	6	726490	726495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412884
15554	NC_006511	CGG	2	6	726621	726626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412884
15555	NC_006511	GCG	2	6	726641	726646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412884
15556	NC_006511	GAA	2	6	726655	726660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412884
15557	NC_006511	AG	3	6	726661	726666	50 %	0 %	50 %	0 %	56412884
15558	NC_006511	TGC	2	6	726708	726713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412884
15559	NC_006511	TGG	2	6	726717	726722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412884
15560	NC_006511	GGC	3	9	726793	726801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412884
15561	NC_006511	GGC	2	6	726815	726820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412884
15562	NC_006511	CCGGTT	2	12	726933	726944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412884
15563	NC_006511	CGG	2	6	726949	726954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412884
15564	NC_006511	ATC	2	6	727049	727054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412884
15565	NC_006511	TGG	3	9	727071	727079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412884
15566	NC_006511	GAT	2	6	727087	727092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412884
15567	NC_006511	CGG	2	6	727192	727197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412884
15568	NC_006511	GAT	2	6	727198	727203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412884
15569	NC_006511	GGC	2	6	727217	727222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412884
15570	NC_006511	GCG	2	6	727235	727240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412884
15571	NC_006511	CTG	2	6	727259	727264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412884
15572	NC_006511	GGC	2	6	727288	727293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412884
15573	NC_006511	CCG	2	6	727316	727321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412884
15574	NC_006511	CGA	2	6	727338	727343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412884
15575	NC_006511	TGG	2	6	727344	727349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412884
15576	NC_006511	GCA	2	6	727372	727377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412884
15577	NC_006511	GCG	2	6	727391	727396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412884
15578	NC_006511	GCG	2	6	727442	727447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412884
15579	NC_006511	CG	3	6	727446	727451	0 %	0 %	50 %	50 %	56412884
15580	NC_006511	GGC	2	6	727484	727489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412884
15581	NC_006511	TGTT	2	8	727551	727558	0 %	75 %	25 %	0 %	56412884
15582	NC_006511	CTG	2	6	727598	727603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412884
15583	NC_006511	TGG	2	6	727623	727628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412884
15584	NC_006511	GGCT	2	8	727632	727639	0 %	25 %	50 %	25 %	56412884
15585	NC_006511	GCG	2	6	727682	727687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412884
15586	NC_006511	A	6	6	727703	727708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15587	NC_006511	GC	3	6	727715	727720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15588	NC_006511	T	6	6	727727	727732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15589	NC_006511	CGT	2	6	727945	727950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412885
15590	NC_006511	T	6	6	728008	728013	0 %	100 %	0 %	0 %	56412885
15591	NC_006511	CGG	2	6	728044	728049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412885
15592	NC_006511	CG	3	6	728083	728088	0 %	0 %	50 %	50 %	56412885
15593	NC_006511	GAT	2	6	728108	728113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412885
15594	NC_006511	GGC	2	6	728114	728119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412885
15595	NC_006511	TCAAAC	2	12	728127	728138	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	56412885
15596	NC_006511	CCG	2	6	728176	728181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412885
15597	NC_006511	TCC	2	6	728241	728246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56412885
15598	NC_006511	GTT	2	6	728302	728307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412885
15599	NC_006511	GCC	2	6	728412	728417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412885
15600	NC_006511	TCA	2	6	728451	728456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412885
15601	NC_006511	G	6	6	728473	728478	0 %	0 %	100 %	0 %	56412885
15602	NC_006511	T	6	6	728499	728504	0 %	100 %	0 %	0 %	56412885
15603	NC_006511	CG	3	6	728540	728545	0 %	0 %	50 %	50 %	56412885
15604	NC_006511	CAG	2	6	728569	728574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412885
15605	NC_006511	TAA	2	6	728674	728679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15606	NC_006511	AAT	2	6	728726	728731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412886
15607	NC_006511	AAT	2	6	728742	728747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412886
15608	NC_006511	CAG	2	6	728759	728764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412886
15609	NC_006511	T	6	6	728780	728785	0 %	100 %	0 %	0 %	56412886
15610	NC_006511	GCC	2	6	728817	728822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412886
15611	NC_006511	CAG	2	6	728834	728839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412886
15612	NC_006511	CCA	2	6	728866	728871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412886
15613	NC_006511	GCA	2	6	728881	728886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412886
15614	NC_006511	GAA	2	6	728918	728923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412886
15615	NC_006511	T	6	6	728953	728958	0 %	100 %	0 %	0 %	56412886
15616	NC_006511	CG	3	6	728989	728994	0 %	0 %	50 %	50 %	56412886
15617	NC_006511	CAT	2	6	729023	729028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412886
15618	NC_006511	GCA	2	6	729034	729039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412886
15619	NC_006511	CATG	2	8	729112	729119	25 %	25 %	25 %	25 %	56412886
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15994	NC_006511	ATA	2	6	748778	748783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412900
15995	NC_006511	TGC	2	6	748787	748792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412900
15996	NC_006511	CG	3	6	748820	748825	0 %	0 %	50 %	50 %	56412900
15997	NC_006511	TGC	2	6	748826	748831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412900
15998	NC_006511	ATA	2	6	748844	748849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412900
15999	NC_006511	TGG	2	6	748889	748894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412900
16000	NC_006511	AAT	2	6	748939	748944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412900

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