MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_006511	T	6	6	699481	699486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_006511	AAT	2	6	699503	699508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_006511	AGG	2	6	699517	699522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_006511	GAT	2	6	699542	699547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_006511	GTA	2	6	699549	699554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_006511	AATA	2	8	699578	699585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_006511	TA	3	6	699668	699673	50 %	50 %	0 %	0 %	459642548
15008	NC_006511	GAT	2	6	699689	699694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459642548
15009	NC_006511	TCAC	2	8	699797	699804	25 %	25 %	0 %	50 %	459642548
15010	NC_006511	GCTG	2	8	699883	699890	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15011	NC_006511	TAAT	2	8	699897	699904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_006511	TGGC	2	8	699934	699941	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15013	NC_006511	AAG	2	6	699990	699995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_006511	TTACC	2	10	700007	700016	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15015	NC_006511	TAT	2	6	700026	700031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_006511	TTC	2	6	700076	700081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412858
15017	NC_006511	A	7	7	700256	700262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_006511	C	6	6	700327	700332	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15019	NC_006511	TAC	2	6	700382	700387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15020	NC_006511	TAAT	2	8	700433	700440	50 %	50 %	0 %	0 %	56412859
15021	NC_006511	TCT	2	6	700462	700467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412859
15022	NC_006511	GCA	3	9	700478	700486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412859
15023	NC_006511	TCT	2	6	700514	700519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412859
15024	NC_006511	TTA	2	6	700552	700557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412859
15025	NC_006511	GCG	2	6	700577	700582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412859
15026	NC_006511	GCC	2	6	700609	700614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412859
15027	NC_006511	TTCG	2	8	700668	700675	0 %	50 %	25 %	25 %	56412859
15028	NC_006511	TCA	2	6	700715	700720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412859
15029	NC_006511	TTC	2	6	700824	700829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412859
15030	NC_006511	ACG	2	6	700867	700872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412859
15031	NC_006511	GATT	2	8	700916	700923	25 %	50 %	25 %	0 %	56412859
15032	NC_006511	GGC	2	6	700941	700946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412859
15033	NC_006511	TTC	2	6	700969	700974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412859
15034	NC_006511	TCA	2	6	700984	700989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412859
15035	NC_006511	CTGG	2	8	701067	701074	0 %	25 %	50 %	25 %	56412859
15036	NC_006511	GAA	2	6	701164	701169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412859
15037	NC_006511	TGG	2	6	701228	701233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412859
15038	NC_006511	CCAT	2	8	701242	701249	25 %	25 %	0 %	50 %	56412859
15039	NC_006511	AGC	2	6	701410	701415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412859
15040	NC_006511	CAG	2	6	701529	701534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412859
15041	NC_006511	AG	3	6	701574	701579	50 %	0 %	50 %	0 %	56412859
15042	NC_006511	GATGC	2	10	701645	701654	20 %	20 %	40 %	20 %	56412859
15043	NC_006511	GGC	3	9	701699	701707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412859
15044	NC_006511	TCAA	2	8	701755	701762	50 %	25 %	0 %	25 %	56412859
15045	NC_006511	TAA	2	6	701780	701785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412859
15046	NC_006511	CG	3	6	701801	701806	0 %	0 %	50 %	50 %	56412859
15047	NC_006511	TGA	2	6	701828	701833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412859
15048	NC_006511	CAA	2	6	701898	701903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412859
15049	NC_006511	TCGG	2	8	702368	702375	0 %	25 %	50 %	25 %	56412860
15050	NC_006511	CAG	2	6	702412	702417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412860
15051	NC_006511	TCA	2	6	702431	702436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412860
15052	NC_006511	TGTT	2	8	702471	702478	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_006511	T	8	8	702511	702518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_006511	TTGC	2	8	702578	702585	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15055	NC_006511	GGT	2	6	702600	702605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_006511	ACC	2	6	702738	702743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412861
15057	NC_006511	TGG	2	6	702754	702759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412861
15058	NC_006511	AG	3	6	702815	702820	50 %	0 %	50 %	0 %	56412861
15059	NC_006511	GAA	2	6	702858	702863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412861
15060	NC_006511	GCG	2	6	702885	702890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412861
15061	NC_006511	CGG	2	6	702935	702940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412861
15062	NC_006511	ATTGT	2	10	702942	702951	20 %	60 %	20 %	0 %	56412861
15063	NC_006511	CTG	2	6	702984	702989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412861
15064	NC_006511	AAC	2	6	703002	703007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412861
15065	NC_006511	CTT	2	6	703178	703183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412861
15066	NC_006511	GCAG	2	8	703244	703251	25 %	0 %	50 %	25 %	56412861
15067	NC_006511	GAT	2	6	703254	703259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412861
15068	NC_006511	CAG	2	6	703308	703313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412861
15069	NC_006511	AG	3	6	703445	703450	50 %	0 %	50 %	0 %	56412861
15070	NC_006511	CGG	2	6	703456	703461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412861
15071	NC_006511	GCG	3	9	703501	703509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412861
15072	NC_006511	GATGC	2	10	703527	703536	20 %	20 %	40 %	20 %	56412861
15073	NC_006511	CGC	2	6	703594	703599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412861
15074	NC_006511	CGGG	2	8	703633	703640	0 %	0 %	75 %	25 %	56412861
15075	NC_006511	GCC	2	6	703697	703702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412862
15076	NC_006511	TGA	2	6	703756	703761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412862
15077	NC_006511	TC	3	6	703790	703795	0 %	50 %	0 %	50 %	56412862
15078	NC_006511	TTC	2	6	703857	703862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412862
15079	NC_006511	GCG	2	6	704092	704097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412862
15080	NC_006511	ATT	2	6	704204	704209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412862
15081	NC_006511	CGG	2	6	704236	704241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412862
15082	NC_006511	AAAGT	2	10	704304	704313	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_006511	GTC	2	6	704334	704339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15084	NC_006511	A	7	7	704358	704364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15085	NC_006511	CGGGG	2	10	704371	704380	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
15086	NC_006511	TTC	2	6	704384	704389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15087	NC_006511	CG	3	6	704406	704411	0 %	0 %	50 %	50 %	56412863
15088	NC_006511	CTT	2	6	704480	704485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412863
15089	NC_006511	CAA	2	6	704492	704497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412863
15090	NC_006511	TCA	2	6	704543	704548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412863
15091	NC_006511	CCG	2	6	704590	704595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412863
15092	NC_006511	GAT	2	6	704598	704603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412863
15093	NC_006511	GCG	2	6	704620	704625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412863
15094	NC_006511	GGC	3	9	704630	704638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412863
15095	NC_006511	TC	3	6	704693	704698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15096	NC_006511	TAA	2	6	704701	704706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_006511	GGCG	2	8	704761	704768	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15098	NC_006511	CGG	2	6	704834	704839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412864
15099	NC_006511	CG	3	6	704897	704902	0 %	0 %	50 %	50 %	56412864
15100	NC_006511	CTG	2	6	704932	704937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412864
15101	NC_006511	CCG	3	9	704949	704957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412864
15102	NC_006511	AATA	2	8	705001	705008	75 %	25 %	0 %	0 %	56412864
15103	NC_006511	GGGC	2	8	705030	705037	0 %	0 %	75 %	25 %	56412864
15104	NC_006511	TGC	2	6	705125	705130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412864
15105	NC_006511	GGC	2	6	705238	705243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412864
15106	NC_006511	AAGCGA	2	12	705281	705292	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	56412864
15107	NC_006511	CGT	2	6	705315	705320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412864
15108	NC_006511	TTG	2	6	705565	705570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412864
15109	NC_006511	GGT	2	6	705637	705642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412864
15110	NC_006511	ATCA	2	8	705691	705698	50 %	25 %	0 %	25 %	56412864
15111	NC_006511	CCG	2	6	705750	705755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412864
15112	NC_006511	GGC	2	6	705793	705798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412864
15113	NC_006511	ATC	2	6	705803	705808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412864
15114	NC_006511	TGA	2	6	705846	705851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412864
15115	NC_006511	GCG	2	6	705855	705860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412864
15116	NC_006511	GCT	3	9	705867	705875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412864
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15119	NC_006511	ACTG	2	8	706185	706192	25 %	25 %	25 %	25 %	56412864
15120	NC_006511	CTC	2	6	706243	706248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56412864
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15123	NC_006511	GC	3	6	706359	706364	0 %	0 %	50 %	50 %	56412864
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15125	NC_006511	CGG	2	6	706491	706496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412864
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15249	NC_006511	CCG	2	6	712371	712376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412871
15250	NC_006511	AAT	2	6	712414	712419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412871
15251	NC_006511	GTA	2	6	712490	712495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412871
15252	NC_006511	GCC	2	6	712499	712504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412871
15253	NC_006511	A	6	6	712508	712513	100 %	0 %	0 %	0 %	56412871
15254	NC_006511	TAA	2	6	712520	712525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412871
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15256	NC_006511	GCT	2	6	712574	712579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412871
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15273	NC_006511	GCA	2	6	713239	713244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412872
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15308	NC_006511	CCTGGG	2	12	714841	714852	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56412872
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15311	NC_006511	AAT	2	6	714957	714962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15312	NC_006511	CGAT	2	8	715246	715253	25 %	25 %	25 %	25 %	56412873
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15339	NC_006511	GTC	2	6	716846	716851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15344	NC_006511	GTTC	2	8	716943	716950	0 %	50 %	25 %	25 %	56412874
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15355	NC_006511	TTG	2	6	717647	717652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15356	NC_006511	GCGA	2	8	717661	717668	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15357	NC_006511	T	6	6	717679	717684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15358	NC_006511	AAT	2	6	717779	717784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15359	NC_006511	ATG	2	6	717796	717801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15362	NC_006511	TCA	2	6	717953	717958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412875
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15365	NC_006511	ATA	2	6	718063	718068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412875
15366	NC_006511	GAT	2	6	718074	718079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412875
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15368	NC_006511	GCA	2	6	718103	718108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412875
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15370	NC_006511	CAT	2	6	718131	718136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412875
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