MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_006511	AAC	2	6	679355	679360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412835
14502	NC_006511	CGG	2	6	679411	679416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412835
14503	NC_006511	AAC	2	6	679433	679438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412835
14504	NC_006511	ATCT	2	8	679439	679446	25 %	50 %	0 %	25 %	56412835
14505	NC_006511	CAA	2	6	679531	679536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412835
14506	NC_006511	CGTC	2	8	679586	679593	0 %	25 %	25 %	50 %	56412835
14507	NC_006511	TAC	2	6	679694	679699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412835
14508	NC_006511	CAA	2	6	679702	679707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412835
14509	NC_006511	CTG	2	6	679742	679747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412835
14510	NC_006511	CGA	2	6	679786	679791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412835
14511	NC_006511	T	6	6	679861	679866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14512	NC_006511	ACG	2	6	679891	679896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14513	NC_006511	GT	3	6	679964	679969	0 %	50 %	50 %	0 %	56412836
14514	NC_006511	GGC	3	9	679972	679980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412836
14515	NC_006511	T	6	6	679981	679986	0 %	100 %	0 %	0 %	56412836
14516	NC_006511	ACA	2	6	680018	680023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412836
14517	NC_006511	CGC	2	6	680107	680112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412836
14518	NC_006511	TGA	2	6	680149	680154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412836
14519	NC_006511	TC	3	6	680482	680487	0 %	50 %	0 %	50 %	56412836
14520	NC_006511	GCG	2	6	680507	680512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412836
14521	NC_006511	AGG	2	6	680538	680543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412836
14522	NC_006511	GCG	2	6	680571	680576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412836
14523	NC_006511	CCGA	2	8	680636	680643	25 %	0 %	25 %	50 %	56412836
14524	NC_006511	GGCAT	2	10	680682	680691	20 %	20 %	40 %	20 %	56412836
14525	NC_006511	TAT	2	6	680717	680722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412836
14526	NC_006511	GCG	2	6	680887	680892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412836
14527	NC_006511	AAG	2	6	680922	680927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412836
14528	NC_006511	CGC	2	6	680952	680957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412836
14529	NC_006511	AC	3	6	681030	681035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14530	NC_006511	AAGC	2	8	681043	681050	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14531	NC_006511	ATG	2	6	681073	681078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412837
14532	NC_006511	A	6	6	681079	681084	100 %	0 %	0 %	0 %	56412837
14533	NC_006511	TTAC	2	8	681088	681095	25 %	50 %	0 %	25 %	56412837
14534	NC_006511	GAT	2	6	681097	681102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412837
14535	NC_006511	GCTG	2	8	681107	681114	0 %	25 %	50 %	25 %	56412837
14536	NC_006511	GC	3	6	681124	681129	0 %	0 %	50 %	50 %	56412837
14537	NC_006511	CGTTT	2	10	681148	681157	0 %	60 %	20 %	20 %	56412837
14538	NC_006511	ACC	2	6	681169	681174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412837
14539	NC_006511	T	6	6	681179	681184	0 %	100 %	0 %	0 %	56412837
14540	NC_006511	GCC	2	6	681185	681190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412837
14541	NC_006511	CTT	2	6	681191	681196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412837
14542	NC_006511	T	6	6	681232	681237	0 %	100 %	0 %	0 %	56412837
14543	NC_006511	GCA	2	6	681246	681251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412837
14544	NC_006511	GC	5	10	681301	681310	0 %	0 %	50 %	50 %	56412837
14545	NC_006511	CGG	2	6	681316	681321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412837
14546	NC_006511	GCCTGC	2	12	681334	681345	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56412837
14547	NC_006511	GTTT	2	8	681425	681432	0 %	75 %	25 %	0 %	56412837
14548	NC_006511	GCA	2	6	681465	681470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412837
14549	NC_006511	GC	3	6	681477	681482	0 %	0 %	50 %	50 %	56412837
14550	NC_006511	CGG	2	6	681484	681489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412837
14551	NC_006511	CGG	2	6	681524	681529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412837
14552	NC_006511	CTA	2	6	681564	681569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412837
14553	NC_006511	GGC	2	6	681619	681624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412837
14554	NC_006511	ACGG	2	8	681665	681672	25 %	0 %	50 %	25 %	56412837
14555	NC_006511	TGG	2	6	681677	681682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412837
14556	NC_006511	GAGC	2	8	681687	681694	25 %	0 %	50 %	25 %	56412837
14557	NC_006511	CGA	2	6	681726	681731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412837
14558	NC_006511	AC	3	6	681750	681755	50 %	0 %	0 %	50 %	56412837
14559	NC_006511	CGG	2	6	681764	681769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412837
14560	NC_006511	CTG	2	6	681782	681787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412837
14561	NC_006511	AC	3	6	681833	681838	50 %	0 %	0 %	50 %	56412837
14562	NC_006511	TGC	2	6	681845	681850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412837
14563	NC_006511	CAG	2	6	681889	681894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412837
14564	NC_006511	GCG	2	6	681923	681928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412837
14565	NC_006511	CG	3	6	681982	681987	0 %	0 %	50 %	50 %	56412837
14566	NC_006511	GCG	2	6	682001	682006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412837
14567	NC_006511	GC	3	6	682058	682063	0 %	0 %	50 %	50 %	56412837
14568	NC_006511	GCGT	2	8	682082	682089	0 %	25 %	50 %	25 %	56412837
14569	NC_006511	TGA	2	6	682154	682159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412838
14570	NC_006511	GGT	2	6	682193	682198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412838
14571	NC_006511	CG	3	6	682218	682223	0 %	0 %	50 %	50 %	56412838
14572	NC_006511	CAGT	2	8	682259	682266	25 %	25 %	25 %	25 %	56412838
14573	NC_006511	GGC	2	6	682293	682298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412838
14574	NC_006511	GCG	2	6	682327	682332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412838
14575	NC_006511	ACC	2	6	682344	682349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412838
14576	NC_006511	GTC	2	6	682435	682440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412838
14577	NC_006511	GGC	2	6	682442	682447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412838
14578	NC_006511	GCCT	2	8	682482	682489	0 %	25 %	25 %	50 %	56412838
14579	NC_006511	GC	4	8	682553	682560	0 %	0 %	50 %	50 %	56412838
14580	NC_006511	TAT	2	6	682562	682567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412838
14581	NC_006511	CGG	2	6	682588	682593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412838
14582	NC_006511	GGC	2	6	682605	682610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412838
14583	NC_006511	GCG	2	6	682672	682677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412838
14584	NC_006511	GGC	2	6	682769	682774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412838
14585	NC_006511	ATT	3	9	682796	682804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14586	NC_006511	AGTT	2	8	682818	682825	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14587	NC_006511	TTA	2	6	682839	682844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14588	NC_006511	CTT	2	6	682869	682874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412839
14589	NC_006511	GGC	2	6	682885	682890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412839
14590	NC_006511	TTA	2	6	682906	682911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412839
14591	NC_006511	GCG	2	6	682938	682943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412839
14592	NC_006511	ATCA	2	8	682968	682975	50 %	25 %	0 %	25 %	56412839
14593	NC_006511	ACC	2	6	682998	683003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412839
14594	NC_006511	TGC	2	6	683011	683016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412839
14595	NC_006511	GTC	2	6	683049	683054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412839
14596	NC_006511	CAC	2	6	683078	683083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412839
14597	NC_006511	TAT	2	6	683255	683260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412839
14598	NC_006511	TCGGC	2	10	683269	683278	0 %	20 %	40 %	40 %	56412839
14599	NC_006511	TGC	2	6	683308	683313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412839
14600	NC_006511	TGG	2	6	683362	683367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412839
14601	NC_006511	TCA	2	6	683528	683533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412839
14602	NC_006511	ATG	2	6	683586	683591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412839
14603	NC_006511	TCT	2	6	683611	683616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412839
14604	NC_006511	CGC	2	6	683692	683697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412839
14605	NC_006511	TAA	2	6	683750	683755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412839
14606	NC_006511	CTG	2	6	683913	683918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412839
14607	NC_006511	GGC	2	6	683928	683933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412839
14608	NC_006511	GCC	2	6	684024	684029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412839
14609	NC_006511	TG	3	6	684077	684082	0 %	50 %	50 %	0 %	56412839
14610	NC_006511	CTG	2	6	684096	684101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412839
14611	NC_006511	ACG	2	6	684184	684189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412839
14612	NC_006511	A	7	7	684223	684229	100 %	0 %	0 %	0 %	56412839
14613	NC_006511	GCT	3	9	684239	684247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412839
14614	NC_006511	ATT	2	6	684270	684275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412839
14615	NC_006511	GCC	2	6	684291	684296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412839
14616	NC_006511	CCG	2	6	684314	684319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412839
14617	NC_006511	ATG	2	6	684385	684390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412839
14618	NC_006511	CGA	2	6	684458	684463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412839
14619	NC_006511	CGC	2	6	684470	684475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412839
14620	NC_006511	CCA	2	6	684587	684592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14621	NC_006511	T	6	6	684605	684610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14622	NC_006511	TG	3	6	684662	684667	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14623	NC_006511	CAT	2	6	684713	684718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412840
14624	NC_006511	CG	3	6	684719	684724	0 %	0 %	50 %	50 %	56412840
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14639	NC_006511	TA	3	6	685401	685406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14728	NC_006511	GC	3	6	690149	690154	0 %	0 %	50 %	50 %	56412845
14729	NC_006511	A	6	6	690199	690204	100 %	0 %	0 %	0 %	56412845
14730	NC_006511	CACC	2	8	690303	690310	25 %	0 %	0 %	75 %	56412845
14731	NC_006511	CAT	2	6	690381	690386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412845
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14734	NC_006511	TGA	2	6	690540	690545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412846
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14866	NC_006511	CGC	2	6	694925	694930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412853
14867	NC_006511	GCT	2	6	694931	694936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412853
14868	NC_006511	GCCC	2	8	694971	694978	0 %	0 %	25 %	75 %	56412853
14869	NC_006511	GGC	2	6	694988	694993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412853
14870	NC_006511	GCTCG	2	10	695021	695030	0 %	20 %	40 %	40 %	56412853
14871	NC_006511	CTA	2	6	695039	695044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412853
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14877	NC_006511	CTG	2	6	695124	695129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412853
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14879	NC_006511	GCT	3	9	695177	695185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412853
14880	NC_006511	CTG	2	6	695211	695216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412853
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14882	NC_006511	CGG	2	6	695318	695323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412853
14883	NC_006511	GCT	3	9	695327	695335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412853
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14885	NC_006511	CG	3	6	695389	695394	0 %	0 %	50 %	50 %	56412853
14886	NC_006511	GCT	3	9	695399	695407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412853
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14888	NC_006511	CTG	2	6	695421	695426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412853
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14900	NC_006511	CTG	2	6	695726	695731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412853
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14902	NC_006511	TGG	2	6	695809	695814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412853
14903	NC_006511	GCGG	2	8	695894	695901	0 %	0 %	75 %	25 %	56412853
14904	NC_006511	CGG	2	6	695975	695980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412853
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14939	NC_006511	TGC	2	6	697160	697165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412855
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14983	NC_006511	T	6	6	698787	698792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14986	NC_006511	ATT	2	6	698923	698928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14987	NC_006511	ATTT	2	8	698937	698944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14988	NC_006511	TTA	2	6	698951	698956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14989	NC_006511	TTAAA	2	10	699004	699013	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14990	NC_006511	AAC	2	6	699136	699141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14991	NC_006511	GGC	2	6	699169	699174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14995	NC_006511	TTA	2	6	699326	699331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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