MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006511	GC	3	6	45671	45676	0 %	0 %	50 %	50 %	56412311
1002	NC_006511	CAG	2	6	45712	45717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412311
1003	NC_006511	TGA	2	6	45756	45761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412311
1004	NC_006511	GCT	2	6	45837	45842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412311
1005	NC_006511	TAC	2	6	45907	45912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412311
1006	NC_006511	AACG	2	8	45924	45931	50 %	0 %	25 %	25 %	56412311
1007	NC_006511	ATC	2	6	46000	46005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_006511	TGAC	2	8	46008	46015	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_006511	A	6	6	46022	46027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_006511	A	6	6	46056	46061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_006511	TCA	2	6	46070	46075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_006511	TA	3	6	46076	46081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_006511	TAG	2	6	46116	46121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_006511	GAA	2	6	46126	46131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_006511	GA	3	6	46143	46148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_006511	T	6	6	46174	46179	0 %	100 %	0 %	0 %	56412312
1017	NC_006511	AGC	2	6	46180	46185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412312
1018	NC_006511	CAT	2	6	46200	46205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412312
1019	NC_006511	TCA	2	6	46208	46213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412312
1020	NC_006511	CGC	2	6	46215	46220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412312
1021	NC_006511	CAA	2	6	46320	46325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412312
1022	NC_006511	TGT	2	6	46334	46339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412312
1023	NC_006511	GCC	2	6	46453	46458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412312
1024	NC_006511	CGG	2	6	46461	46466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412312
1025	NC_006511	GAT	2	6	46467	46472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412312
1026	NC_006511	ACT	2	6	46502	46507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412312
1027	NC_006511	GGGCT	2	10	46527	46536	0 %	20 %	60 %	20 %	56412312
1028	NC_006511	ATC	2	6	46636	46641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412312
1029	NC_006511	CAT	2	6	46656	46661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412312
1030	NC_006511	TAT	2	6	46662	46667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412312
1031	NC_006511	GGC	2	6	46713	46718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412312
1032	NC_006511	GCT	2	6	46740	46745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412312
1033	NC_006511	GCG	2	6	46754	46759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412312
1034	NC_006511	TA	3	6	46775	46780	50 %	50 %	0 %	0 %	56412312
1035	NC_006511	CGG	2	6	46805	46810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412312
1036	NC_006511	CTT	2	6	46857	46862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412312
1037	NC_006511	GAAA	2	8	46872	46879	75 %	0 %	25 %	0 %	56412312
1038	NC_006511	TGC	2	6	47015	47020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412312
1039	NC_006511	ATT	2	6	47029	47034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412312
1040	NC_006511	CTG	2	6	47041	47046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412312
1041	NC_006511	GCTG	2	8	47078	47085	0 %	25 %	50 %	25 %	56412312
1042	NC_006511	TG	3	6	47156	47161	0 %	50 %	50 %	0 %	56412312
1043	NC_006511	TTA	2	6	47225	47230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412312
1044	NC_006511	GTG	2	6	47275	47280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412312
1045	NC_006511	GC	4	8	47295	47302	0 %	0 %	50 %	50 %	56412312
1046	NC_006511	GAAGG	2	10	47330	47339	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_006511	GA	3	6	47377	47382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_006511	TAT	2	6	47417	47422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412313
1049	NC_006511	AAG	2	6	47439	47444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412313
1050	NC_006511	CGC	2	6	47481	47486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412313
1051	NC_006511	TGT	2	6	47667	47672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412313
1052	NC_006511	CAG	2	6	47713	47718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412313
1053	NC_006511	GCG	2	6	47729	47734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412313
1054	NC_006511	GTG	3	9	47735	47743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412313
1055	NC_006511	CACG	2	8	47776	47783	25 %	0 %	25 %	50 %	56412313
1056	NC_006511	CAGC	2	8	47803	47810	25 %	0 %	25 %	50 %	56412313
1057	NC_006511	GCA	2	6	47854	47859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412313
1058	NC_006511	CCTG	3	12	47939	47950	0 %	25 %	25 %	50 %	56412313
1059	NC_006511	GTT	2	6	48001	48006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412313
1060	NC_006511	TGA	2	6	48055	48060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412313
1061	NC_006511	ATG	2	6	48093	48098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412313
1062	NC_006511	GAA	2	6	48185	48190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412313
1063	NC_006511	GA	3	6	48209	48214	50 %	0 %	50 %	0 %	56412313
1064	NC_006511	CGG	2	6	48228	48233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412313
1065	NC_006511	ACT	2	6	48255	48260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412313
1066	NC_006511	TACC	2	8	48287	48294	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_006511	TAC	2	6	48360	48365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412314
1068	NC_006511	GCGTA	2	10	48403	48412	20 %	20 %	40 %	20 %	56412314
1069	NC_006511	CCT	2	6	48426	48431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56412314
1070	NC_006511	CATG	2	8	48508	48515	25 %	25 %	25 %	25 %	56412314
1071	NC_006511	CAG	2	6	48527	48532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412314
1072	NC_006511	TCC	2	6	48636	48641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56412314
1073	NC_006511	CCG	2	6	48906	48911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412314
1074	NC_006511	CGT	2	6	48917	48922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412314
1075	NC_006511	CCA	2	6	48923	48928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412314
1076	NC_006511	CGG	2	6	48958	48963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412314
1077	NC_006511	GAG	2	6	48990	48995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412314
1078	NC_006511	GACCA	2	10	49008	49017	40 %	0 %	20 %	40 %	56412314
1079	NC_006511	A	6	6	49100	49105	100 %	0 %	0 %	0 %	56412314
1080	NC_006511	GTCGTA	2	12	49175	49186	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56412314
1081	NC_006511	CG	4	8	49276	49283	0 %	0 %	50 %	50 %	56412314
1082	NC_006511	AAGT	2	8	49302	49309	50 %	25 %	25 %	0 %	56412314
1083	NC_006511	CCAG	2	8	49360	49367	25 %	0 %	25 %	50 %	56412314
1084	NC_006511	CG	3	6	49489	49494	0 %	0 %	50 %	50 %	56412314
1085	NC_006511	AAG	2	6	49530	49535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412314
1086	NC_006511	GCG	2	6	49565	49570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412314
1087	NC_006511	CAG	2	6	49592	49597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412314
1088	NC_006511	CAT	2	6	49655	49660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412314
1089	NC_006511	CGG	2	6	49661	49666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412314
1090	NC_006511	AGT	2	6	49729	49734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412314
1091	NC_006511	GTT	2	6	49805	49810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412314
1092	NC_006511	T	6	6	49939	49944	0 %	100 %	0 %	0 %	56412314
1093	NC_006511	GAT	2	6	50049	50054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412314
1094	NC_006511	TG	3	6	50107	50112	0 %	50 %	50 %	0 %	56412314
1095	NC_006511	TTGA	2	8	50141	50148	25 %	50 %	25 %	0 %	56412314
1096	NC_006511	TGC	2	6	50334	50339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412314
1097	NC_006511	CAGAC	2	10	50340	50349	40 %	0 %	20 %	40 %	56412314
1098	NC_006511	TTG	2	6	50360	50365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412314
1099	NC_006511	TGG	2	6	50377	50382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412314
1100	NC_006511	TCT	2	6	50449	50454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412315
1101	NC_006511	GAAA	2	8	50476	50483	75 %	0 %	25 %	0 %	56412315
1102	NC_006511	AGT	2	6	50484	50489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412315
1103	NC_006511	GCA	2	6	50559	50564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412315
1104	NC_006511	TTG	2	6	50574	50579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412315
1105	NC_006511	GGC	2	6	50609	50614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412315
1106	NC_006511	GGC	2	6	50786	50791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412315
1107	NC_006511	TGT	2	6	50806	50811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412315
1108	NC_006511	GCCA	2	8	50817	50824	25 %	0 %	25 %	50 %	56412315
1109	NC_006511	CAT	2	6	50825	50830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412315
1110	NC_006511	CGC	2	6	50833	50838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412315
1111	NC_006511	CAG	2	6	50852	50857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412315
1112	NC_006511	AAG	2	6	50898	50903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412315
1113	NC_006511	GAT	2	6	50912	50917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412315
1114	NC_006511	ATA	2	6	50990	50995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412315
1115	NC_006511	GCT	2	6	51013	51018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412315
1116	NC_006511	AGA	2	6	51031	51036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412315
1117	NC_006511	CGC	2	6	51083	51088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412315
1118	NC_006511	T	7	7	51094	51100	0 %	100 %	0 %	0 %	56412315
1119	NC_006511	GC	3	6	51175	51180	0 %	0 %	50 %	50 %	56412315
1120	NC_006511	TAAA	2	8	51210	51217	75 %	25 %	0 %	0 %	56412315
1121	NC_006511	ATC	2	6	51227	51232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412315
1122	NC_006511	A	6	6	51243	51248	100 %	0 %	0 %	0 %	56412315
1123	NC_006511	TAA	2	6	51278	51283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412315
1124	NC_006511	TCA	2	6	51349	51354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412315
1125	NC_006511	GTG	2	6	51373	51378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412315
1126	NC_006511	TGC	2	6	51422	51427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412315
1127	NC_006511	GC	3	6	51475	51480	0 %	0 %	50 %	50 %	56412315
1128	NC_006511	GAC	2	6	51520	51525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412315
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1130	NC_006511	CAG	3	9	51602	51610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412315
1131	NC_006511	CAG	2	6	51689	51694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412315
1132	NC_006511	GTA	2	6	51733	51738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412315
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1137	NC_006511	AGT	2	6	51925	51930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1139	NC_006511	ATT	2	6	51951	51956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_006511	TTA	2	6	51979	51984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1144	NC_006511	GAGG	2	8	52095	52102	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1145	NC_006511	A	6	6	52111	52116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_006511	A	7	7	52193	52199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_006511	TTG	2	6	52256	52261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412316
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1154	NC_006511	GCA	2	6	52617	52622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412317
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1241	NC_006511	GTG	2	6	57222	57227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1242	NC_006511	TTCAC	2	10	57347	57356	20 %	40 %	0 %	40 %	56412321
1243	NC_006511	GAT	2	6	57367	57372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412321
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1246	NC_006511	AGC	3	9	57455	57463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412321
1247	NC_006511	AAG	2	6	57476	57481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412321
1248	NC_006511	AAAG	2	8	57486	57493	75 %	0 %	25 %	0 %	56412321
1249	NC_006511	CGC	2	6	57513	57518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412321
1250	NC_006511	GGC	2	6	57573	57578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412321
1251	NC_006511	ATGG	2	8	57619	57626	25 %	25 %	50 %	0 %	56412321
1252	NC_006511	TTG	2	6	57823	57828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412322
1253	NC_006511	GC	3	6	57850	57855	0 %	0 %	50 %	50 %	56412322
1254	NC_006511	TCT	2	6	57970	57975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412322
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1256	NC_006511	GAA	2	6	58101	58106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412322
1257	NC_006511	G	6	6	58176	58181	0 %	0 %	100 %	0 %	56412322
1258	NC_006511	TGG	2	6	58189	58194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412322
1259	NC_006511	TGAT	2	8	58291	58298	25 %	50 %	25 %	0 %	56412322
1260	NC_006511	TCG	2	6	58324	58329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412322
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1263	NC_006511	TGG	2	6	58414	58419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412322
1264	NC_006511	TCTAAC	2	12	58437	58448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412322
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1272	NC_006511	ACGCT	2	10	58742	58751	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1273	NC_006511	GTC	2	6	58810	58815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1274	NC_006511	AAAAT	2	10	58918	58927	80 %	20 %	0 %	0 %	56412323
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1286	NC_006511	GATC	2	8	59727	59734	25 %	25 %	25 %	25 %	56412323
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1353	NC_006511	TTTC	2	8	63450	63457	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1354	NC_006511	A	6	6	63460	63465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1355	NC_006511	CGG	2	6	63540	63545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412327
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1381	NC_006511	CAG	2	6	64330	64335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412327
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1383	NC_006511	GCG	2	6	64380	64385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412327
1384	NC_006511	GT	3	6	64434	64439	0 %	50 %	50 %	0 %	56412327
1385	NC_006511	CAGCGC	2	12	64486	64497	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56412327
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1387	NC_006511	CGT	2	6	64569	64574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412327
1388	NC_006511	CAG	2	6	64582	64587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412327
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1405	NC_006511	CAC	2	6	65101	65106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412328
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1441	NC_006511	GCG	2	6	66680	66685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412329
1442	NC_006511	GAA	2	6	66697	66702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412329
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1481	NC_006511	TAAT	2	8	68216	68223	50 %	50 %	0 %	0 %	56412330
1482	NC_006511	TAA	2	6	68369	68374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1483	NC_006511	TAAT	2	8	68424	68431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1484	NC_006511	ATT	2	6	68435	68440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1486	NC_006511	TTAA	2	8	68455	68462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1487	NC_006511	AAT	2	6	68524	68529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1489	NC_006511	ATTT	2	8	68602	68609	25 %	75 %	0 %	0 %	56412331
1490	NC_006511	GTCG	2	8	68634	68641	0 %	25 %	50 %	25 %	56412331
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1493	NC_006511	GCAG	2	8	68919	68926	25 %	0 %	50 %	25 %	56412331
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1495	NC_006511	GC	3	6	68968	68973	0 %	0 %	50 %	50 %	56412331
1496	NC_006511	TGG	2	6	69068	69073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412331
1497	NC_006511	AGCA	2	8	69074	69081	50 %	0 %	25 %	25 %	56412331
1498	NC_006511	AGA	2	6	69120	69125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412331
1499	NC_006511	T	7	7	69133	69139	0 %	100 %	0 %	0 %	56412331
1500	NC_006511	ACCG	2	8	69145	69152	25 %	0 %	25 %	50 %	56412331

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