MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_006511	ACTG	2	8	631570	631577	25 %	25 %	25 %	25 %	56412796
13502	NC_006511	GGC	2	6	631591	631596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412796
13503	NC_006511	TGC	2	6	631644	631649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412796
13504	NC_006511	TGG	2	6	631722	631727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412796
13505	NC_006511	TGC	2	6	631734	631739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412796
13506	NC_006511	ATCTGC	2	12	631755	631766	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56412796
13507	NC_006511	CGC	2	6	631791	631796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412796
13508	NC_006511	GAA	2	6	631859	631864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412796
13509	NC_006511	GAT	2	6	631880	631885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412796
13510	NC_006511	GCC	2	6	632042	632047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412796
13511	NC_006511	CGG	2	6	632064	632069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412796
13512	NC_006511	TCA	2	6	632070	632075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412796
13513	NC_006511	TCGA	2	8	632081	632088	25 %	25 %	25 %	25 %	56412796
13514	NC_006511	GCC	2	6	632123	632128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412796
13515	NC_006511	CCTGG	2	10	632196	632205	0 %	20 %	40 %	40 %	56412796
13516	NC_006511	TGA	2	6	632230	632235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412796
13517	NC_006511	GC	3	6	632340	632345	0 %	0 %	50 %	50 %	56412797
13518	NC_006511	GGCG	2	8	632370	632377	0 %	0 %	75 %	25 %	56412797
13519	NC_006511	CTG	2	6	632416	632421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412797
13520	NC_006511	GCG	2	6	632474	632479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412797
13521	NC_006511	CG	3	6	632478	632483	0 %	0 %	50 %	50 %	56412797
13522	NC_006511	GCG	2	6	632623	632628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412797
13523	NC_006511	GC	3	6	632735	632740	0 %	0 %	50 %	50 %	56412797
13524	NC_006511	GCT	2	6	632784	632789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412797
13525	NC_006511	TAT	2	6	632823	632828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412797
13526	NC_006511	GC	3	6	632851	632856	0 %	0 %	50 %	50 %	56412797
13527	NC_006511	GGC	2	6	632936	632941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412797
13528	NC_006511	GCG	2	6	632956	632961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412797
13529	NC_006511	CGG	2	6	632985	632990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412797
13530	NC_006511	GCT	2	6	633041	633046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412797
13531	NC_006511	GAT	2	6	633109	633114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412797
13532	NC_006511	GC	3	6	633119	633124	0 %	0 %	50 %	50 %	56412797
13533	NC_006511	AG	3	6	633136	633141	50 %	0 %	50 %	0 %	56412797
13534	NC_006511	TCG	2	6	633149	633154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412797
13535	NC_006511	GC	3	6	633171	633176	0 %	0 %	50 %	50 %	56412797
13536	NC_006511	CG	3	6	633251	633256	0 %	0 %	50 %	50 %	56412797
13537	NC_006511	GGC	2	6	633296	633301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412797
13538	NC_006511	GCG	3	9	633320	633328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412797
13539	NC_006511	GGA	2	6	633342	633347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412797
13540	NC_006511	TTA	2	6	633359	633364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412797
13541	NC_006511	CAA	2	6	633382	633387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412797
13542	NC_006511	AGA	2	6	633405	633410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412797
13543	NC_006511	CAG	2	6	633586	633591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412797
13544	NC_006511	GT	3	6	633595	633600	0 %	50 %	50 %	0 %	56412797
13545	NC_006511	TGGT	2	8	633722	633729	0 %	50 %	50 %	0 %	56412798
13546	NC_006511	GCG	2	6	633786	633791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412798
13547	NC_006511	GTATT	2	10	633874	633883	20 %	60 %	20 %	0 %	56412798
13548	NC_006511	CGA	2	6	633937	633942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412798
13549	NC_006511	CAT	2	6	633966	633971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412798
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13551	NC_006511	CAG	2	6	634106	634111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412799
13552	NC_006511	CAG	2	6	634155	634160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412799
13553	NC_006511	CAT	2	6	634271	634276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412799
13554	NC_006511	GAGG	2	8	634301	634308	25 %	0 %	75 %	0 %	56412799
13555	NC_006511	TAAT	2	8	634380	634387	50 %	50 %	0 %	0 %	56412800
13556	NC_006511	GCC	2	6	634439	634444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412800
13557	NC_006511	CAG	2	6	634513	634518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412800
13558	NC_006511	CGG	2	6	634580	634585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412800
13559	NC_006511	CGT	2	6	634594	634599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412800
13560	NC_006511	GCTT	2	8	634613	634620	0 %	50 %	25 %	25 %	56412800
13561	NC_006511	GGGAA	2	10	634737	634746	40 %	0 %	60 %	0 %	56412801
13562	NC_006511	TAA	2	6	634790	634795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412801
13563	NC_006511	CCT	2	6	634799	634804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56412801
13564	NC_006511	TCG	2	6	634834	634839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412801
13565	NC_006511	ATA	2	6	634912	634917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412801
13566	NC_006511	CGG	2	6	634946	634951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412801
13567	NC_006511	A	6	6	635016	635021	100 %	0 %	0 %	0 %	56412801
13568	NC_006511	CAG	2	6	635070	635075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412801
13569	NC_006511	GAG	2	6	635233	635238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412801
13570	NC_006511	CGC	2	6	635247	635252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412801
13571	NC_006511	CCG	2	6	635287	635292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412801
13572	NC_006511	GCG	2	6	635305	635310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412801
13573	NC_006511	CTT	2	6	635315	635320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412801
13574	NC_006511	GC	3	6	635340	635345	0 %	0 %	50 %	50 %	56412801
13575	NC_006511	TCGC	2	8	635463	635470	0 %	25 %	25 %	50 %	56412801
13576	NC_006511	GC	3	6	635486	635491	0 %	0 %	50 %	50 %	56412801
13577	NC_006511	AGC	2	6	635527	635532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412801
13578	NC_006511	TCGCG	2	10	635632	635641	0 %	20 %	40 %	40 %	56412801
13579	NC_006511	AGC	2	6	635675	635680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412801
13580	NC_006511	GCCA	2	8	635689	635696	25 %	0 %	25 %	50 %	56412801
13581	NC_006511	GCA	2	6	635744	635749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412801
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13586	NC_006511	GCCAC	2	10	636020	636029	20 %	0 %	20 %	60 %	56412801
13587	NC_006511	GGC	2	6	636245	636250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412801
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13589	NC_006511	ATA	2	6	636300	636305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412801
13590	NC_006511	TCA	2	6	636317	636322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412801
13591	NC_006511	GCA	2	6	636421	636426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412802
13592	NC_006511	ACGA	2	8	636467	636474	50 %	0 %	25 %	25 %	56412802
13593	NC_006511	ATGG	2	8	636521	636528	25 %	25 %	50 %	0 %	56412802
13594	NC_006511	TA	3	6	636529	636534	50 %	50 %	0 %	0 %	56412802
13595	NC_006511	AAT	2	6	636566	636571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412802
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13598	NC_006511	CGGA	2	8	636677	636684	25 %	0 %	50 %	25 %	56412802
13599	NC_006511	GGT	2	6	636689	636694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412802
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13601	NC_006511	GCCG	2	8	636767	636774	0 %	0 %	50 %	50 %	56412802
13602	NC_006511	CG	3	6	636826	636831	0 %	0 %	50 %	50 %	56412802
13603	NC_006511	TCT	2	6	636837	636842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412802
13604	NC_006511	AAT	2	6	636938	636943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412802
13605	NC_006511	T	6	6	636966	636971	0 %	100 %	0 %	0 %	56412802
13606	NC_006511	CAG	2	6	636992	636997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412802
13607	NC_006511	GGC	2	6	637019	637024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412802
13608	NC_006511	GAA	2	6	637106	637111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412802
13609	NC_006511	CAG	2	6	637148	637153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412802
13610	NC_006511	ATG	2	6	637218	637223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412802
13611	NC_006511	AGAA	2	8	637250	637257	75 %	0 %	25 %	0 %	56412803
13612	NC_006511	TTC	2	6	637267	637272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412803
13613	NC_006511	TAA	2	6	637373	637378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412803
13614	NC_006511	CGA	2	6	637389	637394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412803
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13616	NC_006511	GCAGC	2	10	637423	637432	20 %	0 %	40 %	40 %	56412803
13617	NC_006511	AAT	2	6	637546	637551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412803
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13622	NC_006511	CGC	2	6	637687	637692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412803
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13711	NC_006511	TCAA	2	8	642039	642046	50 %	25 %	0 %	25 %	56412806
13712	NC_006511	A	6	6	642119	642124	100 %	0 %	0 %	0 %	56412806
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13729	NC_006511	T	6	6	642785	642790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13730	NC_006511	TTG	2	6	642798	642803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13731	NC_006511	ATG	2	6	642831	642836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13732	NC_006511	AGT	2	6	642849	642854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13734	NC_006511	A	7	7	642976	642982	100 %	0 %	0 %	0 %	56412808
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13742	NC_006511	TAT	3	9	643321	643329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412808
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13744	NC_006511	GC	3	6	643382	643387	0 %	0 %	50 %	50 %	56412808
13745	NC_006511	TCG	2	6	643533	643538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13746	NC_006511	TCC	2	6	643547	643552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13747	NC_006511	TTC	2	6	643564	643569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13748	NC_006511	TCA	2	6	643606	643611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13853	NC_006511	CAT	2	6	648414	648419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412812
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13988	NC_006511	T	6	6	655052	655057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13989	NC_006511	ATT	2	6	655058	655063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13990	NC_006511	AGC	2	6	655235	655240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13991	NC_006511	GTT	2	6	655244	655249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13992	NC_006511	GAAC	2	8	655251	655258	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13993	NC_006511	TAAA	2	8	655274	655281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13994	NC_006511	GC	3	6	655338	655343	0 %	0 %	50 %	50 %	56412820
13995	NC_006511	GCG	2	6	655350	655355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412820
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13997	NC_006511	CG	3	6	655579	655584	0 %	0 %	50 %	50 %	56412820
13998	NC_006511	GCA	2	6	655614	655619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412820
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