MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_006511	TCGG	2	8	608586	608593	0 %	25 %	50 %	25 %	56412775
13002	NC_006511	CCGC	2	8	608596	608603	0 %	0 %	25 %	75 %	56412775
13003	NC_006511	TTC	2	6	608640	608645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412775
13004	NC_006511	ATTTTT	2	12	608733	608744	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	56412775
13005	NC_006511	CTGG	2	8	608751	608758	0 %	25 %	50 %	25 %	56412775
13006	NC_006511	TGGAC	2	10	608788	608797	20 %	20 %	40 %	20 %	56412775
13007	NC_006511	CG	3	6	608801	608806	0 %	0 %	50 %	50 %	56412775
13008	NC_006511	CGC	2	6	608811	608816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412775
13009	NC_006511	TGC	2	6	609066	609071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412776
13010	NC_006511	TGC	2	6	609133	609138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412776
13011	NC_006511	TGG	3	9	609166	609174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412776
13012	NC_006511	GGC	2	6	609276	609281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412776
13013	NC_006511	CCG	2	6	609354	609359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412776
13014	NC_006511	TGC	3	9	609388	609396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412776
13015	NC_006511	GTG	2	6	609435	609440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412776
13016	NC_006511	GCA	3	9	609556	609564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_006511	ACC	2	6	609609	609614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13018	NC_006511	ATC	2	6	609684	609689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412777
13019	NC_006511	TGA	2	6	609691	609696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412777
13020	NC_006511	GTT	2	6	609773	609778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412777
13021	NC_006511	CGC	2	6	609904	609909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412777
13022	NC_006511	ACC	2	6	609927	609932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412777
13023	NC_006511	CAT	2	6	610099	610104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412777
13024	NC_006511	GC	4	8	610151	610158	0 %	0 %	50 %	50 %	56412777
13025	NC_006511	ACC	2	6	610296	610301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412777
13026	NC_006511	TAT	2	6	610324	610329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412777
13027	NC_006511	GAA	2	6	610346	610351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412777
13028	NC_006511	TCG	2	6	610353	610358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412777
13029	NC_006511	CAC	2	6	610382	610387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412777
13030	NC_006511	A	6	6	610398	610403	100 %	0 %	0 %	0 %	56412777
13031	NC_006511	ACCG	2	8	610442	610449	25 %	0 %	25 %	50 %	56412777
13032	NC_006511	GGT	2	6	610463	610468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412777
13033	NC_006511	CTG	2	6	610586	610591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412777
13034	NC_006511	TCT	2	6	610635	610640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412777
13035	NC_006511	ACCG	2	8	610649	610656	25 %	0 %	25 %	50 %	56412777
13036	NC_006511	TGG	2	6	610674	610679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412777
13037	NC_006511	CGG	2	6	610723	610728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412777
13038	NC_006511	CG	3	6	610746	610751	0 %	0 %	50 %	50 %	56412777
13039	NC_006511	CTG	2	6	610763	610768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412777
13040	NC_006511	CAC	2	6	610897	610902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412777
13041	NC_006511	GC	3	6	610915	610920	0 %	0 %	50 %	50 %	56412777
13042	NC_006511	ACTTTG	2	12	610974	610985	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	56412777
13043	NC_006511	GCG	3	9	610998	611006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412777
13044	NC_006511	TTC	2	6	611067	611072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412777
13045	NC_006511	CGC	3	9	611130	611138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412777
13046	NC_006511	TGG	2	6	611235	611240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412777
13047	NC_006511	CGA	2	6	611244	611249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412777
13048	NC_006511	TAC	2	6	611264	611269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412777
13049	NC_006511	GCA	2	6	611283	611288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412777
13050	NC_006511	GCA	2	6	611335	611340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412777
13051	NC_006511	GTA	2	6	611394	611399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412777
13052	NC_006511	CAA	2	6	611446	611451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412778
13053	NC_006511	CAC	2	6	611512	611517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412778
13054	NC_006511	GCG	2	6	611533	611538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412778
13055	NC_006511	AGC	2	6	611567	611572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412778
13056	NC_006511	GCGA	2	8	611629	611636	25 %	0 %	50 %	25 %	56412778
13057	NC_006511	CGGT	2	8	611681	611688	0 %	25 %	50 %	25 %	56412778
13058	NC_006511	GTG	2	6	611716	611721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412778
13059	NC_006511	A	7	7	611762	611768	100 %	0 %	0 %	0 %	56412778
13060	NC_006511	GAC	2	6	611790	611795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412778
13061	NC_006511	GCT	2	6	611814	611819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412778
13062	NC_006511	CTG	2	6	611826	611831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412778
13063	NC_006511	ATG	2	6	611860	611865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412778
13064	NC_006511	TGA	2	6	611868	611873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412778
13065	NC_006511	ACT	2	6	611913	611918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412778
13066	NC_006511	CTGG	2	8	612002	612009	0 %	25 %	50 %	25 %	56412779
13067	NC_006511	GC	3	6	612040	612045	0 %	0 %	50 %	50 %	56412779
13068	NC_006511	GCG	3	9	612115	612123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412779
13069	NC_006511	CTG	2	6	612189	612194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412779
13070	NC_006511	CTG	2	6	612237	612242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412779
13071	NC_006511	AAC	2	6	612247	612252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412779
13072	NC_006511	CTG	2	6	612261	612266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412779
13073	NC_006511	GCG	2	6	612328	612333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412779
13074	NC_006511	AT	3	6	612335	612340	50 %	50 %	0 %	0 %	56412779
13075	NC_006511	GCT	2	6	612392	612397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412779
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13078	NC_006511	GCC	2	6	612530	612535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412779
13079	NC_006511	TG	3	6	612573	612578	0 %	50 %	50 %	0 %	56412779
13080	NC_006511	GAA	2	6	612698	612703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412779
13081	NC_006511	CAC	2	6	612731	612736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412779
13082	NC_006511	CG	4	8	612737	612744	0 %	0 %	50 %	50 %	56412779
13083	NC_006511	CGGG	2	8	612805	612812	0 %	0 %	75 %	25 %	56412779
13084	NC_006511	GCAG	2	8	612879	612886	25 %	0 %	50 %	25 %	56412779
13085	NC_006511	GC	4	8	613034	613041	0 %	0 %	50 %	50 %	56412779
13086	NC_006511	GC	3	6	613123	613128	0 %	0 %	50 %	50 %	56412779
13087	NC_006511	GAA	2	6	613179	613184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412779
13088	NC_006511	AGC	2	6	613201	613206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412779
13089	NC_006511	TGTC	2	8	613365	613372	0 %	50 %	25 %	25 %	56412780
13090	NC_006511	GCC	2	6	613432	613437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412780
13091	NC_006511	GCCA	2	8	613505	613512	25 %	0 %	25 %	50 %	56412780
13092	NC_006511	GAC	2	6	613536	613541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412780
13093	NC_006511	GAA	2	6	613542	613547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412780
13094	NC_006511	GTG	2	6	613569	613574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412780
13095	NC_006511	TGA	2	6	613582	613587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412780
13096	NC_006511	ACC	2	6	613591	613596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412780
13097	NC_006511	TGA	2	6	613654	613659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412780
13098	NC_006511	TCG	2	6	613673	613678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412780
13099	NC_006511	TC	3	6	613729	613734	0 %	50 %	0 %	50 %	56412780
13100	NC_006511	TG	3	6	613767	613772	0 %	50 %	50 %	0 %	56412780
13101	NC_006511	TAC	2	6	613776	613781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412780
13102	NC_006511	GC	3	6	613819	613824	0 %	0 %	50 %	50 %	56412780
13103	NC_006511	CAG	2	6	613983	613988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412780
13104	NC_006511	ACT	2	6	614074	614079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412780
13105	NC_006511	GGCTAT	2	12	614103	614114	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56412780
13106	NC_006511	CGA	2	6	614159	614164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412780
13107	NC_006511	TCA	2	6	614167	614172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412780
13108	NC_006511	GCG	2	6	614202	614207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412780
13109	NC_006511	GAA	2	6	614225	614230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412780
13110	NC_006511	ATCGGT	2	12	614235	614246	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56412780
13111	NC_006511	CGC	2	6	614248	614253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412780
13112	NC_006511	GC	3	6	614252	614257	0 %	0 %	50 %	50 %	56412780
13113	NC_006511	TGGT	2	8	614290	614297	0 %	50 %	50 %	0 %	56412780
13114	NC_006511	CG	4	8	614321	614328	0 %	0 %	50 %	50 %	56412780
13115	NC_006511	TGC	2	6	614362	614367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412780
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13117	NC_006511	GC	4	8	614455	614462	0 %	0 %	50 %	50 %	56412780
13118	NC_006511	GGC	3	9	614510	614518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412780
13119	NC_006511	GAT	2	6	614616	614621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412780
13120	NC_006511	CGC	2	6	614624	614629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412780
13121	NC_006511	CG	3	6	614640	614645	0 %	0 %	50 %	50 %	56412780
13122	NC_006511	GC	3	6	614661	614666	0 %	0 %	50 %	50 %	56412780
13123	NC_006511	CAAAA	2	10	614736	614745	80 %	0 %	0 %	20 %	56412780
13124	NC_006511	A	6	6	614778	614783	100 %	0 %	0 %	0 %	56412780
13125	NC_006511	GGC	2	6	614831	614836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412780
13126	NC_006511	ATG	2	6	614925	614930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412780
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13129	NC_006511	CG	3	6	615031	615036	0 %	0 %	50 %	50 %	56412780
13130	NC_006511	CGC	2	6	615041	615046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412780
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13142	NC_006511	AACC	2	8	615522	615529	50 %	0 %	0 %	50 %	56412780
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13153	NC_006511	CTGG	2	8	615981	615988	0 %	25 %	50 %	25 %	56412780
13154	NC_006511	CG	3	6	615989	615994	0 %	0 %	50 %	50 %	56412780
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13233	NC_006511	TGA	2	6	619237	619242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412785
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13238	NC_006511	GCG	2	6	619404	619409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412785
13239	NC_006511	TGA	2	6	619420	619425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412785
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13241	NC_006511	GCT	2	6	619445	619450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412785
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13243	NC_006511	TGG	2	6	619555	619560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412785
13244	NC_006511	G	6	6	619559	619564	0 %	0 %	100 %	0 %	56412785
13245	NC_006511	CTT	2	6	619601	619606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412785
13246	NC_006511	CTGG	2	8	619623	619630	0 %	25 %	50 %	25 %	56412785
13247	NC_006511	TGG	2	6	619660	619665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412785
13248	NC_006511	GAT	2	6	619709	619714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412785
13249	NC_006511	TCATGC	2	12	619745	619756	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56412785
13250	NC_006511	CCA	2	6	619772	619777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412785
13251	NC_006511	TGA	2	6	619795	619800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412785
13252	NC_006511	GC	3	6	619819	619824	0 %	0 %	50 %	50 %	56412785
13253	NC_006511	GCC	2	6	619832	619837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412785
13254	NC_006511	TGC	2	6	619849	619854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412785
13255	NC_006511	AACTG	2	10	619862	619871	40 %	20 %	20 %	20 %	56412785
13256	NC_006511	GT	3	6	619882	619887	0 %	50 %	50 %	0 %	56412785
13257	NC_006511	TGGCTG	2	12	619944	619955	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56412785
13258	NC_006511	ACGC	2	8	619961	619968	25 %	0 %	25 %	50 %	56412785
13259	NC_006511	GC	3	6	619990	619995	0 %	0 %	50 %	50 %	56412785
13260	NC_006511	CTG	2	6	620004	620009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412785
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13262	NC_006511	GCT	2	6	620090	620095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412785
13263	NC_006511	TGA	2	6	620119	620124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412785
13264	NC_006511	GCT	2	6	620237	620242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412785
13265	NC_006511	TTG	2	6	620261	620266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13266	NC_006511	AAT	2	6	620321	620326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13267	NC_006511	TTA	2	6	620513	620518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412786
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13272	NC_006511	TGG	2	6	620778	620783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412786
13273	NC_006511	CTT	2	6	620851	620856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412786
13274	NC_006511	GGC	2	6	620882	620887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412786
13275	NC_006511	TTC	4	12	620924	620935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412786
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13281	NC_006511	CTT	2	6	621187	621192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412786
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13284	NC_006511	CCG	2	6	621267	621272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412786
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13301	NC_006511	GCT	2	6	622084	622089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13302	NC_006511	TCG	2	6	622092	622097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13303	NC_006511	GGT	3	9	622105	622113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13304	NC_006511	GCT	2	6	622184	622189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13309	NC_006511	CTG	2	6	622397	622402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459642546
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13311	NC_006511	CCG	3	9	622533	622541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459642546
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13332	NC_006511	GTG	2	6	623411	623416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459642546
13333	NC_006511	T	6	6	623543	623548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13334	NC_006511	GCC	2	6	623607	623612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13335	NC_006511	CG	3	6	623692	623697	0 %	0 %	50 %	50 %	56412788
13336	NC_006511	AG	3	6	623722	623727	50 %	0 %	50 %	0 %	56412788
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13340	NC_006511	CG	3	6	624049	624054	0 %	0 %	50 %	50 %	56412788
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13348	NC_006511	ATCA	2	8	624409	624416	50 %	25 %	0 %	25 %	56412788
13349	NC_006511	GCG	2	6	624456	624461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412788
13350	NC_006511	TGCC	2	8	624468	624475	0 %	25 %	25 %	50 %	56412788
13351	NC_006511	CAG	2	6	624580	624585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412788
13352	NC_006511	TCA	2	6	624620	624625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412788
13353	NC_006511	GCCT	2	8	624667	624674	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13354	NC_006511	T	6	6	624674	624679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13355	NC_006511	A	6	6	624701	624706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13356	NC_006511	TCC	2	6	624910	624915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56412789
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13359	NC_006511	CGGGC	2	10	625113	625122	0 %	0 %	60 %	40 %	56412789
13360	NC_006511	GC	3	6	625157	625162	0 %	0 %	50 %	50 %	56412789
13361	NC_006511	CAA	2	6	625178	625183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412789
13362	NC_006511	CGT	2	6	625244	625249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412789
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13364	NC_006511	CACG	2	8	625337	625344	25 %	0 %	25 %	50 %	56412789
13365	NC_006511	GAT	2	6	625424	625429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412789
13366	NC_006511	CGC	2	6	625511	625516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412789
13367	NC_006511	TAA	2	6	625560	625565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412789
13368	NC_006511	A	7	7	625615	625621	100 %	0 %	0 %	0 %	56412789
13369	NC_006511	CAT	2	6	625688	625693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412790
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13372	NC_006511	TGGATG	2	12	625801	625812	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	56412790
13373	NC_006511	GAT	2	6	625815	625820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412790
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13376	NC_006511	GGCGCA	2	12	626036	626047	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	56412790
13377	NC_006511	GGTTT	2	10	626068	626077	0 %	60 %	40 %	0 %	56412790
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13384	NC_006511	TAT	2	6	626388	626393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412791
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13389	NC_006511	CCCT	2	8	626539	626546	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13390	NC_006511	T	6	6	626561	626566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13391	NC_006511	AGGG	2	8	626601	626608	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13392	NC_006511	TAC	2	6	626625	626630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412792
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13394	NC_006511	GCCA	2	8	626746	626753	25 %	0 %	25 %	50 %	56412792
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13419	NC_006511	TGAT	2	8	627974	627981	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13473	NC_006511	CAG	2	6	630106	630111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412794
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13476	NC_006511	GCTG	2	8	630186	630193	0 %	25 %	50 %	25 %	56412794
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13479	NC_006511	AC	3	6	630428	630433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13480	NC_006511	TGA	2	6	630446	630451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412795
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13486	NC_006511	CGG	2	6	630716	630721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412795
13487	NC_006511	CGG	2	6	630827	630832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412795
13488	NC_006511	TGC	2	6	630841	630846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412795
13489	NC_006511	ATG	2	6	630849	630854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412795
13490	NC_006511	CGG	2	6	630871	630876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412795
13491	NC_006511	CGG	2	6	630923	630928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412795
13492	NC_006511	AGA	2	6	630964	630969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412795
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13499	NC_006511	TCAG	2	8	631443	631450	25 %	25 %	25 %	25 %	56412796
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