MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_006511	TGA	2	6	561937	561942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412730
12002	NC_006511	CGC	2	6	561945	561950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412730
12003	NC_006511	G	6	6	562091	562096	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_006511	CAG	2	6	562142	562147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412731
12005	NC_006511	A	6	6	562154	562159	100 %	0 %	0 %	0 %	56412731
12006	NC_006511	T	6	6	562318	562323	0 %	100 %	0 %	0 %	56412731
12007	NC_006511	CG	3	6	562337	562342	0 %	0 %	50 %	50 %	56412731
12008	NC_006511	GGCG	2	8	562416	562423	0 %	0 %	75 %	25 %	56412731
12009	NC_006511	GCT	2	6	562443	562448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412731
12010	NC_006511	GCT	2	6	562476	562481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412731
12011	NC_006511	GCT	2	6	562521	562526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412731
12012	NC_006511	GC	3	6	562613	562618	0 %	0 %	50 %	50 %	56412731
12013	NC_006511	GGC	2	6	562620	562625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412731
12014	NC_006511	GAC	2	6	562683	562688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412731
12015	NC_006511	GCT	2	6	562701	562706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412731
12016	NC_006511	GGGCCT	2	12	562800	562811	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56412731
12017	NC_006511	GGC	2	6	562966	562971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412731
12018	NC_006511	TGC	2	6	563015	563020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412731
12019	NC_006511	TGGC	2	8	563026	563033	0 %	25 %	50 %	25 %	56412731
12020	NC_006511	GGCGC	2	10	563059	563068	0 %	0 %	60 %	40 %	56412731
12021	NC_006511	CGG	2	6	563157	563162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412731
12022	NC_006511	CGC	2	6	563166	563171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412731
12023	NC_006511	CCAG	2	8	563321	563328	25 %	0 %	25 %	50 %	56412732
12024	NC_006511	ATT	2	6	563344	563349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412732
12025	NC_006511	ACA	2	6	563360	563365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412732
12026	NC_006511	CAGA	2	8	563378	563385	50 %	0 %	25 %	25 %	56412732
12027	NC_006511	ATC	2	6	563401	563406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412732
12028	NC_006511	AG	3	6	563436	563441	50 %	0 %	50 %	0 %	56412732
12029	NC_006511	GGT	2	6	563514	563519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412732
12030	NC_006511	GT	3	6	563548	563553	0 %	50 %	50 %	0 %	56412732
12031	NC_006511	GTT	2	6	563597	563602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412732
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12033	NC_006511	ATTG	2	8	563740	563747	25 %	50 %	25 %	0 %	56412732
12034	NC_006511	GTTT	2	8	563756	563763	0 %	75 %	25 %	0 %	56412732
12035	NC_006511	GCC	2	6	563779	563784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412732
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12038	NC_006511	AAT	2	6	563827	563832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412732
12039	NC_006511	TGC	2	6	563854	563859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412732
12040	NC_006511	TTG	2	6	563883	563888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412732
12041	NC_006511	ATT	2	6	563985	563990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412732
12042	NC_006511	AGC	2	6	564001	564006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412732
12043	NC_006511	TGC	2	6	564046	564051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412732
12044	NC_006511	GCG	2	6	564085	564090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412732
12045	NC_006511	GCG	2	6	564110	564115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412732
12046	NC_006511	T	6	6	564121	564126	0 %	100 %	0 %	0 %	56412732
12047	NC_006511	TGC	2	6	564169	564174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412732
12048	NC_006511	GCT	2	6	564239	564244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412732
12049	NC_006511	TAAT	2	8	564314	564321	50 %	50 %	0 %	0 %	56412732
12050	NC_006511	AT	3	6	564347	564352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12051	NC_006511	GGC	2	6	564357	564362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12052	NC_006511	TGA	2	6	564432	564437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412733
12053	NC_006511	ATT	2	6	564459	564464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412733
12054	NC_006511	GCC	2	6	564467	564472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412733
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12056	NC_006511	TGAA	2	8	564563	564570	50 %	25 %	25 %	0 %	56412733
12057	NC_006511	GCT	2	6	564573	564578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412733
12058	NC_006511	GGCA	2	8	564615	564622	25 %	0 %	50 %	25 %	56412733
12059	NC_006511	GTG	2	6	564700	564705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412733
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12063	NC_006511	CGC	2	6	565059	565064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412733
12064	NC_006511	GTG	2	6	565102	565107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412733
12065	NC_006511	TG	3	6	565113	565118	0 %	50 %	50 %	0 %	56412733
12066	NC_006511	GC	3	6	565207	565212	0 %	0 %	50 %	50 %	56412733
12067	NC_006511	CAC	2	6	565215	565220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412733
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12070	NC_006511	ATG	2	6	565367	565372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412733
12071	NC_006511	CGA	2	6	565380	565385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412733
12072	NC_006511	GTC	2	6	565464	565469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412733
12073	NC_006511	TG	3	6	565481	565486	0 %	50 %	50 %	0 %	56412733
12074	NC_006511	ACG	2	6	565487	565492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412733
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12078	NC_006511	AAT	2	6	565578	565583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12079	NC_006511	CGGT	2	8	565710	565717	0 %	25 %	50 %	25 %	56412734
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12082	NC_006511	GAC	2	6	565871	565876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412734
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12084	NC_006511	GCG	2	6	566036	566041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412734
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12086	NC_006511	A	6	6	566117	566122	100 %	0 %	0 %	0 %	56412734
12087	NC_006511	GCT	2	6	566155	566160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412734
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12092	NC_006511	GCT	2	6	566224	566229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412734
12093	NC_006511	CGT	2	6	566261	566266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412734
12094	NC_006511	TCG	2	6	566268	566273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412734
12095	NC_006511	TGA	2	6	566307	566312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412734
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12097	NC_006511	GGC	2	6	566389	566394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412734
12098	NC_006511	GC	3	6	566402	566407	0 %	0 %	50 %	50 %	56412734
12099	NC_006511	AGA	2	6	566443	566448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412734
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12101	NC_006511	TG	3	6	566507	566512	0 %	50 %	50 %	0 %	56412734
12102	NC_006511	CGG	2	6	566575	566580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412734
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12106	NC_006511	TAT	2	6	566701	566706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412735
12107	NC_006511	GAT	2	6	566947	566952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412735
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12112	NC_006511	CG	3	6	567127	567132	0 %	0 %	50 %	50 %	56412735
12113	NC_006511	TGG	2	6	567203	567208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412735
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12118	NC_006511	GTC	2	6	567625	567630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412736
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12122	NC_006511	CCG	2	6	567822	567827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412736
12123	NC_006511	CCA	2	6	567846	567851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412736
12124	NC_006511	CGG	2	6	567867	567872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412736
12125	NC_006511	TCGC	2	8	567887	567894	0 %	25 %	25 %	50 %	56412736
12126	NC_006511	GCC	2	6	567964	567969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412736
12127	NC_006511	GC	3	6	567983	567988	0 %	0 %	50 %	50 %	56412736
12128	NC_006511	TGC	2	6	567998	568003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412736
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12130	NC_006511	GCT	2	6	568062	568067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412736
12131	NC_006511	GC	3	6	568128	568133	0 %	0 %	50 %	50 %	56412736
12132	NC_006511	T	6	6	568180	568185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12133	NC_006511	TAA	2	6	568267	568272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12134	NC_006511	CAT	2	6	568455	568460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412737
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12136	NC_006511	A	6	6	568569	568574	100 %	0 %	0 %	0 %	56412737
12137	NC_006511	AGAC	2	8	568580	568587	50 %	0 %	25 %	25 %	56412737
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12139	NC_006511	TGG	2	6	568627	568632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412737
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12142	NC_006511	TTCG	2	8	568728	568735	0 %	50 %	25 %	25 %	56412737
12143	NC_006511	GT	3	6	568773	568778	0 %	50 %	50 %	0 %	56412737
12144	NC_006511	CGG	2	6	568790	568795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412737
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12146	NC_006511	AAG	2	6	568807	568812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412737
12147	NC_006511	CTG	2	6	568846	568851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412737
12148	NC_006511	GCG	2	6	568915	568920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412737
12149	NC_006511	CG	3	6	568993	568998	0 %	0 %	50 %	50 %	56412737
12150	NC_006511	CCG	2	6	569087	569092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412737
12151	NC_006511	TGA	2	6	569134	569139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412737
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12153	NC_006511	AGGGC	2	10	569229	569238	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12154	NC_006511	AGC	2	6	569274	569279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12155	NC_006511	CGTT	2	8	569432	569439	0 %	50 %	25 %	25 %	56412738
12156	NC_006511	CGG	2	6	569504	569509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412738
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12159	NC_006511	GTG	2	6	569710	569715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412738
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12161	NC_006511	ACTG	2	8	569806	569813	25 %	25 %	25 %	25 %	56412738
12162	NC_006511	TCG	2	6	569882	569887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412738
12163	NC_006511	GC	3	6	569936	569941	0 %	0 %	50 %	50 %	56412738
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12196	NC_006511	T	6	6	571414	571419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12197	NC_006511	TTTA	2	8	571430	571437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12198	NC_006511	GGAA	2	8	571444	571451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12199	NC_006511	TTTTCT	2	12	571467	571478	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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12205	NC_006511	TCG	2	6	571753	571758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412740
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12222	NC_006511	CTGT	2	8	572811	572818	0 %	50 %	25 %	25 %	56412741
12223	NC_006511	A	6	6	572909	572914	100 %	0 %	0 %	0 %	56412741
12224	NC_006511	CGT	2	6	572946	572951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412741
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12229	NC_006511	CGTG	2	8	573165	573172	0 %	25 %	50 %	25 %	56412741
12230	NC_006511	CAC	2	6	573174	573179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412741
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12233	NC_006511	CCG	2	6	573239	573244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412741
12234	NC_006511	ATC	2	6	573340	573345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412741
12235	NC_006511	GC	3	6	573396	573401	0 %	0 %	50 %	50 %	56412741
12236	NC_006511	CAG	2	6	573418	573423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412741
12237	NC_006511	GAC	2	6	573508	573513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412741
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12239	NC_006511	GCG	2	6	573585	573590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12240	NC_006511	CAC	2	6	573618	573623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412742
12241	NC_006511	GTG	2	6	573664	573669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412742
12242	NC_006511	CGG	2	6	573695	573700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412742
12243	NC_006511	ATG	2	6	573865	573870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412742
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12245	NC_006511	TGC	2	6	573905	573910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412742
12246	NC_006511	AATAA	2	10	574029	574038	80 %	20 %	0 %	0 %	56412742
12247	NC_006511	CGGG	2	8	574062	574069	0 %	0 %	75 %	25 %	56412742
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12275	NC_006511	TCG	2	6	575091	575096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12276	NC_006511	TGA	2	6	575100	575105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12277	NC_006511	ATT	2	6	575158	575163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12278	NC_006511	A	6	6	575169	575174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12279	NC_006511	TGAC	2	8	575248	575255	25 %	25 %	25 %	25 %	56412743
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12351	NC_006511	CTG	2	6	578773	578778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412745
12352	NC_006511	ATC	2	6	578807	578812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412745
12353	NC_006511	CGG	2	6	578820	578825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412745
12354	NC_006511	TGAA	2	8	578867	578874	50 %	25 %	25 %	0 %	56412745
12355	NC_006511	CAC	2	6	578878	578883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412745
12356	NC_006511	ATC	2	6	578938	578943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412745
12357	NC_006511	ACCG	2	8	578958	578965	25 %	0 %	25 %	50 %	56412745
12358	NC_006511	GCC	2	6	579056	579061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412745
12359	NC_006511	TG	3	6	579082	579087	0 %	50 %	50 %	0 %	56412745
12360	NC_006511	CGA	2	6	579093	579098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412745
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12362	NC_006511	GTC	2	6	579155	579160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412745
12363	NC_006511	CCG	2	6	579269	579274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12364	NC_006511	CGG	2	6	579286	579291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12365	NC_006511	CAA	2	6	579337	579342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412746
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12389	NC_006511	ATCG	2	8	580541	580548	25 %	25 %	25 %	25 %	56412746
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12401	NC_006511	GCG	2	6	581099	581104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412747
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12448	NC_006511	ACAGG	2	10	583587	583596	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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12489	NC_006511	CG	4	8	585385	585392	0 %	0 %	50 %	50 %	56412752
12490	NC_006511	TGA	2	6	585427	585432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412752
12491	NC_006511	GC	3	6	585433	585438	0 %	0 %	50 %	50 %	56412752
12492	NC_006511	TC	3	6	585460	585465	0 %	50 %	0 %	50 %	56412752
12493	NC_006511	CGG	2	6	585466	585471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412752
12494	NC_006511	CAG	2	6	585476	585481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412752
12495	NC_006511	GC	5	10	585494	585503	0 %	0 %	50 %	50 %	56412752
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