MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_006511	ATC	2	6	538115	538120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_006511	CCG	2	6	538179	538184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11503	NC_006511	A	6	6	538213	538218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_006511	TAT	2	6	538263	538268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_006511	CTAT	2	8	538368	538375	25 %	50 %	0 %	25 %	56412707
11506	NC_006511	ATT	2	6	538379	538384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412707
11507	NC_006511	TTA	2	6	538397	538402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412707
11508	NC_006511	AT	4	8	538521	538528	50 %	50 %	0 %	0 %	56412707
11509	NC_006511	TGG	2	6	538612	538617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412707
11510	NC_006511	T	7	7	538620	538626	0 %	100 %	0 %	0 %	56412707
11511	NC_006511	ACTC	2	8	538629	538636	25 %	25 %	0 %	50 %	56412707
11512	NC_006511	ATT	2	6	538649	538654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412707
11513	NC_006511	CATTC	2	10	538668	538677	20 %	40 %	0 %	40 %	56412707
11514	NC_006511	AAT	2	6	538696	538701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412707
11515	NC_006511	T	7	7	538728	538734	0 %	100 %	0 %	0 %	56412707
11516	NC_006511	CAG	2	6	538807	538812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412707
11517	NC_006511	ACC	2	6	538814	538819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412707
11518	NC_006511	TAT	2	6	538851	538856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412707
11519	NC_006511	TGA	2	6	538866	538871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412707
11520	NC_006511	ATC	2	6	538885	538890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412707
11521	NC_006511	CAA	2	6	538899	538904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412707
11522	NC_006511	AGG	2	6	538909	538914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412707
11523	NC_006511	TTA	2	6	538938	538943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412707
11524	NC_006511	TA	3	6	538942	538947	50 %	50 %	0 %	0 %	56412707
11525	NC_006511	TAT	2	6	538959	538964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412707
11526	NC_006511	TA	3	6	538966	538971	50 %	50 %	0 %	0 %	56412707
11527	NC_006511	GCC	2	6	538994	538999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412707
11528	NC_006511	AT	3	6	539022	539027	50 %	50 %	0 %	0 %	56412707
11529	NC_006511	T	6	6	539039	539044	0 %	100 %	0 %	0 %	56412707
11530	NC_006511	GCA	2	6	539063	539068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412707
11531	NC_006511	AGT	2	6	539102	539107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412707
11532	NC_006511	TAA	2	6	539120	539125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412707
11533	NC_006511	CTG	2	6	539157	539162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412707
11534	NC_006511	AAAT	2	8	539202	539209	75 %	25 %	0 %	0 %	56412707
11535	NC_006511	TAA	2	6	539245	539250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412707
11536	NC_006511	AT	3	6	539261	539266	50 %	50 %	0 %	0 %	56412707
11537	NC_006511	ATA	2	6	539302	539307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412707
11538	NC_006511	ATA	3	9	539331	539339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412707
11539	NC_006511	AGA	2	6	539342	539347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412707
11540	NC_006511	GAAT	2	8	539392	539399	50 %	25 %	25 %	0 %	56412707
11541	NC_006511	TAA	2	6	539433	539438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412707
11542	NC_006511	ACA	2	6	539450	539455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412707
11543	NC_006511	TAT	2	6	539506	539511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412707
11544	NC_006511	AG	3	6	539513	539518	50 %	0 %	50 %	0 %	56412707
11545	NC_006511	ATT	2	6	539534	539539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412707
11546	NC_006511	TA	3	6	539542	539547	50 %	50 %	0 %	0 %	56412707
11547	NC_006511	AGT	2	6	539709	539714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412707
11548	NC_006511	ATA	2	6	539787	539792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412707
11549	NC_006511	ACT	2	6	539837	539842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412707
11550	NC_006511	TA	3	6	539851	539856	50 %	50 %	0 %	0 %	56412707
11551	NC_006511	GTA	2	6	539889	539894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412707
11552	NC_006511	ACTC	2	8	539931	539938	25 %	25 %	0 %	50 %	56412707
11553	NC_006511	ATC	2	6	540001	540006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412707
11554	NC_006511	AATA	2	8	540011	540018	75 %	25 %	0 %	0 %	56412707
11555	NC_006511	CCAA	2	8	540022	540029	50 %	0 %	0 %	50 %	56412707
11556	NC_006511	TTTG	2	8	540115	540122	0 %	75 %	25 %	0 %	56412707
11557	NC_006511	ATT	2	6	540137	540142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412707
11558	NC_006511	AT	3	6	540174	540179	50 %	50 %	0 %	0 %	56412707
11559	NC_006511	CAA	2	6	540186	540191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412707
11560	NC_006511	ACCC	2	8	540192	540199	25 %	0 %	0 %	75 %	56412707
11561	NC_006511	AAT	2	6	540203	540208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412707
11562	NC_006511	AAT	2	6	540216	540221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412707
11563	NC_006511	A	7	7	540313	540319	100 %	0 %	0 %	0 %	56412708
11564	NC_006511	TAA	2	6	540323	540328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412708
11565	NC_006511	CAT	2	6	540346	540351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412708
11566	NC_006511	TAT	2	6	540404	540409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412708
11567	NC_006511	ATT	2	6	540414	540419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412708
11568	NC_006511	TAA	2	6	540448	540453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412708
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11570	NC_006511	TCT	2	6	540525	540530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412708
11571	NC_006511	GAC	2	6	540545	540550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412708
11572	NC_006511	AG	3	6	540552	540557	50 %	0 %	50 %	0 %	56412708
11573	NC_006511	TGA	2	6	540632	540637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412709
11574	NC_006511	TGG	2	6	540648	540653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412709
11575	NC_006511	CCAT	2	8	540671	540678	25 %	25 %	0 %	50 %	56412709
11576	NC_006511	CAA	2	6	540680	540685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412709
11577	NC_006511	CAT	2	6	540717	540722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412709
11578	NC_006511	AGT	2	6	540735	540740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412709
11579	NC_006511	GC	3	6	540759	540764	0 %	0 %	50 %	50 %	56412709
11580	NC_006511	CATA	2	8	540839	540846	50 %	25 %	0 %	25 %	56412709
11581	NC_006511	AATG	2	8	540866	540873	50 %	25 %	25 %	0 %	56412709
11582	NC_006511	CGAT	2	8	540890	540897	25 %	25 %	25 %	25 %	56412709
11583	NC_006511	AAT	2	6	540995	541000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_006511	AT	3	6	541035	541040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_006511	T	6	6	541141	541146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_006511	AG	4	8	541148	541155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_006511	G	6	6	541166	541171	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_006511	ATAAA	2	10	541222	541231	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_006511	A	6	6	541229	541234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_006511	CTG	2	6	541363	541368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11591	NC_006511	GAA	2	6	541507	541512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_006511	ACG	2	6	541529	541534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11593	NC_006511	CGT	2	6	541712	541717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11594	NC_006511	CTGG	2	8	541718	541725	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11595	NC_006511	A	6	6	541809	541814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_006511	TG	3	6	541966	541971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_006511	AGG	2	6	542055	542060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_006511	T	6	6	542111	542116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_006511	GCC	2	6	542138	542143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11600	NC_006511	T	6	6	542184	542189	0 %	100 %	0 %	0 %	56412710
11601	NC_006511	CGC	2	6	542210	542215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412710
11602	NC_006511	CTT	2	6	542225	542230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412710
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11604	NC_006511	GCC	2	6	542295	542300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412710
11605	NC_006511	CGA	2	6	542399	542404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412710
11606	NC_006511	GGT	2	6	542412	542417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412710
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11608	NC_006511	CTG	2	6	542474	542479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412710
11609	NC_006511	GAT	2	6	542505	542510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412710
11610	NC_006511	CCAG	2	8	542511	542518	25 %	0 %	25 %	50 %	56412710
11611	NC_006511	TCA	2	6	542602	542607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412710
11612	NC_006511	AT	3	6	542617	542622	50 %	50 %	0 %	0 %	56412710
11613	NC_006511	CGC	2	6	542634	542639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412710
11614	NC_006511	CAG	2	6	542691	542696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412710
11615	NC_006511	CGG	2	6	542738	542743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412710
11616	NC_006511	AAT	2	6	542761	542766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412710
11617	NC_006511	ATG	2	6	542779	542784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412710
11618	NC_006511	GCC	2	6	542829	542834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412710
11619	NC_006511	CATCG	2	10	542928	542937	20 %	20 %	20 %	40 %	56412710
11620	NC_006511	GAAG	2	8	542995	543002	50 %	0 %	50 %	0 %	56412710
11621	NC_006511	TTC	2	6	543042	543047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412710
11622	NC_006511	CTG	2	6	543067	543072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412710
11623	NC_006511	TCG	2	6	543088	543093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412710
11624	NC_006511	ATG	2	6	543106	543111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412710
11625	NC_006511	TAA	2	6	543134	543139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11627	NC_006511	AAT	2	6	543192	543197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_006511	TGT	2	6	543238	543243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11657	NC_006511	CTGG	2	8	545700	545707	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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11753	NC_006511	AAT	2	6	549855	549860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11754	NC_006511	A	6	6	549895	549900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11863	NC_006511	CGA	3	9	555095	555103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412722
11864	NC_006511	ATCT	2	8	555108	555115	25 %	50 %	0 %	25 %	56412722
11865	NC_006511	CTG	2	6	555118	555123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412722
11866	NC_006511	GTACC	2	10	555132	555141	20 %	20 %	20 %	40 %	56412722
11867	NC_006511	GC	3	6	555175	555180	0 %	0 %	50 %	50 %	56412722
11868	NC_006511	GC	3	6	555216	555221	0 %	0 %	50 %	50 %	56412722
11869	NC_006511	CGGA	2	8	555256	555263	25 %	0 %	50 %	25 %	56412722
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11991	NC_006511	AAG	2	6	561423	561428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11993	NC_006511	AGAA	2	8	561515	561522	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11994	NC_006511	AGA	2	6	561541	561546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11995	NC_006511	TCA	2	6	561559	561564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11996	NC_006511	GAAAG	2	10	561568	561577	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11997	NC_006511	GAG	2	6	561725	561730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412730
11998	NC_006511	AT	3	6	561735	561740	50 %	50 %	0 %	0 %	56412730
11999	NC_006511	GAC	2	6	561773	561778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412730
12000	NC_006511	GAT	2	6	561844	561849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412730

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