MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_006511	TGGTT	2	10	489047	489056	0 %	60 %	40 %	0 %	56412667
10502	NC_006511	CCG	2	6	489096	489101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412667
10503	NC_006511	CGC	2	6	489105	489110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412667
10504	NC_006511	GAA	2	6	489113	489118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412667
10505	NC_006511	GTG	2	6	489188	489193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412667
10506	NC_006511	G	6	6	489301	489306	0 %	0 %	100 %	0 %	56412667
10507	NC_006511	CCT	2	6	489467	489472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56412667
10508	NC_006511	A	6	6	489484	489489	100 %	0 %	0 %	0 %	56412667
10509	NC_006511	CGT	2	6	489515	489520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412667
10510	NC_006511	CGCTT	2	10	489541	489550	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10511	NC_006511	AGG	2	6	489608	489613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_006511	GC	3	6	489707	489712	0 %	0 %	50 %	50 %	56412668
10513	NC_006511	CAG	2	6	489716	489721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412668
10514	NC_006511	CAA	2	6	489797	489802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412668
10515	NC_006511	GC	3	6	489809	489814	0 %	0 %	50 %	50 %	56412668
10516	NC_006511	GCG	3	9	489820	489828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412668
10517	NC_006511	GAA	2	6	489837	489842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412668
10518	NC_006511	GGC	2	6	489950	489955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412668
10519	NC_006511	AGA	2	6	489989	489994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412668
10520	NC_006511	GAA	2	6	490017	490022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412668
10521	NC_006511	CGG	2	6	490060	490065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412668
10522	NC_006511	CGG	2	6	490115	490120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412668
10523	NC_006511	GAT	3	9	490193	490201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412668
10524	NC_006511	AAG	2	6	490213	490218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412668
10525	NC_006511	AGA	2	6	490283	490288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412668
10526	NC_006511	CAG	2	6	490395	490400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412668
10527	NC_006511	ACGCG	2	10	490433	490442	20 %	0 %	40 %	40 %	56412668
10528	NC_006511	TGC	2	6	490444	490449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412668
10529	NC_006511	TCA	2	6	490590	490595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10530	NC_006511	T	7	7	490638	490644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_006511	TTA	2	6	490692	490697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_006511	TCGC	2	8	490819	490826	0 %	25 %	25 %	50 %	56412669
10533	NC_006511	GGC	2	6	490964	490969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412669
10534	NC_006511	GC	4	8	490974	490981	0 %	0 %	50 %	50 %	56412669
10535	NC_006511	GAA	2	6	491061	491066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412669
10536	NC_006511	ATATTA	2	12	491086	491097	50 %	50 %	0 %	0 %	56412669
10537	NC_006511	CCA	2	6	491113	491118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412669
10538	NC_006511	GAT	2	6	491135	491140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412669
10539	NC_006511	TGA	2	6	491164	491169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412669
10540	NC_006511	TGG	2	6	491191	491196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412669
10541	NC_006511	GCC	2	6	491232	491237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412669
10542	NC_006511	CGC	2	6	491409	491414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412669
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10544	NC_006511	GGC	2	6	491505	491510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412669
10545	NC_006511	AGCGTA	2	12	491526	491537	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56412669
10546	NC_006511	TGAT	2	8	491544	491551	25 %	50 %	25 %	0 %	56412669
10547	NC_006511	TCC	2	6	491559	491564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10548	NC_006511	CCGCG	2	10	491565	491574	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10549	NC_006511	GGGA	2	8	491577	491584	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_006511	ATC	2	6	491612	491617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10551	NC_006511	TA	3	6	491624	491629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_006511	ATG	2	6	491662	491667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_006511	GCA	2	6	491743	491748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412670
10554	NC_006511	GGCAG	2	10	491760	491769	20 %	0 %	60 %	20 %	56412670
10555	NC_006511	GCT	2	6	491784	491789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412670
10556	NC_006511	GCC	2	6	491824	491829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412670
10557	NC_006511	CCG	2	6	491836	491841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412670
10558	NC_006511	CAA	2	6	491848	491853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412670
10559	NC_006511	CGG	2	6	491868	491873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412670
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10565	NC_006511	GCG	2	6	492205	492210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412670
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10567	NC_006511	CGG	2	6	492291	492296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412670
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10571	NC_006511	CAT	2	6	492537	492542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412670
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10574	NC_006511	TGA	2	6	492656	492661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412670
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10578	NC_006511	TTC	2	6	492731	492736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412671
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10589	NC_006511	CGC	2	6	493448	493453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412671
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10605	NC_006511	GGT	2	6	494218	494223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412672
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10622	NC_006511	CGG	2	6	494831	494836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412673
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10625	NC_006511	CTG	2	6	494892	494897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412673
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10668	NC_006511	TAA	2	6	496989	496994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10740	NC_006511	ATC	2	6	500777	500782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412680
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10742	NC_006511	T	6	6	500870	500875	0 %	100 %	0 %	0 %	56412681
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10991	NC_006511	GAC	2	6	512261	512266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412690
10992	NC_006511	CAA	2	6	512311	512316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412690
10993	NC_006511	GAT	2	6	512383	512388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412690
10994	NC_006511	CGA	2	6	512395	512400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412690
10995	NC_006511	CGGTG	2	10	512425	512434	0 %	20 %	60 %	20 %	56412690
10996	NC_006511	GCG	2	6	512511	512516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412690
10997	NC_006511	GAT	2	6	512542	512547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412690
10998	NC_006511	CGGTG	2	10	512563	512572	0 %	20 %	60 %	20 %	56412690
10999	NC_006511	CTG	2	6	512606	512611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412690
11000	NC_006511	ACC	2	6	512619	512624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412690

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