MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006511	T	7	7	22744	22750	0 %	100 %	0 %	0 %	459642539
502	NC_006511	CT	3	6	22787	22792	0 %	50 %	0 %	50 %	459642539
503	NC_006511	GGT	2	6	22940	22945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459642539
504	NC_006511	CTA	2	6	22947	22952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459642539
505	NC_006511	CGG	2	6	22987	22992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459642539
506	NC_006511	CTGG	2	8	22993	23000	0 %	25 %	50 %	25 %	459642539
507	NC_006511	TAT	2	6	23018	23023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459642539
508	NC_006511	ATA	2	6	23044	23049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459642539
509	NC_006511	TTA	2	6	23159	23164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_006511	TCTTAA	2	12	23196	23207	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
511	NC_006511	TTAT	2	8	23258	23265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_006511	A	7	7	23331	23337	100 %	0 %	0 %	0 %	56412294
513	NC_006511	TGA	2	6	23338	23343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412294
514	NC_006511	ATA	2	6	23362	23367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412294
515	NC_006511	CTTTT	2	10	23386	23395	0 %	80 %	0 %	20 %	56412294
516	NC_006511	T	6	6	23392	23397	0 %	100 %	0 %	0 %	56412294
517	NC_006511	CAG	2	6	23400	23405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412294
518	NC_006511	TTG	2	6	23445	23450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412294
519	NC_006511	TTTA	2	8	23491	23498	25 %	75 %	0 %	0 %	56412294
520	NC_006511	ATG	2	6	23506	23511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412294
521	NC_006511	TTTC	2	8	23545	23552	0 %	75 %	0 %	25 %	56412294
522	NC_006511	TGA	2	6	23558	23563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412294
523	NC_006511	AT	3	6	23575	23580	50 %	50 %	0 %	0 %	56412294
524	NC_006511	CG	3	6	23645	23650	0 %	0 %	50 %	50 %	56412294
525	NC_006511	ACG	2	6	23746	23751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412294
526	NC_006511	TGA	2	6	23782	23787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412294
527	NC_006511	GC	4	8	23788	23795	0 %	0 %	50 %	50 %	56412294
528	NC_006511	GCT	2	6	23840	23845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412294
529	NC_006511	TCTG	2	8	23948	23955	0 %	50 %	25 %	25 %	56412294
530	NC_006511	A	7	7	23960	23966	100 %	0 %	0 %	0 %	56412294
531	NC_006511	GGC	2	6	23992	23997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412294
532	NC_006511	AT	3	6	24049	24054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_006511	TAA	2	6	24088	24093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_006511	AAG	2	6	24115	24120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_006511	ATT	2	6	24121	24126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_006511	A	6	6	24129	24134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_006511	ACA	2	6	24188	24193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_006511	GAT	2	6	24225	24230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_006511	TAA	2	6	24252	24257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_006511	TAA	2	6	24259	24264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_006511	ACG	2	6	24299	24304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_006511	AAG	2	6	24346	24351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_006511	T	7	7	24356	24362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_006511	GAA	2	6	24392	24397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_006511	CAG	2	6	24402	24407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_006511	A	6	6	24418	24423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_006511	TGAA	2	8	24459	24466	50 %	25 %	25 %	0 %	56412295
548	NC_006511	TGT	2	6	24514	24519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412295
549	NC_006511	TAC	2	6	24536	24541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412295
550	NC_006511	CGGTA	2	10	24554	24563	20 %	20 %	40 %	20 %	56412295
551	NC_006511	CGC	2	6	24587	24592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412295
552	NC_006511	CTGTT	2	10	24593	24602	0 %	60 %	20 %	20 %	56412295
553	NC_006511	GGC	2	6	24674	24679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412295
554	NC_006511	AGA	2	6	24689	24694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412295
555	NC_006511	CCAG	2	8	24730	24737	25 %	0 %	25 %	50 %	56412295
556	NC_006511	GCG	2	6	24741	24746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412295
557	NC_006511	CAG	2	6	24762	24767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412295
558	NC_006511	CGA	2	6	24817	24822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412295
559	NC_006511	T	7	7	25018	25024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_006511	CG	3	6	25057	25062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_006511	A	8	8	25108	25115	100 %	0 %	0 %	0 %	56412296
562	NC_006511	ATT	2	6	25134	25139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412296
563	NC_006511	CTG	2	6	25144	25149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412296
564	NC_006511	CGG	2	6	25151	25156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412296
565	NC_006511	CCT	2	6	25238	25243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56412296
566	NC_006511	ATT	2	6	25249	25254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412296
567	NC_006511	TTC	2	6	25257	25262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412296
568	NC_006511	T	7	7	25274	25280	0 %	100 %	0 %	0 %	56412296
569	NC_006511	CGC	2	6	25337	25342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412296
570	NC_006511	CT	3	6	25343	25348	0 %	50 %	0 %	50 %	56412296
571	NC_006511	A	6	6	25363	25368	100 %	0 %	0 %	0 %	56412296
572	NC_006511	AT	3	6	25373	25378	50 %	50 %	0 %	0 %	56412296
573	NC_006511	TAT	2	6	25383	25388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412296
574	NC_006511	ACCG	2	8	25407	25414	25 %	0 %	25 %	50 %	56412296
575	NC_006511	TTTA	2	8	25430	25437	25 %	75 %	0 %	0 %	56412296
576	NC_006511	TAC	2	6	25624	25629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412296
577	NC_006511	A	6	6	25660	25665	100 %	0 %	0 %	0 %	56412296
578	NC_006511	CCG	2	6	25684	25689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412296
579	NC_006511	ACG	2	6	25759	25764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412296
580	NC_006511	ATG	2	6	25788	25793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412296
581	NC_006511	GCGCCT	2	12	25880	25891	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56412297
582	NC_006511	TCTG	2	8	25924	25931	0 %	50 %	25 %	25 %	56412297
583	NC_006511	GGC	2	6	25981	25986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412297
584	NC_006511	GAC	2	6	26062	26067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412297
585	NC_006511	GC	3	6	26076	26081	0 %	0 %	50 %	50 %	56412297
586	NC_006511	GCCT	2	8	26105	26112	0 %	25 %	25 %	50 %	56412297
587	NC_006511	GGC	3	9	26173	26181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412297
588	NC_006511	GCC	2	6	26216	26221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412297
589	NC_006511	GCA	2	6	26242	26247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412297
590	NC_006511	GGC	2	6	26272	26277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412297
591	NC_006511	GGC	2	6	26390	26395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412297
592	NC_006511	ACT	2	6	26463	26468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412297
593	NC_006511	GCG	2	6	26487	26492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412297
594	NC_006511	AGCGAC	2	12	26501	26512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412297
595	NC_006511	GCA	2	6	26515	26520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412297
596	NC_006511	ATT	2	6	26599	26604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412297
597	NC_006511	CCTT	2	8	26611	26618	0 %	50 %	0 %	50 %	56412297
598	NC_006511	GAC	2	6	26642	26647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412297
599	NC_006511	CAT	2	6	26740	26745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412297
600	NC_006511	GCC	2	6	26761	26766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412297
601	NC_006511	CCG	2	6	26799	26804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412297
602	NC_006511	CCG	2	6	26874	26879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412297
603	NC_006511	GGC	2	6	26901	26906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412297
604	NC_006511	GCG	2	6	26915	26920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412297
605	NC_006511	TAG	2	6	26944	26949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412297
606	NC_006511	TCAG	2	8	26970	26977	25 %	25 %	25 %	25 %	56412297
607	NC_006511	GCG	2	6	27066	27071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412297
608	NC_006511	ATA	2	6	27135	27140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412297
609	NC_006511	GAT	2	6	27254	27259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412297
610	NC_006511	ATT	2	6	27336	27341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412297
611	NC_006511	TAT	2	6	27350	27355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412297
612	NC_006511	AGG	2	6	27359	27364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412297
613	NC_006511	ATCA	2	8	27383	27390	50 %	25 %	0 %	25 %	56412297
614	NC_006511	TTA	2	6	27417	27422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412297
615	NC_006511	TGA	2	6	27451	27456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412297
616	NC_006511	TTG	2	6	27467	27472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412297
617	NC_006511	ACA	2	6	27522	27527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412297
618	NC_006511	ATG	3	9	27609	27617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412297
619	NC_006511	ACT	2	6	27709	27714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412297
620	NC_006511	ACA	2	6	27735	27740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412297
621	NC_006511	GCG	2	6	27777	27782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412297
622	NC_006511	CAG	2	6	27857	27862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412297
623	NC_006511	GCG	2	6	27879	27884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412297
624	NC_006511	TGG	2	6	27888	27893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412297
625	NC_006511	AGCC	2	8	27917	27924	25 %	0 %	25 %	50 %	56412297
626	NC_006511	CG	3	6	28006	28011	0 %	0 %	50 %	50 %	56412297
627	NC_006511	GGT	2	6	28021	28026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412297
628	NC_006511	CGA	2	6	28035	28040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412297
629	NC_006511	TGA	2	6	28084	28089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412297
630	NC_006511	TGA	2	6	28099	28104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412297
631	NC_006511	CCGA	2	8	28124	28131	25 %	0 %	25 %	50 %	56412297
632	NC_006511	GC	3	6	28134	28139	0 %	0 %	50 %	50 %	56412297
633	NC_006511	GCGT	2	8	28170	28177	0 %	25 %	50 %	25 %	56412297
634	NC_006511	ACGGTG	2	12	28226	28237	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56412297
635	NC_006511	TTG	2	6	28260	28265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412297
636	NC_006511	GCGTC	2	10	28350	28359	0 %	20 %	40 %	40 %	56412297
637	NC_006511	ATC	2	6	28362	28367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412297
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642	NC_006511	GT	3	6	28484	28489	0 %	50 %	50 %	0 %	56412298
643	NC_006511	ATTA	2	8	28517	28524	50 %	50 %	0 %	0 %	56412298
644	NC_006511	A	6	6	28584	28589	100 %	0 %	0 %	0 %	56412298
645	NC_006511	GT	3	6	28613	28618	0 %	50 %	50 %	0 %	56412298
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651	NC_006511	CCG	2	6	28938	28943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412298
652	NC_006511	A	6	6	29111	29116	100 %	0 %	0 %	0 %	56412298
653	NC_006511	ATG	2	6	29277	29282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412298
654	NC_006511	ACA	2	6	29357	29362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412298
655	NC_006511	GAC	2	6	29495	29500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412299
656	NC_006511	AAC	2	6	29623	29628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412299
657	NC_006511	ATG	2	6	29805	29810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412299
658	NC_006511	AAT	2	6	29831	29836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412299
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662	NC_006511	GGC	2	6	30025	30030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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664	NC_006511	CG	3	6	30161	30166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
665	NC_006511	GCA	2	6	30216	30221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
666	NC_006511	GCG	2	6	30228	30233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
667	NC_006511	CG	3	6	30424	30429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
668	NC_006511	GGC	2	6	30443	30448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
669	NC_006511	AT	3	6	30525	30530	50 %	50 %	0 %	0 %	56412300
670	NC_006511	TGCT	2	8	30534	30541	0 %	50 %	25 %	25 %	56412300
671	NC_006511	TATC	2	8	30590	30597	25 %	50 %	0 %	25 %	56412300
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716	NC_006511	GGT	2	6	32457	32462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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733	NC_006511	ATA	2	6	33127	33132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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735	NC_006511	T	6	6	33147	33152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
736	NC_006511	T	6	6	33179	33184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
737	NC_006511	CAT	2	6	33194	33199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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756	NC_006511	TTGG	2	8	33906	33913	0 %	50 %	50 %	0 %	56412304
757	NC_006511	A	6	6	33919	33924	100 %	0 %	0 %	0 %	56412304
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761	NC_006511	TTA	2	6	34052	34057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412304
762	NC_006511	GTT	2	6	34086	34091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412304
763	NC_006511	A	6	6	34093	34098	100 %	0 %	0 %	0 %	56412304
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765	NC_006511	TATAA	2	10	34158	34167	60 %	40 %	0 %	0 %	56412304
766	NC_006511	TAC	2	6	34171	34176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412304
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895	NC_006511	AATT	2	8	40035	40042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
896	NC_006511	AT	3	6	40076	40081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
897	NC_006511	TGAAA	2	10	40114	40123	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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