MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_006511	ATTT	2	8	421788	421795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_006511	GCATC	2	10	421848	421857	20 %	20 %	20 %	40 %	56412608
9003	NC_006511	GC	3	6	421897	421902	0 %	0 %	50 %	50 %	56412608
9004	NC_006511	CGTG	2	8	421905	421912	0 %	25 %	50 %	25 %	56412608
9005	NC_006511	ATT	2	6	421987	421992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412608
9006	NC_006511	CGG	2	6	421998	422003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412608
9007	NC_006511	CAC	2	6	422013	422018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412608
9008	NC_006511	GAA	2	6	422020	422025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412608
9009	NC_006511	CG	4	8	422033	422040	0 %	0 %	50 %	50 %	56412608
9010	NC_006511	GC	3	6	422183	422188	0 %	0 %	50 %	50 %	56412608
9011	NC_006511	GCT	2	6	422232	422237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412608
9012	NC_006511	TCCG	2	8	422277	422284	0 %	25 %	25 %	50 %	56412608
9013	NC_006511	CAT	2	6	422325	422330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412608
9014	NC_006511	GAA	2	6	422338	422343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412608
9015	NC_006511	ATC	2	6	422464	422469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412608
9016	NC_006511	GAC	2	6	422470	422475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412608
9017	NC_006511	GC	3	6	422482	422487	0 %	0 %	50 %	50 %	56412608
9018	NC_006511	CGA	2	6	422505	422510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412608
9019	NC_006511	TC	3	6	422526	422531	0 %	50 %	0 %	50 %	56412608
9020	NC_006511	CGG	2	6	422532	422537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412608
9021	NC_006511	TTC	2	6	422544	422549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412608
9022	NC_006511	TGC	3	9	422561	422569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412608
9023	NC_006511	CG	3	6	422572	422577	0 %	0 %	50 %	50 %	56412608
9024	NC_006511	TCG	2	6	422603	422608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412608
9025	NC_006511	CTG	2	6	422617	422622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412608
9026	NC_006511	CGG	2	6	422693	422698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412608
9027	NC_006511	TGGC	2	8	422720	422727	0 %	25 %	50 %	25 %	56412608
9028	NC_006511	GAAGC	2	10	422740	422749	40 %	0 %	40 %	20 %	56412608
9029	NC_006511	CGA	2	6	422784	422789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412608
9030	NC_006511	TGGC	2	8	422818	422825	0 %	25 %	50 %	25 %	56412608
9031	NC_006511	GCG	2	6	422860	422865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412608
9032	NC_006511	TCA	2	6	422888	422893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412608
9033	NC_006511	CAC	2	6	422899	422904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412608
9034	NC_006511	GGC	2	6	422911	422916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412608
9035	NC_006511	GGGCC	2	10	423040	423049	0 %	0 %	60 %	40 %	56412608
9036	NC_006511	GTGAA	2	10	423068	423077	40 %	20 %	40 %	0 %	56412608
9037	NC_006511	GGT	2	6	423231	423236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412608
9038	NC_006511	CAT	2	6	423324	423329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412608
9039	NC_006511	GTG	2	6	423355	423360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412608
9040	NC_006511	ACC	2	6	423378	423383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412608
9041	NC_006511	TTTA	2	8	423476	423483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_006511	GGC	2	6	423522	423527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412609
9043	NC_006511	GCA	2	6	423563	423568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412609
9044	NC_006511	CA	3	6	423567	423572	50 %	0 %	0 %	50 %	56412609
9045	NC_006511	CGAG	2	8	423594	423601	25 %	0 %	50 %	25 %	56412609
9046	NC_006511	CAA	2	6	423621	423626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412609
9047	NC_006511	T	6	6	423720	423725	0 %	100 %	0 %	0 %	512156988
9048	NC_006511	CAA	2	6	423776	423781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512156988
9049	NC_006511	GGTT	2	8	423791	423798	0 %	50 %	50 %	0 %	512156988
9050	NC_006511	G	7	7	423801	423807	0 %	0 %	100 %	0 %	512156988
9051	NC_006511	GCCT	2	8	423840	423847	0 %	25 %	25 %	50 %	512156988
9052	NC_006511	CCG	2	6	423886	423891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512156988
9053	NC_006511	A	6	6	424006	424011	100 %	0 %	0 %	0 %	512156988
9054	NC_006511	AAG	3	9	424053	424061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512156988
9055	NC_006511	GCT	2	6	424101	424106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512156988
9056	NC_006511	TTG	2	6	424117	424122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512156988
9057	NC_006511	CAA	2	6	424163	424168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512156988
9058	NC_006511	CCATG	2	10	424187	424196	20 %	20 %	20 %	40 %	512156988
9059	NC_006511	GTA	2	6	424199	424204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512156988
9060	NC_006511	GAT	2	6	424235	424240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512156988
9061	NC_006511	TCA	2	6	424264	424269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512156988
9062	NC_006511	TTGCCT	2	12	424303	424314	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	512156988
9063	NC_006511	CTT	2	6	424326	424331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512156988
9064	NC_006511	TGA	2	6	424516	424521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_006511	AAC	2	6	424537	424542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9066	NC_006511	CCTG	2	8	424561	424568	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9067	NC_006511	TTAGGT	2	12	424574	424585	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_006511	GCA	2	6	424694	424699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412610
9069	NC_006511	AGAT	2	8	424716	424723	50 %	25 %	25 %	0 %	56412610
9070	NC_006511	TCTG	2	8	424756	424763	0 %	50 %	25 %	25 %	56412610
9071	NC_006511	GCCAGT	2	12	424831	424842	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56412610
9072	NC_006511	ACG	2	6	424863	424868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412610
9073	NC_006511	CG	3	6	424892	424897	0 %	0 %	50 %	50 %	56412610
9074	NC_006511	TTGC	2	8	424928	424935	0 %	50 %	25 %	25 %	56412610
9075	NC_006511	GCT	2	6	424970	424975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412610
9076	NC_006511	CTGT	2	8	425055	425062	0 %	50 %	25 %	25 %	56412610
9077	NC_006511	T	6	6	425071	425076	0 %	100 %	0 %	0 %	56412610
9078	NC_006511	CCG	2	6	425099	425104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412610
9079	NC_006511	AGA	3	9	425121	425129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412610
9080	NC_006511	TTC	2	6	425176	425181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412610
9081	NC_006511	GGT	2	6	425277	425282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412611
9082	NC_006511	CTT	2	6	425330	425335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412611
9083	NC_006511	CGC	2	6	425388	425393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412611
9084	NC_006511	CCG	2	6	425407	425412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412611
9085	NC_006511	AGT	2	6	425427	425432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412611
9086	NC_006511	CGC	2	6	425471	425476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412611
9087	NC_006511	T	7	7	425516	425522	0 %	100 %	0 %	0 %	56412611
9088	NC_006511	TAT	2	6	425531	425536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412611
9089	NC_006511	ATA	2	6	425566	425571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412611
9090	NC_006511	GCG	2	6	425626	425631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412611
9091	NC_006511	CAAA	2	8	425675	425682	75 %	0 %	0 %	25 %	56412611
9092	NC_006511	T	8	8	425698	425705	0 %	100 %	0 %	0 %	56412611
9093	NC_006511	TCA	2	6	425711	425716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412611
9094	NC_006511	TAA	2	6	425733	425738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_006511	A	7	7	425770	425776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_006511	T	8	8	425805	425812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9097	NC_006511	A	8	8	425818	425825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_006511	ATA	2	6	425837	425842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9099	NC_006511	ATA	2	6	425923	425928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_006511	GTG	2	6	425974	425979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_006511	CTT	2	6	426002	426007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412612
9102	NC_006511	T	6	6	426006	426011	0 %	100 %	0 %	0 %	56412612
9103	NC_006511	TGC	2	6	426022	426027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412612
9104	NC_006511	AGA	2	6	426039	426044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412612
9105	NC_006511	AGA	3	9	426062	426070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412612
9106	NC_006511	TTC	2	6	426199	426204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412612
9107	NC_006511	TAT	2	6	426210	426215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412612
9108	NC_006511	GAA	2	6	426222	426227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412612
9109	NC_006511	TAA	3	9	426354	426362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412613
9110	NC_006511	TAA	2	6	426447	426452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412613
9111	NC_006511	CAT	2	6	426486	426491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9112	NC_006511	CTGT	2	8	426515	426522	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9113	NC_006511	G	6	6	426541	426546	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_006511	CTG	2	6	426549	426554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9115	NC_006511	TA	3	6	426580	426585	50 %	50 %	0 %	0 %	56412614
9116	NC_006511	TGG	2	6	426601	426606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412614
9117	NC_006511	TCCT	2	8	426620	426627	0 %	50 %	0 %	50 %	56412614
9118	NC_006511	TAC	2	6	426635	426640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412614
9119	NC_006511	T	6	6	426695	426700	0 %	100 %	0 %	0 %	56412614
9120	NC_006511	GCA	2	6	426748	426753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412614
9121	NC_006511	TGCT	2	8	426767	426774	0 %	50 %	25 %	25 %	56412614
9122	NC_006511	TCT	2	6	426776	426781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412614
9123	NC_006511	GGC	2	6	426862	426867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412614
9124	NC_006511	C	6	6	426881	426886	0 %	0 %	0 %	100 %	56412614
9125	NC_006511	TGT	2	6	426920	426925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412614
9126	NC_006511	ATT	2	6	426963	426968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412614
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9131	NC_006511	TAT	2	6	427156	427161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412614
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9134	NC_006511	ATA	2	6	427268	427273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412614
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9139	NC_006511	AGTG	2	8	427524	427531	25 %	25 %	50 %	0 %	56412614
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9159	NC_006511	AGC	2	6	428360	428365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412614
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9173	NC_006511	T	6	6	429063	429068	0 %	100 %	0 %	0 %	56412615
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9244	NC_006511	TCG	2	6	432281	432286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412616
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9246	NC_006511	TCAA	2	8	432323	432330	50 %	25 %	0 %	25 %	56412616
9247	NC_006511	CCG	2	6	432345	432350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412616
9248	NC_006511	CGTT	2	8	432365	432372	0 %	50 %	25 %	25 %	56412616
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9250	NC_006511	AT	3	6	432401	432406	50 %	50 %	0 %	0 %	56412616
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