MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_006511	GCGG	2	8	398444	398451	0 %	0 %	75 %	25 %	56412604
8502	NC_006511	CGA	2	6	398464	398469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412604
8503	NC_006511	GGT	2	6	398485	398490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412604
8504	NC_006511	TGT	2	6	398506	398511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412604
8505	NC_006511	GAA	2	6	398545	398550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412604
8506	NC_006511	GAC	2	6	398557	398562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412604
8507	NC_006511	ACC	2	6	398576	398581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412604
8508	NC_006511	AACGGC	2	12	398609	398620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412604
8509	NC_006511	ATG	2	6	398625	398630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412604
8510	NC_006511	TCG	2	6	398673	398678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412604
8511	NC_006511	ACTGGC	2	12	398699	398710	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56412604
8512	NC_006511	CGG	2	6	398797	398802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412604
8513	NC_006511	GCTTT	2	10	398832	398841	0 %	60 %	20 %	20 %	56412604
8514	NC_006511	CG	3	6	398926	398931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8515	NC_006511	ATT	2	6	399157	399162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412605
8516	NC_006511	TGC	2	6	399182	399187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412605
8517	NC_006511	CG	3	6	399230	399235	0 %	0 %	50 %	50 %	56412605
8518	NC_006511	TGCG	2	8	399266	399273	0 %	25 %	50 %	25 %	56412605
8519	NC_006511	CCG	2	6	399313	399318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412605
8520	NC_006511	GCC	2	6	399342	399347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412605
8521	NC_006511	GCC	2	6	399373	399378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412605
8522	NC_006511	CGC	2	6	399389	399394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412605
8523	NC_006511	CGC	2	6	399398	399403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412605
8524	NC_006511	CGGA	2	8	399444	399451	25 %	0 %	50 %	25 %	56412605
8525	NC_006511	AAT	2	6	399529	399534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412605
8526	NC_006511	GCG	2	6	399608	399613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412605
8527	NC_006511	GA	3	6	399656	399661	50 %	0 %	50 %	0 %	56412605
8528	NC_006511	CCG	2	6	399729	399734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412605
8529	NC_006511	GTG	3	9	399859	399867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412605
8530	NC_006511	TCG	2	6	399905	399910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412605
8531	NC_006511	GACG	2	8	399933	399940	25 %	0 %	50 %	25 %	56412605
8532	NC_006511	CAC	2	6	399957	399962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412605
8533	NC_006511	AGCGCC	2	12	400015	400026	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56412605
8534	NC_006511	GCG	2	6	400139	400144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412605
8535	NC_006511	AAC	2	6	400178	400183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412605
8536	NC_006511	TGG	2	6	400184	400189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412605
8537	NC_006511	CGC	2	6	400293	400298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412605
8538	NC_006511	GTCG	2	8	400317	400324	0 %	25 %	50 %	25 %	56412605
8539	NC_006511	GCT	2	6	400347	400352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412605
8540	NC_006511	G	6	6	400540	400545	0 %	0 %	100 %	0 %	56412605
8541	NC_006511	GC	3	6	400596	400601	0 %	0 %	50 %	50 %	56412605
8542	NC_006511	TCG	2	6	400603	400608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412605
8543	NC_006511	GGC	2	6	400723	400728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412605
8544	NC_006511	GCG	2	6	400811	400816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412605
8545	NC_006511	TGG	2	6	400817	400822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412605
8546	NC_006511	GCT	2	6	400848	400853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412605
8547	NC_006511	AGCC	2	8	400863	400870	25 %	0 %	25 %	50 %	56412605
8548	NC_006511	TCAGT	2	10	400881	400890	20 %	40 %	20 %	20 %	56412605
8549	NC_006511	AAC	2	6	400894	400899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412605
8550	NC_006511	GCG	2	6	400946	400951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412605
8551	NC_006511	CCGA	2	8	401035	401042	25 %	0 %	25 %	50 %	56412605
8552	NC_006511	ACT	2	6	401045	401050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412605
8553	NC_006511	GCC	2	6	401056	401061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412605
8554	NC_006511	ACCTG	2	10	401138	401147	20 %	20 %	20 %	40 %	56412605
8555	NC_006511	TGG	2	6	401162	401167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412605
8556	NC_006511	ACG	2	6	401189	401194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412605
8557	NC_006511	TCACCA	2	12	401303	401314	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	56412605
8558	NC_006511	GCG	2	6	401328	401333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412605
8559	NC_006511	GCT	2	6	401481	401486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412605
8560	NC_006511	CCA	2	6	401561	401566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412605
8561	NC_006511	AG	3	6	401688	401693	50 %	0 %	50 %	0 %	56412605
8562	NC_006511	CG	3	6	401708	401713	0 %	0 %	50 %	50 %	56412605
8563	NC_006511	CGG	2	6	401729	401734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412605
8564	NC_006511	GCGG	2	8	401746	401753	0 %	0 %	75 %	25 %	56412605
8565	NC_006511	GCG	2	6	401758	401763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412605
8566	NC_006511	GCG	3	9	401813	401821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412605
8567	NC_006511	TTAA	2	8	401851	401858	50 %	50 %	0 %	0 %	56412605
8568	NC_006511	GTC	2	6	401865	401870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412605
8569	NC_006511	CCA	2	6	401885	401890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412605
8570	NC_006511	GCA	2	6	401933	401938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412605
8571	NC_006511	GCC	2	6	401986	401991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412605
8572	NC_006511	ACG	2	6	402026	402031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412605
8573	NC_006511	GCG	2	6	402035	402040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412605
8574	NC_006511	GTG	2	6	402220	402225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412605
8575	NC_006511	ACC	2	6	402253	402258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412605
8576	NC_006511	CAT	2	6	402294	402299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412605
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8578	NC_006511	GCC	2	6	402364	402369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412605
8579	NC_006511	CGT	2	6	402399	402404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412605
8580	NC_006511	TGC	2	6	402525	402530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412605
8581	NC_006511	AACG	2	8	402547	402554	50 %	0 %	25 %	25 %	56412605
8582	NC_006511	TCCG	2	8	402624	402631	0 %	25 %	25 %	50 %	56412605
8583	NC_006511	ATC	2	6	402700	402705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412605
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8585	NC_006511	ATG	3	9	402785	402793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412605
8586	NC_006511	CGC	2	6	402854	402859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412605
8587	NC_006511	A	6	6	402930	402935	100 %	0 %	0 %	0 %	56412605
8588	NC_006511	CAC	3	9	402960	402968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412605
8589	NC_006511	GCG	2	6	402973	402978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412605
8590	NC_006511	GC	3	6	403030	403035	0 %	0 %	50 %	50 %	56412605
8591	NC_006511	GCA	2	6	403058	403063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412605
8592	NC_006511	ATG	2	6	403069	403074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412605
8593	NC_006511	GCC	2	6	403080	403085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412605
8594	NC_006511	CTA	2	6	403107	403112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412605
8595	NC_006511	ACGGC	2	10	403148	403157	20 %	0 %	40 %	40 %	56412605
8596	NC_006511	GGT	2	6	403251	403256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412605
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8598	NC_006511	AAT	2	6	403432	403437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412605
8599	NC_006511	CGAC	2	8	403535	403542	25 %	0 %	25 %	50 %	56412605
8600	NC_006511	GAA	2	6	403560	403565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412605
8601	NC_006511	TGG	2	6	403567	403572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412605
8602	NC_006511	CTG	2	6	403585	403590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412605
8603	NC_006511	AT	3	6	403614	403619	50 %	50 %	0 %	0 %	56412605
8604	NC_006511	CT	3	6	403717	403722	0 %	50 %	0 %	50 %	56412605
8605	NC_006511	CGG	2	6	403748	403753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412605
8606	NC_006511	A	6	6	403762	403767	100 %	0 %	0 %	0 %	56412605
8607	NC_006511	AACG	2	8	403797	403804	50 %	0 %	25 %	25 %	56412605
8608	NC_006511	CG	3	6	403844	403849	0 %	0 %	50 %	50 %	56412605
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8610	NC_006511	AAC	2	6	403888	403893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412605
8611	NC_006511	AT	3	6	403965	403970	50 %	50 %	0 %	0 %	56412605
8612	NC_006511	ATA	2	6	404021	404026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412605
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8621	NC_006511	GCCT	2	8	404509	404516	0 %	25 %	25 %	50 %	56412605
8622	NC_006511	GATG	2	8	404565	404572	25 %	25 %	50 %	0 %	56412605
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