MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_006511	CA	3	6	305877	305882	50 %	0 %	0 %	50 %	56412527
6502	NC_006511	GCA	2	6	305898	305903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412527
6503	NC_006511	GCG	2	6	305917	305922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412527
6504	NC_006511	GC	4	8	305957	305964	0 %	0 %	50 %	50 %	56412527
6505	NC_006511	CAGC	2	8	306094	306101	25 %	0 %	25 %	50 %	56412528
6506	NC_006511	TCG	2	6	306171	306176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412528
6507	NC_006511	TGC	2	6	306180	306185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412528
6508	NC_006511	TCT	2	6	306260	306265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412528
6509	NC_006511	CAC	2	6	306331	306336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412528
6510	NC_006511	AAC	2	6	306401	306406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412528
6511	NC_006511	TCG	2	6	306449	306454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412528
6512	NC_006511	CG	3	6	306535	306540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6513	NC_006511	GAG	2	6	306569	306574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_006511	ACA	2	6	306585	306590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_006511	CGCTG	2	10	306687	306696	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6516	NC_006511	A	6	6	306723	306728	100 %	0 %	0 %	0 %	56412529
6517	NC_006511	CAAAGT	2	12	306738	306749	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56412529
6518	NC_006511	ATGT	2	8	306751	306758	25 %	50 %	25 %	0 %	56412529
6519	NC_006511	TGA	3	9	306765	306773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412529
6520	NC_006511	GCC	2	6	306818	306823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412529
6521	NC_006511	CGCCC	2	10	306853	306862	0 %	0 %	20 %	80 %	56412529
6522	NC_006511	TGA	2	6	306864	306869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412529
6523	NC_006511	AAT	2	6	306874	306879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412529
6524	NC_006511	CG	3	6	306928	306933	0 %	0 %	50 %	50 %	56412529
6525	NC_006511	TGG	2	6	306966	306971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412529
6526	NC_006511	CG	3	6	307031	307036	0 %	0 %	50 %	50 %	56412529
6527	NC_006511	TGCC	2	8	307050	307057	0 %	25 %	25 %	50 %	56412529
6528	NC_006511	GC	3	6	307092	307097	0 %	0 %	50 %	50 %	56412529
6529	NC_006511	CGC	2	6	307118	307123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412529
6530	NC_006511	GCGCT	2	10	307135	307144	0 %	20 %	40 %	40 %	56412529
6531	NC_006511	GGC	2	6	307149	307154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412529
6532	NC_006511	TGG	2	6	307175	307180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412529
6533	NC_006511	CAC	2	6	307216	307221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412529
6534	NC_006511	GT	3	6	307228	307233	0 %	50 %	50 %	0 %	56412529
6535	NC_006511	GGC	2	6	307284	307289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412529
6536	NC_006511	ATG	2	6	307348	307353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412529
6537	NC_006511	GC	3	6	307361	307366	0 %	0 %	50 %	50 %	56412529
6538	NC_006511	GTG	2	6	307384	307389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412529
6539	NC_006511	GCG	2	6	307399	307404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412529
6540	NC_006511	CGGCG	2	10	307416	307425	0 %	0 %	60 %	40 %	56412529
6541	NC_006511	GGCGG	2	10	307441	307450	0 %	0 %	80 %	20 %	56412529
6542	NC_006511	TTG	2	6	307481	307486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412529
6543	NC_006511	GAT	2	6	307495	307500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412529
6544	NC_006511	GTG	2	6	307522	307527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412529
6545	NC_006511	ACG	2	6	307528	307533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412529
6546	NC_006511	GCG	2	6	307624	307629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412529
6547	NC_006511	CG	3	6	307628	307633	0 %	0 %	50 %	50 %	56412529
6548	NC_006511	CGA	2	6	307638	307643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412529
6549	NC_006511	TGC	2	6	307709	307714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412529
6550	NC_006511	GTG	2	6	307722	307727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412529
6551	NC_006511	CG	3	6	307769	307774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6552	NC_006511	ATG	2	6	307783	307788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_006511	GCC	2	6	307852	307857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6554	NC_006511	GTT	2	6	307915	307920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412530
6555	NC_006511	A	6	6	307958	307963	100 %	0 %	0 %	0 %	56412530
6556	NC_006511	AG	3	6	307976	307981	50 %	0 %	50 %	0 %	56412530
6557	NC_006511	TGG	2	6	308010	308015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412530
6558	NC_006511	AAT	2	6	308027	308032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412530
6559	NC_006511	TCT	2	6	308041	308046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412530
6560	NC_006511	CAG	2	6	308063	308068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412530
6561	NC_006511	GCCTG	2	10	308154	308163	0 %	20 %	40 %	40 %	56412530
6562	NC_006511	CGG	2	6	308291	308296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412530
6563	NC_006511	CAC	2	6	308375	308380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412530
6564	NC_006511	GCG	2	6	308431	308436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412530
6565	NC_006511	TCA	2	6	308511	308516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412530
6566	NC_006511	CTT	2	6	308592	308597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_006511	TA	4	8	308782	308789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_006511	CAA	2	6	308798	308803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_006511	CCGA	2	8	308831	308838	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6570	NC_006511	AAT	2	6	308844	308849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_006511	GAC	2	6	308906	308911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412531
6572	NC_006511	CTG	2	6	308912	308917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412531
6573	NC_006511	GCT	2	6	308929	308934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412531
6574	NC_006511	GC	3	6	308954	308959	0 %	0 %	50 %	50 %	56412531
6575	NC_006511	AACGTT	2	12	309089	309100	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56412531
6576	NC_006511	CGT	2	6	309104	309109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412531
6577	NC_006511	CAG	2	6	309209	309214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412531
6578	NC_006511	TAA	2	6	309265	309270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_006511	A	6	6	309320	309325	100 %	0 %	0 %	0 %	56412532
6580	NC_006511	CAG	2	6	309345	309350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412532
6581	NC_006511	AC	3	6	309426	309431	50 %	0 %	0 %	50 %	56412532
6582	NC_006511	AAT	2	6	309540	309545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412532
6583	NC_006511	CCG	2	6	309614	309619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412532
6584	NC_006511	TGG	2	6	309626	309631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412532
6585	NC_006511	GCCA	2	8	309643	309650	25 %	0 %	25 %	50 %	56412532
6586	NC_006511	CCCA	2	8	309667	309674	25 %	0 %	0 %	75 %	56412532
6587	NC_006511	ATGA	2	8	309684	309691	50 %	25 %	25 %	0 %	56412532
6588	NC_006511	CAG	2	6	309735	309740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412532
6589	NC_006511	TGC	2	6	309810	309815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412532
6590	NC_006511	A	7	7	309950	309956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_006511	T	6	6	309963	309968	0 %	100 %	0 %	0 %	56412533
6592	NC_006511	TGG	2	6	309997	310002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412533
6593	NC_006511	TTA	2	6	310021	310026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412533
6594	NC_006511	TGC	2	6	310080	310085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412533
6595	NC_006511	CGG	2	6	310268	310273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412533
6596	NC_006511	T	6	6	310435	310440	0 %	100 %	0 %	0 %	56412533
6597	NC_006511	ATG	2	6	310453	310458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412533
6598	NC_006511	GCA	2	6	310472	310477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412533
6599	NC_006511	CGCTGG	2	12	310492	310503	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56412533
6600	NC_006511	TCA	3	9	310567	310575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412533
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6602	NC_006511	GCT	2	6	310689	310694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412533
6603	NC_006511	GC	3	6	310774	310779	0 %	0 %	50 %	50 %	56412533
6604	NC_006511	CAT	2	6	310809	310814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412533
6605	NC_006511	A	7	7	310887	310893	100 %	0 %	0 %	0 %	56412533
6606	NC_006511	ATT	3	9	310915	310923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412534
6607	NC_006511	GCG	2	6	310967	310972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412534
6608	NC_006511	T	6	6	310983	310988	0 %	100 %	0 %	0 %	56412534
6609	NC_006511	CG	3	6	311011	311016	0 %	0 %	50 %	50 %	56412534
6610	NC_006511	T	6	6	311036	311041	0 %	100 %	0 %	0 %	56412534
6611	NC_006511	T	6	6	311066	311071	0 %	100 %	0 %	0 %	56412534
6612	NC_006511	TCA	2	6	311124	311129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412534
6613	NC_006511	CG	3	6	311134	311139	0 %	0 %	50 %	50 %	56412534
6614	NC_006511	CAG	2	6	311174	311179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412534
6615	NC_006511	GTCG	2	8	311339	311346	0 %	25 %	50 %	25 %	56412534
6616	NC_006511	TTG	2	6	311433	311438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412534
6617	NC_006511	GTA	2	6	311576	311581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412534
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6619	NC_006511	ATCGC	2	10	311670	311679	20 %	20 %	20 %	40 %	56412534
6620	NC_006511	GTTT	2	8	311706	311713	0 %	75 %	25 %	0 %	56412534
6621	NC_006511	TCT	2	6	311826	311831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412534
6622	NC_006511	TA	3	6	311834	311839	50 %	50 %	0 %	0 %	56412534
6623	NC_006511	GCA	2	6	311842	311847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412534
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6997	NC_006511	GAC	2	6	330205	330210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412554
6998	NC_006511	GGT	2	6	330315	330320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412554
6999	NC_006511	GATGC	2	10	330322	330331	20 %	20 %	40 %	20 %	56412554
7000	NC_006511	GGT	2	6	330349	330354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412554

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