MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_006511	T	6	6	280149	280154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_006511	CAT	2	6	280171	280176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412507
6003	NC_006511	TAT	2	6	280202	280207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412507
6004	NC_006511	TTG	2	6	280289	280294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412507
6005	NC_006511	GCG	2	6	280323	280328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412507
6006	NC_006511	CT	3	6	280398	280403	0 %	50 %	0 %	50 %	56412507
6007	NC_006511	T	6	6	280469	280474	0 %	100 %	0 %	0 %	56412507
6008	NC_006511	GCTG	2	8	280489	280496	0 %	25 %	50 %	25 %	56412507
6009	NC_006511	TCA	2	6	280516	280521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412507
6010	NC_006511	ATA	2	6	280542	280547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412507
6011	NC_006511	CGC	2	6	280551	280556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412507
6012	NC_006511	AAG	2	6	280587	280592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412507
6013	NC_006511	T	6	6	280673	280678	0 %	100 %	0 %	0 %	56412507
6014	NC_006511	GGC	2	6	280679	280684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412507
6015	NC_006511	GCT	2	6	280732	280737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412507
6016	NC_006511	GTAT	2	8	280848	280855	25 %	50 %	25 %	0 %	56412507
6017	NC_006511	TGA	3	9	280920	280928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412507
6018	NC_006511	CT	3	6	280941	280946	0 %	50 %	0 %	50 %	56412507
6019	NC_006511	CGG	2	6	280981	280986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412507
6020	NC_006511	CTG	2	6	281096	281101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412507
6021	NC_006511	GCG	2	6	281214	281219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412507
6022	NC_006511	GGC	2	6	281272	281277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412507
6023	NC_006511	ATG	2	6	281345	281350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412507
6024	NC_006511	CGG	2	6	281400	281405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412507
6025	NC_006511	TGC	2	6	281409	281414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412507
6026	NC_006511	GATT	2	8	281433	281440	25 %	50 %	25 %	0 %	56412507
6027	NC_006511	AAG	2	6	281475	281480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412507
6028	NC_006511	TGA	2	6	281542	281547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412507
6029	NC_006511	CCGATG	2	12	281595	281606	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56412507
6030	NC_006511	GATG	2	8	281656	281663	25 %	25 %	50 %	0 %	56412507
6031	NC_006511	CGC	2	6	281695	281700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412507
6032	NC_006511	TGG	2	6	281703	281708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412507
6033	NC_006511	GTG	3	9	281732	281740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412507
6034	NC_006511	A	6	6	281742	281747	100 %	0 %	0 %	0 %	56412507
6035	NC_006511	CTG	2	6	281762	281767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412507
6036	NC_006511	GCT	2	6	281809	281814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412507
6037	NC_006511	GAT	2	6	282010	282015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412507
6038	NC_006511	CTG	2	6	282191	282196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412507
6039	NC_006511	TGCTC	2	10	282198	282207	0 %	40 %	20 %	40 %	56412507
6040	NC_006511	TCA	2	6	282383	282388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412508
6041	NC_006511	TCCCT	2	10	282545	282554	0 %	40 %	0 %	60 %	56412508
6042	NC_006511	T	6	6	282704	282709	0 %	100 %	0 %	0 %	56412508
6043	NC_006511	CT	3	6	282845	282850	0 %	50 %	0 %	50 %	56412509
6044	NC_006511	GCG	2	6	282876	282881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412509
6045	NC_006511	TCA	2	6	282964	282969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412509
6046	NC_006511	GC	3	6	283103	283108	0 %	0 %	50 %	50 %	56412509
6047	NC_006511	GCA	2	6	283159	283164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412509
6048	NC_006511	CTG	2	6	283190	283195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412509
6049	NC_006511	CCGG	2	8	283217	283224	0 %	0 %	50 %	50 %	56412509
6050	NC_006511	CTT	2	6	283268	283273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412509
6051	NC_006511	GA	3	6	283285	283290	50 %	0 %	50 %	0 %	56412509
6052	NC_006511	T	6	6	283381	283386	0 %	100 %	0 %	0 %	56412509
6053	NC_006511	GC	4	8	283393	283400	0 %	0 %	50 %	50 %	56412509
6054	NC_006511	GCG	2	6	283414	283419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412509
6055	NC_006511	GCG	2	6	283436	283441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412509
6056	NC_006511	GCT	2	6	283480	283485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412509
6057	NC_006511	CGG	2	6	283524	283529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412509
6058	NC_006511	CT	3	6	283544	283549	0 %	50 %	0 %	50 %	56412509
6059	NC_006511	TTGATG	2	12	283553	283564	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	56412509
6060	NC_006511	CGG	2	6	283574	283579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412509
6061	NC_006511	GCTG	2	8	283596	283603	0 %	25 %	50 %	25 %	56412509
6062	NC_006511	TGGCGC	2	12	283662	283673	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56412509
6063	NC_006511	CGA	2	6	283675	283680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412509
6064	NC_006511	TGG	2	6	283739	283744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412509
6065	NC_006511	ACA	2	6	283762	283767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412509
6066	NC_006511	ACG	2	6	283772	283777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412509
6067	NC_006511	GTC	2	6	283778	283783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412509
6068	NC_006511	CTGC	2	8	283811	283818	0 %	25 %	25 %	50 %	56412509
6069	NC_006511	GGC	2	6	283847	283852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412509
6070	NC_006511	GAA	2	6	283874	283879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412509
6071	NC_006511	CGA	2	6	283985	283990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412509
6072	NC_006511	GTT	3	9	284002	284010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412509
6073	NC_006511	AGC	2	6	284062	284067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412509
6074	NC_006511	AGA	2	6	284068	284073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412509
6075	NC_006511	AAG	2	6	284076	284081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412509
6076	NC_006511	GCGCT	2	10	284110	284119	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6077	NC_006511	CAC	2	6	284167	284172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6078	NC_006511	CAA	2	6	284180	284185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_006511	T	6	6	284351	284356	0 %	100 %	0 %	0 %	56412510
6080	NC_006511	ATG	2	6	284377	284382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412510
6081	NC_006511	TCAT	2	8	284438	284445	25 %	50 %	0 %	25 %	56412510
6082	NC_006511	GCA	2	6	284475	284480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412511
6083	NC_006511	GCC	2	6	284523	284528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412511
6084	NC_006511	CCT	2	6	284643	284648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56412511
6085	NC_006511	CGT	2	6	284865	284870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412512
6086	NC_006511	ATG	2	6	284953	284958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412512
6087	NC_006511	TGA	2	6	284988	284993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412512
6088	NC_006511	ATC	2	6	285056	285061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412512
6089	NC_006511	GCGA	2	8	285130	285137	25 %	0 %	50 %	25 %	56412512
6090	NC_006511	GCG	2	6	285166	285171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412512
6091	NC_006511	TGG	2	6	285178	285183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412512
6092	NC_006511	CAG	2	6	285184	285189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412512
6093	NC_006511	GC	3	6	285203	285208	0 %	0 %	50 %	50 %	56412512
6094	NC_006511	CGA	2	6	285296	285301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412512
6095	NC_006511	AAT	2	6	285337	285342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412512
6096	NC_006511	CG	3	6	285438	285443	0 %	0 %	50 %	50 %	56412513
6097	NC_006511	GGT	2	6	285453	285458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412513
6098	NC_006511	TAT	2	6	285528	285533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412513
6099	NC_006511	GCCA	2	8	285552	285559	25 %	0 %	25 %	50 %	56412513
6100	NC_006511	GAT	2	6	285573	285578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412513
6101	NC_006511	TCATTA	2	12	285583	285594	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	56412513
6102	NC_006511	CGC	2	6	285726	285731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412513
6103	NC_006511	TCT	2	6	285753	285758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412513
6104	NC_006511	TCG	2	6	285782	285787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412513
6105	NC_006511	TAA	2	6	285894	285899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412514
6106	NC_006511	GGC	2	6	285933	285938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412514
6107	NC_006511	GCA	2	6	285954	285959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412514
6108	NC_006511	GCG	2	6	285968	285973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412514
6109	NC_006511	TGC	2	6	285974	285979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412514
6110	NC_006511	TGA	2	6	286040	286045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412514
6111	NC_006511	GAA	2	6	286069	286074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412514
6112	NC_006511	CGG	2	6	286112	286117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412514
6113	NC_006511	TAT	2	6	286156	286161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412514
6114	NC_006511	CG	3	6	286162	286167	0 %	0 %	50 %	50 %	56412514
6115	NC_006511	GTAT	3	12	286283	286294	25 %	50 %	25 %	0 %	56412514
6116	NC_006511	GCG	2	6	286306	286311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412514
6117	NC_006511	GGC	2	6	286383	286388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412514
6118	NC_006511	TGC	2	6	286412	286417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412514
6119	NC_006511	CACT	2	8	286524	286531	25 %	25 %	0 %	50 %	56412514
6120	NC_006511	CAA	2	6	286593	286598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_006511	ACG	2	6	286676	286681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412515
6122	NC_006511	TCG	2	6	286698	286703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412515
6123	NC_006511	GC	4	8	286819	286826	0 %	0 %	50 %	50 %	56412515
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6132	NC_006511	CGC	2	6	287425	287430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412515
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6152	NC_006511	GTT	2	6	288137	288142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412515
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6154	NC_006511	T	6	6	288170	288175	0 %	100 %	0 %	0 %	56412515
6155	NC_006511	TA	3	6	288205	288210	50 %	50 %	0 %	0 %	56412515
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6162	NC_006511	CGT	2	6	288619	288624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412516
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6239	NC_006511	GGCA	2	8	292105	292112	25 %	0 %	50 %	25 %	56412520
6240	NC_006511	GC	3	6	292147	292152	0 %	0 %	50 %	50 %	56412520
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6242	NC_006511	TAT	2	6	292203	292208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6243	NC_006511	AATGA	2	10	292212	292221	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6244	NC_006511	ATCA	2	8	292296	292303	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6245	NC_006511	CTG	2	6	292331	292336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6246	NC_006511	A	8	8	292509	292516	100 %	0 %	0 %	0 %	56412521
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6248	NC_006511	CG	4	8	292557	292564	0 %	0 %	50 %	50 %	56412521
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6375	NC_006511	TTTA	2	8	299398	299405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6376	NC_006511	CAA	2	6	299460	299465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6377	NC_006511	ATT	2	6	299485	299490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412523
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6380	NC_006511	GCTC	2	8	299609	299616	0 %	25 %	25 %	50 %	56412523
6381	NC_006511	TCT	2	6	299630	299635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412523
6382	NC_006511	ACT	2	6	299653	299658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412523
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6384	NC_006511	T	6	6	299694	299699	0 %	100 %	0 %	0 %	56412523
6385	NC_006511	GGT	2	6	299713	299718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412523
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6409	NC_006511	GA	3	6	301060	301065	50 %	0 %	50 %	0 %	56412524
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6412	NC_006511	GGC	2	6	301186	301191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412525
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6433	NC_006511	ACTG	2	8	302427	302434	25 %	25 %	25 %	25 %	56412525
6434	NC_006511	GTT	2	6	302461	302466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412525
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6438	NC_006511	GAC	2	6	302546	302551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6439	NC_006511	AAT	2	6	302562	302567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6442	NC_006511	AACCC	2	10	302806	302815	40 %	0 %	0 %	60 %	56412526
6443	NC_006511	CG	4	8	302876	302883	0 %	0 %	50 %	50 %	56412526
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6446	NC_006511	CCAC	2	8	303118	303125	25 %	0 %	0 %	75 %	56412526
6447	NC_006511	TGG	2	6	303135	303140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412526
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6466	NC_006511	GCAG	2	8	304300	304307	25 %	0 %	50 %	25 %	56412526
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6472	NC_006511	GCA	2	6	304477	304482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412526
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6483	NC_006511	TTC	2	6	304946	304951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412526
6484	NC_006511	GGCCA	2	10	305091	305100	20 %	0 %	40 %	40 %	56412526
6485	NC_006511	GGCG	2	8	305123	305130	0 %	0 %	75 %	25 %	56412526
6486	NC_006511	CCGC	2	8	305157	305164	0 %	0 %	25 %	75 %	56412526
6487	NC_006511	CAA	2	6	305165	305170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412526
6488	NC_006511	CAT	2	6	305177	305182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412526
6489	NC_006511	CG	3	6	305192	305197	0 %	0 %	50 %	50 %	56412526
6490	NC_006511	CGAT	2	8	305227	305234	25 %	25 %	25 %	25 %	56412526
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6496	NC_006511	CGG	2	6	305625	305630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412527
6497	NC_006511	CG	3	6	305649	305654	0 %	0 %	50 %	50 %	56412527
6498	NC_006511	GCG	2	6	305730	305735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412527
6499	NC_006511	CGC	2	6	305758	305763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412527
6500	NC_006511	GCCG	2	8	305790	305797	0 %	0 %	50 %	50 %	56412527

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