MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_006511	ACGC	2	8	255168	255175	25 %	0 %	25 %	50 %	56412487
5502	NC_006511	GCA	2	6	255245	255250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412487
5503	NC_006511	TGAC	2	8	255404	255411	25 %	25 %	25 %	25 %	56412487
5504	NC_006511	CAG	2	6	255414	255419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412487
5505	NC_006511	CCAG	2	8	255431	255438	25 %	0 %	25 %	50 %	56412487
5506	NC_006511	GC	3	6	255500	255505	0 %	0 %	50 %	50 %	56412487
5507	NC_006511	CGC	3	9	255521	255529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412487
5508	NC_006511	GCG	2	6	255556	255561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412487
5509	NC_006511	TCT	2	6	255631	255636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412487
5510	NC_006511	GT	3	6	255673	255678	0 %	50 %	50 %	0 %	56412487
5511	NC_006511	CGA	2	6	255722	255727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412487
5512	NC_006511	GCA	2	6	255779	255784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412487
5513	NC_006511	GC	3	6	255834	255839	0 %	0 %	50 %	50 %	56412487
5514	NC_006511	GGC	2	6	255872	255877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412487
5515	NC_006511	CGT	2	6	255900	255905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412487
5516	NC_006511	CAT	2	6	255939	255944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412487
5517	NC_006511	GTC	2	6	255990	255995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412487
5518	NC_006511	GCAG	2	8	256060	256067	25 %	0 %	50 %	25 %	56412487
5519	NC_006511	AGC	2	6	256096	256101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412487
5520	NC_006511	AGT	2	6	256139	256144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412487
5521	NC_006511	TCA	2	6	256148	256153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412487
5522	NC_006511	CGC	2	6	256178	256183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412487
5523	NC_006511	CAG	2	6	256224	256229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412487
5524	NC_006511	ACC	2	6	256249	256254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412487
5525	NC_006511	CG	3	6	256308	256313	0 %	0 %	50 %	50 %	56412487
5526	NC_006511	CCA	2	6	256340	256345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412487
5527	NC_006511	CGAG	2	8	256352	256359	25 %	0 %	50 %	25 %	56412487
5528	NC_006511	GCC	2	6	256413	256418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412487
5529	NC_006511	GCT	2	6	256422	256427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412487
5530	NC_006511	TGG	2	6	256471	256476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412487
5531	NC_006511	GGC	2	6	256500	256505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412487
5532	NC_006511	CAG	2	6	256584	256589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412487
5533	NC_006511	TTG	2	6	256607	256612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412487
5534	NC_006511	CAGA	2	8	256625	256632	50 %	0 %	25 %	25 %	56412487
5535	NC_006511	CAG	2	6	256638	256643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412487
5536	NC_006511	CGTA	2	8	256656	256663	25 %	25 %	25 %	25 %	56412487
5537	NC_006511	AAAGT	2	10	256694	256703	60 %	20 %	20 %	0 %	56412487
5538	NC_006511	CAG	2	6	256704	256709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412487
5539	NC_006511	CGC	2	6	256793	256798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412487
5540	NC_006511	GCC	2	6	256806	256811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412487
5541	NC_006511	CAA	2	6	256872	256877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412487
5542	NC_006511	TTCGG	2	10	256890	256899	0 %	40 %	40 %	20 %	56412487
5543	NC_006511	CCAG	2	8	256946	256953	25 %	0 %	25 %	50 %	56412487
5544	NC_006511	GC	3	6	257002	257007	0 %	0 %	50 %	50 %	56412487
5545	NC_006511	AGGG	2	8	257037	257044	25 %	0 %	75 %	0 %	56412487
5546	NC_006511	TGG	2	6	257113	257118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_006511	AGT	2	6	257144	257149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_006511	ATT	2	6	257199	257204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412488
5549	NC_006511	CGT	2	6	257205	257210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412488
5550	NC_006511	GT	3	6	257209	257214	0 %	50 %	50 %	0 %	56412488
5551	NC_006511	GAT	2	6	257215	257220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412488
5552	NC_006511	ACG	2	6	257414	257419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412488
5553	NC_006511	CCA	2	6	257420	257425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412488
5554	NC_006511	CAT	2	6	257433	257438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412488
5555	NC_006511	GCA	2	6	257442	257447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412488
5556	NC_006511	TTC	2	6	257455	257460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412488
5557	NC_006511	CCTTCG	2	12	257513	257524	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	56412488
5558	NC_006511	GGC	2	6	257539	257544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412488
5559	NC_006511	CT	3	6	257600	257605	0 %	50 %	0 %	50 %	56412488
5560	NC_006511	CGA	2	6	257649	257654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412488
5561	NC_006511	CAC	2	6	257764	257769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412488
5562	NC_006511	AGGC	2	8	257816	257823	25 %	0 %	50 %	25 %	56412488
5563	NC_006511	GTT	2	6	257835	257840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412488
5564	NC_006511	GGT	2	6	257881	257886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412488
5565	NC_006511	T	6	6	257955	257960	0 %	100 %	0 %	0 %	56412488
5566	NC_006511	GAT	2	6	258015	258020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_006511	AAT	2	6	258027	258032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_006511	TCAG	2	8	258055	258062	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5569	NC_006511	T	6	6	258131	258136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_006511	GCC	2	6	258184	258189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_006511	CAA	2	6	258233	258238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_006511	GC	3	6	258272	258277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5573	NC_006511	AC	3	6	258303	258308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5574	NC_006511	AAC	2	6	258341	258346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_006511	AC	4	8	258345	258352	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5576	NC_006511	GC	3	6	258542	258547	0 %	0 %	50 %	50 %	56412489
5577	NC_006511	CAT	2	6	258561	258566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412489
5578	NC_006511	CTGAA	2	10	258608	258617	40 %	20 %	20 %	20 %	56412489
5579	NC_006511	AAGCG	2	10	258672	258681	40 %	0 %	40 %	20 %	56412489
5580	NC_006511	GCT	2	6	258691	258696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412489
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5582	NC_006511	GCTG	2	8	258728	258735	0 %	25 %	50 %	25 %	56412489
5583	NC_006511	AAGA	2	8	258835	258842	75 %	0 %	25 %	0 %	56412489
5584	NC_006511	AAC	2	6	258973	258978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412489
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5587	NC_006511	GGC	2	6	259212	259217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_006511	GTA	2	6	259325	259330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_006511	ATG	2	6	259485	259490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412490
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5591	NC_006511	CTGA	2	8	259506	259513	25 %	25 %	25 %	25 %	56412490
5592	NC_006511	AGC	2	6	259571	259576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412490
5593	NC_006511	A	6	6	259578	259583	100 %	0 %	0 %	0 %	56412490
5594	NC_006511	GCT	2	6	259596	259601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412490
5595	NC_006511	GACT	2	8	259664	259671	25 %	25 %	25 %	25 %	56412490
5596	NC_006511	GAA	2	6	259773	259778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412490
5597	NC_006511	TCG	2	6	259823	259828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412490
5598	NC_006511	GC	3	6	259875	259880	0 %	0 %	50 %	50 %	56412490
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5600	NC_006511	GAAA	2	8	260051	260058	75 %	0 %	25 %	0 %	56412490
5601	NC_006511	GAA	2	6	260087	260092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412490
5602	NC_006511	CTG	2	6	260160	260165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412490
5603	NC_006511	GACT	2	8	260234	260241	25 %	25 %	25 %	25 %	56412490
5604	NC_006511	GCA	2	6	260244	260249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412490
5605	NC_006511	TGC	2	6	260255	260260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412490
5606	NC_006511	GAG	2	6	260287	260292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_006511	CTT	2	6	260307	260312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_006511	CT	3	6	260320	260325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5609	NC_006511	GAAA	2	8	260415	260422	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_006511	GCG	2	6	260473	260478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412491
5611	NC_006511	TGGTG	2	10	260576	260585	0 %	40 %	60 %	0 %	56412491
5612	NC_006511	GGT	2	6	260592	260597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412491
5613	NC_006511	CGCC	2	8	260726	260733	0 %	0 %	25 %	75 %	56412491
5614	NC_006511	CTG	2	6	260796	260801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412491
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5616	NC_006511	TCTG	2	8	260822	260829	0 %	50 %	25 %	25 %	56412491
5617	NC_006511	TTC	2	6	260847	260852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412491
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5620	NC_006511	CGT	2	6	261102	261107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412491
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5624	NC_006511	TTA	2	6	261198	261203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5626	NC_006511	GTCTG	2	10	261257	261266	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5751	NC_006511	TGT	2	6	267766	267771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412497
5752	NC_006511	GCG	2	6	267834	267839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412497
5753	NC_006511	CAG	2	6	267860	267865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412497
5754	NC_006511	GGT	2	6	267983	267988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412497
5755	NC_006511	TCT	2	6	267993	267998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412497
5756	NC_006511	GAT	2	6	268016	268021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412497
5757	NC_006511	CAA	2	6	268042	268047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412497
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5763	NC_006511	TAC	2	6	268334	268339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412497
5764	NC_006511	GTGG	2	8	268390	268397	0 %	25 %	75 %	0 %	56412497
5765	NC_006511	GGC	2	6	268436	268441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412497
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5784	NC_006511	TGG	2	6	269465	269470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412498
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5793	NC_006511	A	6	6	269979	269984	100 %	0 %	0 %	0 %	56412499
5794	NC_006511	TCCAG	2	10	270065	270074	20 %	20 %	20 %	40 %	56412499
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5875	NC_006511	CGG	2	6	274089	274094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412504
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5877	NC_006511	TGC	2	6	274242	274247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412504
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5935	NC_006511	TGA	2	6	276972	276977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412504
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5946	NC_006511	TGA	2	6	277476	277481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412505
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5969	NC_006511	A	6	6	278337	278342	100 %	0 %	0 %	0 %	56412506
5970	NC_006511	GCCGC	2	10	278399	278408	0 %	0 %	40 %	60 %	56412506
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5993	NC_006511	GCCGG	2	10	279629	279638	0 %	0 %	60 %	40 %	56412506
5994	NC_006511	CGAC	2	8	279687	279694	25 %	0 %	25 %	50 %	56412506
5995	NC_006511	GCC	2	6	279884	279889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412506
5996	NC_006511	ACC	2	6	279911	279916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412506
5997	NC_006511	CCTG	2	8	279923	279930	0 %	25 %	25 %	50 %	56412506
5998	NC_006511	AGC	3	9	279932	279940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412506
5999	NC_006511	GCCT	2	8	280030	280037	0 %	25 %	25 %	50 %	56412506
6000	NC_006511	TAA	2	6	280088	280093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412506

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