MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 96712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_006511	CGC	2	6	209899	209904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412451
4502	NC_006511	GCC	2	6	209941	209946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412451
4503	NC_006511	T	6	6	210074	210079	0 %	100 %	0 %	0 %	56412451
4504	NC_006511	ACG	2	6	210092	210097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412451
4505	NC_006511	ATG	2	6	210340	210345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412452
4506	NC_006511	CCAGA	2	10	210387	210396	40 %	0 %	20 %	40 %	56412452
4507	NC_006511	CGG	2	6	210407	210412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412452
4508	NC_006511	TAA	2	6	210419	210424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412452
4509	NC_006511	GC	4	8	210448	210455	0 %	0 %	50 %	50 %	56412452
4510	NC_006511	TA	3	6	210468	210473	50 %	50 %	0 %	0 %	56412452
4511	NC_006511	TTG	2	6	210509	210514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412452
4512	NC_006511	TTGA	2	8	210535	210542	25 %	50 %	25 %	0 %	56412452
4513	NC_006511	CAA	2	6	210575	210580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412452
4514	NC_006511	CAT	2	6	210620	210625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412452
4515	NC_006511	CAC	2	6	210638	210643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412452
4516	NC_006511	ACC	2	6	210687	210692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412452
4517	NC_006511	CGT	2	6	210711	210716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412452
4518	NC_006511	GC	3	6	210770	210775	0 %	0 %	50 %	50 %	56412452
4519	NC_006511	CTTT	2	8	210959	210966	0 %	75 %	0 %	25 %	56412453
4520	NC_006511	CAC	2	6	210979	210984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412453
4521	NC_006511	CGC	2	6	211008	211013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412453
4522	NC_006511	GGCCT	2	10	211030	211039	0 %	20 %	40 %	40 %	56412453
4523	NC_006511	CGGTA	2	10	211180	211189	20 %	20 %	40 %	20 %	56412453
4524	NC_006511	GCT	3	9	211309	211317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412453
4525	NC_006511	CGC	2	6	211341	211346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412453
4526	NC_006511	TGC	2	6	211383	211388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412453
4527	NC_006511	CGC	2	6	211404	211409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412453
4528	NC_006511	GCA	2	6	211416	211421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412453
4529	NC_006511	GTC	2	6	211462	211467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412453
4530	NC_006511	GCT	2	6	211501	211506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412453
4531	NC_006511	GCT	2	6	211555	211560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412453
4532	NC_006511	TGT	3	9	211812	211820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412453
4533	NC_006511	CAT	2	6	211851	211856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412453
4534	NC_006511	AGT	2	6	211860	211865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412453
4535	NC_006511	GTT	2	6	211901	211906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412453
4536	NC_006511	TCA	2	6	211979	211984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412453
4537	NC_006511	TGC	2	6	212000	212005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412453
4538	NC_006511	AGC	2	6	212086	212091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412453
4539	NC_006511	ATC	2	6	212170	212175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412453
4540	NC_006511	TAA	2	6	212242	212247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412453
4541	NC_006511	GC	3	6	212277	212282	0 %	0 %	50 %	50 %	56412453
4542	NC_006511	GTT	2	6	212302	212307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412453
4543	NC_006511	ATC	2	6	212359	212364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412453
4544	NC_006511	CGCCGA	2	12	212373	212384	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56412453
4545	NC_006511	TGAC	2	8	212421	212428	25 %	25 %	25 %	25 %	56412453
4546	NC_006511	TGC	2	6	212454	212459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412453
4547	NC_006511	CTT	2	6	212466	212471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412453
4548	NC_006511	CAG	2	6	212482	212487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412453
4549	NC_006511	CGG	2	6	212536	212541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412453
4550	NC_006511	GGT	2	6	212545	212550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412453
4551	NC_006511	CGC	2	6	212607	212612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412453
4552	NC_006511	TAAA	2	8	212767	212774	75 %	25 %	0 %	0 %	56412453
4553	NC_006511	TTG	2	6	212783	212788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412453
4554	NC_006511	TCATA	2	10	212925	212934	40 %	40 %	0 %	20 %	56412453
4555	NC_006511	GCC	2	6	212945	212950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412453
4556	NC_006511	GTA	2	6	213073	213078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412453
4557	NC_006511	T	7	7	213079	213085	0 %	100 %	0 %	0 %	56412453
4558	NC_006511	GTG	2	6	213098	213103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412453
4559	NC_006511	GTC	2	6	213106	213111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412453
4560	NC_006511	GCG	2	6	213134	213139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412453
4561	NC_006511	CCTG	2	8	213149	213156	0 %	25 %	25 %	50 %	56412453
4562	NC_006511	GCG	2	6	213168	213173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412453
4563	NC_006511	GCT	2	6	213322	213327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412453
4564	NC_006511	CAA	2	6	213372	213377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412453
4565	NC_006511	T	6	6	213381	213386	0 %	100 %	0 %	0 %	56412453
4566	NC_006511	CTG	3	9	213387	213395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412453
4567	NC_006511	GCA	2	6	213401	213406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412453
4568	NC_006511	ATA	2	6	213444	213449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412453
4569	NC_006511	AAT	2	6	213479	213484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_006511	CCA	2	6	213567	213572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412454
4571	NC_006511	ATT	2	6	213611	213616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412454
4572	NC_006511	TCT	2	6	213768	213773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412454
4573	NC_006511	T	6	6	213773	213778	0 %	100 %	0 %	0 %	56412454
4574	NC_006511	AAT	2	6	213843	213848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412454
4575	NC_006511	AGTTGA	2	12	213870	213881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412454
4576	NC_006511	CTT	2	6	213895	213900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412454
4577	NC_006511	CCAG	2	8	214090	214097	25 %	0 %	25 %	50 %	56412454
4578	NC_006511	TGA	2	6	214154	214159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412454
4579	NC_006511	GGT	2	6	214250	214255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412454
4580	NC_006511	TAA	2	6	214270	214275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412454
4581	NC_006511	CCCT	2	8	214293	214300	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4582	NC_006511	TAAAAT	2	12	214313	214324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_006511	GTT	2	6	214525	214530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412455
4584	NC_006511	GTT	2	6	214570	214575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412455
4585	NC_006511	CTG	2	6	214599	214604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412455
4586	NC_006511	GGT	2	6	214622	214627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412455
4587	NC_006511	ACC	2	6	214636	214641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412455
4588	NC_006511	TAT	2	6	214752	214757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412455
4589	NC_006511	TAT	2	6	214836	214841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412455
4590	NC_006511	AG	3	6	214844	214849	50 %	0 %	50 %	0 %	56412455
4591	NC_006511	CTG	2	6	214908	214913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412455
4592	NC_006511	ATAAAT	2	12	215003	215014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_006511	AT	3	6	215018	215023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_006511	TA	3	6	215025	215030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_006511	TTG	2	6	215037	215042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_006511	AG	3	6	215071	215076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_006511	CCAT	2	8	215098	215105	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4598	NC_006511	T	7	7	215121	215127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_006511	TAT	2	6	215145	215150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_006511	ATAA	2	8	215163	215170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_006511	ATA	2	6	215174	215179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_006511	TTAT	2	8	215180	215187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_006511	A	7	7	215197	215203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_006511	TAT	2	6	215245	215250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_006511	CTT	2	6	215346	215351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412456
4606	NC_006511	GCC	2	6	215411	215416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412456
4607	NC_006511	GAT	2	6	215431	215436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412456
4608	NC_006511	CTTGC	2	10	215611	215620	0 %	40 %	20 %	40 %	56412456
4609	NC_006511	CTT	2	6	215640	215645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_006511	GGC	2	6	215786	215791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412457
4611	NC_006511	CAG	2	6	215831	215836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412457
4612	NC_006511	GTC	2	6	215861	215866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412457
4613	NC_006511	TTCA	2	8	215882	215889	25 %	50 %	0 %	25 %	56412457
4614	NC_006511	GGCAAT	2	12	215900	215911	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56412457
4615	NC_006511	TCA	2	6	215962	215967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412457
4616	NC_006511	GCT	2	6	215995	216000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412457
4617	NC_006511	TGAGC	2	10	216023	216032	20 %	20 %	40 %	20 %	56412457
4618	NC_006511	AAT	2	6	216053	216058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412457
4619	NC_006511	CGA	2	6	216067	216072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412457
4620	NC_006511	CCA	2	6	216097	216102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412457
4621	NC_006511	CGC	2	6	216199	216204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412457
4622	NC_006511	TGG	2	6	216238	216243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412457
4623	NC_006511	CAC	2	6	216434	216439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412457
4624	NC_006511	CGT	2	6	216481	216486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412457
4625	NC_006511	TGG	2	6	216499	216504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412457
4626	NC_006511	GAC	2	6	216538	216543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412457
4627	NC_006511	GCA	2	6	216556	216561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412457
4628	NC_006511	CAA	2	6	216586	216591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412457
4629	NC_006511	TGA	2	6	216608	216613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_006511	GCGCT	2	10	216626	216635	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4631	NC_006511	CGCGT	2	10	216678	216687	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4632	NC_006511	TTC	2	6	216727	216732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412458
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4643	NC_006511	GCC	2	6	217156	217161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412458
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4648	NC_006511	CAGG	2	8	217326	217333	25 %	0 %	50 %	25 %	56412458
4649	NC_006511	TCG	2	6	217397	217402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412458
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4654	NC_006511	G	6	6	217558	217563	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4655	NC_006511	GCA	2	6	217643	217648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412459
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4663	NC_006511	CG	3	6	218124	218129	0 %	0 %	50 %	50 %	56412460
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4701	NC_006511	GCA	2	6	219742	219747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412461
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4722	NC_006511	CAGC	2	8	220653	220660	25 %	0 %	25 %	50 %	56412462
4723	NC_006511	GGC	2	6	220704	220709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412462
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4730	NC_006511	ACGC	2	8	221214	221221	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4731	NC_006511	TAA	2	6	221234	221239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4732	NC_006511	GTTC	2	8	221276	221283	0 %	50 %	25 %	25 %	56412463
4733	NC_006511	T	6	6	221291	221296	0 %	100 %	0 %	0 %	56412463
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4739	NC_006511	CGT	2	6	221871	221876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412463
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4743	NC_006511	CGG	3	9	222085	222093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412464
4744	NC_006511	TGGC	2	8	222107	222114	0 %	25 %	50 %	25 %	56412464
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4748	NC_006511	GC	4	8	222183	222190	0 %	0 %	50 %	50 %	56412464
4749	NC_006511	CAA	2	6	222208	222213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412464
4750	NC_006511	CG	3	6	222216	222221	0 %	0 %	50 %	50 %	56412464
4751	NC_006511	CG	3	6	222249	222254	0 %	0 %	50 %	50 %	56412464
4752	NC_006511	GC	3	6	222330	222335	0 %	0 %	50 %	50 %	56412464
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4764	NC_006511	TGT	2	6	222650	222655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412465
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4766	NC_006511	CGT	2	6	222748	222753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412465
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4781	NC_006511	GC	3	6	223545	223550	0 %	0 %	50 %	50 %	56412465
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4785	NC_006511	TTG	2	6	223657	223662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412465
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4787	NC_006511	GCC	2	6	223719	223724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412465
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4791	NC_006511	GCGA	2	8	223781	223788	25 %	0 %	50 %	25 %	56412465
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4804	NC_006511	CGC	2	6	224180	224185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412465
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4812	NC_006511	TGC	2	6	224573	224578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412465
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4814	NC_006511	CCCG	2	8	224748	224755	0 %	0 %	25 %	75 %	56412465
4815	NC_006511	CAGCG	2	10	224849	224858	20 %	0 %	40 %	40 %	56412465
4816	NC_006511	CG	3	6	224873	224878	0 %	0 %	50 %	50 %	56412465
4817	NC_006511	GAA	2	6	224994	224999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412465
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4820	NC_006511	GTC	2	6	225090	225095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4822	NC_006511	CGT	2	6	225222	225227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412466
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4824	NC_006511	GAC	2	6	225237	225242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412466
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4828	NC_006511	A	6	6	225400	225405	100 %	0 %	0 %	0 %	56412466
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4858	NC_006511	CG	3	6	226587	226592	0 %	0 %	50 %	50 %	56412466
4859	NC_006511	GGCGG	2	10	226599	226608	0 %	0 %	80 %	20 %	56412466
4860	NC_006511	GC	3	6	226644	226649	0 %	0 %	50 %	50 %	56412466
4861	NC_006511	CGC	2	6	226780	226785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412466
4862	NC_006511	ACG	2	6	226789	226794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412466
4863	NC_006511	TCG	2	6	226796	226801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412466
4864	NC_006511	TGG	2	6	226828	226833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412466
4865	NC_006511	CGG	2	6	226894	226899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412466
4866	NC_006511	GCG	2	6	227023	227028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412466
4867	NC_006511	GGC	2	6	227129	227134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412466
4868	NC_006511	GCA	2	6	227156	227161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412466
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4872	NC_006511	AAC	2	6	227313	227318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412466
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4994	NC_006511	GCC	2	6	232357	232362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412469
4995	NC_006511	TCG	2	6	232379	232384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412469
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4997	NC_006511	GGCGT	2	10	232399	232408	0 %	20 %	60 %	20 %	56412469
4998	NC_006511	TGG	2	6	232451	232456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412469
4999	NC_006511	CCA	2	6	232500	232505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412469
5000	NC_006511	GCG	2	6	232565	232570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412469

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