MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus CNRZ1066 chromosome

Total Repeats: 36918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006449	TGA	2	6	192073	192078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822171
4002	NC_006449	AAGA	2	8	192089	192096	75 %	0 %	25 %	0 %	55822171
4003	NC_006449	AT	3	6	192097	192102	50 %	50 %	0 %	0 %	55822171
4004	NC_006449	T	6	6	192106	192111	0 %	100 %	0 %	0 %	55822171
4005	NC_006449	ATTT	2	8	192141	192148	25 %	75 %	0 %	0 %	55822171
4006	NC_006449	TA	3	6	192177	192182	50 %	50 %	0 %	0 %	55822171
4007	NC_006449	ATT	2	6	192303	192308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822171
4008	NC_006449	TAA	2	6	192313	192318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822171
4009	NC_006449	GAG	2	6	192320	192325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55822171
4010	NC_006449	AG	3	6	192324	192329	50 %	0 %	50 %	0 %	55822171
4011	NC_006449	AGG	2	6	192378	192383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55822171
4012	NC_006449	T	7	7	192396	192402	0 %	100 %	0 %	0 %	55822172
4013	NC_006449	ACA	2	6	192403	192408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822172
4014	NC_006449	ACC	2	6	192458	192463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55822172
4015	NC_006449	T	6	6	192653	192658	0 %	100 %	0 %	0 %	55822172
4016	NC_006449	TGG	2	6	192686	192691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822172
4017	NC_006449	ATT	2	6	192731	192736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822172
4018	NC_006449	TCG	2	6	192772	192777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822172
4019	NC_006449	GGT	2	6	192778	192783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822172
4020	NC_006449	GAG	2	6	192788	192793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55822172
4021	NC_006449	CTG	2	6	192881	192886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822172
4022	NC_006449	CTT	2	6	192936	192941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822172
4023	NC_006449	CGA	2	6	192953	192958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822172
4024	NC_006449	TGA	2	6	192982	192987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822172
4025	NC_006449	AAC	2	6	193008	193013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822172
4026	NC_006449	TGA	2	6	193161	193166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822172
4027	NC_006449	CTTT	2	8	193248	193255	0 %	75 %	0 %	25 %	55822172
4028	NC_006449	TTG	2	6	193334	193339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822172
4029	NC_006449	TCTT	2	8	193396	193403	0 %	75 %	0 %	25 %	55822172
4030	NC_006449	TCCAA	2	10	193421	193430	40 %	20 %	0 %	40 %	55822172
4031	NC_006449	TCT	2	6	193449	193454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822172
4032	NC_006449	CT	3	6	193581	193586	0 %	50 %	0 %	50 %	55822172
4033	NC_006449	GGAA	2	8	193629	193636	50 %	0 %	50 %	0 %	55822172
4034	NC_006449	TAT	2	6	193661	193666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_006449	AGA	2	6	193774	193779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822173
4036	NC_006449	CTC	2	6	193835	193840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55822173
4037	NC_006449	GCT	2	6	193958	193963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822173
4038	NC_006449	AAGA	2	8	194012	194019	75 %	0 %	25 %	0 %	55822173
4039	NC_006449	GAT	2	6	194024	194029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822173
4040	NC_006449	AAG	2	6	194058	194063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822173
4041	NC_006449	ACC	2	6	194094	194099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55822173
4042	NC_006449	ATC	2	6	194142	194147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822173
4043	NC_006449	A	6	6	194190	194195	100 %	0 %	0 %	0 %	55822173
4044	NC_006449	ATG	2	6	194245	194250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822174
4045	NC_006449	TTA	2	6	194341	194346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822174
4046	NC_006449	AAG	2	6	194373	194378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822174
4047	NC_006449	AAG	2	6	194415	194420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822174
4048	NC_006449	CGT	2	6	194529	194534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822174
4049	NC_006449	AACA	2	8	194538	194545	75 %	0 %	0 %	25 %	55822174
4050	NC_006449	TC	3	6	194618	194623	0 %	50 %	0 %	50 %	55822174
4051	NC_006449	GGT	2	6	194625	194630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822174
4052	NC_006449	GATG	2	8	194708	194715	25 %	25 %	50 %	0 %	55822174
4053	NC_006449	CAC	2	6	194748	194753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55822174
4054	NC_006449	GTCT	2	8	194774	194781	0 %	50 %	25 %	25 %	55822174
4055	NC_006449	GTT	2	6	194866	194871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822174
4056	NC_006449	GAG	2	6	194895	194900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55822174
4057	NC_006449	CA	4	8	194901	194908	50 %	0 %	0 %	50 %	55822174
4058	NC_006449	ATT	2	6	194919	194924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822175
4059	NC_006449	CTT	2	6	194997	195002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822175
4060	NC_006449	TCG	2	6	195009	195014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822175
4061	NC_006449	TGA	2	6	195023	195028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822175
4062	NC_006449	TTGTGG	2	12	195107	195118	0 %	50 %	50 %	0 %	55822175
4063	NC_006449	TGC	2	6	195123	195128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822175
4064	NC_006449	AGT	2	6	195244	195249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822175
4065	NC_006449	TAT	2	6	195279	195284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822175
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4067	NC_006449	CTC	2	6	195349	195354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55822175
4068	NC_006449	CTC	2	6	195433	195438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55822175
4069	NC_006449	TGA	2	6	195470	195475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822175
4070	NC_006449	CAG	3	9	195479	195487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822175
4071	NC_006449	CAT	2	6	195507	195512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822175
4072	NC_006449	TTC	2	6	195515	195520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822175
4073	NC_006449	CAG	2	6	195521	195526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822175
4074	NC_006449	TATTGG	2	12	195576	195587	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	55822175
4075	NC_006449	TTGG	2	8	195589	195596	0 %	50 %	50 %	0 %	55822175
4076	NC_006449	CT	3	6	195601	195606	0 %	50 %	0 %	50 %	55822175
4077	NC_006449	TAT	2	6	195622	195627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822175
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4079	NC_006449	CT	3	6	195701	195706	0 %	50 %	0 %	50 %	55822175
4080	NC_006449	ATA	2	6	195721	195726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_006449	T	6	6	195775	195780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_006449	AAT	2	6	195795	195800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_006449	A	6	6	195818	195823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_006449	TCAG	2	8	195824	195831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4085	NC_006449	TGTC	2	8	195842	195849	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4086	NC_006449	CAAAAA	2	12	195861	195872	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4087	NC_006449	GGA	2	6	195873	195878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_006449	TGA	2	6	195971	195976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822176
4089	NC_006449	TTGCC	2	10	196015	196024	0 %	40 %	20 %	40 %	55822176
4090	NC_006449	CAG	3	9	196060	196068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822176
4091	NC_006449	TTTG	2	8	196121	196128	0 %	75 %	25 %	0 %	55822176
4092	NC_006449	CAG	2	6	196138	196143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822176
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4095	NC_006449	T	6	6	196301	196306	0 %	100 %	0 %	0 %	55822176
4096	NC_006449	T	6	6	196387	196392	0 %	100 %	0 %	0 %	55822176
4097	NC_006449	TTA	2	6	196423	196428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822176
4098	NC_006449	TTC	2	6	196435	196440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822176
4099	NC_006449	AAC	2	6	196493	196498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822176
4100	NC_006449	A	6	6	196563	196568	100 %	0 %	0 %	0 %	55822176
4101	NC_006449	TCC	2	6	196638	196643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55822176
4102	NC_006449	TGA	2	6	196654	196659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822176
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4104	NC_006449	GCT	2	6	196746	196751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822176
4105	NC_006449	TAA	2	6	196818	196823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822176
4106	NC_006449	TGG	2	6	196848	196853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_006449	A	7	7	196865	196871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_006449	A	6	6	196874	196879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_006449	TA	3	6	196925	196930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_006449	GAAAT	2	10	196963	196972	60 %	20 %	20 %	0 %	55822177
4111	NC_006449	GTT	2	6	197034	197039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822177
4112	NC_006449	CAG	3	9	197053	197061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822177
4113	NC_006449	CAC	2	6	197113	197118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55822177
4114	NC_006449	TTA	2	6	197122	197127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822177
4115	NC_006449	TTGG	2	8	197149	197156	0 %	50 %	50 %	0 %	55822177
4116	NC_006449	G	6	6	197155	197160	0 %	0 %	100 %	0 %	55822177
4117	NC_006449	TGG	2	6	197198	197203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822177
4118	NC_006449	AGG	2	6	197225	197230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55822177
4119	NC_006449	GCA	2	6	197238	197243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822177
4120	NC_006449	CA	3	6	197331	197336	50 %	0 %	0 %	50 %	55822177
4121	NC_006449	CTT	2	6	197337	197342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822177
4122	NC_006449	ATCA	2	8	197349	197356	50 %	25 %	0 %	25 %	55822177
4123	NC_006449	ACT	2	6	197366	197371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822177
4124	NC_006449	TCA	2	6	197372	197377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_006449	ATC	2	6	197423	197428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822178
4126	NC_006449	ACA	2	6	197454	197459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822178
4127	NC_006449	TTC	2	6	197498	197503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822178
4128	NC_006449	TTC	2	6	197535	197540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822178
4129	NC_006449	GAAA	2	8	197629	197636	75 %	0 %	25 %	0 %	55822179
4130	NC_006449	TCT	2	6	197680	197685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822179
4131	NC_006449	CCA	2	6	197701	197706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55822179
4132	NC_006449	GGT	2	6	197741	197746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822179
4133	NC_006449	CTT	2	6	197870	197875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822179
4134	NC_006449	TGG	2	6	197943	197948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822179
4135	NC_006449	TGA	3	9	197968	197976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822179
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4137	NC_006449	CAT	2	6	198088	198093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822179
4138	NC_006449	TGC	2	6	198112	198117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822179
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4141	NC_006449	TTC	2	6	198346	198351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822179
4142	NC_006449	CTG	2	6	198357	198362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822179
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4146	NC_006449	GAA	2	6	198509	198514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822179
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4148	NC_006449	CAAGT	2	10	198655	198664	40 %	20 %	20 %	20 %	55822180
4149	NC_006449	CTG	2	6	198667	198672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822180
4150	NC_006449	ATG	2	6	198783	198788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822180
4151	NC_006449	TTGGT	2	10	198880	198889	0 %	60 %	40 %	0 %	55822180
4152	NC_006449	TGC	2	6	198989	198994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822180
4153	NC_006449	AGT	2	6	199058	199063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822180
4154	NC_006449	ATA	2	6	199166	199171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4155	NC_006449	TTGT	2	8	199198	199205	0 %	75 %	25 %	0 %	55822181
4156	NC_006449	TTG	2	6	199214	199219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822181
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4171	NC_006449	A	7	7	200106	200112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4172	NC_006449	ATAA	2	8	200125	200132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4173	NC_006449	GA	3	6	200170	200175	50 %	0 %	50 %	0 %	55822182
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4183	NC_006449	AGA	2	6	200496	200501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822182
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4187	NC_006449	AAC	3	9	200619	200627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822182
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4200	NC_006449	CTT	2	6	201375	201380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822182
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4202	NC_006449	CTT	2	6	201472	201477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822182
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4205	NC_006449	T	6	6	201558	201563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4206	NC_006449	TTA	2	6	201567	201572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4207	NC_006449	A	6	6	201660	201665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4208	NC_006449	A	7	7	201667	201673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4209	NC_006449	AGA	2	6	201701	201706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4212	NC_006449	TGG	2	6	202067	202072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161936384
4213	NC_006449	A	6	6	202113	202118	100 %	0 %	0 %	0 %	161936384
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4216	NC_006449	GAT	3	9	202389	202397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161936384
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4218	NC_006449	TAG	2	6	202522	202527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4219	NC_006449	ATT	2	6	202539	202544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4220	NC_006449	GGA	2	6	202545	202550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4221	NC_006449	ATATGA	2	12	202558	202569	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	55822184
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4224	NC_006449	GCCGTC	2	12	202621	202632	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55822184
4225	NC_006449	AAG	2	6	202645	202650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822184
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4233	NC_006449	A	7	7	203041	203047	100 %	0 %	0 %	0 %	55822185
4234	NC_006449	TCA	2	6	203050	203055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822185
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4237	NC_006449	T	6	6	203297	203302	0 %	100 %	0 %	0 %	55822185
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4240	NC_006449	GGT	2	6	203459	203464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822185
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4242	NC_006449	TGA	2	6	203565	203570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822185
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4248	NC_006449	GGT	2	6	203852	203857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822186
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4250	NC_006449	TAG	2	6	203979	203984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822186
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4252	NC_006449	TAT	2	6	204043	204048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822186
4253	NC_006449	T	6	6	204052	204057	0 %	100 %	0 %	0 %	55822186
4254	NC_006449	TGA	2	6	204100	204105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822186
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4258	NC_006449	A	7	7	204261	204267	100 %	0 %	0 %	0 %	55822186
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4263	NC_006449	T	6	6	204576	204581	0 %	100 %	0 %	0 %	55822186
4264	NC_006449	GTG	3	9	204586	204594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_006449	TAT	2	6	204608	204613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822187
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4267	NC_006449	TG	3	6	204633	204638	0 %	50 %	50 %	0 %	55822187
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4294	NC_006449	CTTT	2	8	205852	205859	0 %	75 %	0 %	25 %	55822187
4295	NC_006449	CCT	2	6	205914	205919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4337	NC_006449	TGT	2	6	208325	208330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4369	NC_006449	GGTACA	2	12	210080	210091	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55822189
4370	NC_006449	TGGCT	2	10	210100	210109	0 %	40 %	40 %	20 %	55822189
4371	NC_006449	ATC	2	6	210113	210118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822189
4372	NC_006449	TTG	2	6	210171	210176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822189
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4374	NC_006449	ATC	2	6	210272	210277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822189
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4472	NC_006449	GAT	2	6	214679	214684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4473	NC_006449	AAAG	2	8	214720	214727	75 %	0 %	25 %	0 %	55822196
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4483	NC_006449	TTA	2	6	215023	215028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4484	NC_006449	ATTT	2	8	215046	215053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4485	NC_006449	CTT	2	6	215078	215083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4486	NC_006449	ATC	2	6	215130	215135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4488	NC_006449	CAT	2	6	215153	215158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4489	NC_006449	CAT	2	6	215168	215173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4492	NC_006449	GTTT	2	8	215290	215297	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4493	NC_006449	GCT	2	6	215329	215334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4494	NC_006449	A	6	6	215380	215385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4495	NC_006449	CAATC	2	10	215387	215396	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4496	NC_006449	TTG	2	6	215397	215402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4497	NC_006449	GAAAGA	2	12	215538	215549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822197
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4499	NC_006449	GTG	2	6	215697	215702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822197
4500	NC_006449	A	7	7	215761	215767	100 %	0 %	0 %	0 %	55822197

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