MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus CNRZ1066 chromosome

Total Repeats: 36918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_006449	CTT	2	6	144112	144117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_006449	TGA	2	6	144123	144128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_006449	TAG	2	6	144177	144182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_006449	AAT	2	6	144270	144275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_006449	CT	3	6	144324	144329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_006449	TGAAAA	2	12	144335	144346	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_006449	TAG	2	6	144368	144373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_006449	TTC	2	6	144413	144418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_006449	TCG	2	6	144431	144436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_006449	AGT	2	6	144542	144547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822116
3011	NC_006449	GAT	2	6	144566	144571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822116
3012	NC_006449	GAAA	2	8	144572	144579	75 %	0 %	25 %	0 %	55822116
3013	NC_006449	TCAC	2	8	144703	144710	25 %	25 %	0 %	50 %	55822116
3014	NC_006449	AAT	2	6	144753	144758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822116
3015	NC_006449	CTTT	2	8	144826	144833	0 %	75 %	0 %	25 %	55822116
3016	NC_006449	CAT	2	6	144873	144878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822116
3017	NC_006449	ATT	2	6	144952	144957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_006449	ATTGAA	2	12	145176	145187	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	55822117
3019	NC_006449	GCA	2	6	145189	145194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822117
3020	NC_006449	ATTG	2	8	145202	145209	25 %	50 %	25 %	0 %	55822117
3021	NC_006449	T	6	6	145235	145240	0 %	100 %	0 %	0 %	55822117
3022	NC_006449	GAAT	2	8	145298	145305	50 %	25 %	25 %	0 %	55822117
3023	NC_006449	AGA	2	6	145310	145315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822117
3024	NC_006449	GGATG	2	10	145403	145412	20 %	20 %	60 %	0 %	55822117
3025	NC_006449	GAA	2	6	145419	145424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822117
3026	NC_006449	AAG	2	6	145479	145484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822117
3027	NC_006449	AGA	2	6	145571	145576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822117
3028	NC_006449	TGG	2	6	145847	145852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822117
3029	NC_006449	CA	4	8	145880	145887	50 %	0 %	0 %	50 %	55822117
3030	NC_006449	TGC	2	6	146051	146056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822117
3031	NC_006449	T	6	6	146205	146210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_006449	CAAG	2	8	146282	146289	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3033	NC_006449	GTGA	2	8	146332	146339	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_006449	TTA	2	6	146353	146358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_006449	TAT	2	6	146369	146374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_006449	TACAGC	2	12	146375	146386	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_006449	CAG	2	6	146433	146438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822118
3038	NC_006449	TCT	2	6	146512	146517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822118
3039	NC_006449	ACG	2	6	146653	146658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822118
3040	NC_006449	T	6	6	146659	146664	0 %	100 %	0 %	0 %	55822118
3041	NC_006449	GTA	2	6	146670	146675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822118
3042	NC_006449	T	7	7	146717	146723	0 %	100 %	0 %	0 %	55822118
3043	NC_006449	ATC	2	6	146738	146743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822118
3044	NC_006449	ATG	2	6	146763	146768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822118
3045	NC_006449	TAA	2	6	146877	146882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822118
3046	NC_006449	TTC	2	6	146893	146898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_006449	ATG	2	6	146902	146907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_006449	AGT	2	6	146978	146983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_006449	ATA	2	6	147013	147018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_006449	A	6	6	147041	147046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_006449	CTG	2	6	147073	147078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_006449	TGAT	2	8	147090	147097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_006449	T	7	7	147111	147117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_006449	AGT	2	6	147231	147236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_006449	TA	3	6	147242	147247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_006449	TTC	2	6	147258	147263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_006449	TTG	2	6	147365	147370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_006449	GAA	2	6	147470	147475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_006449	ACC	2	6	147479	147484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3060	NC_006449	GTGG	2	8	147492	147499	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_006449	TTAT	2	8	147539	147546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_006449	AT	3	6	147553	147558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_006449	TATTT	2	10	147564	147573	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_006449	ATTTAT	2	12	147618	147629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_006449	AAG	2	6	147650	147655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822119
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3069	NC_006449	CGT	2	6	147820	147825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822119
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3080	NC_006449	ATT	2	6	148184	148189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_006449	TTA	2	6	148207	148212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_006449	GTTT	2	8	148234	148241	0 %	75 %	25 %	0 %	55822120
3083	NC_006449	TTTA	2	8	148291	148298	25 %	75 %	0 %	0 %	55822120
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3094	NC_006449	ACG	2	6	148724	148729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822120
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3096	NC_006449	T	7	7	148890	148896	0 %	100 %	0 %	0 %	55822120
3097	NC_006449	GAT	2	6	148984	148989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822120
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3099	NC_006449	AAATT	2	10	149045	149054	60 %	40 %	0 %	0 %	55822120
3100	NC_006449	TA	3	6	149059	149064	50 %	50 %	0 %	0 %	55822120
3101	NC_006449	TTA	2	6	149136	149141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_006449	A	7	7	149150	149156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_006449	TAAAC	2	10	149181	149190	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3109	NC_006449	TGT	2	6	149480	149485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822121
3110	NC_006449	GTT	2	6	149550	149555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822121
3111	NC_006449	AAG	2	6	149617	149622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822121
3112	NC_006449	GAA	2	6	149631	149636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822121
3113	NC_006449	AACG	2	8	149655	149662	50 %	0 %	25 %	25 %	55822121
3114	NC_006449	ATTG	2	8	149678	149685	25 %	50 %	25 %	0 %	55822121
3115	NC_006449	GGT	2	6	149763	149768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822121
3116	NC_006449	CT	3	6	149783	149788	0 %	50 %	0 %	50 %	55822121
3117	NC_006449	TTGG	2	8	149832	149839	0 %	50 %	50 %	0 %	55822121
3118	NC_006449	TGA	2	6	149852	149857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822121
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3121	NC_006449	AAG	2	6	149956	149961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822121
3122	NC_006449	TGA	3	9	149972	149980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822121
3123	NC_006449	TGA	2	6	149996	150001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822121
3124	NC_006449	TGA	2	6	150017	150022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822121
3125	NC_006449	AGC	2	6	150053	150058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822121
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3242	NC_006449	A	7	7	155922	155928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3243	NC_006449	TAT	2	6	155961	155966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_006449	TGT	2	6	156023	156028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3247	NC_006449	AGG	2	6	156181	156186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_006449	CAT	2	6	156243	156248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3249	NC_006449	CAAG	2	8	156268	156275	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3250	NC_006449	AAG	2	6	156278	156283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_006449	CAG	2	6	156320	156325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822128
3252	NC_006449	CAA	2	6	156395	156400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822128
3253	NC_006449	TAT	2	6	156433	156438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822128
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3255	NC_006449	TGG	2	6	156525	156530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822129
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3362	NC_006449	GGT	2	6	162232	162237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3363	NC_006449	TAA	2	6	162290	162295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3364	NC_006449	TTA	2	6	162302	162307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3372	NC_006449	GAT	2	6	162987	162992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822136
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3374	NC_006449	ACA	2	6	163124	163129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822137
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