MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus CNRZ1066 chromosome

Total Repeats: 36918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_006449	ATA	2	6	1519289	1519294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31002	NC_006449	CTGA	2	8	1519364	1519371	25 %	25 %	25 %	25 %	55823603
31003	NC_006449	CTT	2	6	1519385	1519390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823603
31004	NC_006449	ATT	2	6	1519392	1519397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823603
31005	NC_006449	TAAC	2	8	1519436	1519443	50 %	25 %	0 %	25 %	55823603
31006	NC_006449	TGT	2	6	1519464	1519469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55823603
31007	NC_006449	GTA	3	9	1519471	1519479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823603
31008	NC_006449	CTT	4	12	1519502	1519513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823603
31009	NC_006449	CTC	2	6	1519590	1519595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31010	NC_006449	C	6	6	1519630	1519635	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31011	NC_006449	T	6	6	1519652	1519657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31012	NC_006449	T	6	6	1519663	1519668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31013	NC_006449	ATT	2	6	1519683	1519688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31014	NC_006449	AT	3	6	1519693	1519698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31015	NC_006449	T	6	6	1519704	1519709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31016	NC_006449	TTA	2	6	1519741	1519746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31017	NC_006449	ATA	2	6	1519759	1519764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31018	NC_006449	A	6	6	1519764	1519769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31019	NC_006449	T	6	6	1519804	1519809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31020	NC_006449	CTC	2	6	1519858	1519863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31021	NC_006449	AT	3	6	1519880	1519885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31022	NC_006449	TTGACC	2	12	1519975	1519986	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55823604
31023	NC_006449	T	6	6	1520046	1520051	0 %	100 %	0 %	0 %	55823604
31024	NC_006449	TCA	2	6	1520234	1520239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823604
31025	NC_006449	CTA	2	6	1520247	1520252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823604
31026	NC_006449	CG	3	6	1520347	1520352	0 %	0 %	50 %	50 %	55823604
31027	NC_006449	TTC	2	6	1520404	1520409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823604
31028	NC_006449	AAC	2	6	1520425	1520430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823604
31029	NC_006449	GA	3	6	1520431	1520436	50 %	0 %	50 %	0 %	55823604
31030	NC_006449	GCA	2	6	1520441	1520446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823604
31031	NC_006449	AC	4	8	1520449	1520456	50 %	0 %	0 %	50 %	55823604
31032	NC_006449	TGA	2	6	1520478	1520483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823604
31033	NC_006449	TTTC	2	8	1520574	1520581	0 %	75 %	0 %	25 %	55823604
31034	NC_006449	CCA	2	6	1520640	1520645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55823604
31035	NC_006449	CAA	2	6	1520679	1520684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823604
31036	NC_006449	CTG	2	6	1520697	1520702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823604
31037	NC_006449	TCC	2	6	1520773	1520778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55823604
31038	NC_006449	GAA	2	6	1520781	1520786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823604
31039	NC_006449	ATT	2	6	1520794	1520799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823604
31040	NC_006449	AAGGC	2	10	1520807	1520816	40 %	0 %	40 %	20 %	55823604
31041	NC_006449	ACT	2	6	1520927	1520932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823604
31042	NC_006449	ATA	2	6	1521080	1521085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823604
31043	NC_006449	CTA	2	6	1521099	1521104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823604
31044	NC_006449	GCT	2	6	1521140	1521145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823604
31045	NC_006449	GAC	2	6	1521165	1521170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823604
31046	NC_006449	CTG	2	6	1521184	1521189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823604
31047	NC_006449	ATGT	2	8	1521203	1521210	25 %	50 %	25 %	0 %	55823604
31048	NC_006449	TCC	2	6	1521219	1521224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55823605
31049	NC_006449	GAA	2	6	1521265	1521270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823605
31050	NC_006449	CATT	2	8	1521289	1521296	25 %	50 %	0 %	25 %	55823605
31051	NC_006449	TCA	2	6	1521349	1521354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823605
31052	NC_006449	ACC	2	6	1521356	1521361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55823605
31053	NC_006449	TAC	2	6	1521373	1521378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823605
31054	NC_006449	CAG	2	6	1521379	1521384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823605
31055	NC_006449	ACA	2	6	1521490	1521495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823605
31056	NC_006449	TAAG	2	8	1521499	1521506	50 %	25 %	25 %	0 %	55823605
31057	NC_006449	CAA	2	6	1521514	1521519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823605
31058	NC_006449	CAT	2	6	1521595	1521600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823605
31059	NC_006449	ACT	2	6	1521618	1521623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823605
31060	NC_006449	AAG	2	6	1521701	1521706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823605
31061	NC_006449	TTGGT	2	10	1521717	1521726	0 %	60 %	40 %	0 %	55823605
31062	NC_006449	TCA	2	6	1521754	1521759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823605
31063	NC_006449	TACC	2	8	1521796	1521803	25 %	25 %	0 %	50 %	55823605
31064	NC_006449	CTG	2	6	1521805	1521810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823605
31065	NC_006449	AGCT	2	8	1521911	1521918	25 %	25 %	25 %	25 %	55823605
31066	NC_006449	T	6	6	1521925	1521930	0 %	100 %	0 %	0 %	55823605
31067	NC_006449	TA	3	6	1522028	1522033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31068	NC_006449	AT	3	6	1522054	1522059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31069	NC_006449	TAT	2	6	1522083	1522088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31070	NC_006449	A	6	6	1522094	1522099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31071	NC_006449	AG	3	6	1522114	1522119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31072	NC_006449	A	6	6	1522145	1522150	100 %	0 %	0 %	0 %	55823606
31073	NC_006449	CAA	2	6	1522183	1522188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823606
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31086	NC_006449	TAA	2	6	1522792	1522797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823606
31087	NC_006449	ATG	2	6	1522826	1522831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823606
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31093	NC_006449	CAA	2	6	1523048	1523053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823606
31094	NC_006449	ACCA	2	8	1523099	1523106	50 %	0 %	0 %	50 %	55823606
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31099	NC_006449	AG	3	6	1523449	1523454	50 %	0 %	50 %	0 %	55823606
31100	NC_006449	AAT	2	6	1523570	1523575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823606
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31103	NC_006449	TCT	2	6	1523638	1523643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823606
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31105	NC_006449	TTC	2	6	1523843	1523848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823607
31106	NC_006449	CCT	2	6	1523919	1523924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55823607
31107	NC_006449	CTT	2	6	1523943	1523948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823607
31108	NC_006449	AGA	2	6	1524020	1524025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823607
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31110	NC_006449	GA	3	6	1524060	1524065	50 %	0 %	50 %	0 %	55823607
31111	NC_006449	AGTCA	2	10	1524094	1524103	40 %	20 %	20 %	20 %	55823607
31112	NC_006449	TCT	2	6	1524241	1524246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823608
31113	NC_006449	CTGA	2	8	1524263	1524270	25 %	25 %	25 %	25 %	55823608
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31117	NC_006449	GA	3	6	1524411	1524416	50 %	0 %	50 %	0 %	55823608
31118	NC_006449	ATC	2	6	1524459	1524464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823608
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31120	NC_006449	T	6	6	1524547	1524552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31121	NC_006449	AGG	2	6	1524721	1524726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31122	NC_006449	ATC	2	6	1524752	1524757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823609
31123	NC_006449	AGG	2	6	1524778	1524783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55823609
31124	NC_006449	GGA	2	6	1524791	1524796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55823609
31125	NC_006449	AGA	2	6	1524817	1524822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823609
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31127	NC_006449	ATC	2	6	1524938	1524943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823609
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31131	NC_006449	T	7	7	1525248	1525254	0 %	100 %	0 %	0 %	55823609
31132	NC_006449	CTTCT	2	10	1525256	1525265	0 %	60 %	0 %	40 %	55823609
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31136	NC_006449	ATT	2	6	1525577	1525582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31137	NC_006449	TTCT	2	8	1525632	1525639	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31138	NC_006449	TAT	2	6	1525665	1525670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31139	NC_006449	T	6	6	1525707	1525712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31140	NC_006449	A	6	6	1525772	1525777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31141	NC_006449	T	6	6	1525800	1525805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31142	NC_006449	CTA	2	6	1525835	1525840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31146	NC_006449	TCT	2	6	1526090	1526095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823610
31147	NC_006449	TCT	2	6	1526108	1526113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823610
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31152	NC_006449	AGGT	2	8	1526497	1526504	25 %	25 %	50 %	0 %	55823610
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31154	NC_006449	TCC	2	6	1526573	1526578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55823610
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31231	NC_006449	GTC	2	6	1531262	1531267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823611
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31484	NC_006449	CTT	2	6	1544119	1544124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823621
31485	NC_006449	TTGT	2	8	1544144	1544151	0 %	75 %	25 %	0 %	55823621
31486	NC_006449	GCA	2	6	1544157	1544162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823621
31487	NC_006449	CGACG	2	10	1544234	1544243	20 %	0 %	40 %	40 %	55823621
31488	NC_006449	GTT	2	6	1544251	1544256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55823621
31489	NC_006449	TCT	2	6	1544259	1544264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823621
31490	NC_006449	AAGG	2	8	1544311	1544318	50 %	0 %	50 %	0 %	55823621
31491	NC_006449	CAG	2	6	1544341	1544346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823621
31492	NC_006449	ATTA	2	8	1544405	1544412	50 %	50 %	0 %	0 %	55823621
31493	NC_006449	CTT	3	9	1544524	1544532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823621
31494	NC_006449	TGA	2	6	1544629	1544634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823621
31495	NC_006449	GCTT	2	8	1544658	1544665	0 %	50 %	25 %	25 %	55823621
31496	NC_006449	T	6	6	1544722	1544727	0 %	100 %	0 %	0 %	55823621
31497	NC_006449	CTGTTG	2	12	1544904	1544915	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	55823622
31498	NC_006449	TCA	2	6	1544967	1544972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823622
31499	NC_006449	CAT	2	6	1544985	1544990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823622
31500	NC_006449	GTT	2	6	1545055	1545060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55823622

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