MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus CNRZ1066 chromosome

Total Repeats: 36918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_006449	TCA	2	6	1469238	1469243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823551
30003	NC_006449	ATC	2	6	1469369	1469374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823551
30004	NC_006449	CAC	2	6	1469416	1469421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55823551
30005	NC_006449	ATT	2	6	1469441	1469446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823551
30006	NC_006449	AGG	2	6	1469469	1469474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55823551
30007	NC_006449	TAA	2	6	1469495	1469500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823551
30008	NC_006449	CCA	2	6	1469501	1469506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55823551
30009	NC_006449	AAC	2	6	1469580	1469585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823552
30010	NC_006449	AAAT	2	8	1469620	1469627	75 %	25 %	0 %	0 %	55823552
30011	NC_006449	TAT	2	6	1469918	1469923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823552
30012	NC_006449	A	6	6	1469924	1469929	100 %	0 %	0 %	0 %	55823552
30013	NC_006449	TA	3	6	1469934	1469939	50 %	50 %	0 %	0 %	55823552
30014	NC_006449	AAT	2	6	1469970	1469975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823552
30015	NC_006449	CTT	2	6	1470137	1470142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823553
30016	NC_006449	CTC	2	6	1470207	1470212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55823553
30017	NC_006449	CGC	2	6	1470306	1470311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55823553
30018	NC_006449	CGA	2	6	1470385	1470390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823553
30019	NC_006449	CAG	2	6	1470407	1470412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823553
30020	NC_006449	A	6	6	1470461	1470466	100 %	0 %	0 %	0 %	55823553
30021	NC_006449	TCC	2	6	1470480	1470485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55823553
30022	NC_006449	AAAG	2	8	1470489	1470496	75 %	0 %	25 %	0 %	55823553
30023	NC_006449	GTT	2	6	1470535	1470540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55823553
30024	NC_006449	CGCC	2	8	1470577	1470584	0 %	0 %	25 %	75 %	55823553
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30027	NC_006449	A	6	6	1470659	1470664	100 %	0 %	0 %	0 %	55823553
30028	NC_006449	CA	3	6	1470666	1470671	50 %	0 %	0 %	50 %	55823553
30029	NC_006449	AGG	2	6	1470687	1470692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30030	NC_006449	ATC	2	6	1470708	1470713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30031	NC_006449	ACACAA	2	12	1470714	1470725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30032	NC_006449	A	6	6	1470724	1470729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30033	NC_006449	TCACC	2	10	1471013	1471022	20 %	20 %	0 %	60 %	55823554
30034	NC_006449	TCA	2	6	1471063	1471068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823554
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30036	NC_006449	ACG	2	6	1471164	1471169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823554
30037	NC_006449	AAAT	2	8	1471204	1471211	75 %	25 %	0 %	0 %	55823554
30038	NC_006449	CTT	2	6	1471214	1471219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823554
30039	NC_006449	CAG	2	6	1471223	1471228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823554
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30042	NC_006449	TGT	2	6	1471310	1471315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55823554
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30044	NC_006449	TTGGT	2	10	1471378	1471387	0 %	60 %	40 %	0 %	55823554
30045	NC_006449	CTC	2	6	1471389	1471394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55823554
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30047	NC_006449	TGC	2	6	1471629	1471634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823554
30048	NC_006449	CAA	2	6	1471731	1471736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30049	NC_006449	CAT	2	6	1471811	1471816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823555
30050	NC_006449	CAT	2	6	1471822	1471827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823555
30051	NC_006449	CAAA	3	12	1471907	1471918	75 %	0 %	0 %	25 %	55823555
30052	NC_006449	TAA	2	6	1471961	1471966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823555
30053	NC_006449	ACA	2	6	1472005	1472010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30054	NC_006449	TAA	3	9	1472033	1472041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30055	NC_006449	AAG	2	6	1472204	1472209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823556
30056	NC_006449	GAA	2	6	1472211	1472216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823556
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30058	NC_006449	TCA	2	6	1472254	1472259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823556
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30060	NC_006449	TGAC	2	8	1472338	1472345	25 %	25 %	25 %	25 %	55823556
30061	NC_006449	GATT	2	8	1472382	1472389	25 %	50 %	25 %	0 %	55823556
30062	NC_006449	ACCA	2	8	1472400	1472407	50 %	0 %	0 %	50 %	55823556
30063	NC_006449	CAAG	2	8	1472438	1472445	50 %	0 %	25 %	25 %	55823556
30064	NC_006449	ACC	2	6	1472499	1472504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55823556
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30068	NC_006449	CCTT	2	8	1472617	1472624	0 %	50 %	0 %	50 %	55823556
30069	NC_006449	ACG	2	6	1472643	1472648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823556
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30087	NC_006449	TTA	2	6	1474015	1474020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30092	NC_006449	AAG	2	6	1474197	1474202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823558
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30102	NC_006449	T	6	6	1474737	1474742	0 %	100 %	0 %	0 %	55823558
30103	NC_006449	AGTC	2	8	1474766	1474773	25 %	25 %	25 %	25 %	55823558
30104	NC_006449	T	6	6	1474881	1474886	0 %	100 %	0 %	0 %	55823558
30105	NC_006449	TAA	3	9	1474958	1474966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30106	NC_006449	A	6	6	1474965	1474970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30107	NC_006449	GATA	2	8	1474980	1474987	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30108	NC_006449	A	6	6	1475024	1475029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30109	NC_006449	AAC	2	6	1475044	1475049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30110	NC_006449	TTA	2	6	1475066	1475071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30111	NC_006449	ATTAT	2	10	1475073	1475082	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30112	NC_006449	ATTG	2	8	1475083	1475090	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30113	NC_006449	TA	3	6	1475129	1475134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30114	NC_006449	AG	3	6	1475141	1475146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30115	NC_006449	AAC	2	6	1475149	1475154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30116	NC_006449	TAT	2	6	1475166	1475171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30117	NC_006449	ACT	2	6	1475176	1475181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30118	NC_006449	TTA	2	6	1475199	1475204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30119	NC_006449	CTA	2	6	1475214	1475219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30121	NC_006449	TGT	2	6	1475482	1475487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55823559
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30231	NC_006449	AAT	2	6	1481140	1481145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30232	NC_006449	AAG	2	6	1481153	1481158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30233	NC_006449	GAA	2	6	1481173	1481178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30234	NC_006449	TAA	2	6	1481213	1481218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30235	NC_006449	A	6	6	1481221	1481226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30236	NC_006449	CTT	3	9	1481256	1481264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30237	NC_006449	TTG	2	6	1481265	1481270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30238	NC_006449	T	7	7	1481317	1481323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30239	NC_006449	A	7	7	1481363	1481369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30240	NC_006449	A	7	7	1481393	1481399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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