MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus CNRZ1066 chromosome

Total Repeats: 36918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_006449	CTT	2	6	1220133	1220138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823294
25003	NC_006449	AT	3	6	1220144	1220149	50 %	50 %	0 %	0 %	55823294
25004	NC_006449	AGA	3	9	1220176	1220184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823294
25005	NC_006449	GAG	2	6	1220205	1220210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55823294
25006	NC_006449	CAT	2	6	1220218	1220223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823294
25007	NC_006449	TGA	2	6	1220252	1220257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823294
25008	NC_006449	CTT	2	6	1220370	1220375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823294
25009	NC_006449	CTT	2	6	1220403	1220408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25010	NC_006449	AATA	2	8	1220474	1220481	75 %	25 %	0 %	0 %	55823295
25011	NC_006449	AGA	2	6	1220506	1220511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823295
25012	NC_006449	A	7	7	1220511	1220517	100 %	0 %	0 %	0 %	55823295
25013	NC_006449	TGAA	2	8	1220571	1220578	50 %	25 %	25 %	0 %	55823295
25014	NC_006449	GAT	2	6	1220588	1220593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823295
25015	NC_006449	TGA	2	6	1220614	1220619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823295
25016	NC_006449	CAA	2	6	1220667	1220672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25017	NC_006449	ATA	2	6	1220677	1220682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25018	NC_006449	GTT	2	6	1220686	1220691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25019	NC_006449	T	7	7	1220694	1220700	0 %	100 %	0 %	0 %	55823296
25020	NC_006449	TC	3	6	1220802	1220807	0 %	50 %	0 %	50 %	55823296
25021	NC_006449	GTTG	2	8	1220866	1220873	0 %	50 %	50 %	0 %	55823296
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25027	NC_006449	TGC	2	6	1221023	1221028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823296
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25032	NC_006449	TCT	2	6	1221206	1221211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823297
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25036	NC_006449	AAT	2	6	1221326	1221331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823297
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25040	NC_006449	TC	3	6	1221495	1221500	0 %	50 %	0 %	50 %	55823297
25041	NC_006449	GAA	2	6	1221543	1221548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823297
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25044	NC_006449	TTGA	2	8	1221695	1221702	25 %	50 %	25 %	0 %	55823297
25045	NC_006449	TGGT	2	8	1221822	1221829	0 %	50 %	50 %	0 %	55823297
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25051	NC_006449	CTT	2	6	1222436	1222441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823297
25052	NC_006449	AAT	2	6	1222452	1222457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823297
25053	NC_006449	A	7	7	1222561	1222567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25054	NC_006449	AGT	2	6	1222596	1222601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25057	NC_006449	TCA	2	6	1222749	1222754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823298
25058	NC_006449	TGA	2	6	1222793	1222798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823298
25059	NC_006449	TTG	3	9	1222817	1222825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55823298
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25113	NC_006449	AAT	2	6	1224778	1224783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25114	NC_006449	TAAA	2	8	1224869	1224876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25115	NC_006449	AAATA	2	10	1224881	1224890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25117	NC_006449	ATA	2	6	1224909	1224914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823301
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25119	NC_006449	CTTAT	2	10	1224987	1224996	20 %	60 %	0 %	20 %	55823301
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25229	NC_006449	TAT	2	6	1230195	1230200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25246	NC_006449	CAG	2	6	1231127	1231132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823305
25247	NC_006449	GTTG	2	8	1231220	1231227	0 %	50 %	50 %	0 %	55823305
25248	NC_006449	TGA	2	6	1231276	1231281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823305
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25250	NC_006449	ATA	2	6	1231497	1231502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823305
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25252	NC_006449	CTTTT	2	10	1231713	1231722	0 %	80 %	0 %	20 %	55823305
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25322	NC_006449	AAT	2	6	1235424	1235429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25353	NC_006449	ATGTT	2	10	1237418	1237427	20 %	60 %	20 %	0 %	55823308
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25359	NC_006449	TTTG	2	8	1237829	1237836	0 %	75 %	25 %	0 %	55823308
25360	NC_006449	CAA	2	6	1238001	1238006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823308
25361	NC_006449	T	6	6	1238122	1238127	0 %	100 %	0 %	0 %	55823308
25362	NC_006449	CAT	2	6	1238139	1238144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823308
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25364	NC_006449	TGA	2	6	1238295	1238300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823308
25365	NC_006449	TCA	2	6	1238315	1238320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823308
25366	NC_006449	TTC	2	6	1238428	1238433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823308
25367	NC_006449	TGAG	2	8	1238458	1238465	25 %	25 %	50 %	0 %	55823308
25368	NC_006449	T	6	6	1238517	1238522	0 %	100 %	0 %	0 %	55823308
25369	NC_006449	ATT	2	6	1238538	1238543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823309
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25413	NC_006449	TGA	2	6	1240552	1240557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823310
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25430	NC_006449	AAT	2	6	1241569	1241574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823310
25431	NC_006449	ATT	2	6	1241593	1241598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25432	NC_006449	A	6	6	1241604	1241609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25433	NC_006449	ACA	2	6	1241618	1241623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25434	NC_006449	TA	4	8	1241626	1241633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25435	NC_006449	T	7	7	1241641	1241647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25436	NC_006449	TAT	2	6	1241651	1241656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25437	NC_006449	ATC	2	6	1241671	1241676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823311
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25441	NC_006449	TCCA	2	8	1241751	1241758	25 %	25 %	0 %	50 %	55823311
25442	NC_006449	CAAT	2	8	1241787	1241794	50 %	25 %	0 %	25 %	55823311
25443	NC_006449	AT	3	6	1241793	1241798	50 %	50 %	0 %	0 %	55823311
25444	NC_006449	GAC	2	6	1241811	1241816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823311
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25459	NC_006449	CTA	4	12	1242570	1242581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823311
25460	NC_006449	A	6	6	1242684	1242689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25461	NC_006449	TCT	2	6	1242772	1242777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823312
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25464	NC_006449	TCAA	2	8	1242982	1242989	50 %	25 %	0 %	25 %	55823312
25465	NC_006449	TCTT	2	8	1243000	1243007	0 %	75 %	0 %	25 %	55823312
25466	NC_006449	GATA	2	8	1243034	1243041	50 %	25 %	25 %	0 %	55823312
25467	NC_006449	TTC	2	6	1243053	1243058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823312
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25469	NC_006449	TGGTG	2	10	1243130	1243139	0 %	40 %	60 %	0 %	55823312
25470	NC_006449	CTT	2	6	1243246	1243251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823312
25471	NC_006449	GAA	2	6	1243256	1243261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823312
25472	NC_006449	ACC	2	6	1243362	1243367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55823312
25473	NC_006449	ACC	2	6	1243395	1243400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55823312
25474	NC_006449	CAA	2	6	1243451	1243456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823312
25475	NC_006449	AGA	2	6	1243517	1243522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823312
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25478	NC_006449	TTGC	2	8	1243856	1243863	0 %	50 %	25 %	25 %	55823312
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25481	NC_006449	TCAA	2	8	1244023	1244030	50 %	25 %	0 %	25 %	55823312
25482	NC_006449	CCAA	2	8	1244068	1244075	50 %	0 %	0 %	50 %	55823312
25483	NC_006449	TTTG	2	8	1244085	1244092	0 %	75 %	25 %	0 %	55823312
25484	NC_006449	CTT	2	6	1244183	1244188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823312
25485	NC_006449	ACC	2	6	1244212	1244217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55823313
25486	NC_006449	CTT	2	6	1244259	1244264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823313
25487	NC_006449	T	6	6	1244284	1244289	0 %	100 %	0 %	0 %	55823313
25488	NC_006449	CTTTGT	2	12	1244301	1244312	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	55823313
25489	NC_006449	CTT	2	6	1244373	1244378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823313
25490	NC_006449	TG	4	8	1244389	1244396	0 %	50 %	50 %	0 %	55823313
25491	NC_006449	AAG	2	6	1244603	1244608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823313
25492	NC_006449	CTG	2	6	1244658	1244663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823313
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25494	NC_006449	ACG	2	6	1244710	1244715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55823313
25495	NC_006449	ATG	2	6	1244729	1244734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55823313
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