MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus CNRZ1066 chromosome

Total Repeats: 36918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21003	NC_006449	CTG	2	6	1020685	1020690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823087
21004	NC_006449	TC	3	6	1020727	1020732	0 %	50 %	0 %	50 %	55823087
21005	NC_006449	GTTT	2	8	1020766	1020773	0 %	75 %	25 %	0 %	55823087
21006	NC_006449	ATA	2	6	1020803	1020808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823087
21007	NC_006449	ACC	2	6	1020908	1020913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55823087
21008	NC_006449	TAA	2	6	1021064	1021069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823087
21009	NC_006449	TTA	2	6	1021119	1021124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823087
21010	NC_006449	TAA	2	6	1021174	1021179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823087
21011	NC_006449	TCCAT	2	10	1021193	1021202	20 %	40 %	0 %	40 %	55823087
21012	NC_006449	GCT	2	6	1021258	1021263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823087
21013	NC_006449	GACT	2	8	1021275	1021282	25 %	25 %	25 %	25 %	55823087
21014	NC_006449	TTG	2	6	1021285	1021290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55823087
21015	NC_006449	GCT	2	6	1021410	1021415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823087
21016	NC_006449	ATT	2	6	1021416	1021421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823087
21017	NC_006449	TCTT	2	8	1021462	1021469	0 %	75 %	0 %	25 %	55823087
21018	NC_006449	TCTT	2	8	1021483	1021490	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21019	NC_006449	AAT	2	6	1021560	1021565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823088
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21021	NC_006449	TAA	2	6	1021689	1021694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823088
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21023	NC_006449	GTT	3	9	1021826	1021834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55823089
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21033	NC_006449	CTG	2	6	1022544	1022549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55823089
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21048	NC_006449	TAT	2	6	1023038	1023043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21049	NC_006449	TAA	2	6	1023153	1023158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823090
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21051	NC_006449	TAA	2	6	1023294	1023299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823090
21052	NC_006449	GTT	2	6	1023432	1023437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21053	NC_006449	A	6	6	1023440	1023445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21054	NC_006449	TGT	2	6	1023518	1023523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55823091
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21056	NC_006449	CTT	2	6	1023586	1023591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823091
21057	NC_006449	ATC	2	6	1023848	1023853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823091
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21065	NC_006449	TCT	2	6	1024290	1024295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55823091
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21088	NC_006449	TAAAA	2	10	1025249	1025258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21089	NC_006449	AAG	2	6	1025270	1025275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21091	NC_006449	AATGT	2	10	1025431	1025440	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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21093	NC_006449	CCA	2	6	1025502	1025507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21102	NC_006449	TTA	2	6	1025772	1025777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21105	NC_006449	ATT	2	6	1025909	1025914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21106	NC_006449	CAAAA	2	10	1025921	1025930	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21107	NC_006449	A	6	6	1025927	1025932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21108	NC_006449	A	7	7	1025941	1025947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21109	NC_006449	ATT	2	6	1025968	1025973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21110	NC_006449	ATA	2	6	1025983	1025988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21111	NC_006449	ATT	2	6	1025993	1025998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21115	NC_006449	CAG	2	6	1026289	1026294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161936369
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21122	NC_006449	TGT	2	6	1026588	1026593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161936369
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21238	NC_006449	T	7	7	1032194	1032200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21239	NC_006449	GAAAA	2	10	1032235	1032244	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21240	NC_006449	A	7	7	1032241	1032247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21241	NC_006449	TAA	2	6	1032250	1032255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21243	NC_006449	TTA	3	9	1032261	1032269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21244	NC_006449	TGA	2	6	1032282	1032287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21245	NC_006449	TCTT	2	8	1032296	1032303	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21246	NC_006449	TCA	2	6	1032362	1032367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21247	NC_006449	ATC	2	6	1032376	1032381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21248	NC_006449	ACC	2	6	1032409	1032414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21249	NC_006449	GAT	2	6	1032439	1032444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21251	NC_006449	TCT	2	6	1032484	1032489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21252	NC_006449	CAA	2	6	1032496	1032501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21253	NC_006449	CCT	2	6	1032529	1032534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21261	NC_006449	A	6	6	1032766	1032771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21263	NC_006449	T	8	8	1032831	1032838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21264	NC_006449	A	6	6	1032879	1032884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21265	NC_006449	TAAA	2	8	1032916	1032923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21266	NC_006449	AGG	2	6	1033017	1033022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21269	NC_006449	A	6	6	1033058	1033063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21270	NC_006449	T	6	6	1033081	1033086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21271	NC_006449	ATT	2	6	1033102	1033107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55823098
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21276	NC_006449	TG	3	6	1033519	1033524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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21310	NC_006449	ATTGA	2	10	1035151	1035160	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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21343	NC_006449	T	6	6	1036767	1036772	0 %	100 %	0 %	0 %	55823102
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21350	NC_006449	CAA	2	6	1037124	1037129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55823102
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21352	NC_006449	TCC	2	6	1037195	1037200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21353	NC_006449	ATA	2	6	1037204	1037209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21354	NC_006449	TATAT	2	10	1037216	1037225	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21355	NC_006449	AAAT	2	8	1037240	1037247	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21356	NC_006449	A	6	6	1037262	1037267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21357	NC_006449	ATC	2	6	1037513	1037518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823103
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21363	NC_006449	CAT	2	6	1037973	1037978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55823104
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21366	NC_006449	GTT	2	6	1038241	1038246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55823104
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21385	NC_006449	CCAT	2	8	1039041	1039048	25 %	25 %	0 %	50 %	55823105
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21401	NC_006449	GAA	2	6	1039935	1039940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55823106
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21473	NC_006449	TA	3	6	1043894	1043899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21474	NC_006449	CT	3	6	1043908	1043913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21475	NC_006449	A	7	7	1043957	1043963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21477	NC_006449	A	7	7	1043976	1043982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21478	NC_006449	AGA	2	6	1043985	1043990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21479	NC_006449	T	7	7	1044001	1044007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21480	NC_006449	T	6	6	1044012	1044017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21481	NC_006449	ATA	2	6	1044047	1044052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55823110
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21483	NC_006449	GAC	2	6	1044309	1044314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21484	NC_006449	ATTG	2	8	1044376	1044383	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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