MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_006448	CCT	2	6	1706985	1706990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821899
35003	NC_006448	GAA	2	6	1707010	1707015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821899
35004	NC_006448	CTT	2	6	1707070	1707075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821899
35005	NC_006448	GT	3	6	1707103	1707108	0 %	50 %	50 %	0 %	55821899
35006	NC_006448	ACG	2	6	1707239	1707244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821899
35007	NC_006448	CAA	2	6	1707286	1707291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821899
35008	NC_006448	T	6	6	1707311	1707316	0 %	100 %	0 %	0 %	55821899
35009	NC_006448	GTGAA	2	10	1707428	1707437	40 %	20 %	40 %	0 %	55821899
35010	NC_006448	TGAA	2	8	1707504	1707511	50 %	25 %	25 %	0 %	55821899
35011	NC_006448	GAT	2	6	1707587	1707592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821899
35012	NC_006448	CCT	2	6	1707639	1707644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821900
35013	NC_006448	ACT	2	6	1707660	1707665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821900
35014	NC_006448	TTG	2	6	1707684	1707689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821900
35015	NC_006448	TTG	2	6	1707733	1707738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821900
35016	NC_006448	TAC	2	6	1707764	1707769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821900
35017	NC_006448	CCAAA	2	10	1707784	1707793	60 %	0 %	0 %	40 %	55821900
35018	NC_006448	GTT	2	6	1707794	1707799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821900
35019	NC_006448	CAA	2	6	1707835	1707840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821900
35020	NC_006448	GCT	2	6	1707846	1707851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821900
35021	NC_006448	GATTGC	2	12	1707872	1707883	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55821900
35022	NC_006448	TCC	3	9	1707993	1708001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35023	NC_006448	ACG	2	6	1708007	1708012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821901
35024	NC_006448	TCT	2	6	1708089	1708094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821901
35025	NC_006448	CAT	2	6	1708123	1708128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821901
35026	NC_006448	ACG	2	6	1708172	1708177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821901
35027	NC_006448	T	6	6	1708196	1708201	0 %	100 %	0 %	0 %	55821901
35028	NC_006448	T	6	6	1708229	1708234	0 %	100 %	0 %	0 %	55821901
35029	NC_006448	CGA	2	6	1708249	1708254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821901
35030	NC_006448	T	6	6	1708262	1708267	0 %	100 %	0 %	0 %	55821901
35031	NC_006448	TAAAT	2	10	1708300	1708309	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35032	NC_006448	AAG	2	6	1708330	1708335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35033	NC_006448	ATT	2	6	1708375	1708380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821902
35034	NC_006448	ACG	3	9	1708388	1708396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821902
35035	NC_006448	CAC	3	9	1708504	1708512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821902
35036	NC_006448	TTG	2	6	1708610	1708615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821902
35037	NC_006448	CTT	2	6	1708705	1708710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821902
35038	NC_006448	TGT	2	6	1708780	1708785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821902
35039	NC_006448	GAT	2	6	1708895	1708900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821902
35040	NC_006448	AGTGT	2	10	1708919	1708928	20 %	40 %	40 %	0 %	55821902
35041	NC_006448	AAC	2	6	1708976	1708981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821902
35042	NC_006448	TCAA	2	8	1709013	1709020	50 %	25 %	0 %	25 %	55821902
35043	NC_006448	TTG	2	6	1709073	1709078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821902
35044	NC_006448	AAG	2	6	1709155	1709160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821902
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35046	NC_006448	ATT	2	6	1709226	1709231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821903
35047	NC_006448	AAC	2	6	1709246	1709251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821903
35048	NC_006448	TGA	2	6	1709280	1709285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821903
35049	NC_006448	T	6	6	1709290	1709295	0 %	100 %	0 %	0 %	55821903
35050	NC_006448	TTTTG	2	10	1709333	1709342	0 %	80 %	20 %	0 %	55821903
35051	NC_006448	TG	3	6	1709421	1709426	0 %	50 %	50 %	0 %	55821903
35052	NC_006448	T	6	6	1709497	1709502	0 %	100 %	0 %	0 %	55821903
35053	NC_006448	CCT	2	6	1709534	1709539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821904
35054	NC_006448	TGA	2	6	1709544	1709549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821904
35055	NC_006448	CTT	2	6	1709555	1709560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821904
35056	NC_006448	AAG	2	6	1709568	1709573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821904
35057	NC_006448	TTGCAG	2	12	1709603	1709614	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55821904
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35059	NC_006448	CAG	2	6	1709735	1709740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821904
35060	NC_006448	GA	3	6	1709758	1709763	50 %	0 %	50 %	0 %	55821904
35061	NC_006448	TCT	2	6	1709785	1709790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821904
35062	NC_006448	CGA	2	6	1709827	1709832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821904
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35064	NC_006448	CCA	3	9	1709887	1709895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821904
35065	NC_006448	CCA	2	6	1709965	1709970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821904
35066	NC_006448	CTG	2	6	1709978	1709983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821904
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35069	NC_006448	TTA	2	6	1710168	1710173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821905
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35071	NC_006448	CTG	2	6	1710188	1710193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821905
35072	NC_006448	GTTT	2	8	1710329	1710336	0 %	75 %	25 %	0 %	55821905
35073	NC_006448	GAC	2	6	1710377	1710382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821905
35074	NC_006448	ACCTTT	2	12	1710450	1710461	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	55821905
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35081	NC_006448	T	6	6	1710852	1710857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35083	NC_006448	T	6	6	1710884	1710889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35084	NC_006448	AATC	2	8	1710900	1710907	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35085	NC_006448	TTAAA	2	10	1710909	1710918	60 %	40 %	0 %	0 %	55821906
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35088	NC_006448	T	6	6	1710976	1710981	0 %	100 %	0 %	0 %	55821906
35089	NC_006448	TG	3	6	1711012	1711017	0 %	50 %	50 %	0 %	55821906
35090	NC_006448	AAT	2	6	1711067	1711072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821906
35091	NC_006448	T	6	6	1711150	1711155	0 %	100 %	0 %	0 %	55821906
35092	NC_006448	T	7	7	1711207	1711213	0 %	100 %	0 %	0 %	55821906
35093	NC_006448	T	6	6	1711222	1711227	0 %	100 %	0 %	0 %	55821906
35094	NC_006448	CTC	2	6	1711228	1711233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35095	NC_006448	ATA	2	6	1711249	1711254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35096	NC_006448	CTC	2	6	1711261	1711266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35097	NC_006448	ATA	2	6	1711353	1711358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35098	NC_006448	AGA	2	6	1711366	1711371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35099	NC_006448	TTTTA	2	10	1711411	1711420	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35100	NC_006448	TAAA	2	8	1711430	1711437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35101	NC_006448	ATTA	2	8	1711465	1711472	50 %	50 %	0 %	0 %	55821907
35102	NC_006448	TAGG	2	8	1711562	1711569	25 %	25 %	50 %	0 %	55821907
35103	NC_006448	CATA	2	8	1711573	1711580	50 %	25 %	0 %	25 %	55821907
35104	NC_006448	TCT	2	6	1711581	1711586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821907
35105	NC_006448	GGA	2	6	1711669	1711674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821907
35106	NC_006448	T	6	6	1711675	1711680	0 %	100 %	0 %	0 %	55821907
35107	NC_006448	GTG	2	6	1711816	1711821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821907
35108	NC_006448	ATA	2	6	1711925	1711930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821907
35109	NC_006448	ACCA	2	8	1712000	1712007	50 %	0 %	0 %	50 %	55821907
35110	NC_006448	GTA	2	6	1712075	1712080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821907
35111	NC_006448	CTT	2	6	1712104	1712109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821907
35112	NC_006448	TCA	2	6	1712136	1712141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821907
35113	NC_006448	ATAA	2	8	1712142	1712149	75 %	25 %	0 %	0 %	55821907
35114	NC_006448	CAAA	2	8	1712293	1712300	75 %	0 %	0 %	25 %	55821907
35115	NC_006448	TCA	2	6	1712319	1712324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821907
35116	NC_006448	GCT	2	6	1712334	1712339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821907
35117	NC_006448	AT	3	6	1712382	1712387	50 %	50 %	0 %	0 %	55821907
35118	NC_006448	CTC	2	6	1712426	1712431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821907
35119	NC_006448	CAAAA	2	10	1712483	1712492	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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