MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34502	NC_006448	TA	3	6	1685204	1685209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34503	NC_006448	TCA	2	6	1685259	1685264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34504	NC_006448	ATA	2	6	1685276	1685281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821857
34505	NC_006448	TCT	2	6	1685288	1685293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821857
34506	NC_006448	TCG	2	6	1685345	1685350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821857
34507	NC_006448	TTC	2	6	1685425	1685430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821857
34508	NC_006448	TCG	2	6	1685451	1685456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821857
34509	NC_006448	TCA	2	6	1685492	1685497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821857
34510	NC_006448	GCT	2	6	1685504	1685509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821857
34511	NC_006448	CAC	2	6	1685526	1685531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821857
34512	NC_006448	CAGT	2	8	1685556	1685563	25 %	25 %	25 %	25 %	55821857
34513	NC_006448	CCA	2	6	1685659	1685664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821857
34514	NC_006448	GAAG	2	8	1685689	1685696	50 %	0 %	50 %	0 %	55821857
34515	NC_006448	ACC	2	6	1685749	1685754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821857
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34517	NC_006448	CTG	2	6	1685830	1685835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821857
34518	NC_006448	GGCA	2	8	1685863	1685870	25 %	0 %	50 %	25 %	55821857
34519	NC_006448	CACT	2	8	1685876	1685883	25 %	25 %	0 %	50 %	55821857
34520	NC_006448	AACT	2	8	1685935	1685942	50 %	25 %	0 %	25 %	55821857
34521	NC_006448	TCA	2	6	1685972	1685977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821857
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34523	NC_006448	TGA	2	6	1686033	1686038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821857
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34525	NC_006448	CCAA	2	8	1686078	1686085	50 %	0 %	0 %	50 %	55821857
34526	NC_006448	GCT	2	6	1686230	1686235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821857
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34528	NC_006448	ATG	2	6	1686327	1686332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821857
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34533	NC_006448	TCC	2	6	1686710	1686715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821857
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34539	NC_006448	TC	3	6	1687002	1687007	0 %	50 %	0 %	50 %	55821857
34540	NC_006448	GTT	2	6	1687025	1687030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821857
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34544	NC_006448	TCC	2	6	1687171	1687176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34545	NC_006448	TAT	2	6	1687196	1687201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34546	NC_006448	GCAC	2	8	1687328	1687335	25 %	0 %	25 %	50 %	55821858
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34550	NC_006448	CTTC	2	8	1687471	1687478	0 %	50 %	0 %	50 %	55821858
34551	NC_006448	AATT	2	8	1687509	1687516	50 %	50 %	0 %	0 %	55821858
34552	NC_006448	TA	3	6	1687520	1687525	50 %	50 %	0 %	0 %	55821858
34553	NC_006448	CATTG	2	10	1687636	1687645	20 %	40 %	20 %	20 %	55821858
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34574	NC_006448	AG	3	6	1689083	1689088	50 %	0 %	50 %	0 %	55821862
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34585	NC_006448	T	7	7	1689494	1689500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34587	NC_006448	A	6	6	1689524	1689529	100 %	0 %	0 %	0 %	55821864
34588	NC_006448	TAG	2	6	1689615	1689620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821864
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34592	NC_006448	TC	3	6	1689813	1689818	0 %	50 %	0 %	50 %	55821865
34593	NC_006448	ATC	2	6	1689827	1689832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821865
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34595	NC_006448	TC	3	6	1689844	1689849	0 %	50 %	0 %	50 %	55821865
34596	NC_006448	AAG	2	6	1689868	1689873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821865
34597	NC_006448	TGT	2	6	1689925	1689930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821865
34598	NC_006448	CTCAA	2	10	1689963	1689972	40 %	20 %	0 %	40 %	55821865
34599	NC_006448	GCA	2	6	1689975	1689980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821865
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34602	NC_006448	CGT	2	6	1690114	1690119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821865
34603	NC_006448	AAT	2	6	1690145	1690150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821865
34604	NC_006448	TAT	2	6	1690208	1690213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821865
34605	NC_006448	TCA	2	6	1690222	1690227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821865
34606	NC_006448	CAC	2	6	1690328	1690333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821866
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34608	NC_006448	ATA	2	6	1690390	1690395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821866
34609	NC_006448	TCT	2	6	1690477	1690482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821866
34610	NC_006448	TCC	2	6	1690495	1690500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821866
34611	NC_006448	AGC	2	6	1690512	1690517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821866
34612	NC_006448	CCA	2	6	1690531	1690536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821866
34613	NC_006448	AAGC	2	8	1690583	1690590	50 %	0 %	25 %	25 %	55821866
34614	NC_006448	CAA	2	6	1690598	1690603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821866
34615	NC_006448	CCA	2	6	1690729	1690734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821866
34616	NC_006448	GATCCA	2	12	1690771	1690782	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55821866
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34980	NC_006448	T	6	6	1706186	1706191	0 %	100 %	0 %	0 %	55821896
34981	NC_006448	AGT	2	6	1706194	1706199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821896
34982	NC_006448	GGT	2	6	1706221	1706226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821896
34983	NC_006448	TAC	2	6	1706276	1706281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821896
34984	NC_006448	CAA	2	6	1706287	1706292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821896
34985	NC_006448	ATT	2	6	1706316	1706321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821896
34986	NC_006448	TAT	2	6	1706343	1706348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821897
34987	NC_006448	T	6	6	1706387	1706392	0 %	100 %	0 %	0 %	55821897
34988	NC_006448	CTG	2	6	1706428	1706433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821897
34989	NC_006448	TTCT	2	8	1706459	1706466	0 %	75 %	0 %	25 %	55821897
34990	NC_006448	T	6	6	1706480	1706485	0 %	100 %	0 %	0 %	55821897
34991	NC_006448	CTT	2	6	1706494	1706499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821897
34992	NC_006448	CAA	2	6	1706521	1706526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821897
34993	NC_006448	TTC	2	6	1706537	1706542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821897
34994	NC_006448	TCT	2	6	1706553	1706558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34995	NC_006448	CTT	2	6	1706638	1706643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821898
34996	NC_006448	TG	3	6	1706761	1706766	0 %	50 %	50 %	0 %	55821898
34997	NC_006448	ACC	2	6	1706789	1706794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821898
34998	NC_006448	AGC	2	6	1706825	1706830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821898
34999	NC_006448	CTT	2	6	1706896	1706901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821898
35000	NC_006448	ACC	2	6	1706903	1706908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821898

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