MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_006448	TAG	2	6	144341	144346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_006448	TTC	2	6	144386	144391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_006448	TCG	2	6	144404	144409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_006448	AGT	2	6	144515	144520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820225
3005	NC_006448	GAT	2	6	144539	144544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820225
3006	NC_006448	GAAA	2	8	144545	144552	75 %	0 %	25 %	0 %	55820225
3007	NC_006448	TCAC	2	8	144676	144683	25 %	25 %	0 %	50 %	55820225
3008	NC_006448	AAT	2	6	144726	144731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820225
3009	NC_006448	CTTT	2	8	144799	144806	0 %	75 %	0 %	25 %	55820225
3010	NC_006448	CAT	2	6	144846	144851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820225
3011	NC_006448	ATT	2	6	144946	144951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_006448	ATTGAA	2	12	145170	145181	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	55820226
3013	NC_006448	GCA	2	6	145183	145188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820226
3014	NC_006448	ATTG	2	8	145196	145203	25 %	50 %	25 %	0 %	55820226
3015	NC_006448	T	6	6	145229	145234	0 %	100 %	0 %	0 %	55820226
3016	NC_006448	GAAT	2	8	145292	145299	50 %	25 %	25 %	0 %	55820226
3017	NC_006448	AGA	2	6	145304	145309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820226
3018	NC_006448	GGATG	2	10	145397	145406	20 %	20 %	60 %	0 %	55820226
3019	NC_006448	GAA	2	6	145413	145418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820226
3020	NC_006448	AAG	2	6	145473	145478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820226
3021	NC_006448	AGA	2	6	145565	145570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820226
3022	NC_006448	TGG	2	6	145841	145846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820226
3023	NC_006448	CA	4	8	145874	145881	50 %	0 %	0 %	50 %	55820226
3024	NC_006448	TGC	2	6	146045	146050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820226
3025	NC_006448	T	6	6	146199	146204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_006448	CAAG	2	8	146277	146284	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_006448	GTGA	2	8	146327	146334	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_006448	TTA	2	6	146348	146353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_006448	TAT	2	6	146364	146369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_006448	TACAGC	2	12	146370	146381	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_006448	CAG	2	6	146428	146433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820227
3032	NC_006448	TCT	2	6	146507	146512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820227
3033	NC_006448	TG	3	6	146550	146555	0 %	50 %	50 %	0 %	55820227
3034	NC_006448	ACG	2	6	146648	146653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820227
3035	NC_006448	T	6	6	146654	146659	0 %	100 %	0 %	0 %	55820227
3036	NC_006448	GTA	2	6	146665	146670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820227
3037	NC_006448	T	7	7	146712	146718	0 %	100 %	0 %	0 %	55820227
3038	NC_006448	ATC	2	6	146733	146738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820227
3039	NC_006448	ATG	2	6	146758	146763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820227
3040	NC_006448	ATG	2	6	146829	146834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820227
3041	NC_006448	TAA	2	6	146872	146877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820227
3042	NC_006448	TTC	2	6	146888	146893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_006448	ATG	2	6	146897	146902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_006448	AGT	2	6	146973	146978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_006448	ATA	2	6	147008	147013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_006448	A	6	6	147036	147041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_006448	CTG	2	6	147068	147073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_006448	ATTG	2	8	147083	147090	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_006448	T	7	7	147106	147112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_006448	AGT	2	6	147226	147231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_006448	TA	3	6	147237	147242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_006448	TTC	2	6	147253	147258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_006448	TTG	2	6	147360	147365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_006448	GAA	2	6	147465	147470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_006448	ACC	2	6	147474	147479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_006448	GTGG	2	8	147487	147494	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_006448	TTAT	2	8	147534	147541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_006448	AT	3	6	147548	147553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_006448	ATTTAT	2	12	147613	147624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_006448	AAG	2	6	147645	147650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820228
3061	NC_006448	GAT	2	6	147751	147756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820228
3062	NC_006448	A	6	6	147775	147780	100 %	0 %	0 %	0 %	55820228
3063	NC_006448	GAT	3	9	147800	147808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820228
3064	NC_006448	CGT	2	6	147815	147820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820228
3065	NC_006448	ATG	2	6	147852	147857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820228
3066	NC_006448	GGC	2	6	147864	147869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55820228
3067	NC_006448	ATG	2	6	147975	147980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820228
3068	NC_006448	ATC	2	6	148009	148014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820228
3069	NC_006448	TTG	2	6	148040	148045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820228
3070	NC_006448	GGT	2	6	148046	148051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820228
3071	NC_006448	GAT	2	6	148075	148080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820228
3072	NC_006448	GAA	2	6	148124	148129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820228
3073	NC_006448	ATT	2	6	148142	148147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_006448	GTTT	2	8	148153	148160	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_006448	ATT	2	6	148179	148184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_006448	TTA	2	6	148202	148207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_006448	GTTT	2	8	148229	148236	0 %	75 %	25 %	0 %	55820229
3078	NC_006448	TTTA	2	8	148286	148293	25 %	75 %	0 %	0 %	55820229
3079	NC_006448	TTG	2	6	148337	148342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820229
3080	NC_006448	T	6	6	148347	148352	0 %	100 %	0 %	0 %	55820229
3081	NC_006448	GAT	2	6	148406	148411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820229
3082	NC_006448	AAT	2	6	148424	148429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820229
3083	NC_006448	TGT	2	6	148447	148452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820229
3084	NC_006448	TTG	2	6	148463	148468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820229
3085	NC_006448	AGT	2	6	148616	148621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820229
3086	NC_006448	TAG	2	6	148633	148638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820229
3087	NC_006448	TCT	2	6	148692	148697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820229
3088	NC_006448	A	6	6	148707	148712	100 %	0 %	0 %	0 %	55820229
3089	NC_006448	ACG	2	6	148719	148724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820229
3090	NC_006448	TGCA	2	8	148854	148861	25 %	25 %	25 %	25 %	55820229
3091	NC_006448	T	7	7	148885	148891	0 %	100 %	0 %	0 %	55820229
3092	NC_006448	GAT	2	6	148979	148984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820229
3093	NC_006448	GAA	2	6	148987	148992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820229
3094	NC_006448	AAATT	2	10	149040	149049	60 %	40 %	0 %	0 %	55820229
3095	NC_006448	TA	3	6	149054	149059	50 %	50 %	0 %	0 %	55820229
3096	NC_006448	TTA	2	6	149131	149136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_006448	A	7	7	149145	149151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_006448	TAAAC	2	10	149176	149185	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3099	NC_006448	GTG	2	6	149252	149257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820230
3100	NC_006448	GAA	2	6	149395	149400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820230
3101	NC_006448	GAT	2	6	149410	149415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820230
3102	NC_006448	CAG	2	6	149435	149440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820230
3103	NC_006448	AGC	2	6	149448	149453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820230
3104	NC_006448	TGT	2	6	149475	149480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820230
3105	NC_006448	GTT	2	6	149545	149550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820230
3106	NC_006448	AAG	2	6	149612	149617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820230
3107	NC_006448	GAA	2	6	149626	149631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820230
3108	NC_006448	AACG	2	8	149650	149657	50 %	0 %	25 %	25 %	55820230
3109	NC_006448	ATTG	2	8	149673	149680	25 %	50 %	25 %	0 %	55820230
3110	NC_006448	GGT	2	6	149758	149763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820230
3111	NC_006448	CT	3	6	149778	149783	0 %	50 %	0 %	50 %	55820230
3112	NC_006448	TTGG	2	8	149827	149834	0 %	50 %	50 %	0 %	55820230
3113	NC_006448	TGA	2	6	149847	149852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820230
3114	NC_006448	AGA	2	6	149877	149882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820230
3115	NC_006448	GCT	2	6	149911	149916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820230
3116	NC_006448	AAG	2	6	149951	149956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820230
3117	NC_006448	TGA	3	9	149967	149975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820230
3118	NC_006448	TGA	2	6	149991	149996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820230
3119	NC_006448	TGA	2	6	150012	150017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820230
3120	NC_006448	AGC	2	6	150048	150053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820230
3121	NC_006448	TGA	2	6	150069	150074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820230
3122	NC_006448	TGC	2	6	150087	150092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820230
3123	NC_006448	CAG	2	6	150134	150139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820230
3124	NC_006448	TGC	3	9	150318	150326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820230
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3126	NC_006448	CTT	2	6	150418	150423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820230
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3250	NC_006448	TTGA	2	8	156568	156575	25 %	50 %	25 %	0 %	55820238
3251	NC_006448	ACT	2	6	156753	156758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820239
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3281	NC_006448	A	7	7	158519	158525	100 %	0 %	0 %	0 %	55820241
3282	NC_006448	T	6	6	158556	158561	0 %	100 %	0 %	0 %	55820241
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3290	NC_006448	TCTA	2	8	159042	159049	25 %	50 %	0 %	25 %	55820242
3291	NC_006448	TGTT	2	8	159057	159064	0 %	75 %	25 %	0 %	55820242
3292	NC_006448	TGT	2	6	159084	159089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820242
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3294	NC_006448	TAA	2	6	159115	159120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3296	NC_006448	ATAAA	2	10	159158	159167	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3297	NC_006448	TTAA	2	8	159170	159177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3336	NC_006448	TTGG	2	8	161517	161524	0 %	50 %	50 %	0 %	55820244
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3348	NC_006448	A	6	6	162034	162039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3349	NC_006448	ATG	2	6	162049	162054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3350	NC_006448	A	6	6	162080	162085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3351	NC_006448	CAAATA	2	12	162106	162117	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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3353	NC_006448	T	6	6	162150	162155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3354	NC_006448	AAAG	2	8	162177	162184	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3355	NC_006448	ATT	2	6	162198	162203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3359	NC_006448	TTA	2	6	162293	162298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3362	NC_006448	AGT	2	6	162514	162519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820245
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3366	NC_006448	TTCT	2	8	162730	162737	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3367	NC_006448	GAT	2	6	162978	162983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820246
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3369	NC_006448	AACT	2	8	163069	163076	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3370	NC_006448	ACA	2	6	163115	163120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3371	NC_006448	GCT	2	6	163205	163210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3372	NC_006448	AGT	2	6	163289	163294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820247
3373	NC_006448	TCAA	2	8	163302	163309	50 %	25 %	0 %	25 %	55820247
3374	NC_006448	ACA	3	9	163374	163382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820247
3375	NC_006448	TCAGAA	2	12	163401	163412	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	55820247
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