MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_006448	AGC	2	6	1661700	1661705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821839
34003	NC_006448	TTGT	2	8	1661718	1661725	0 %	75 %	25 %	0 %	55821839
34004	NC_006448	AGT	3	9	1661777	1661785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821839
34005	NC_006448	ATG	2	6	1661857	1661862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821839
34006	NC_006448	TCT	2	6	1661876	1661881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821839
34007	NC_006448	TGT	2	6	1661982	1661987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821839
34008	NC_006448	GTT	2	6	1662046	1662051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821839
34009	NC_006448	TTTC	2	8	1662074	1662081	0 %	75 %	0 %	25 %	55821839
34010	NC_006448	TCA	2	6	1662166	1662171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821839
34011	NC_006448	ACCTTC	2	12	1662189	1662200	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	55821839
34012	NC_006448	AAG	2	6	1662306	1662311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821839
34013	NC_006448	CTT	2	6	1662335	1662340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821839
34014	NC_006448	ATCA	2	8	1662432	1662439	50 %	25 %	0 %	25 %	55821839
34015	NC_006448	AAG	2	6	1662492	1662497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821839
34016	NC_006448	TCA	2	6	1662544	1662549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821839
34017	NC_006448	AGC	2	6	1662570	1662575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821839
34018	NC_006448	CAC	2	6	1662659	1662664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821839
34019	NC_006448	AACGG	2	10	1662699	1662708	40 %	0 %	40 %	20 %	55821839
34020	NC_006448	CAAG	2	8	1662731	1662738	50 %	0 %	25 %	25 %	55821839
34021	NC_006448	GAC	2	6	1662794	1662799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821839
34022	NC_006448	GAC	2	6	1662818	1662823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821839
34023	NC_006448	ACG	2	6	1662825	1662830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821839
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34025	NC_006448	GAT	2	6	1662888	1662893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821839
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34028	NC_006448	TGC	2	6	1662975	1662980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821839
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34030	NC_006448	CCAT	2	8	1663049	1663056	25 %	25 %	0 %	50 %	55821839
34031	NC_006448	TTA	2	6	1663063	1663068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821839
34032	NC_006448	ACG	2	6	1663101	1663106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821839
34033	NC_006448	CTT	2	6	1663148	1663153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821839
34034	NC_006448	AG	3	6	1663283	1663288	50 %	0 %	50 %	0 %	55821839
34035	NC_006448	CTT	2	6	1663349	1663354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821839
34036	NC_006448	CGA	2	6	1663465	1663470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821839
34037	NC_006448	TAG	2	6	1663565	1663570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821839
34038	NC_006448	TCG	2	6	1663585	1663590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821839
34039	NC_006448	CTTT	2	8	1663740	1663747	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34040	NC_006448	AGC	2	6	1663763	1663768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34041	NC_006448	CT	3	6	1663815	1663820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34042	NC_006448	TTATT	2	10	1663826	1663835	20 %	80 %	0 %	0 %	55821840
34043	NC_006448	CTT	3	9	1663851	1663859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821840
34044	NC_006448	CAG	2	6	1663875	1663880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821840
34045	NC_006448	CTT	2	6	1663881	1663886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821840
34046	NC_006448	TTG	2	6	1663891	1663896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821840
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34049	NC_006448	TCA	2	6	1663949	1663954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821840
34050	NC_006448	TCA	2	6	1663985	1663990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821840
34051	NC_006448	GAA	2	6	1664148	1664153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821840
34052	NC_006448	CCA	2	6	1664210	1664215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821840
34053	NC_006448	ACC	2	6	1664227	1664232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821840
34054	NC_006448	GTT	2	6	1664238	1664243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821840
34055	NC_006448	GAGT	2	8	1664251	1664258	25 %	25 %	50 %	0 %	55821840
34056	NC_006448	ATC	2	6	1664287	1664292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821840
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34058	NC_006448	TCT	2	6	1664429	1664434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821840
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34062	NC_006448	GAC	2	6	1664640	1664645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821840
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34065	NC_006448	CAC	2	6	1664775	1664780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821840
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34102	NC_006448	GT	3	6	1666401	1666406	0 %	50 %	50 %	0 %	55821840
34103	NC_006448	AATC	2	8	1666449	1666456	50 %	25 %	0 %	25 %	55821840
34104	NC_006448	CAA	2	6	1666485	1666490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821840
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34106	NC_006448	T	6	6	1666564	1666569	0 %	100 %	0 %	0 %	55821840
34107	NC_006448	CAG	2	6	1666590	1666595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821840
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34109	NC_006448	CAAG	2	8	1666632	1666639	50 %	0 %	25 %	25 %	55821840
34110	NC_006448	CAG	2	6	1666653	1666658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821840
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34113	NC_006448	CAA	2	6	1666788	1666793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821840
34114	NC_006448	TCA	2	6	1666799	1666804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821840
34115	NC_006448	GCAC	2	8	1666820	1666827	25 %	0 %	25 %	50 %	55821840
34116	NC_006448	TCAAGC	2	12	1666895	1666906	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55821840
34117	NC_006448	ATA	2	6	1667012	1667017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821840
34118	NC_006448	CAC	2	6	1667022	1667027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821840
34119	NC_006448	TGA	2	6	1667031	1667036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821840
34120	NC_006448	GAA	2	6	1667074	1667079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821840
34121	NC_006448	TAA	2	6	1667115	1667120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821840
34122	NC_006448	ATG	2	6	1667151	1667156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821840
34123	NC_006448	CAT	2	6	1667157	1667162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821840
34124	NC_006448	CTT	2	6	1667172	1667177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821840
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34126	NC_006448	ATTCCA	2	12	1667217	1667228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821840
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34128	NC_006448	TCAA	2	8	1667321	1667328	50 %	25 %	0 %	25 %	55821840
34129	NC_006448	CTT	2	6	1667346	1667351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821840
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34132	NC_006448	T	6	6	1667483	1667488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34133	NC_006448	AGC	2	6	1667631	1667636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34134	NC_006448	A	6	6	1667649	1667654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34135	NC_006448	CTG	2	6	1667666	1667671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34136	NC_006448	TCAA	2	8	1667694	1667701	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34137	NC_006448	GAC	2	6	1667706	1667711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34138	NC_006448	TAT	2	6	1667758	1667763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34141	NC_006448	AT	3	6	1668057	1668062	50 %	50 %	0 %	0 %	55821841
34142	NC_006448	TCA	2	6	1668108	1668113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821841
34143	NC_006448	CAAC	2	8	1668154	1668161	50 %	0 %	0 %	50 %	55821841
34144	NC_006448	GTC	2	6	1668183	1668188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821841
34145	NC_006448	CTT	2	6	1668280	1668285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821841
34146	NC_006448	TAAG	2	8	1668286	1668293	50 %	25 %	25 %	0 %	55821841
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34148	NC_006448	ATCA	2	8	1668386	1668393	50 %	25 %	0 %	25 %	55821841
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34179	NC_006448	CCTT	2	8	1670086	1670093	0 %	50 %	0 %	50 %	55821841
34180	NC_006448	T	7	7	1670113	1670119	0 %	100 %	0 %	0 %	55821841
34181	NC_006448	TAT	2	6	1670177	1670182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821841
34182	NC_006448	T	6	6	1670182	1670187	0 %	100 %	0 %	0 %	55821841
34183	NC_006448	TAT	2	6	1670215	1670220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34215	NC_006448	TTG	2	6	1671359	1671364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821842
34216	NC_006448	CTAT	2	8	1671431	1671438	25 %	50 %	0 %	25 %	55821842
34217	NC_006448	AAG	2	6	1671526	1671531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821842
34218	NC_006448	T	8	8	1671588	1671595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34219	NC_006448	AC	3	6	1671596	1671601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34220	NC_006448	A	6	6	1671643	1671648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34221	NC_006448	CAT	2	6	1671701	1671706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821843
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34223	NC_006448	AGC	2	6	1671774	1671779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821843
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34225	NC_006448	CAG	2	6	1671938	1671943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821843
34226	NC_006448	ATTG	2	8	1671952	1671959	25 %	50 %	25 %	0 %	55821843
34227	NC_006448	ATTTC	2	10	1672004	1672013	20 %	60 %	0 %	20 %	55821843
34228	NC_006448	ACC	2	6	1672098	1672103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821843
34229	NC_006448	CAAA	2	8	1672124	1672131	75 %	0 %	0 %	25 %	55821843
34230	NC_006448	TCT	2	6	1672132	1672137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821843
34231	NC_006448	TCT	2	6	1672144	1672149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821843
34232	NC_006448	TGT	2	6	1672155	1672160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821843
34233	NC_006448	AAG	2	6	1672164	1672169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821843
34234	NC_006448	TGC	2	6	1672179	1672184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821843
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34475	NC_006448	AAGT	2	8	1683713	1683720	50 %	25 %	25 %	0 %	55821854
34476	NC_006448	GAA	2	6	1683736	1683741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821854
34477	NC_006448	TTG	2	6	1683747	1683752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821854
34478	NC_006448	ATG	2	6	1683873	1683878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821854
34479	NC_006448	TGT	2	6	1683885	1683890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821854
34480	NC_006448	TTGGAG	2	12	1683967	1683978	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	55821854
34481	NC_006448	T	6	6	1684045	1684050	0 %	100 %	0 %	0 %	55821854
34482	NC_006448	TTG	2	6	1684128	1684133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821854
34483	NC_006448	ACT	2	6	1684261	1684266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821855
34484	NC_006448	T	6	6	1684290	1684295	0 %	100 %	0 %	0 %	55821855
34485	NC_006448	AAT	2	6	1684299	1684304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821855
34486	NC_006448	TCA	2	6	1684339	1684344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821855
34487	NC_006448	GCT	2	6	1684366	1684371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821855
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34490	NC_006448	CAG	2	6	1684452	1684457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34491	NC_006448	CCA	2	6	1684539	1684544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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34494	NC_006448	GAT	2	6	1684685	1684690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34495	NC_006448	GTT	2	6	1684781	1684786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821856
34496	NC_006448	AAACC	2	10	1684827	1684836	60 %	0 %	0 %	40 %	55821856
34497	NC_006448	TCA	2	6	1684955	1684960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821856
34498	NC_006448	AGC	2	6	1684996	1685001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821856
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34500	NC_006448	GTTT	2	8	1685117	1685124	0 %	75 %	25 %	0 %	55821856

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