MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33503	NC_006448	TGT	2	6	1637919	1637924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821806
33504	NC_006448	TCG	2	6	1638061	1638066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821807
33505	NC_006448	TCT	2	6	1638074	1638079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821807
33506	NC_006448	T	6	6	1638083	1638088	0 %	100 %	0 %	0 %	55821807
33507	NC_006448	CTT	2	6	1638156	1638161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821807
33508	NC_006448	GGTTT	2	10	1638171	1638180	0 %	60 %	40 %	0 %	55821807
33509	NC_006448	ACG	2	6	1638199	1638204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821807
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33512	NC_006448	TGT	2	6	1638352	1638357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821807
33513	NC_006448	TAG	2	6	1638393	1638398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821807
33514	NC_006448	T	6	6	1638469	1638474	0 %	100 %	0 %	0 %	55821807
33515	NC_006448	CTT	2	6	1638547	1638552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821807
33516	NC_006448	CTT	2	6	1638588	1638593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821807
33517	NC_006448	CTT	2	6	1638669	1638674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821807
33518	NC_006448	CTT	2	6	1638722	1638727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821807
33519	NC_006448	ATA	2	6	1638734	1638739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821807
33520	NC_006448	ATTTTT	2	12	1638767	1638778	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	55821807
33521	NC_006448	ATA	2	6	1638807	1638812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33522	NC_006448	ATTTA	2	10	1638828	1638837	40 %	60 %	0 %	0 %	55821808
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33529	NC_006448	TAAA	2	8	1639204	1639211	75 %	25 %	0 %	0 %	55821808
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33532	NC_006448	GAAAA	2	10	1639282	1639291	80 %	0 %	20 %	0 %	55821808
33533	NC_006448	CGT	2	6	1639450	1639455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821808
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33540	NC_006448	CAAT	2	8	1639928	1639935	50 %	25 %	0 %	25 %	55821809
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33542	NC_006448	TATCA	2	10	1640033	1640042	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33543	NC_006448	A	6	6	1640042	1640047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33544	NC_006448	T	7	7	1640072	1640078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33545	NC_006448	TCAC	2	8	1640133	1640140	25 %	25 %	0 %	50 %	55821810
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33553	NC_006448	GAG	2	6	1640450	1640455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821810
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33574	NC_006448	TGA	2	6	1641370	1641375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821811
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33598	NC_006448	A	7	7	1642936	1642942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33599	NC_006448	CAA	2	6	1642946	1642951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33600	NC_006448	TAC	2	6	1642978	1642983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821814
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33603	NC_006448	CA	3	6	1643126	1643131	50 %	0 %	0 %	50 %	55821814
33604	NC_006448	GAT	2	6	1643224	1643229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821814
33605	NC_006448	GTC	2	6	1643275	1643280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821814
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33608	NC_006448	TAG	2	6	1643571	1643576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821814
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33610	NC_006448	A	6	6	1643649	1643654	100 %	0 %	0 %	0 %	55821814
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33612	NC_006448	A	7	7	1643811	1643817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33613	NC_006448	CA	3	6	1643821	1643826	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33614	NC_006448	GCT	2	6	1643843	1643848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33615	NC_006448	TCC	2	6	1643853	1643858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33616	NC_006448	AAGAC	2	10	1643936	1643945	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33617	NC_006448	ATT	2	6	1643974	1643979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33745	NC_006448	GTA	2	6	1649593	1649598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821823
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33971	NC_006448	TTA	2	6	1659963	1659968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33972	NC_006448	TGA	2	6	1660039	1660044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33979	NC_006448	GAAT	2	8	1660323	1660330	50 %	25 %	25 %	0 %	55821839
33980	NC_006448	AAG	2	6	1660359	1660364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821839
33981	NC_006448	ACC	2	6	1660389	1660394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821839
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