MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_006448	TAA	2	6	1614292	1614297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33003	NC_006448	ATA	2	6	1614307	1614312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33004	NC_006448	AAGA	2	8	1614377	1614384	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33005	NC_006448	A	7	7	1614384	1614390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33006	NC_006448	TAAA	2	8	1614410	1614417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33007	NC_006448	TCA	2	6	1614492	1614497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821778
33008	NC_006448	CAA	2	6	1614590	1614595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821778
33009	NC_006448	GT	3	6	1614613	1614618	0 %	50 %	50 %	0 %	55821778
33010	NC_006448	TCT	2	6	1614666	1614671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821778
33011	NC_006448	GCA	2	6	1614678	1614683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821778
33012	NC_006448	ACT	2	6	1614690	1614695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821778
33013	NC_006448	ATCA	2	8	1614785	1614792	50 %	25 %	0 %	25 %	55821778
33014	NC_006448	GTTT	2	8	1614829	1614836	0 %	75 %	25 %	0 %	55821778
33015	NC_006448	ACC	2	6	1614905	1614910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821778
33016	NC_006448	CGA	2	6	1615020	1615025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821778
33017	NC_006448	T	6	6	1615073	1615078	0 %	100 %	0 %	0 %	55821778
33018	NC_006448	TCA	2	6	1615123	1615128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821778
33019	NC_006448	ATT	2	6	1615145	1615150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821778
33020	NC_006448	CTGAA	2	10	1615151	1615160	40 %	20 %	20 %	20 %	55821778
33021	NC_006448	GAAA	2	8	1615176	1615183	75 %	0 %	25 %	0 %	55821778
33022	NC_006448	TCC	2	6	1615268	1615273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821778
33023	NC_006448	CCA	2	6	1615320	1615325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821778
33024	NC_006448	TCA	2	6	1615341	1615346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821778
33025	NC_006448	GAT	2	6	1615363	1615368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821778
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33029	NC_006448	TCTT	2	8	1615524	1615531	0 %	75 %	0 %	25 %	55821778
33030	NC_006448	ATCA	2	8	1615556	1615563	50 %	25 %	0 %	25 %	55821778
33031	NC_006448	T	6	6	1615601	1615606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33032	NC_006448	AGCG	2	8	1615607	1615614	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33033	NC_006448	CT	3	6	1615665	1615670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33034	NC_006448	TCA	2	6	1615704	1615709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33036	NC_006448	ACT	2	6	1615816	1615821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821779
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33039	NC_006448	AT	3	6	1615911	1615916	50 %	50 %	0 %	0 %	55821779
33040	NC_006448	GTCG	2	8	1616011	1616018	0 %	25 %	50 %	25 %	55821779
33041	NC_006448	GAG	2	6	1616061	1616066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821779
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33044	NC_006448	GTA	2	6	1616256	1616261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821779
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33048	NC_006448	GGA	2	6	1616353	1616358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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33050	NC_006448	A	6	6	1616426	1616431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33051	NC_006448	ACG	3	9	1616495	1616503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821780
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33054	NC_006448	ATT	2	6	1616674	1616679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33055	NC_006448	ATT	2	6	1616719	1616724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33056	NC_006448	TA	3	6	1616808	1616813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33057	NC_006448	CTC	2	6	1616826	1616831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33058	NC_006448	T	6	6	1616890	1616895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33059	NC_006448	CTCA	2	8	1616903	1616910	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33060	NC_006448	A	6	6	1617011	1617016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33061	NC_006448	TAT	2	6	1617026	1617031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33062	NC_006448	TCT	2	6	1617109	1617114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33063	NC_006448	T	7	7	1617204	1617210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33064	NC_006448	AG	3	6	1617224	1617229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33065	NC_006448	TTG	2	6	1617240	1617245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33068	NC_006448	TAT	2	6	1617321	1617326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33069	NC_006448	GTA	2	6	1617368	1617373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33071	NC_006448	A	9	9	1617432	1617440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33072	NC_006448	GCAA	2	8	1617467	1617474	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33073	NC_006448	CAC	2	6	1617502	1617507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821781
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33076	NC_006448	ATGA	2	8	1617574	1617581	50 %	25 %	25 %	0 %	55821781
33077	NC_006448	CT	3	6	1617619	1617624	0 %	50 %	0 %	50 %	55821781
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33102	NC_006448	TCT	2	6	1618431	1618436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821781
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33123	NC_006448	TTC	2	6	1619393	1619398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33241	NC_006448	ACC	2	6	1625315	1625320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33242	NC_006448	ATC	2	6	1625449	1625454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33246	NC_006448	TGGA	2	8	1625787	1625794	25 %	25 %	50 %	0 %	55821787
33247	NC_006448	CTG	3	9	1625844	1625852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821787
33248	NC_006448	AGTA	2	8	1625865	1625872	50 %	25 %	25 %	0 %	55821787
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33251	NC_006448	ACTT	2	8	1625981	1625988	25 %	50 %	0 %	25 %	55821788
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33340	NC_006448	ATA	2	6	1629660	1629665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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