MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_006448	ACG	2	6	1542269	1542274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821702
31502	NC_006448	CCA	2	6	1542309	1542314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821702
31503	NC_006448	CAC	2	6	1542385	1542390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821702
31504	NC_006448	ATA	2	6	1542408	1542413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821702
31505	NC_006448	CTT	2	6	1542418	1542423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821702
31506	NC_006448	CAAC	2	8	1542469	1542476	50 %	0 %	0 %	50 %	55821702
31507	NC_006448	ACG	2	6	1542545	1542550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821702
31508	NC_006448	TCA	2	6	1542606	1542611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821702
31509	NC_006448	TTG	2	6	1542637	1542642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821702
31510	NC_006448	TACCAG	2	12	1542697	1542708	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55821702
31511	NC_006448	CTT	2	6	1542796	1542801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821702
31512	NC_006448	TGG	2	6	1542816	1542821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821702
31513	NC_006448	ACG	2	6	1542836	1542841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821702
31514	NC_006448	CAA	2	6	1542871	1542876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821702
31515	NC_006448	GAA	2	6	1543004	1543009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821702
31516	NC_006448	TTG	2	6	1543054	1543059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821702
31517	NC_006448	ATC	2	6	1543076	1543081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821702
31518	NC_006448	TCA	2	6	1543176	1543181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821702
31519	NC_006448	AAC	2	6	1543250	1543255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821702
31520	NC_006448	ACCT	2	8	1543280	1543287	25 %	25 %	0 %	50 %	55821702
31521	NC_006448	TTCCC	2	10	1543506	1543515	0 %	40 %	0 %	60 %	55821702
31522	NC_006448	ACC	2	6	1543556	1543561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821702
31523	NC_006448	AAC	2	6	1543616	1543621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821702
31524	NC_006448	GTT	2	6	1543672	1543677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821702
31525	NC_006448	TTC	2	6	1543682	1543687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821702
31526	NC_006448	TTC	2	6	1543703	1543708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821702
31527	NC_006448	GCC	2	6	1543719	1543724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55821702
31528	NC_006448	T	6	6	1543759	1543764	0 %	100 %	0 %	0 %	55821702
31529	NC_006448	T	6	6	1543769	1543774	0 %	100 %	0 %	0 %	55821702
31530	NC_006448	AT	3	6	1543810	1543815	50 %	50 %	0 %	0 %	55821702
31531	NC_006448	T	6	6	1543824	1543829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31532	NC_006448	A	6	6	1543907	1543912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31533	NC_006448	CTT	2	6	1543959	1543964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31534	NC_006448	AAAG	2	8	1544077	1544084	75 %	0 %	25 %	0 %	55821703
31535	NC_006448	ACT	2	6	1544092	1544097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821703
31536	NC_006448	CAC	2	6	1544202	1544207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821703
31537	NC_006448	ATA	2	6	1544266	1544271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31538	NC_006448	ATA	2	6	1544284	1544289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31539	NC_006448	TACTCA	2	12	1544340	1544351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821704
31540	NC_006448	TGAC	2	8	1544365	1544372	25 %	25 %	25 %	25 %	55821704
31541	NC_006448	ATC	2	6	1544374	1544379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821704
31542	NC_006448	ATT	2	6	1544412	1544417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821704
31543	NC_006448	GAA	2	6	1544420	1544425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821704
31544	NC_006448	T	7	7	1544439	1544445	0 %	100 %	0 %	0 %	55821704
31545	NC_006448	ATC	2	6	1544700	1544705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821704
31546	NC_006448	TTG	2	6	1544748	1544753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821704
31547	NC_006448	AGGATA	2	12	1544761	1544772	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	55821704
31548	NC_006448	GCAT	2	8	1544785	1544792	25 %	25 %	25 %	25 %	55821704
31549	NC_006448	T	7	7	1544823	1544829	0 %	100 %	0 %	0 %	55821704
31550	NC_006448	TCAA	2	8	1544869	1544876	50 %	25 %	0 %	25 %	55821704
31551	NC_006448	AAT	2	6	1544943	1544948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821704
31552	NC_006448	CCATA	2	10	1544987	1544996	40 %	20 %	0 %	40 %	55821704
31553	NC_006448	CAA	2	6	1545054	1545059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821704
31554	NC_006448	GT	3	6	1545199	1545204	0 %	50 %	50 %	0 %	55821704
31555	NC_006448	T	6	6	1545257	1545262	0 %	100 %	0 %	0 %	55821704
31556	NC_006448	TCC	2	6	1545301	1545306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31557	NC_006448	ACC	2	6	1545548	1545553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821705
31558	NC_006448	CAG	2	6	1545598	1545603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821705
31559	NC_006448	GTA	2	6	1545614	1545619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821705
31560	NC_006448	TCAA	2	8	1545651	1545658	50 %	25 %	0 %	25 %	55821705
31561	NC_006448	CAC	2	6	1545661	1545666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821705
31562	NC_006448	CAG	2	6	1545697	1545702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821705
31563	NC_006448	CAT	2	6	1545760	1545765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821705
31564	NC_006448	CCA	2	6	1545813	1545818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821705
31565	NC_006448	AGCACC	2	12	1545839	1545850	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	55821705
31566	NC_006448	TAA	2	6	1545870	1545875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821705
31567	NC_006448	AAG	2	6	1545980	1545985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821705
31568	NC_006448	TTCC	2	8	1546084	1546091	0 %	50 %	0 %	50 %	55821705
31569	NC_006448	GTT	2	6	1546152	1546157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821705
31570	NC_006448	T	6	6	1546168	1546173	0 %	100 %	0 %	0 %	55821705
31571	NC_006448	TCA	2	6	1546191	1546196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821705
31572	NC_006448	CAAA	2	8	1546206	1546213	75 %	0 %	0 %	25 %	55821705
31573	NC_006448	ACC	2	6	1546220	1546225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821705
31574	NC_006448	TAA	2	6	1546281	1546286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31575	NC_006448	TAT	2	6	1546303	1546308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31576	NC_006448	TAAA	2	8	1546336	1546343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31577	NC_006448	GCT	2	6	1546355	1546360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31578	NC_006448	CTT	2	6	1546383	1546388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31579	NC_006448	A	6	6	1546405	1546410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31580	NC_006448	TTA	2	6	1546437	1546442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821706
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31587	NC_006448	TGCAA	2	10	1546891	1546900	40 %	20 %	20 %	20 %	55821706
31588	NC_006448	CTG	2	6	1546913	1546918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821706
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31590	NC_006448	CCTCTT	2	12	1546958	1546969	0 %	50 %	0 %	50 %	55821706
31591	NC_006448	AGA	2	6	1547059	1547064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821706
31592	NC_006448	CCAA	2	8	1547120	1547127	50 %	0 %	0 %	50 %	55821706
31593	NC_006448	CCA	2	6	1547128	1547133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821706
31594	NC_006448	GCA	2	6	1547134	1547139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821706
31595	NC_006448	CTG	2	6	1547219	1547224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821706
31596	NC_006448	TGA	2	6	1547321	1547326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821706
31597	NC_006448	CAAG	2	8	1547372	1547379	50 %	0 %	25 %	25 %	55821706
31598	NC_006448	GTG	2	6	1547388	1547393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821706
31599	NC_006448	ACG	2	6	1547404	1547409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821706
31600	NC_006448	ACC	2	6	1547424	1547429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821706
31601	NC_006448	GGCAA	2	10	1547455	1547464	40 %	0 %	40 %	20 %	55821706
31602	NC_006448	TG	3	6	1547502	1547507	0 %	50 %	50 %	0 %	55821706
31603	NC_006448	ACA	2	6	1547557	1547562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821706
31604	NC_006448	GAA	2	6	1547643	1547648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821706
31605	NC_006448	ACT	2	6	1547677	1547682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821706
31606	NC_006448	AAG	2	6	1547695	1547700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821706
31607	NC_006448	GCA	2	6	1547713	1547718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821706
31608	NC_006448	ACA	2	6	1547725	1547730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821706
31609	NC_006448	CAT	2	6	1547760	1547765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821706
31610	NC_006448	AACCA	2	10	1547775	1547784	60 %	0 %	0 %	40 %	55821706
31611	NC_006448	GTG	2	6	1547789	1547794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821706
31612	NC_006448	ACC	2	6	1547796	1547801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821706
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31982	NC_006448	CTA	2	6	1565664	1565669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821729
31983	NC_006448	ACA	2	6	1565694	1565699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821729
31984	NC_006448	AGA	2	6	1565781	1565786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821729
31985	NC_006448	CTC	2	6	1565791	1565796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821729
31986	NC_006448	TAC	2	6	1565818	1565823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821729
31987	NC_006448	CAA	2	6	1565854	1565859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821729
31988	NC_006448	TGAC	2	8	1565864	1565871	25 %	25 %	25 %	25 %	55821729
31989	NC_006448	CTG	2	6	1565936	1565941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821729
31990	NC_006448	CTG	2	6	1565978	1565983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821729
31991	NC_006448	TAT	2	6	1566072	1566077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821729
31992	NC_006448	TGAT	2	8	1566086	1566093	25 %	50 %	25 %	0 %	55821729
31993	NC_006448	TAT	2	6	1566282	1566287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821729
31994	NC_006448	TCT	2	6	1566309	1566314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821729
31995	NC_006448	A	7	7	1566317	1566323	100 %	0 %	0 %	0 %	55821729
31996	NC_006448	CTA	2	6	1566337	1566342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821729
31997	NC_006448	GGT	2	6	1566343	1566348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821729
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31999	NC_006448	GACA	2	8	1566483	1566490	50 %	0 %	25 %	25 %	55821729
32000	NC_006448	CCA	2	6	1566522	1566527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821729

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