MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_006448	TGA	2	6	1515849	1515854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821682
31002	NC_006448	TTTC	2	8	1515945	1515952	0 %	75 %	0 %	25 %	55821682
31003	NC_006448	CCA	2	6	1516011	1516016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821682
31004	NC_006448	CAA	2	6	1516050	1516055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821682
31005	NC_006448	CTG	2	6	1516068	1516073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821682
31006	NC_006448	TCC	2	6	1516144	1516149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821682
31007	NC_006448	GAA	2	6	1516152	1516157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821682
31008	NC_006448	ATT	2	6	1516165	1516170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821682
31009	NC_006448	AAGGC	2	10	1516178	1516187	40 %	0 %	40 %	20 %	55821682
31010	NC_006448	ACT	2	6	1516298	1516303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821682
31011	NC_006448	ATA	2	6	1516451	1516456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821682
31012	NC_006448	CTA	2	6	1516470	1516475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821682
31013	NC_006448	GCT	2	6	1516511	1516516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821682
31014	NC_006448	GAC	2	6	1516536	1516541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821682
31015	NC_006448	CTG	2	6	1516555	1516560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821682
31016	NC_006448	ATGT	2	8	1516574	1516581	25 %	50 %	25 %	0 %	55821682
31017	NC_006448	TCC	2	6	1516590	1516595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821683
31018	NC_006448	GAA	2	6	1516636	1516641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821683
31019	NC_006448	CATT	2	8	1516660	1516667	25 %	50 %	0 %	25 %	55821683
31020	NC_006448	TCA	2	6	1516720	1516725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821683
31021	NC_006448	ACC	2	6	1516727	1516732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821683
31022	NC_006448	TAC	2	6	1516744	1516749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821683
31023	NC_006448	CAG	2	6	1516750	1516755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821683
31024	NC_006448	ACA	2	6	1516861	1516866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821683
31025	NC_006448	TAAG	2	8	1516870	1516877	50 %	25 %	25 %	0 %	55821683
31026	NC_006448	CAA	2	6	1516885	1516890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821683
31027	NC_006448	CAT	2	6	1516966	1516971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821683
31028	NC_006448	ACT	2	6	1516989	1516994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821683
31029	NC_006448	AAG	2	6	1517072	1517077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821683
31030	NC_006448	TTGGT	2	10	1517088	1517097	0 %	60 %	40 %	0 %	55821683
31031	NC_006448	TCA	2	6	1517125	1517130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821683
31032	NC_006448	TACC	2	8	1517167	1517174	25 %	25 %	0 %	50 %	55821683
31033	NC_006448	CTG	2	6	1517176	1517181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821683
31034	NC_006448	AGCT	2	8	1517282	1517289	25 %	25 %	25 %	25 %	55821683
31035	NC_006448	T	6	6	1517296	1517301	0 %	100 %	0 %	0 %	55821683
31036	NC_006448	TA	3	6	1517399	1517404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31037	NC_006448	AT	3	6	1517425	1517430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31038	NC_006448	TAT	2	6	1517454	1517459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31039	NC_006448	A	6	6	1517465	1517470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31040	NC_006448	AG	3	6	1517485	1517490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31041	NC_006448	A	6	6	1517516	1517521	100 %	0 %	0 %	0 %	55821684
31042	NC_006448	CAA	2	6	1517554	1517559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821684
31043	NC_006448	AAC	2	6	1517612	1517617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821684
31044	NC_006448	ACTT	2	8	1517632	1517639	25 %	50 %	0 %	25 %	55821684
31045	NC_006448	AGA	2	6	1517644	1517649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821684
31046	NC_006448	ACC	2	6	1517654	1517659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821684
31047	NC_006448	CCG	2	6	1517715	1517720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55821684
31048	NC_006448	CTT	2	6	1517743	1517748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821684
31049	NC_006448	ATG	2	6	1517826	1517831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821684
31050	NC_006448	TCC	2	6	1517882	1517887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821684
31051	NC_006448	TAA	2	6	1517888	1517893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821684
31052	NC_006448	ATTG	2	8	1517957	1517964	25 %	50 %	25 %	0 %	55821684
31053	NC_006448	TTG	2	6	1518025	1518030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821684
31054	NC_006448	AT	3	6	1518135	1518140	50 %	50 %	0 %	0 %	55821684
31055	NC_006448	TAA	2	6	1518163	1518168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821684
31056	NC_006448	ATG	2	6	1518197	1518202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821684
31057	NC_006448	CTTTGA	2	12	1518219	1518230	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	55821684
31058	NC_006448	GAAT	2	8	1518325	1518332	50 %	25 %	25 %	0 %	55821684
31059	NC_006448	AGG	2	6	1518360	1518365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821684
31060	NC_006448	AGC	2	6	1518383	1518388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821684
31061	NC_006448	ACA	2	6	1518390	1518395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821684
31062	NC_006448	CAA	2	6	1518419	1518424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821684
31063	NC_006448	ACCA	2	8	1518470	1518477	50 %	0 %	0 %	50 %	55821684
31064	NC_006448	ATC	2	6	1518513	1518518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821684
31065	NC_006448	ACT	2	6	1518585	1518590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821684
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31067	NC_006448	ACCA	2	8	1518716	1518723	50 %	0 %	0 %	50 %	55821684
31068	NC_006448	AG	3	6	1518820	1518825	50 %	0 %	50 %	0 %	55821684
31069	NC_006448	AAT	2	6	1518941	1518946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821684
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31071	NC_006448	T	6	6	1518998	1519003	0 %	100 %	0 %	0 %	55821684
31072	NC_006448	TCT	2	6	1519009	1519014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821684
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31074	NC_006448	TTC	2	6	1519214	1519219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821685
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31079	NC_006448	GA	3	6	1519431	1519436	50 %	0 %	50 %	0 %	55821685
31080	NC_006448	AGTCA	2	10	1519465	1519474	40 %	20 %	20 %	20 %	55821685
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31087	NC_006448	ATC	2	6	1519830	1519835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821686
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31089	NC_006448	T	6	6	1519918	1519923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31090	NC_006448	AGG	2	6	1520092	1520097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31091	NC_006448	ATC	2	6	1520123	1520128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821687
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31099	NC_006448	CAAG	2	8	1520391	1520398	50 %	0 %	25 %	25 %	55821687
31100	NC_006448	T	7	7	1520619	1520625	0 %	100 %	0 %	0 %	55821687
31101	NC_006448	CTTCT	2	10	1520627	1520636	0 %	60 %	0 %	40 %	55821687
31102	NC_006448	TTC	2	6	1520652	1520657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821687
31103	NC_006448	CAG	2	6	1520759	1520764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31104	NC_006448	CTTGGG	2	12	1520801	1520812	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31105	NC_006448	ATT	2	6	1520948	1520953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31106	NC_006448	TTCT	2	8	1521003	1521010	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31107	NC_006448	TAT	2	6	1521036	1521041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31108	NC_006448	T	6	6	1521078	1521083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31109	NC_006448	A	6	6	1521143	1521148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31110	NC_006448	T	6	6	1521171	1521176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31111	NC_006448	CTA	2	6	1521206	1521211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31112	NC_006448	GGTC	2	8	1521384	1521391	0 %	25 %	50 %	25 %	55821688
31113	NC_006448	AAG	3	9	1521421	1521429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821688
31114	NC_006448	AAC	2	6	1521451	1521456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821688
31115	NC_006448	TCT	2	6	1521461	1521466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821688
31116	NC_006448	TCT	2	6	1521479	1521484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821688
31117	NC_006448	ACG	2	6	1521508	1521513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821688
31118	NC_006448	AAG	2	6	1521560	1521565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821688
31119	NC_006448	CTTGA	2	10	1521595	1521604	20 %	40 %	20 %	20 %	55821688
31120	NC_006448	T	6	6	1521726	1521731	0 %	100 %	0 %	0 %	55821688
31121	NC_006448	AGGT	2	8	1521868	1521875	25 %	25 %	50 %	0 %	55821688
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31124	NC_006448	ATC	2	6	1521970	1521975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821688
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31351	NC_006448	AGT	2	6	1533708	1533713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31357	NC_006448	A	7	7	1533916	1533922	100 %	0 %	0 %	0 %	55821696
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31382	NC_006448	TAA	2	6	1535279	1535284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31394	NC_006448	T	6	6	1535716	1535721	0 %	100 %	0 %	0 %	55821697
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31482	NC_006448	GCTT	2	8	1541158	1541165	0 %	50 %	25 %	25 %	55821701
31483	NC_006448	T	6	6	1541222	1541227	0 %	100 %	0 %	0 %	55821701
31484	NC_006448	CTGTTG	2	12	1541404	1541415	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	55821702
31485	NC_006448	TCA	2	6	1541467	1541472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821702
31486	NC_006448	CAT	2	6	1541485	1541490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821702
31487	NC_006448	GTT	2	6	1541555	1541560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821702
31488	NC_006448	TTA	2	6	1541628	1541633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821702
31489	NC_006448	CAA	2	6	1541635	1541640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821702
31490	NC_006448	CCT	2	6	1541677	1541682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821702
31491	NC_006448	TCAG	2	8	1541730	1541737	25 %	25 %	25 %	25 %	55821702
31492	NC_006448	CAT	2	6	1541752	1541757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821702
31493	NC_006448	CTT	2	6	1541788	1541793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821702
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31495	NC_006448	CTG	2	6	1541956	1541961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821702
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