MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_006448	CAC	2	6	1465442	1465447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821629
30003	NC_006448	ATG	2	6	1465570	1465575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821629
30004	NC_006448	ACG	2	6	1465578	1465583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821629
30005	NC_006448	GCT	2	6	1465681	1465686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821629
30006	NC_006448	AAAGGC	2	12	1465692	1465703	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	55821629
30007	NC_006448	TGG	2	6	1465722	1465727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821629
30008	NC_006448	GAAG	2	8	1465775	1465782	50 %	0 %	50 %	0 %	55821629
30009	NC_006448	AAG	2	6	1465837	1465842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821629
30010	NC_006448	AAC	2	6	1465893	1465898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821629
30011	NC_006448	GAA	2	6	1465926	1465931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821629
30012	NC_006448	ACCA	2	8	1466142	1466149	50 %	0 %	0 %	50 %	55821629
30013	NC_006448	TTA	2	6	1466372	1466377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30014	NC_006448	CTT	2	6	1466493	1466498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821630
30015	NC_006448	T	6	6	1466551	1466556	0 %	100 %	0 %	0 %	55821630
30016	NC_006448	AAG	2	6	1466562	1466567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821630
30017	NC_006448	ATC	2	6	1466598	1466603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821630
30018	NC_006448	CAT	2	6	1466666	1466671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821630
30019	NC_006448	CTT	2	6	1466693	1466698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821630
30020	NC_006448	ATTG	2	8	1466745	1466752	25 %	50 %	25 %	0 %	55821630
30021	NC_006448	TAGT	2	8	1466806	1466813	25 %	50 %	25 %	0 %	55821630
30022	NC_006448	TGT	2	6	1466829	1466834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821630
30023	NC_006448	TGA	2	6	1466882	1466887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821630
30024	NC_006448	CGT	2	6	1467018	1467023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821630
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30027	NC_006448	AGTC	2	8	1467134	1467141	25 %	25 %	25 %	25 %	55821630
30028	NC_006448	T	6	6	1467249	1467254	0 %	100 %	0 %	0 %	55821630
30029	NC_006448	TAA	3	9	1467326	1467334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30030	NC_006448	GTG	2	6	1467343	1467348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30031	NC_006448	TAA	2	6	1467372	1467377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30032	NC_006448	A	6	6	1467390	1467395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30033	NC_006448	TAC	2	6	1467432	1467437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30034	NC_006448	TTA	2	6	1467456	1467461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30035	NC_006448	CTA	2	6	1467471	1467476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30036	NC_006448	T	6	6	1467582	1467587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30037	NC_006448	TGT	2	6	1467729	1467734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821631
30038	NC_006448	TCA	2	6	1467757	1467762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821631
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30040	NC_006448	AG	3	6	1467867	1467872	50 %	0 %	50 %	0 %	55821631
30041	NC_006448	TCTT	2	8	1467898	1467905	0 %	75 %	0 %	25 %	55821631
30042	NC_006448	CTTC	2	8	1467914	1467921	0 %	50 %	0 %	50 %	55821631
30043	NC_006448	T	6	6	1468036	1468041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30044	NC_006448	TAT	2	6	1468134	1468139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30045	NC_006448	TTAC	2	8	1468150	1468157	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30046	NC_006448	ATG	2	6	1468180	1468185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30047	NC_006448	CTA	2	6	1468222	1468227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30048	NC_006448	TA	3	6	1468229	1468234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30049	NC_006448	TA	3	6	1468241	1468246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30050	NC_006448	GTCTAA	2	12	1468260	1468271	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	55821632
30051	NC_006448	CTT	2	6	1468280	1468285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821632
30052	NC_006448	ACT	2	6	1468329	1468334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821632
30053	NC_006448	TCC	2	6	1468339	1468344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821632
30054	NC_006448	TGA	2	6	1468454	1468459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821632
30055	NC_006448	CGAC	2	8	1468468	1468475	25 %	0 %	25 %	50 %	55821632
30056	NC_006448	T	6	6	1468476	1468481	0 %	100 %	0 %	0 %	55821632
30057	NC_006448	TA	3	6	1468720	1468725	50 %	50 %	0 %	0 %	55821632
30058	NC_006448	TAC	2	6	1468821	1468826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821632
30059	NC_006448	CAG	2	6	1468835	1468840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821632
30060	NC_006448	AGA	2	6	1469136	1469141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821632
30061	NC_006448	ACACC	2	10	1469189	1469198	40 %	0 %	0 %	60 %	55821632
30062	NC_006448	ATA	2	6	1469230	1469235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821632
30063	NC_006448	A	6	6	1469283	1469288	100 %	0 %	0 %	0 %	55821632
30064	NC_006448	AAT	2	6	1469307	1469312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821632
30065	NC_006448	ATTA	2	8	1469328	1469335	50 %	50 %	0 %	0 %	55821632
30066	NC_006448	CTT	2	6	1469354	1469359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30067	NC_006448	CCT	2	6	1469361	1469366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30068	NC_006448	A	7	7	1469452	1469458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30069	NC_006448	TAT	2	6	1469497	1469502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30070	NC_006448	TG	3	6	1469551	1469556	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30071	NC_006448	ATA	2	6	1469559	1469564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30072	NC_006448	GAT	2	6	1469583	1469588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30073	NC_006448	TAT	2	6	1469610	1469615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30074	NC_006448	ACTG	2	8	1469690	1469697	25 %	25 %	25 %	25 %	55821633
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30100	NC_006448	AC	3	6	1470687	1470692	50 %	0 %	0 %	50 %	55821633
30101	NC_006448	ATA	2	6	1470696	1470701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821633
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30105	NC_006448	GAA	2	6	1470896	1470901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821633
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30350	NC_006448	CTT	2	6	1483104	1483109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821647
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30357	NC_006448	CAAC	2	8	1483756	1483763	50 %	0 %	0 %	50 %	55821647
30358	NC_006448	CAA	2	6	1483776	1483781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821647
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30485	NC_006448	GCT	2	6	1490301	1490306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821659
30486	NC_006448	CCA	2	6	1490409	1490414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821659
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30491	NC_006448	A	7	7	1490652	1490658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30492	NC_006448	AG	3	6	1490714	1490719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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