MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29005	NC_006448	GCT	2	6	1415027	1415032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821572
29006	NC_006448	T	6	6	1415064	1415069	0 %	100 %	0 %	0 %	55821572
29007	NC_006448	TAG	2	6	1415081	1415086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821572
29008	NC_006448	T	6	6	1415158	1415163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29009	NC_006448	CAA	2	6	1415190	1415195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29011	NC_006448	TC	3	6	1415318	1415323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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29021	NC_006448	AAAC	2	8	1415865	1415872	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29022	NC_006448	CT	3	6	1415877	1415882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29023	NC_006448	CT	3	6	1415907	1415912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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29038	NC_006448	TA	3	6	1416377	1416382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29042	NC_006448	ACTT	2	8	1416500	1416507	25 %	50 %	0 %	25 %	55821575
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29121	NC_006448	ACC	2	6	1420266	1420271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821580
29122	NC_006448	CAA	2	6	1420322	1420327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821580
29123	NC_006448	TGA	2	6	1420332	1420337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821580
29124	NC_006448	ACA	2	6	1420343	1420348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821580
29125	NC_006448	ACC	2	6	1420365	1420370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821580
29126	NC_006448	ACA	2	6	1420390	1420395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821580
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29134	NC_006448	ACC	2	6	1420878	1420883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821580
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29140	NC_006448	ACC	2	6	1421247	1421252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821580
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29150	NC_006448	TAGT	2	8	1421708	1421715	25 %	50 %	25 %	0 %	55821580
29151	NC_006448	A	6	6	1421763	1421768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29152	NC_006448	TAAAA	2	10	1421809	1421818	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29153	NC_006448	TGG	2	6	1421847	1421852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821581
29154	NC_006448	CTG	2	6	1421858	1421863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821581
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29161	NC_006448	TAT	2	6	1422156	1422161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821581
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29169	NC_006448	AGGAG	2	10	1423092	1423101	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
29170	NC_006448	TGTC	2	8	1423417	1423424	0 %	50 %	25 %	25 %	55821582
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29190	NC_006448	ATC	2	6	1424745	1424750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821584
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29197	NC_006448	GATT	2	8	1425242	1425249	25 %	50 %	25 %	0 %	55821584
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29200	NC_006448	AAAAT	2	10	1425330	1425339	80 %	20 %	0 %	0 %	55821584
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29204	NC_006448	CTT	2	6	1425499	1425504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821584
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29216	NC_006448	TAGC	2	8	1426289	1426296	25 %	25 %	25 %	25 %	55821585
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29219	NC_006448	AAT	2	6	1426360	1426365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821585
29220	NC_006448	TTG	3	9	1426374	1426382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821585
29221	NC_006448	ACCA	2	8	1426411	1426418	50 %	0 %	0 %	50 %	55821585
29222	NC_006448	ACC	2	6	1426474	1426479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821585
29223	NC_006448	TC	3	6	1426511	1426516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29224	NC_006448	TAT	2	6	1426534	1426539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29225	NC_006448	TTA	2	6	1426563	1426568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821586
29226	NC_006448	TCA	2	6	1426613	1426618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821586
29227	NC_006448	GAC	2	6	1426631	1426636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821586
29228	NC_006448	CTG	2	6	1426728	1426733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821586
29229	NC_006448	CTG	2	6	1426737	1426742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821586
29230	NC_006448	CGTGC	2	10	1426775	1426784	0 %	20 %	40 %	40 %	55821586
29231	NC_006448	TAA	2	6	1426819	1426824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821586
29232	NC_006448	GAA	2	6	1426829	1426834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821586
29233	NC_006448	ACGAAC	2	12	1426917	1426928	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	55821586
29234	NC_006448	CTA	2	6	1427031	1427036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821587
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29236	NC_006448	AGA	2	6	1427064	1427069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821587
29237	NC_006448	TC	3	6	1427102	1427107	0 %	50 %	0 %	50 %	55821587
29238	NC_006448	CAT	2	6	1427139	1427144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821587
29239	NC_006448	TGA	2	6	1427166	1427171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821587
29240	NC_006448	CAT	2	6	1427235	1427240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821587
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29244	NC_006448	TTG	2	6	1427375	1427380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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29484	NC_006448	GCT	2	6	1440207	1440212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821601
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