MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_006448	AAT	2	6	1338795	1338800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821494
27503	NC_006448	TAAA	2	8	1338836	1338843	75 %	25 %	0 %	0 %	55821494
27504	NC_006448	AAT	2	6	1338855	1338860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821494
27505	NC_006448	CCT	2	6	1338893	1338898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821494
27506	NC_006448	ACA	2	6	1339037	1339042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27507	NC_006448	T	8	8	1339103	1339110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27508	NC_006448	ATC	2	6	1339132	1339137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27509	NC_006448	CTA	2	6	1339156	1339161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821495
27510	NC_006448	GA	3	6	1339326	1339331	50 %	0 %	50 %	0 %	55821495
27511	NC_006448	ACC	2	6	1339504	1339509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821495
27512	NC_006448	ACCT	2	8	1339519	1339526	25 %	25 %	0 %	50 %	55821495
27513	NC_006448	TTG	2	6	1339571	1339576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821495
27514	NC_006448	AATG	2	8	1339578	1339585	50 %	25 %	25 %	0 %	55821495
27515	NC_006448	CTT	3	9	1339746	1339754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821495
27516	NC_006448	TAA	2	6	1339783	1339788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821495
27517	NC_006448	TA	3	6	1339830	1339835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27518	NC_006448	TTA	2	6	1339840	1339845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27519	NC_006448	TTC	2	6	1339876	1339881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27520	NC_006448	A	6	6	1339882	1339887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27521	NC_006448	TCTT	2	8	1339910	1339917	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27522	NC_006448	T	6	6	1339941	1339946	0 %	100 %	0 %	0 %	55821496
27523	NC_006448	TTC	2	6	1340008	1340013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821496
27524	NC_006448	AAC	2	6	1340045	1340050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821496
27525	NC_006448	CAG	2	6	1340079	1340084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821496
27526	NC_006448	GTT	2	6	1340121	1340126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821496
27527	NC_006448	AAC	2	6	1340146	1340151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821496
27528	NC_006448	T	6	6	1340186	1340191	0 %	100 %	0 %	0 %	55821496
27529	NC_006448	TTG	2	6	1340274	1340279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821496
27530	NC_006448	AGA	2	6	1340280	1340285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821496
27531	NC_006448	AAG	2	6	1340294	1340299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821496
27532	NC_006448	TCA	2	6	1340378	1340383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821496
27533	NC_006448	CAG	2	6	1340451	1340456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821496
27534	NC_006448	GAA	2	6	1340538	1340543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821496
27535	NC_006448	CTG	2	6	1340544	1340549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821496
27536	NC_006448	CTT	2	6	1340640	1340645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821496
27537	NC_006448	TTG	2	6	1340654	1340659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821496
27538	NC_006448	AAC	2	6	1340710	1340715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821496
27539	NC_006448	ATG	2	6	1340721	1340726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821496
27540	NC_006448	T	7	7	1340783	1340789	0 %	100 %	0 %	0 %	55821496
27541	NC_006448	TCAA	2	8	1340903	1340910	50 %	25 %	0 %	25 %	55821496
27542	NC_006448	ATC	2	6	1340932	1340937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821496
27543	NC_006448	ATC	2	6	1340953	1340958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821496
27544	NC_006448	TCT	2	6	1340985	1340990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821496
27545	NC_006448	CTC	2	6	1341019	1341024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821496
27546	NC_006448	TGA	2	6	1341064	1341069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821496
27547	NC_006448	CAAGT	2	10	1341190	1341199	40 %	20 %	20 %	20 %	55821496
27548	NC_006448	TTCTT	2	10	1341221	1341230	0 %	80 %	0 %	20 %	55821496
27549	NC_006448	TCT	2	6	1341275	1341280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821496
27550	NC_006448	ATT	2	6	1341307	1341312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821496
27551	NC_006448	GAA	2	6	1341331	1341336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821496
27552	NC_006448	TCAT	2	8	1341347	1341354	25 %	50 %	0 %	25 %	55821496
27553	NC_006448	GAAT	2	8	1341391	1341398	50 %	25 %	25 %	0 %	55821496
27554	NC_006448	TTG	2	6	1341399	1341404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821496
27555	NC_006448	GTT	2	6	1341440	1341445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821496
27556	NC_006448	CTT	2	6	1341477	1341482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821496
27557	NC_006448	TTC	2	6	1341487	1341492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821496
27558	NC_006448	TTC	2	6	1341526	1341531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821496
27559	NC_006448	TAA	2	6	1341564	1341569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821496
27560	NC_006448	TAAG	2	8	1341580	1341587	50 %	25 %	25 %	0 %	55821496
27561	NC_006448	TAT	2	6	1341661	1341666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27562	NC_006448	TTC	2	6	1341769	1341774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821497
27563	NC_006448	GCA	2	6	1341839	1341844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821497
27564	NC_006448	TGG	2	6	1341905	1341910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821497
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27567	NC_006448	CTGG	2	8	1342014	1342021	0 %	25 %	50 %	25 %	55821497
27568	NC_006448	AACC	2	8	1342041	1342048	50 %	0 %	0 %	50 %	55821497
27569	NC_006448	TGG	2	6	1342063	1342068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821497
27570	NC_006448	CATCGG	2	12	1342161	1342172	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55821497
27571	NC_006448	ACC	2	6	1342369	1342374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821497
27572	NC_006448	TCAT	2	8	1342403	1342410	25 %	50 %	0 %	25 %	55821497
27573	NC_006448	CTT	2	6	1342474	1342479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821497
27574	NC_006448	AGC	2	6	1342504	1342509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821497
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27577	NC_006448	CAT	2	6	1342716	1342721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821497
27578	NC_006448	ATC	2	6	1342735	1342740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821497
27579	NC_006448	ACC	2	6	1342822	1342827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821497
27580	NC_006448	ATT	2	6	1342843	1342848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821497
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27582	NC_006448	CCAT	2	8	1342913	1342920	25 %	25 %	0 %	50 %	55821497
27583	NC_006448	TCA	2	6	1342943	1342948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821497
27584	NC_006448	AGCT	2	8	1343080	1343087	25 %	25 %	25 %	25 %	55821497
27585	NC_006448	CGT	2	6	1343125	1343130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821497
27586	NC_006448	TCTGGA	2	12	1343144	1343155	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55821497
27587	NC_006448	TTC	2	6	1343179	1343184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821497
27588	NC_006448	AAT	2	6	1343194	1343199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821497
27589	NC_006448	GTC	2	6	1343206	1343211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821497
27590	NC_006448	CTC	2	6	1343220	1343225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821497
27591	NC_006448	GAA	2	6	1343303	1343308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821497
27592	NC_006448	ACC	2	6	1343323	1343328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821497
27593	NC_006448	ACC	2	6	1343359	1343364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821497
27594	NC_006448	GAA	2	6	1343370	1343375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821497
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27600	NC_006448	TCA	2	6	1343516	1343521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821497
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27602	NC_006448	CTGG	2	8	1343635	1343642	0 %	25 %	50 %	25 %	55821497
27603	NC_006448	CAT	2	6	1343643	1343648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821497
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27605	NC_006448	T	6	6	1343672	1343677	0 %	100 %	0 %	0 %	55821497
27606	NC_006448	TCA	2	6	1343681	1343686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821497
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27609	NC_006448	T	6	6	1343815	1343820	0 %	100 %	0 %	0 %	55821498
27610	NC_006448	TAAA	2	8	1343824	1343831	75 %	25 %	0 %	0 %	55821498
27611	NC_006448	AAT	2	6	1343892	1343897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821498
27612	NC_006448	TCC	2	6	1344041	1344046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821498
27613	NC_006448	ATGGCA	2	12	1344089	1344100	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55821498
27614	NC_006448	CAT	2	6	1344123	1344128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821498
27615	NC_006448	CTG	2	6	1344144	1344149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821498
27616	NC_006448	CAA	2	6	1344208	1344213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821498
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