MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_006448	AC	3	6	1315832	1315837	50 %	0 %	0 %	50 %	55821469
27003	NC_006448	CTT	2	6	1315937	1315942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821469
27004	NC_006448	CCA	2	6	1315964	1315969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821469
27005	NC_006448	GTA	2	6	1316018	1316023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821469
27006	NC_006448	CGA	2	6	1316126	1316131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821469
27007	NC_006448	CTT	2	6	1316192	1316197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821469
27008	NC_006448	AGC	2	6	1316226	1316231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821469
27009	NC_006448	ATC	2	6	1316275	1316280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821469
27010	NC_006448	GAC	2	6	1316300	1316305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821469
27011	NC_006448	TCC	2	6	1316338	1316343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821469
27012	NC_006448	GAT	2	6	1316421	1316426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821469
27013	NC_006448	TAG	2	6	1316465	1316470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821469
27014	NC_006448	GGA	2	6	1316492	1316497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821469
27015	NC_006448	TAT	2	6	1316498	1316503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821469
27016	NC_006448	AGCT	2	8	1316525	1316532	25 %	25 %	25 %	25 %	55821469
27017	NC_006448	T	7	7	1316579	1316585	0 %	100 %	0 %	0 %	55821469
27018	NC_006448	A	7	7	1316600	1316606	100 %	0 %	0 %	0 %	55821469
27019	NC_006448	TC	3	6	1316641	1316646	0 %	50 %	0 %	50 %	55821469
27020	NC_006448	TTC	2	6	1316715	1316720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821469
27021	NC_006448	TCA	2	6	1316741	1316746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821469
27022	NC_006448	ATA	2	6	1316816	1316821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27023	NC_006448	A	6	6	1316846	1316851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27024	NC_006448	TGA	2	6	1316937	1316942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27025	NC_006448	AAG	2	6	1317007	1317012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27026	NC_006448	TAA	2	6	1317035	1317040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27027	NC_006448	TACT	2	8	1317092	1317099	25 %	50 %	0 %	25 %	55821470
27028	NC_006448	TTGT	2	8	1317100	1317107	0 %	75 %	25 %	0 %	55821470
27029	NC_006448	CTT	2	6	1317117	1317122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821470
27030	NC_006448	TGA	2	6	1317162	1317167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821470
27031	NC_006448	CAT	2	6	1317270	1317275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821470
27032	NC_006448	ATC	2	6	1317350	1317355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821470
27033	NC_006448	GTTT	2	8	1317446	1317453	0 %	75 %	25 %	0 %	55821470
27034	NC_006448	T	6	6	1317493	1317498	0 %	100 %	0 %	0 %	55821470
27035	NC_006448	TAG	2	6	1317524	1317529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821470
27036	NC_006448	T	6	6	1317550	1317555	0 %	100 %	0 %	0 %	55821470
27037	NC_006448	GCAATG	2	12	1317581	1317592	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55821470
27038	NC_006448	T	6	6	1317667	1317672	0 %	100 %	0 %	0 %	55821470
27039	NC_006448	CAA	2	6	1317834	1317839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821470
27040	NC_006448	TTC	2	6	1317881	1317886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821470
27041	NC_006448	CTT	2	6	1317962	1317967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821471
27042	NC_006448	T	6	6	1317966	1317971	0 %	100 %	0 %	0 %	55821471
27043	NC_006448	TTA	2	6	1317988	1317993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821471
27044	NC_006448	ATC	2	6	1318008	1318013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821471
27045	NC_006448	CAC	2	6	1318131	1318136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821471
27046	NC_006448	TTTG	2	8	1318286	1318293	0 %	75 %	25 %	0 %	55821471
27047	NC_006448	T	6	6	1318298	1318303	0 %	100 %	0 %	0 %	55821471
27048	NC_006448	T	6	6	1318314	1318319	0 %	100 %	0 %	0 %	55821471
27049	NC_006448	AAG	2	6	1318323	1318328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821471
27050	NC_006448	AGTA	2	8	1318346	1318353	50 %	25 %	25 %	0 %	55821471
27051	NC_006448	TAG	2	6	1318385	1318390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821471
27052	NC_006448	TCA	2	6	1318489	1318494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821471
27053	NC_006448	T	6	6	1318612	1318617	0 %	100 %	0 %	0 %	55821471
27054	NC_006448	GAA	2	6	1318642	1318647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821471
27055	NC_006448	CAAAG	2	10	1318665	1318674	60 %	0 %	20 %	20 %	55821471
27056	NC_006448	T	6	6	1318698	1318703	0 %	100 %	0 %	0 %	55821471
27057	NC_006448	AATC	2	8	1318716	1318723	50 %	25 %	0 %	25 %	55821471
27058	NC_006448	TATT	2	8	1318733	1318740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27059	NC_006448	TAA	2	6	1318754	1318759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27060	NC_006448	TAT	3	9	1318762	1318770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27061	NC_006448	TTTTTA	2	12	1318808	1318819	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27062	NC_006448	A	7	7	1318889	1318895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27063	NC_006448	ATTC	2	8	1318898	1318905	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27064	NC_006448	AATA	2	8	1318911	1318918	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27065	NC_006448	AAG	2	6	1318944	1318949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821472
27066	NC_006448	AGA	2	6	1318972	1318977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821472
27067	NC_006448	TCT	2	6	1318992	1318997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821472
27068	NC_006448	AC	3	6	1319002	1319007	50 %	0 %	0 %	50 %	55821472
27069	NC_006448	TC	3	6	1319053	1319058	0 %	50 %	0 %	50 %	55821472
27070	NC_006448	TTC	2	6	1319210	1319215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821472
27071	NC_006448	CTA	2	6	1319239	1319244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821472
27072	NC_006448	GCT	2	6	1319280	1319285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821472
27073	NC_006448	AT	3	6	1319391	1319396	50 %	50 %	0 %	0 %	55821472
27074	NC_006448	CTTA	2	8	1319404	1319411	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27075	NC_006448	AGC	2	6	1319498	1319503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821473
27076	NC_006448	CTT	2	6	1319544	1319549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821473
27077	NC_006448	TTCT	2	8	1319554	1319561	0 %	75 %	0 %	25 %	55821473
27078	NC_006448	TTTC	2	8	1319640	1319647	0 %	75 %	0 %	25 %	55821473
27079	NC_006448	TTA	2	6	1319678	1319683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821473
27080	NC_006448	ACG	3	9	1319701	1319709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821473
27081	NC_006448	GCA	2	6	1319789	1319794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821473
27082	NC_006448	CCTT	2	8	1319837	1319844	0 %	50 %	0 %	50 %	55821473
27083	NC_006448	GAA	2	6	1319898	1319903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821473
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27088	NC_006448	CGGA	2	8	1320172	1320179	25 %	0 %	50 %	25 %	55821473
27089	NC_006448	CAGTCT	2	12	1320195	1320206	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55821473
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27091	NC_006448	ACG	2	6	1320277	1320282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821473
27092	NC_006448	TCT	2	6	1320336	1320341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821473
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27099	NC_006448	ATA	2	6	1320623	1320628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821473
27100	NC_006448	CTT	2	6	1320639	1320644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821473
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27103	NC_006448	CAA	2	6	1320999	1321004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821473
27104	NC_006448	CAT	2	6	1321008	1321013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821473
27105	NC_006448	TCA	2	6	1321061	1321066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821473
27106	NC_006448	TGA	2	6	1321099	1321104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821473
27107	NC_006448	CTGG	2	8	1321119	1321126	0 %	25 %	50 %	25 %	55821473
27108	NC_006448	TAA	2	6	1321127	1321132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821473
27109	NC_006448	ATA	2	6	1321135	1321140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821473
27110	NC_006448	TTA	2	6	1321241	1321246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821473
27111	NC_006448	TGACT	2	10	1321257	1321266	20 %	40 %	20 %	20 %	55821473
27112	NC_006448	CCTGTC	2	12	1321283	1321294	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55821473
27113	NC_006448	TCT	2	6	1321409	1321414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821473
27114	NC_006448	TCTA	2	8	1321417	1321424	25 %	50 %	0 %	25 %	55821473
27115	NC_006448	TGAT	2	8	1321541	1321548	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27116	NC_006448	GAA	2	6	1321591	1321596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821474
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27118	NC_006448	TCC	2	6	1321702	1321707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821474
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27120	NC_006448	GTA	2	6	1321788	1321793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821474
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27482	NC_006448	AAT	2	6	1337702	1337707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27483	NC_006448	ATC	2	6	1337780	1337785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821493
27484	NC_006448	CTGC	2	8	1337805	1337812	0 %	25 %	25 %	50 %	55821493
27485	NC_006448	CTT	3	9	1337905	1337913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821493
27486	NC_006448	TCT	2	6	1337926	1337931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821493
27487	NC_006448	TAT	2	6	1338004	1338009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821493
27488	NC_006448	ACT	2	6	1338044	1338049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821493
27489	NC_006448	GTC	2	6	1338086	1338091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821493
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27491	NC_006448	CCA	2	6	1338204	1338209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821493
27492	NC_006448	CGTTGA	2	12	1338271	1338282	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55821493
27493	NC_006448	CTT	2	6	1338525	1338530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821493
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27495	NC_006448	TCT	2	6	1338573	1338578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821493
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27498	NC_006448	T	6	6	1338686	1338691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27499	NC_006448	TCAA	2	8	1338696	1338703	50 %	25 %	0 %	25 %	55821494
27500	NC_006448	TAC	2	6	1338746	1338751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821494

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