MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_006448	GCAGCT	2	12	1267638	1267649	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55821418
26003	NC_006448	CTT	2	6	1267658	1267663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821418
26004	NC_006448	TTC	2	6	1267775	1267780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821418
26005	NC_006448	TCT	3	9	1267830	1267838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821418
26006	NC_006448	GTT	2	6	1267881	1267886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821418
26007	NC_006448	TGA	2	6	1267895	1267900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821418
26008	NC_006448	TTA	2	6	1267953	1267958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821418
26009	NC_006448	AAT	2	6	1267995	1268000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821418
26010	NC_006448	TTA	2	6	1268028	1268033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821419
26011	NC_006448	ATGG	2	8	1268049	1268056	25 %	25 %	50 %	0 %	55821419
26012	NC_006448	TTC	2	6	1268073	1268078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821419
26013	NC_006448	TGACT	2	10	1268201	1268210	20 %	40 %	20 %	20 %	55821419
26014	NC_006448	TC	4	8	1268365	1268372	0 %	50 %	0 %	50 %	55821419
26015	NC_006448	ACC	2	6	1268383	1268388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821419
26016	NC_006448	TTA	2	6	1268389	1268394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821419
26017	NC_006448	TCA	2	6	1268416	1268421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821419
26018	NC_006448	CAA	2	6	1268435	1268440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821419
26019	NC_006448	ATC	2	6	1268571	1268576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821419
26020	NC_006448	TCTT	2	8	1268587	1268594	0 %	75 %	0 %	25 %	55821419
26021	NC_006448	TTA	2	6	1268611	1268616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821419
26022	NC_006448	AACC	2	8	1268622	1268629	50 %	0 %	0 %	50 %	55821419
26023	NC_006448	GTC	2	6	1268658	1268663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821419
26024	NC_006448	GAC	2	6	1268708	1268713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821419
26025	NC_006448	GCC	2	6	1268749	1268754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55821419
26026	NC_006448	AGC	2	6	1268760	1268765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821419
26027	NC_006448	CAG	2	6	1268774	1268779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821419
26028	NC_006448	TCCA	2	8	1268808	1268815	25 %	25 %	0 %	50 %	55821419
26029	NC_006448	CAA	2	6	1268826	1268831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821419
26030	NC_006448	TCA	2	6	1268930	1268935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821420
26031	NC_006448	ATA	2	6	1269086	1269091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821420
26032	NC_006448	AGT	2	6	1269109	1269114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821420
26033	NC_006448	CAC	2	6	1269153	1269158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821420
26034	NC_006448	ATG	2	6	1269164	1269169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821420
26035	NC_006448	ATC	2	6	1269205	1269210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821420
26036	NC_006448	TTG	2	6	1269228	1269233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821420
26037	NC_006448	TAG	2	6	1269248	1269253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821420
26038	NC_006448	TCT	2	6	1269287	1269292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821420
26039	NC_006448	CTC	2	6	1269303	1269308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821420
26040	NC_006448	AAT	2	6	1269445	1269450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821420
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26042	NC_006448	AG	3	6	1269495	1269500	50 %	0 %	50 %	0 %	55821420
26043	NC_006448	GGT	2	6	1269588	1269593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821420
26044	NC_006448	A	6	6	1269596	1269601	100 %	0 %	0 %	0 %	55821420
26045	NC_006448	CCAT	2	8	1269605	1269612	25 %	25 %	0 %	50 %	55821420
26046	NC_006448	ATT	2	6	1269729	1269734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26047	NC_006448	A	6	6	1269777	1269782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26048	NC_006448	TGA	2	6	1269831	1269836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821421
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26050	NC_006448	A	6	6	1270064	1270069	100 %	0 %	0 %	0 %	55821421
26051	NC_006448	CAT	2	6	1270152	1270157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821421
26052	NC_006448	AACA	2	8	1270172	1270179	75 %	0 %	0 %	25 %	55821421
26053	NC_006448	TTG	2	6	1270293	1270298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821422
26054	NC_006448	AAC	2	6	1270327	1270332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821422
26055	NC_006448	TAC	2	6	1270475	1270480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821422
26056	NC_006448	TTC	2	6	1270487	1270492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821422
26057	NC_006448	CTTGC	2	10	1270523	1270532	0 %	40 %	20 %	40 %	55821422
26058	NC_006448	GGA	2	6	1270540	1270545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821422
26059	NC_006448	TAA	2	6	1270591	1270596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821422
26060	NC_006448	TGA	2	6	1270651	1270656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821422
26061	NC_006448	TGG	2	6	1270663	1270668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821422
26062	NC_006448	TAT	2	6	1270705	1270710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821422
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26067	NC_006448	AGG	2	6	1270896	1270901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821422
26068	NC_006448	CTTT	2	8	1271072	1271079	0 %	75 %	0 %	25 %	55821423
26069	NC_006448	TGATTG	2	12	1271084	1271095	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	55821423
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26073	NC_006448	TC	3	6	1271269	1271274	0 %	50 %	0 %	50 %	55821423
26074	NC_006448	TCC	2	6	1271330	1271335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821423
26075	NC_006448	CTATT	2	10	1271428	1271437	20 %	60 %	0 %	20 %	55821423
26076	NC_006448	ATTCT	2	10	1271518	1271527	20 %	60 %	0 %	20 %	55821423
26077	NC_006448	TCT	2	6	1271537	1271542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821423
26078	NC_006448	CAA	2	6	1271573	1271578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821423
26079	NC_006448	TAAT	2	8	1271585	1271592	50 %	50 %	0 %	0 %	55821423
26080	NC_006448	AT	3	6	1271601	1271606	50 %	50 %	0 %	0 %	55821423
26081	NC_006448	TAGTC	2	10	1271610	1271619	20 %	40 %	20 %	20 %	55821423
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26083	NC_006448	GCA	2	6	1271638	1271643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821423
26084	NC_006448	CTA	2	6	1271658	1271663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821423
26085	NC_006448	T	7	7	1271724	1271730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26086	NC_006448	ACTT	3	12	1271742	1271753	25 %	50 %	0 %	25 %	55821424
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26089	NC_006448	GGAT	2	8	1271940	1271947	25 %	25 %	50 %	0 %	55821424
26090	NC_006448	TTG	2	6	1271952	1271957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821424
26091	NC_006448	TCA	2	6	1272147	1272152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821424
26092	NC_006448	ACGTTG	2	12	1272200	1272211	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55821424
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26098	NC_006448	TTCA	2	8	1272368	1272375	25 %	50 %	0 %	25 %	55821424
26099	NC_006448	ATC	2	6	1272399	1272404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821424
26100	NC_006448	ACG	2	6	1272410	1272415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821424
26101	NC_006448	TCT	2	6	1272457	1272462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821424
26102	NC_006448	AAT	2	6	1272473	1272478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821424
26103	NC_006448	TTG	2	6	1272573	1272578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821424
26104	NC_006448	A	6	6	1272582	1272587	100 %	0 %	0 %	0 %	55821424
26105	NC_006448	CTT	2	6	1272611	1272616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821424
26106	NC_006448	CTTC	2	8	1272618	1272625	0 %	50 %	0 %	50 %	55821424
26107	NC_006448	TCC	2	6	1272679	1272684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821424
26108	NC_006448	T	6	6	1272722	1272727	0 %	100 %	0 %	0 %	55821425
26109	NC_006448	AATC	2	8	1272842	1272849	50 %	25 %	0 %	25 %	55821425
26110	NC_006448	AAGGCA	2	12	1272871	1272882	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	55821425
26111	NC_006448	CAA	2	6	1272887	1272892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821425
26112	NC_006448	TGG	2	6	1272909	1272914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821425
26113	NC_006448	ATC	2	6	1272945	1272950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821425
26114	NC_006448	AAGC	2	8	1272972	1272979	50 %	0 %	25 %	25 %	55821425
26115	NC_006448	ACG	2	6	1273084	1273089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821425
26116	NC_006448	CTC	2	6	1273128	1273133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821425
26117	NC_006448	GTT	2	6	1273189	1273194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821425
26118	NC_006448	GAC	2	6	1273220	1273225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821425
26119	NC_006448	GGCAAT	2	12	1273233	1273244	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55821425
26120	NC_006448	CCA	2	6	1273264	1273269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821425
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26344	NC_006448	AATT	2	8	1284571	1284578	50 %	50 %	0 %	0 %	55821435
26345	NC_006448	TTG	2	6	1284644	1284649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821435
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26451	NC_006448	GAC	2	6	1289956	1289961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821442
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26454	NC_006448	AT	3	6	1290190	1290195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26455	NC_006448	TC	4	8	1290232	1290239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26456	NC_006448	TCA	2	6	1290294	1290299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26457	NC_006448	T	9	9	1290329	1290337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26458	NC_006448	TAT	2	6	1290363	1290368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26459	NC_006448	T	7	7	1290397	1290403	0 %	100 %	0 %	0 %	55821444
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26461	NC_006448	A	6	6	1290489	1290494	100 %	0 %	0 %	0 %	55821444
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26463	NC_006448	CTA	2	6	1290612	1290617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821444
26464	NC_006448	ACC	2	6	1290633	1290638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821444
26465	NC_006448	TCA	2	6	1290651	1290656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821444
26466	NC_006448	TGAT	2	8	1290657	1290664	25 %	50 %	25 %	0 %	55821444
26467	NC_006448	TGC	2	6	1290739	1290744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821444
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26470	NC_006448	TAC	2	6	1290899	1290904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821444
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26475	NC_006448	CAT	2	6	1291054	1291059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821444
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26478	NC_006448	TGG	2	6	1291198	1291203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821444
26479	NC_006448	AAT	2	6	1291389	1291394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821444
26480	NC_006448	GCA	2	6	1291415	1291420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821445
26481	NC_006448	ACT	2	6	1291421	1291426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821445
26482	NC_006448	CTG	2	6	1291437	1291442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821445
26483	NC_006448	ATCC	2	8	1291485	1291492	25 %	25 %	0 %	50 %	55821445
26484	NC_006448	GTC	2	6	1291509	1291514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821445
26485	NC_006448	GAA	2	6	1291544	1291549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821445
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26500	NC_006448	AATCA	2	10	1292489	1292498	60 %	20 %	0 %	20 %	55821445

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