MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_006448	TTA	2	6	1242245	1242250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821392
25503	NC_006448	TCA	2	6	1242260	1242265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821392
25504	NC_006448	CTT	2	6	1242358	1242363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821392
25505	NC_006448	AAG	2	6	1242427	1242432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821392
25506	NC_006448	CGT	2	6	1242522	1242527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821392
25507	NC_006448	GAA	2	6	1242600	1242605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821392
25508	NC_006448	ACG	2	6	1242640	1242645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821392
25509	NC_006448	GTAA	2	8	1242743	1242750	50 %	25 %	25 %	0 %	55821392
25510	NC_006448	ATAG	2	8	1242779	1242786	50 %	25 %	25 %	0 %	55821393
25511	NC_006448	AAC	2	6	1242969	1242974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821393
25512	NC_006448	AATC	2	8	1243045	1243052	50 %	25 %	0 %	25 %	55821393
25513	NC_006448	AAT	2	6	1243155	1243160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821393
25514	NC_006448	TCAT	2	8	1243293	1243300	25 %	50 %	0 %	25 %	55821394
25515	NC_006448	ATT	2	6	1243417	1243422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25516	NC_006448	ATG	2	6	1243448	1243453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25517	NC_006448	TTC	2	6	1243493	1243498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25518	NC_006448	AGAAT	2	10	1243533	1243542	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25519	NC_006448	T	7	7	1243581	1243587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25520	NC_006448	CAA	2	6	1243628	1243633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25524	NC_006448	CACC	2	8	1243779	1243786	25 %	0 %	0 %	75 %	55821395
25525	NC_006448	CTT	2	6	1243832	1243837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821395
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25533	NC_006448	T	6	6	1244182	1244187	0 %	100 %	0 %	0 %	55821397
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25543	NC_006448	T	6	6	1244859	1244864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25544	NC_006448	AGC	2	6	1244899	1244904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25545	NC_006448	ACT	2	6	1244983	1244988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25546	NC_006448	GATA	2	8	1245039	1245046	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25547	NC_006448	TCA	2	6	1245063	1245068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25548	NC_006448	ATT	2	6	1245108	1245113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25549	NC_006448	CAA	2	6	1245124	1245129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25550	NC_006448	ACT	2	6	1245148	1245153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25551	NC_006448	A	7	7	1245163	1245169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25552	NC_006448	AT	3	6	1245304	1245309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25553	NC_006448	T	7	7	1245386	1245392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25554	NC_006448	CTT	2	6	1245538	1245543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821399
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25563	NC_006448	TTCC	2	8	1246326	1246333	0 %	50 %	0 %	50 %	55821399
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25570	NC_006448	GACTG	2	10	1246756	1246765	20 %	20 %	40 %	20 %	55821399
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25602	NC_006448	AGA	2	6	1248638	1248643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25603	NC_006448	AG	3	6	1248697	1248702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25604	NC_006448	T	6	6	1248711	1248716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25605	NC_006448	TCA	2	6	1248898	1248903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821401
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25607	NC_006448	CT	3	6	1248963	1248968	0 %	50 %	0 %	50 %	55821401
25608	NC_006448	CT	3	6	1249034	1249039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25609	NC_006448	TAT	2	6	1249048	1249053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25611	NC_006448	GTA	2	6	1249078	1249083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25619	NC_006448	CTT	2	6	1249266	1249271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821402
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25621	NC_006448	TAA	2	6	1249389	1249394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821402
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25862	NC_006448	ATC	2	6	1260358	1260363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821412
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25981	NC_006448	TCT	2	6	1266691	1266696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821418
25982	NC_006448	ACCAC	2	10	1266750	1266759	40 %	0 %	0 %	60 %	55821418
25983	NC_006448	ATA	2	6	1266909	1266914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821418
25984	NC_006448	T	6	6	1266922	1266927	0 %	100 %	0 %	0 %	55821418
25985	NC_006448	TTTGT	2	10	1266950	1266959	0 %	80 %	20 %	0 %	55821418
25986	NC_006448	ATCA	2	8	1266974	1266981	50 %	25 %	0 %	25 %	55821418
25987	NC_006448	ACG	2	6	1267082	1267087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821418
25988	NC_006448	CAG	2	6	1267132	1267137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821418
25989	NC_006448	CTT	2	6	1267159	1267164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821418
25990	NC_006448	TATT	2	8	1267170	1267177	25 %	75 %	0 %	0 %	55821418
25991	NC_006448	CAA	2	6	1267222	1267227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821418
25992	NC_006448	CTC	2	6	1267265	1267270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821418
25993	NC_006448	AAT	2	6	1267310	1267315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821418
25994	NC_006448	AG	3	6	1267412	1267417	50 %	0 %	50 %	0 %	55821418
25995	NC_006448	TTC	2	6	1267427	1267432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821418
25996	NC_006448	TCA	2	6	1267452	1267457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821418
25997	NC_006448	ACG	2	6	1267460	1267465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821418
25998	NC_006448	GAA	2	6	1267475	1267480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821418
25999	NC_006448	TTCA	2	8	1267481	1267488	25 %	50 %	0 %	25 %	55821418
26000	NC_006448	AGC	2	6	1267493	1267498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821418

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