MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_006448	T	6	6	1117206	1117211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23003	NC_006448	AATC	2	8	1117421	1117428	50 %	25 %	0 %	25 %	55821272
23004	NC_006448	TC	3	6	1117437	1117442	0 %	50 %	0 %	50 %	55821272
23005	NC_006448	TTA	2	6	1117467	1117472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821272
23006	NC_006448	TTC	2	6	1117478	1117483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821272
23007	NC_006448	CTT	2	6	1117505	1117510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821272
23008	NC_006448	TCTT	2	8	1117542	1117549	0 %	75 %	0 %	25 %	55821272
23009	NC_006448	T	6	6	1117579	1117584	0 %	100 %	0 %	0 %	55821272
23010	NC_006448	CTT	2	6	1117639	1117644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821272
23011	NC_006448	AATA	2	8	1117723	1117730	75 %	25 %	0 %	0 %	55821272
23012	NC_006448	GCA	2	6	1117758	1117763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821272
23013	NC_006448	ATTCA	2	10	1117775	1117784	40 %	40 %	0 %	20 %	55821272
23014	NC_006448	GAA	2	6	1117795	1117800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821272
23015	NC_006448	ATTTCA	2	12	1117824	1117835	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	55821272
23016	NC_006448	TGA	2	6	1117939	1117944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821272
23017	NC_006448	TA	3	6	1118020	1118025	50 %	50 %	0 %	0 %	55821272
23018	NC_006448	GAA	2	6	1118050	1118055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821272
23019	NC_006448	CAG	2	6	1118189	1118194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821272
23020	NC_006448	TTA	2	6	1118220	1118225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821272
23021	NC_006448	ATATC	2	10	1118241	1118250	40 %	40 %	0 %	20 %	55821272
23022	NC_006448	TCA	2	6	1118268	1118273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821272
23023	NC_006448	ATA	2	6	1118274	1118279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821272
23024	NC_006448	TGT	2	6	1118333	1118338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821272
23025	NC_006448	T	7	7	1118358	1118364	0 %	100 %	0 %	0 %	55821273
23026	NC_006448	ACC	2	6	1118385	1118390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821273
23027	NC_006448	TAG	2	6	1118398	1118403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821273
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23029	NC_006448	CAT	2	6	1118486	1118491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821273
23030	NC_006448	CAT	2	6	1118595	1118600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821273
23031	NC_006448	TAC	2	6	1118643	1118648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821273
23032	NC_006448	CCATA	2	10	1118699	1118708	40 %	20 %	0 %	40 %	55821273
23033	NC_006448	CTT	2	6	1118744	1118749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821273
23034	NC_006448	AGC	2	6	1118760	1118765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821273
23035	NC_006448	CCA	2	6	1118806	1118811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821273
23036	NC_006448	CAT	2	6	1118865	1118870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821273
23037	NC_006448	ACG	2	6	1118886	1118891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821273
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23039	NC_006448	ATT	2	6	1119033	1119038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821273
23040	NC_006448	ATC	2	6	1119057	1119062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821273
23041	NC_006448	AGT	2	6	1119138	1119143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821273
23042	NC_006448	TCA	2	6	1119238	1119243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821273
23043	NC_006448	ATA	2	6	1119253	1119258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821273
23044	NC_006448	TCT	2	6	1119259	1119264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821273
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23048	NC_006448	GCTA	2	8	1119363	1119370	25 %	25 %	25 %	25 %	55821273
23049	NC_006448	CGT	2	6	1119507	1119512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821273
23050	NC_006448	AAC	2	6	1119588	1119593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821273
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23052	NC_006448	GCC	2	6	1119676	1119681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55821273
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23054	NC_006448	T	6	6	1119788	1119793	0 %	100 %	0 %	0 %	55821273
23055	NC_006448	CTT	2	6	1119801	1119806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821273
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23085	NC_006448	A	8	8	1121058	1121065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23086	NC_006448	TG	3	6	1121085	1121090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23087	NC_006448	TTA	2	6	1121096	1121101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23089	NC_006448	TTG	2	6	1121115	1121120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23090	NC_006448	ATAA	2	8	1121138	1121145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23091	NC_006448	ATTTA	2	10	1121151	1121160	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23092	NC_006448	A	7	7	1121160	1121166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23093	NC_006448	A	7	7	1121318	1121324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23094	NC_006448	A	6	6	1121360	1121365	100 %	0 %	0 %	0 %	55821274
23095	NC_006448	ATGCA	2	10	1121373	1121382	40 %	20 %	20 %	20 %	55821274
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23101	NC_006448	CTG	2	6	1121485	1121490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821274
23102	NC_006448	TA	3	6	1121574	1121579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23103	NC_006448	TAT	2	6	1121644	1121649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821275
23104	NC_006448	A	6	6	1121656	1121661	100 %	0 %	0 %	0 %	55821275
23105	NC_006448	CAA	2	6	1121689	1121694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821275
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23108	NC_006448	TTGA	2	8	1121825	1121832	25 %	50 %	25 %	0 %	55821275
23109	NC_006448	CAA	2	6	1121957	1121962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821275
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23111	NC_006448	TGA	2	6	1122049	1122054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821275
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23114	NC_006448	TGC	2	6	1122307	1122312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821275
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23117	NC_006448	AAGA	2	8	1122446	1122453	75 %	0 %	25 %	0 %	55821275
23118	NC_006448	TGA	2	6	1122460	1122465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821275
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23120	NC_006448	TATG	2	8	1122616	1122623	25 %	50 %	25 %	0 %	55821275
23121	NC_006448	CAA	2	6	1122701	1122706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821275
23122	NC_006448	AT	3	6	1122721	1122726	50 %	50 %	0 %	0 %	55821275
23123	NC_006448	CTA	2	6	1122885	1122890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821275
23124	NC_006448	ATG	2	6	1122902	1122907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821275
23125	NC_006448	ACAG	2	8	1122965	1122972	50 %	0 %	25 %	25 %	55821275
23126	NC_006448	ATCA	2	8	1122994	1123001	50 %	25 %	0 %	25 %	55821275
23127	NC_006448	CAA	2	6	1123013	1123018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821275
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23139	NC_006448	ACT	2	6	1123834	1123839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23141	NC_006448	T	6	6	1123879	1123884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23142	NC_006448	A	6	6	1123898	1123903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23143	NC_006448	AAAG	2	8	1123949	1123956	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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23195	NC_006448	T	6	6	1126525	1126530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23196	NC_006448	AGG	2	6	1126555	1126560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23197	NC_006448	ATA	2	6	1126608	1126613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23200	NC_006448	A	6	6	1126685	1126690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23216	NC_006448	AATAG	2	10	1127710	1127719	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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23218	NC_006448	A	7	7	1127798	1127804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23219	NC_006448	AAAG	2	8	1127844	1127851	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23220	NC_006448	AGAC	2	8	1127985	1127992	50 %	0 %	25 %	25 %	55821281
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23225	NC_006448	TCA	2	6	1128406	1128411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821282
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23227	NC_006448	T	6	6	1128505	1128510	0 %	100 %	0 %	0 %	55821282
23228	NC_006448	CTAT	2	8	1128514	1128521	25 %	50 %	0 %	25 %	55821282
23229	NC_006448	AAT	2	6	1128581	1128586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821282
23230	NC_006448	CCCA	2	8	1128594	1128601	25 %	0 %	0 %	75 %	55821282
23231	NC_006448	CCA	2	6	1128703	1128708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821283
23232	NC_006448	GACT	2	8	1128747	1128754	25 %	25 %	25 %	25 %	55821283
23233	NC_006448	CTTA	2	8	1128834	1128841	25 %	50 %	0 %	25 %	55821283
23234	NC_006448	TTA	2	6	1128850	1128855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821283
23235	NC_006448	AATT	2	8	1128882	1128889	50 %	50 %	0 %	0 %	55821283
23236	NC_006448	CAA	2	6	1128911	1128916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821283
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23238	NC_006448	CAC	2	6	1129012	1129017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23239	NC_006448	TTC	2	6	1129046	1129051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821284
23240	NC_006448	CAAAG	2	10	1129061	1129070	60 %	0 %	20 %	20 %	55821284
23241	NC_006448	ATC	2	6	1129088	1129093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821284
23242	NC_006448	GA	3	6	1129135	1129140	50 %	0 %	50 %	0 %	55821284
23243	NC_006448	ATA	2	6	1129161	1129166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821284
23244	NC_006448	ATA	2	6	1129188	1129193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821284
23245	NC_006448	TCA	2	6	1129197	1129202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821284
23246	NC_006448	ACC	2	6	1129271	1129276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821284
23247	NC_006448	CTT	2	6	1129345	1129350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821284
23248	NC_006448	GCT	2	6	1129365	1129370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821284
23249	NC_006448	CAG	2	6	1129417	1129422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821284
23250	NC_006448	AAT	3	9	1129487	1129495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821284
23251	NC_006448	TTC	2	6	1129496	1129501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821284
23252	NC_006448	AAG	2	6	1129515	1129520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821284
23253	NC_006448	TCA	2	6	1129533	1129538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821284
23254	NC_006448	CTT	2	6	1129594	1129599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821284
23255	NC_006448	TCG	2	6	1129659	1129664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821284
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23257	NC_006448	TAAAG	2	10	1129804	1129813	60 %	20 %	20 %	0 %	55821284
23258	NC_006448	TTG	2	6	1129828	1129833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821284
23259	NC_006448	GTC	2	6	1129853	1129858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821284
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23262	NC_006448	TCTTCA	2	12	1129986	1129997	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	55821284
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23272	NC_006448	CCTTAT	2	12	1130365	1130376	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	55821284
23273	NC_006448	ACG	2	6	1130387	1130392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821284
23274	NC_006448	AAGGA	2	10	1130442	1130451	60 %	0 %	40 %	0 %	55821284
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23278	NC_006448	GTT	2	6	1130727	1130732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821284
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23284	NC_006448	AAG	2	6	1130978	1130983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821284
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23291	NC_006448	TCAT	2	8	1131318	1131325	25 %	50 %	0 %	25 %	55821284
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23294	NC_006448	TCAA	2	8	1131494	1131501	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23295	NC_006448	ATT	2	6	1131502	1131507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23296	NC_006448	AAT	2	6	1131522	1131527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23297	NC_006448	TAA	2	6	1131593	1131598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23298	NC_006448	TTA	2	6	1131603	1131608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23301	NC_006448	AACTA	2	10	1131699	1131708	60 %	20 %	0 %	20 %	55821285
23302	NC_006448	A	6	6	1131712	1131717	100 %	0 %	0 %	0 %	55821285
23303	NC_006448	TTG	2	6	1131725	1131730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821285
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23313	NC_006448	GTTCA	2	10	1132202	1132211	20 %	40 %	20 %	20 %	55821285
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23322	NC_006448	AAC	2	6	1132583	1132588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821285
23323	NC_006448	TGA	2	6	1132629	1132634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821285
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23326	NC_006448	TAAA	2	8	1132690	1132697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23327	NC_006448	T	6	6	1132714	1132719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23344	NC_006448	TA	3	6	1133913	1133918	50 %	50 %	0 %	0 %	55821286
23345	NC_006448	CTT	2	6	1133945	1133950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821286
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23348	NC_006448	ATA	2	6	1134166	1134171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23349	NC_006448	TTA	2	6	1134277	1134282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23350	NC_006448	ACTG	2	8	1134327	1134334	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23351	NC_006448	TAT	2	6	1134359	1134364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23352	NC_006448	ACT	3	9	1134377	1134385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23353	NC_006448	AGTG	2	8	1134411	1134418	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23354	NC_006448	ATT	2	6	1134621	1134626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821287
23355	NC_006448	CTC	2	6	1134668	1134673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821287
23356	NC_006448	CTT	2	6	1134812	1134817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821287
23357	NC_006448	AAT	2	6	1134876	1134881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821287
23358	NC_006448	CGA	2	6	1134929	1134934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821287
23359	NC_006448	GGTTTT	2	12	1135069	1135080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821287
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23361	NC_006448	T	6	6	1135116	1135121	0 %	100 %	0 %	0 %	55821287
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23481	NC_006448	TTTGG	2	10	1141793	1141802	0 %	60 %	40 %	0 %	55821296
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