MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_006448	AT	3	6	1019268	1019273	50 %	50 %	0 %	0 %	55821168
21002	NC_006448	CAA	2	6	1019314	1019319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821168
21003	NC_006448	GAT	2	6	1019402	1019407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821168
21004	NC_006448	T	7	7	1019414	1019420	0 %	100 %	0 %	0 %	55821168
21005	NC_006448	TAGC	2	8	1019478	1019485	25 %	25 %	25 %	25 %	55821168
21006	NC_006448	CT	3	6	1019553	1019558	0 %	50 %	0 %	50 %	55821168
21007	NC_006448	CAA	2	6	1019625	1019630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821168
21008	NC_006448	TTC	2	6	1019694	1019699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821169
21009	NC_006448	TAA	2	6	1019703	1019708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821169
21010	NC_006448	ACG	2	6	1019717	1019722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821169
21011	NC_006448	AT	3	6	1019730	1019735	50 %	50 %	0 %	0 %	55821169
21012	NC_006448	T	6	6	1019761	1019766	0 %	100 %	0 %	0 %	55821169
21013	NC_006448	GAC	2	6	1019773	1019778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821169
21014	NC_006448	TCAAC	2	10	1019911	1019920	40 %	20 %	0 %	40 %	55821169
21015	NC_006448	T	6	6	1019933	1019938	0 %	100 %	0 %	0 %	55821169
21016	NC_006448	CAA	2	6	1019941	1019946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821169
21017	NC_006448	AAT	2	6	1019960	1019965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821169
21018	NC_006448	CT	3	6	1020006	1020011	0 %	50 %	0 %	50 %	55821169
21019	NC_006448	ACG	2	6	1020038	1020043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821169
21020	NC_006448	CAA	2	6	1020065	1020070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821169
21021	NC_006448	GTC	2	6	1020101	1020106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821169
21022	NC_006448	GT	3	6	1020172	1020177	0 %	50 %	50 %	0 %	55821169
21023	NC_006448	T	6	6	1020257	1020262	0 %	100 %	0 %	0 %	55821169
21024	NC_006448	CCT	2	6	1020319	1020324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55821169
21025	NC_006448	TGA	2	6	1020340	1020345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821169
21026	NC_006448	TCA	3	9	1020363	1020371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821169
21027	NC_006448	T	7	7	1020382	1020388	0 %	100 %	0 %	0 %	55821169
21028	NC_006448	A	6	6	1020468	1020473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21029	NC_006448	AT	3	6	1020513	1020518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21030	NC_006448	CTTT	2	8	1020522	1020529	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21031	NC_006448	TTA	2	6	1020536	1020541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21032	NC_006448	CCTT	2	8	1020557	1020564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21033	NC_006448	ACA	2	6	1020587	1020592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21034	NC_006448	CAT	2	6	1020647	1020652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21035	NC_006448	ACC	2	6	1020678	1020683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21036	NC_006448	AAC	2	6	1020687	1020692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21037	NC_006448	T	7	7	1020755	1020761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21038	NC_006448	CTATAT	2	12	1020762	1020773	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21039	NC_006448	T	6	6	1020829	1020834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21040	NC_006448	CTAAA	2	10	1020855	1020864	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21041	NC_006448	A	6	6	1020862	1020867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21042	NC_006448	AGG	2	6	1020907	1020912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21043	NC_006448	AATA	2	8	1020945	1020952	75 %	25 %	0 %	0 %	55821170
21044	NC_006448	TTCTGG	2	12	1021028	1021039	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	55821170
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21049	NC_006448	TGG	2	6	1021340	1021345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55821170
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21052	NC_006448	GTT	2	6	1021497	1021502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821170
21053	NC_006448	AGGTC	2	10	1021559	1021568	20 %	20 %	40 %	20 %	55821170
21054	NC_006448	CTT	2	6	1021595	1021600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821170
21055	NC_006448	CT	3	6	1021635	1021640	0 %	50 %	0 %	50 %	55821170
21056	NC_006448	ACC	2	6	1021651	1021656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821170
21057	NC_006448	AGG	2	6	1021685	1021690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55821170
21058	NC_006448	A	7	7	1021706	1021712	100 %	0 %	0 %	0 %	55821171
21059	NC_006448	AGA	2	6	1021786	1021791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821171
21060	NC_006448	TGA	2	6	1021948	1021953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821171
21061	NC_006448	ACTT	2	8	1022028	1022035	25 %	50 %	0 %	25 %	55821171
21062	NC_006448	ATG	2	6	1022055	1022060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821171
21063	NC_006448	CTT	2	6	1022070	1022075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821171
21064	NC_006448	TTA	2	6	1022092	1022097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821171
21065	NC_006448	GCC	2	6	1022201	1022206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55821171
21066	NC_006448	CT	3	6	1022330	1022335	0 %	50 %	0 %	50 %	55821171
21067	NC_006448	CAAG	2	8	1022403	1022410	50 %	0 %	25 %	25 %	55821171
21068	NC_006448	TTGA	2	8	1022423	1022430	25 %	50 %	25 %	0 %	55821171
21069	NC_006448	AAAT	2	8	1022521	1022528	75 %	25 %	0 %	0 %	55821171
21070	NC_006448	GCT	2	6	1022596	1022601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821172
21071	NC_006448	TA	3	6	1022639	1022644	50 %	50 %	0 %	0 %	55821172
21072	NC_006448	GATT	2	8	1022690	1022697	25 %	50 %	25 %	0 %	55821172
21073	NC_006448	CAA	2	6	1022721	1022726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821172
21074	NC_006448	TGAC	2	8	1022822	1022829	25 %	25 %	25 %	25 %	55821172
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21079	NC_006448	ATT	2	6	1023082	1023087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821172
21080	NC_006448	AACT	2	8	1023135	1023142	50 %	25 %	0 %	25 %	55821172
21081	NC_006448	GCT	2	6	1023163	1023168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821172
21082	NC_006448	CGT	2	6	1023211	1023216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821172
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21086	NC_006448	TCTT	2	8	1023327	1023334	0 %	75 %	0 %	25 %	55821173
21087	NC_006448	CAT	2	6	1023335	1023340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821173
21088	NC_006448	TTC	2	6	1023400	1023405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821173
21089	NC_006448	TCTA	2	8	1023417	1023424	25 %	50 %	0 %	25 %	55821173
21090	NC_006448	GTTC	2	8	1023431	1023438	0 %	50 %	25 %	25 %	55821173
21091	NC_006448	TCT	2	6	1023472	1023477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821173
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21094	NC_006448	TTTA	2	8	1023633	1023640	25 %	75 %	0 %	0 %	55821173
21095	NC_006448	TAT	2	6	1023641	1023646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821173
21096	NC_006448	CTT	2	6	1023715	1023720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821173
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21098	NC_006448	CTTTA	2	10	1023803	1023812	20 %	60 %	0 %	20 %	55821173
21099	NC_006448	CT	3	6	1023876	1023881	0 %	50 %	0 %	50 %	55821173
21100	NC_006448	A	6	6	1023907	1023912	100 %	0 %	0 %	0 %	55821173
21101	NC_006448	T	6	6	1023928	1023933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21102	NC_006448	TTC	2	6	1023975	1023980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821174
21103	NC_006448	CTG	2	6	1024068	1024073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821174
21104	NC_006448	TC	3	6	1024110	1024115	0 %	50 %	0 %	50 %	55821174
21105	NC_006448	GTTT	2	8	1024149	1024156	0 %	75 %	25 %	0 %	55821174
21106	NC_006448	ATA	2	6	1024186	1024191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821174
21107	NC_006448	ACC	2	6	1024291	1024296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821174
21108	NC_006448	TAA	2	6	1024447	1024452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821174
21109	NC_006448	TTA	2	6	1024502	1024507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821174
21110	NC_006448	TAA	2	6	1024557	1024562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821174
21111	NC_006448	TCCAT	2	10	1024576	1024585	20 %	40 %	0 %	40 %	55821174
21112	NC_006448	GCT	2	6	1024641	1024646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821174
21113	NC_006448	GACT	2	8	1024658	1024665	25 %	25 %	25 %	25 %	55821174
21114	NC_006448	TTG	2	6	1024668	1024673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821174
21115	NC_006448	GCT	2	6	1024793	1024798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821174
21116	NC_006448	ATT	2	6	1024799	1024804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821174
21117	NC_006448	TCTT	2	8	1024845	1024852	0 %	75 %	0 %	25 %	55821174
21118	NC_006448	TCTT	2	8	1024866	1024873	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21119	NC_006448	AAT	2	6	1024943	1024948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821175
21120	NC_006448	TGCC	2	8	1024949	1024956	0 %	25 %	25 %	50 %	55821175
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21122	NC_006448	GT	3	6	1025190	1025195	0 %	50 %	50 %	0 %	55821176
21123	NC_006448	GTT	3	9	1025209	1025217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821176
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21127	NC_006448	TAA	2	6	1025618	1025623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821176
21128	NC_006448	GCT	3	9	1025644	1025652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821176
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21147	NC_006448	TAT	2	6	1026421	1026426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21151	NC_006448	GTT	2	6	1026815	1026820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21152	NC_006448	A	6	6	1026823	1026828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21153	NC_006448	TGT	2	6	1026901	1026906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821178
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21182	NC_006448	AGAT	2	8	1028512	1028519	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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21187	NC_006448	AAG	2	6	1028653	1028658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21230	NC_006448	CTG	2	6	1030699	1030704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21231	NC_006448	TAA	2	6	1030718	1030723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21233	NC_006448	TTA	2	6	1030766	1030771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21234	NC_006448	TAT	2	6	1030821	1030826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21235	NC_006448	GTT	2	6	1030971	1030976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821182
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21238	NC_006448	CAACT	2	10	1031049	1031058	40 %	20 %	0 %	40 %	55821182
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21241	NC_006448	GCT	2	6	1031286	1031291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821182
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21243	NC_006448	AAC	2	6	1031364	1031369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821182
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21256	NC_006448	A	6	6	1031857	1031862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21354	NC_006448	ATC	2	6	1036143	1036148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21356	NC_006448	A	6	6	1036241	1036246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21357	NC_006448	TAAA	2	8	1036278	1036285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21358	NC_006448	AGG	2	6	1036379	1036384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21359	NC_006448	GTT	2	6	1036387	1036392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21360	NC_006448	TTA	2	6	1036415	1036420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21361	NC_006448	A	6	6	1036420	1036425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21362	NC_006448	T	6	6	1036443	1036448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21364	NC_006448	AGT	2	6	1036515	1036520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821188
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21368	NC_006448	TG	3	6	1036881	1036886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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