MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

< Previous12...3233343536373839404142...7374Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_006448	TCAA	2	8	876633	876640	50 %	25 %	0 %	25 %	55821006
18003	NC_006448	CAT	2	6	876665	876670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821006
18004	NC_006448	GTC	2	6	876708	876713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821006
18005	NC_006448	CTA	2	6	876742	876747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821006
18006	NC_006448	GATT	2	8	876798	876805	25 %	50 %	25 %	0 %	55821006
18007	NC_006448	AAG	2	6	876846	876851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821006
18008	NC_006448	TAA	2	6	876874	876879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821006
18009	NC_006448	A	6	6	876887	876892	100 %	0 %	0 %	0 %	55821006
18010	NC_006448	AAAAG	2	10	877094	877103	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18011	NC_006448	CAG	2	6	877194	877199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18012	NC_006448	AGCA	2	8	877265	877272	50 %	0 %	25 %	25 %	55821007
18013	NC_006448	TTC	2	6	877476	877481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821007
18014	NC_006448	CTAT	2	8	877683	877690	25 %	50 %	0 %	25 %	55821007
18015	NC_006448	AG	3	6	877742	877747	50 %	0 %	50 %	0 %	55821007
18016	NC_006448	GAA	2	6	877778	877783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821007
18017	NC_006448	TAACT	2	10	877839	877848	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18018	NC_006448	TTA	2	6	877849	877854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18019	NC_006448	TTGC	2	8	877933	877940	0 %	50 %	25 %	25 %	55821008
18020	NC_006448	TCA	2	6	877941	877946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821008
18021	NC_006448	CTG	2	6	878008	878013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821008
18022	NC_006448	ACG	2	6	878038	878043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821008
18023	NC_006448	AAG	2	6	878083	878088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821008
18024	NC_006448	ACT	2	6	878182	878187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821008
18025	NC_006448	AGA	2	6	878192	878197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821008
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18027	NC_006448	A	6	6	878214	878219	100 %	0 %	0 %	0 %	55821008
18028	NC_006448	ATTC	2	8	878245	878252	25 %	50 %	0 %	25 %	55821008
18029	NC_006448	AGC	2	6	878321	878326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821008
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18031	NC_006448	TTG	2	6	878381	878386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821009
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18033	NC_006448	A	6	6	878471	878476	100 %	0 %	0 %	0 %	55821009
18034	NC_006448	CAA	2	6	878546	878551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821009
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18037	NC_006448	GAAG	2	8	878616	878623	50 %	0 %	50 %	0 %	55821009
18038	NC_006448	AAT	2	6	878723	878728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821009
18039	NC_006448	ATT	2	6	878789	878794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18040	NC_006448	T	6	6	878887	878892	0 %	100 %	0 %	0 %	55821010
18041	NC_006448	TTC	2	6	878897	878902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821010
18042	NC_006448	CATTT	2	10	878958	878967	20 %	60 %	0 %	20 %	55821010
18043	NC_006448	GCCT	2	8	879014	879021	0 %	25 %	25 %	50 %	55821010
18044	NC_006448	TCA	2	6	879109	879114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821010
18045	NC_006448	CTG	2	6	879119	879124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821010
18046	NC_006448	GCT	2	6	879145	879150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821010
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18048	NC_006448	CATCA	2	10	879184	879193	40 %	20 %	0 %	40 %	55821010
18049	NC_006448	CAC	2	6	879224	879229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821010
18050	NC_006448	ATT	2	6	879312	879317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821011
18051	NC_006448	TTTA	2	8	879363	879370	25 %	75 %	0 %	0 %	55821011
18052	NC_006448	CTT	2	6	879396	879401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821011
18053	NC_006448	ATT	2	6	879490	879495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18054	NC_006448	TACA	2	8	879512	879519	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18055	NC_006448	T	8	8	879558	879565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18056	NC_006448	TGA	2	6	879568	879573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821012
18057	NC_006448	AGT	2	6	879695	879700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821012
18058	NC_006448	GCA	2	6	879735	879740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821012
18059	NC_006448	CTAG	2	8	879771	879778	25 %	25 %	25 %	25 %	55821012
18060	NC_006448	AACT	2	8	879782	879789	50 %	25 %	0 %	25 %	55821012
18061	NC_006448	CAG	2	6	879866	879871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18062	NC_006448	AAT	2	6	879898	879903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821013
18063	NC_006448	TTC	2	6	879917	879922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821013
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18065	NC_006448	AAC	2	6	880023	880028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821013
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18068	NC_006448	CGT	2	6	880177	880182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821013
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18070	NC_006448	ATC	2	6	880207	880212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821013
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18086	NC_006448	TAAC	2	8	880943	880950	50 %	25 %	0 %	25 %	55821013
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18101	NC_006448	AGA	2	6	881512	881517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821014
18102	NC_006448	A	6	6	881574	881579	100 %	0 %	0 %	0 %	55821014
18103	NC_006448	AGT	2	6	881599	881604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821014
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18105	NC_006448	TCT	2	6	881625	881630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821014
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18107	NC_006448	CAA	2	6	881706	881711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18108	NC_006448	TCT	2	6	881737	881742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18109	NC_006448	ATAA	2	8	881823	881830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18110	NC_006448	TTG	2	6	881867	881872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821015
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18112	NC_006448	GTT	2	6	881944	881949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821015
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18121	NC_006448	TC	3	6	882292	882297	0 %	50 %	0 %	50 %	55821015
18122	NC_006448	TCA	2	6	882356	882361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821015
18123	NC_006448	AAATGA	2	12	882461	882472	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18124	NC_006448	GTC	2	6	882654	882659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18125	NC_006448	A	7	7	882688	882694	100 %	0 %	0 %	0 %	55821016
18126	NC_006448	ATC	2	6	882702	882707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821016
18127	NC_006448	ATCAGT	2	12	882729	882740	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	55821016
18128	NC_006448	TTG	2	6	882744	882749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821016
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18131	NC_006448	TAA	2	6	882870	882875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18132	NC_006448	TTTAA	2	10	882876	882885	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18133	NC_006448	ATCT	2	8	882901	882908	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18134	NC_006448	TAA	2	6	882966	882971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821017
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18142	NC_006448	T	6	6	883434	883439	0 %	100 %	0 %	0 %	55821017
18143	NC_006448	CAT	2	6	883446	883451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821017
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18152	NC_006448	AAG	2	6	883937	883942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821017
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18159	NC_006448	AGT	2	6	884371	884376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18493	NC_006448	A	6	6	900404	900409	100 %	0 %	0 %	0 %	55821035
18494	NC_006448	ATT	2	6	900452	900457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821036
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18496	NC_006448	CA	3	6	900507	900512	50 %	0 %	0 %	50 %	55821036
18497	NC_006448	TCA	2	6	900539	900544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821036
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