MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_006448	GTTT	2	8	707641	707648	0 %	75 %	25 %	0 %	55820813
14503	NC_006448	CAAG	2	8	707662	707669	50 %	0 %	25 %	25 %	55820813
14504	NC_006448	T	6	6	707719	707724	0 %	100 %	0 %	0 %	55820813
14505	NC_006448	GAA	2	6	707738	707743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820813
14506	NC_006448	CCA	2	6	707754	707759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820813
14507	NC_006448	AGC	2	6	707771	707776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820813
14508	NC_006448	TG	3	6	707819	707824	0 %	50 %	50 %	0 %	55820813
14509	NC_006448	AGG	2	6	707865	707870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820813
14510	NC_006448	TGGT	2	8	707897	707904	0 %	50 %	50 %	0 %	55820813
14511	NC_006448	AAT	2	6	707911	707916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820813
14512	NC_006448	CAT	2	6	707918	707923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820813
14513	NC_006448	CAA	2	6	707953	707958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820813
14514	NC_006448	GTCACC	2	12	707975	707986	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55820813
14515	NC_006448	TTC	2	6	708041	708046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820813
14516	NC_006448	TTGA	2	8	708152	708159	25 %	50 %	25 %	0 %	55820813
14517	NC_006448	TAAGA	2	10	708332	708341	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14518	NC_006448	ATT	2	6	708373	708378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14519	NC_006448	AG	3	6	708380	708385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14520	NC_006448	TCTTTA	2	12	708456	708467	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	55820814
14521	NC_006448	GATT	2	8	708500	708507	25 %	50 %	25 %	0 %	55820814
14522	NC_006448	GAT	2	6	708516	708521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820814
14523	NC_006448	GAG	2	6	708522	708527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820814
14524	NC_006448	TAC	2	6	708607	708612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820814
14525	NC_006448	TGC	2	6	708635	708640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820814
14526	NC_006448	ATG	2	6	708643	708648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820814
14527	NC_006448	GCT	2	6	708660	708665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820814
14528	NC_006448	AAG	2	6	708778	708783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820814
14529	NC_006448	TAT	2	6	708791	708796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820814
14530	NC_006448	ATCA	2	8	708832	708839	50 %	25 %	0 %	25 %	55820814
14531	NC_006448	TGA	2	6	708857	708862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820814
14532	NC_006448	TTG	2	6	708889	708894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820814
14533	NC_006448	GCA	2	6	709158	709163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820814
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14535	NC_006448	ATA	2	6	709321	709326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820814
14536	NC_006448	TGA	2	6	709355	709360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820814
14537	NC_006448	AGAA	2	8	709363	709370	75 %	0 %	25 %	0 %	55820814
14538	NC_006448	GTA	2	6	709414	709419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_006448	CTT	2	6	709426	709431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14540	NC_006448	TAG	2	6	709435	709440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_006448	GAG	2	6	709465	709470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14542	NC_006448	AGA	2	6	709480	709485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14543	NC_006448	T	7	7	709547	709553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_006448	ATT	2	6	709559	709564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14545	NC_006448	CT	3	6	709569	709574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14546	NC_006448	GAT	2	6	709755	709760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820815
14547	NC_006448	TGA	2	6	709850	709855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820815
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14549	NC_006448	TTG	2	6	709936	709941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820815
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14551	NC_006448	GGTACA	2	12	710129	710140	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55820815
14552	NC_006448	TA	3	6	710246	710251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_006448	CAAG	2	8	710426	710433	50 %	0 %	25 %	25 %	55820816
14554	NC_006448	GAT	2	6	710462	710467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820816
14555	NC_006448	GTG	2	6	710479	710484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820816
14556	NC_006448	GAA	2	6	710496	710501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820816
14557	NC_006448	GAA	2	6	710511	710516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820816
14558	NC_006448	A	6	6	710520	710525	100 %	0 %	0 %	0 %	55820816
14559	NC_006448	AGC	2	6	710531	710536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820816
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14561	NC_006448	GAA	2	6	710550	710555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820816
14562	NC_006448	GAC	2	6	710592	710597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820816
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14585	NC_006448	A	6	6	712295	712300	100 %	0 %	0 %	0 %	55820818
14586	NC_006448	T	6	6	712403	712408	0 %	100 %	0 %	0 %	55820818
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14588	NC_006448	AG	3	6	712515	712520	50 %	0 %	50 %	0 %	55820818
14589	NC_006448	GGAA	2	8	712570	712577	50 %	0 %	50 %	0 %	55820818
14590	NC_006448	GTC	2	6	712582	712587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820818
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14592	NC_006448	GAT	2	6	712638	712643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820818
14593	NC_006448	CGA	2	6	712666	712671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820818
14594	NC_006448	GTT	2	6	712826	712831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14598	NC_006448	ATTGA	2	10	712951	712960	40 %	40 %	20 %	0 %	55820819
14599	NC_006448	GCT	2	6	712996	713001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820819
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14601	NC_006448	CTCA	2	8	713147	713154	25 %	25 %	0 %	50 %	55820819
14602	NC_006448	AGCCA	2	10	713158	713167	40 %	0 %	20 %	40 %	55820819
14603	NC_006448	TGC	2	6	713169	713174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820819
14604	NC_006448	GGAT	2	8	713216	713223	25 %	25 %	50 %	0 %	55820819
14605	NC_006448	GGT	2	6	713233	713238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820819
14606	NC_006448	AGTT	2	8	713259	713266	25 %	50 %	25 %	0 %	55820819
14607	NC_006448	CTT	2	6	713320	713325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820819
14608	NC_006448	ATG	2	6	713330	713335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820819
14609	NC_006448	AAG	2	6	713354	713359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820819
14610	NC_006448	TCA	2	6	713499	713504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820819
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14612	NC_006448	GTG	2	6	713570	713575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820819
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14616	NC_006448	TGC	3	9	713742	713750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820819
14617	NC_006448	CAAC	2	8	713766	713773	50 %	0 %	0 %	50 %	55820819
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14622	NC_006448	TA	3	6	714131	714136	50 %	50 %	0 %	0 %	55820820
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14729	NC_006448	A	6	6	719334	719339	100 %	0 %	0 %	0 %	55820824
14730	NC_006448	TA	3	6	719371	719376	50 %	50 %	0 %	0 %	55820824
14731	NC_006448	A	6	6	719376	719381	100 %	0 %	0 %	0 %	55820824
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14745	NC_006448	CTT	2	6	720054	720059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820825
14746	NC_006448	GAT	2	6	720074	720079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820825
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14748	NC_006448	CTTC	2	8	720201	720208	0 %	50 %	0 %	50 %	55820825
14749	NC_006448	CAT	2	6	720283	720288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820825
14750	NC_006448	TGT	2	6	720304	720309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820825
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14847	NC_006448	AT	3	6	725140	725145	50 %	50 %	0 %	0 %	55820833
14848	NC_006448	AT	3	6	725217	725222	50 %	50 %	0 %	0 %	55820833
14849	NC_006448	ATA	2	6	725251	725256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820833
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14851	NC_006448	T	6	6	725317	725322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14852	NC_006448	ATA	2	6	725334	725339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14853	NC_006448	AAT	2	6	725341	725346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14864	NC_006448	GCA	2	6	725934	725939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820834
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