MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_006448	CTAT	2	8	638457	638464	25 %	50 %	0 %	25 %	55820745
13003	NC_006448	TCAA	2	8	638598	638605	50 %	25 %	0 %	25 %	55820745
13004	NC_006448	CAG	2	6	638660	638665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820745
13005	NC_006448	TACC	2	8	638691	638698	25 %	25 %	0 %	50 %	55820745
13006	NC_006448	ATT	2	6	638738	638743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820745
13007	NC_006448	TAA	2	6	638761	638766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820745
13008	NC_006448	CAT	2	6	638899	638904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820745
13009	NC_006448	AAC	2	6	638937	638942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820745
13010	NC_006448	TAA	2	6	639014	639019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820746
13011	NC_006448	T	7	7	639054	639060	0 %	100 %	0 %	0 %	55820746
13012	NC_006448	TTA	2	6	639116	639121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820746
13013	NC_006448	TGC	2	6	639135	639140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820746
13014	NC_006448	CGT	2	6	639178	639183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820746
13015	NC_006448	GAA	2	6	639199	639204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820746
13016	NC_006448	TTC	2	6	639215	639220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820746
13017	NC_006448	CAAA	2	8	639247	639254	75 %	0 %	0 %	25 %	55820746
13018	NC_006448	GGCTAA	2	12	639264	639275	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55820746
13019	NC_006448	CT	3	6	639320	639325	0 %	50 %	0 %	50 %	55820746
13020	NC_006448	GCT	2	6	639388	639393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820746
13021	NC_006448	GCA	2	6	639403	639408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820746
13022	NC_006448	A	6	6	639475	639480	100 %	0 %	0 %	0 %	55820746
13023	NC_006448	A	6	6	639487	639492	100 %	0 %	0 %	0 %	55820746
13024	NC_006448	AGG	2	6	639495	639500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820746
13025	NC_006448	ATT	2	6	639532	639537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820747
13026	NC_006448	GCA	2	6	639541	639546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820747
13027	NC_006448	GCA	2	6	639556	639561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820747
13028	NC_006448	TGA	2	6	639609	639614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820747
13029	NC_006448	TTCA	2	8	639624	639631	25 %	50 %	0 %	25 %	55820747
13030	NC_006448	AAG	2	6	639632	639637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820747
13031	NC_006448	AGT	2	6	639660	639665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820747
13032	NC_006448	A	6	6	639776	639781	100 %	0 %	0 %	0 %	55820747
13033	NC_006448	AG	3	6	639807	639812	50 %	0 %	50 %	0 %	55820747
13034	NC_006448	TCA	2	6	639821	639826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820747
13035	NC_006448	A	6	6	639830	639835	100 %	0 %	0 %	0 %	55820747
13036	NC_006448	TGA	2	6	639891	639896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820747
13037	NC_006448	GAA	2	6	639925	639930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820747
13038	NC_006448	AGA	2	6	640046	640051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820748
13039	NC_006448	AAGG	2	8	640086	640093	50 %	0 %	50 %	0 %	55820748
13040	NC_006448	TACTAT	2	12	640160	640171	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	55820748
13041	NC_006448	GAC	2	6	640205	640210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820748
13042	NC_006448	CTG	2	6	640268	640273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_006448	CCT	2	6	640274	640279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13044	NC_006448	TA	3	6	640283	640288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_006448	TAA	2	6	640357	640362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_006448	T	8	8	640389	640396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_006448	TAT	2	6	640407	640412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_006448	A	7	7	640463	640469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_006448	TCAA	2	8	640470	640477	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13050	NC_006448	A	7	7	640501	640507	100 %	0 %	0 %	0 %	55820749
13051	NC_006448	A	6	6	640589	640594	100 %	0 %	0 %	0 %	55820749
13052	NC_006448	ATG	2	6	640714	640719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820749
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13054	NC_006448	ATG	2	6	640838	640843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820749
13055	NC_006448	CAGG	2	8	640891	640898	25 %	0 %	50 %	25 %	55820749
13056	NC_006448	TCA	2	6	640946	640951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820749
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13062	NC_006448	ACT	2	6	641120	641125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820749
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13065	NC_006448	TAAAA	2	10	641420	641429	80 %	20 %	0 %	0 %	55820749
13066	NC_006448	TCC	2	6	641435	641440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13067	NC_006448	A	6	6	641536	641541	100 %	0 %	0 %	0 %	55820750
13068	NC_006448	CTG	2	6	641561	641566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820750
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13088	NC_006448	GA	3	6	642846	642851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_006448	CA	3	6	642867	642872	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13091	NC_006448	TAT	2	6	642915	642920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13093	NC_006448	GAG	2	6	643037	643042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_006448	ATTT	2	8	643112	643119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_006448	T	7	7	643171	643177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_006448	T	6	6	643199	643204	0 %	100 %	0 %	0 %	55820751
13097	NC_006448	ACCG	2	8	643282	643289	25 %	0 %	25 %	50 %	55820751
13098	NC_006448	ACC	2	6	643339	643344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820751
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13102	NC_006448	CCT	2	6	643499	643504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820751
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13104	NC_006448	ATG	2	6	643640	643645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820751
13105	NC_006448	GCA	2	6	643658	643663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820751
13106	NC_006448	ATA	2	6	643664	643669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820751
13107	NC_006448	GAA	2	6	643686	643691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820751
13108	NC_006448	CTA	2	6	643767	643772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13109	NC_006448	TAT	2	6	643975	643980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820752
13110	NC_006448	GATA	2	8	643990	643997	50 %	25 %	25 %	0 %	55820752
13111	NC_006448	TAA	2	6	644002	644007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820752
13112	NC_006448	TGA	2	6	644058	644063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820752
13113	NC_006448	AAT	2	6	644124	644129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_006448	A	7	7	644191	644197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_006448	GAA	2	6	644248	644253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820753
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13119	NC_006448	AGGT	2	8	644537	644544	25 %	25 %	50 %	0 %	55820754
13120	NC_006448	T	6	6	644581	644586	0 %	100 %	0 %	0 %	55820754
13121	NC_006448	GTA	2	6	644593	644598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820754
13122	NC_006448	GGCAA	2	10	644621	644630	40 %	0 %	40 %	20 %	55820754
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13247	NC_006448	ATT	2	6	650325	650330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13368	NC_006448	TGG	2	6	655024	655029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13369	NC_006448	AGA	2	6	655097	655102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13498	NC_006448	TAT	2	6	661577	661582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820771
13499	NC_006448	GCT	2	6	661586	661591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820771
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