MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11503	NC_006448	TTGT	2	8	561467	561474	0 %	75 %	25 %	0 %	55820668
11504	NC_006448	CTT	2	6	561515	561520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820668
11505	NC_006448	TCT	2	6	561579	561584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820668
11506	NC_006448	A	6	6	561599	561604	100 %	0 %	0 %	0 %	55820668
11507	NC_006448	T	6	6	561645	561650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_006448	AAT	2	6	561678	561683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_006448	AACAT	2	10	561698	561707	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11510	NC_006448	ATC	2	6	561905	561910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820669
11511	NC_006448	AAG	2	6	561931	561936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820669
11512	NC_006448	CTG	2	6	562024	562029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820669
11513	NC_006448	A	6	6	562080	562085	100 %	0 %	0 %	0 %	55820669
11514	NC_006448	GAA	2	6	562101	562106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820669
11515	NC_006448	CCA	2	6	562113	562118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820669
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11517	NC_006448	ACT	2	6	562234	562239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820669
11518	NC_006448	GCA	2	6	562293	562298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820669
11519	NC_006448	TGC	2	6	562313	562318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820669
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11522	NC_006448	CTT	2	6	562445	562450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820669
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11524	NC_006448	ATCT	2	8	562493	562500	25 %	50 %	0 %	25 %	55820669
11525	NC_006448	GCT	2	6	562626	562631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820669
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11529	NC_006448	TCT	2	6	562678	562683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820669
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11532	NC_006448	TAAA	2	8	562801	562808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_006448	ATT	2	6	562811	562816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_006448	A	6	6	562918	562923	100 %	0 %	0 %	0 %	55820670
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11540	NC_006448	GCTT	2	8	563157	563164	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11541	NC_006448	GA	3	6	563204	563209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_006448	CGG	2	6	563228	563233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11543	NC_006448	TTCGGG	2	12	563250	563261	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11544	NC_006448	CT	4	8	563273	563280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11545	NC_006448	T	7	7	563330	563336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_006448	TAA	2	6	563458	563463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_006448	AT	3	6	563488	563493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_006448	TGGC	2	8	563513	563520	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11549	NC_006448	TTG	2	6	563523	563528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_006448	T	7	7	563534	563540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_006448	GAA	2	6	563556	563561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161611290
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11580	NC_006448	TA	3	6	564785	564790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_006448	T	6	6	564921	564926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11587	NC_006448	TATT	2	8	565139	565146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11596	NC_006448	TTGGT	2	10	565799	565808	0 %	60 %	40 %	0 %	55820672
11597	NC_006448	GCAG	2	8	565832	565839	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11598	NC_006448	TGT	3	9	565880	565888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_006448	GCA	2	6	565890	565895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11600	NC_006448	GTT	2	6	565917	565922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_006448	TCT	2	6	566058	566063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820673
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11603	NC_006448	TAA	2	6	566244	566249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_006448	CTT	2	6	566335	566340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_006448	T	6	6	566427	566432	0 %	100 %	0 %	0 %	55820674
11606	NC_006448	TTA	2	6	566447	566452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820674
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11608	NC_006448	TTG	2	6	566510	566515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820674
11609	NC_006448	ATA	2	6	566561	566566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820674
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11612	NC_006448	CAAGGA	2	12	566750	566761	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	55820674
11613	NC_006448	TTAT	2	8	566799	566806	25 %	75 %	0 %	0 %	55820674
11614	NC_006448	TTG	2	6	566822	566827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820674
11615	NC_006448	GTC	2	6	566835	566840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11616	NC_006448	AGGA	2	8	566915	566922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_006448	A	7	7	566922	566928	100 %	0 %	0 %	0 %	55820675
11618	NC_006448	AGA	2	6	566951	566956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820675
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11621	NC_006448	AAG	2	6	567064	567069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820675
11622	NC_006448	AGT	2	6	567285	567290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820675
11623	NC_006448	TGG	2	6	567362	567367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820675
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12000	NC_006448	T	6	6	586078	586083	0 %	100 %	0 %	0 %	55820697

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