MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_006448	CTT	2	6	535574	535579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11002	NC_006448	T	7	7	535621	535627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_006448	CTA	2	6	535628	535633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_006448	A	6	6	535718	535723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_006448	TATAA	2	10	535769	535778	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_006448	T	7	7	535780	535786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_006448	CTAT	2	8	535795	535802	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11008	NC_006448	TTG	2	6	535837	535842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_006448	AAT	2	6	535877	535882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_006448	CTA	2	6	535911	535916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_006448	TAA	2	6	536005	536010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_006448	TGA	2	6	536071	536076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_006448	AGA	2	6	536080	536085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_006448	CCT	2	6	536153	536158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11015	NC_006448	AAC	2	6	536258	536263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11016	NC_006448	GATT	2	8	536268	536275	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_006448	GAC	2	6	536396	536401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_006448	GAA	2	6	536480	536485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820646
11019	NC_006448	CA	3	6	536487	536492	50 %	0 %	0 %	50 %	55820646
11020	NC_006448	TGGA	2	8	536559	536566	25 %	25 %	50 %	0 %	55820646
11021	NC_006448	AG	3	6	536651	536656	50 %	0 %	50 %	0 %	55820646
11022	NC_006448	ATG	2	6	536721	536726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820646
11023	NC_006448	CAAGC	2	10	536764	536773	40 %	0 %	20 %	40 %	55820646
11024	NC_006448	ATG	2	6	536808	536813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820646
11025	NC_006448	AGA	2	6	536914	536919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820646
11026	NC_006448	TTCAG	2	10	536968	536977	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11027	NC_006448	AGC	2	6	537110	537115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820647
11028	NC_006448	TCCT	2	8	537121	537128	0 %	50 %	0 %	50 %	55820647
11029	NC_006448	CAA	2	6	537143	537148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820647
11030	NC_006448	CTA	2	6	537159	537164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820647
11031	NC_006448	AAC	2	6	537173	537178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820647
11032	NC_006448	TCG	2	6	537335	537340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820647
11033	NC_006448	T	6	6	537390	537395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_006448	ACA	2	6	537595	537600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820648
11035	NC_006448	ATG	2	6	537617	537622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820648
11036	NC_006448	TGT	2	6	537659	537664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820648
11037	NC_006448	TGCA	2	8	537665	537672	25 %	25 %	25 %	25 %	55820648
11038	NC_006448	CGT	2	6	537679	537684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820648
11039	NC_006448	AAG	2	6	537688	537693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820648
11040	NC_006448	TCA	2	6	537695	537700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820648
11041	NC_006448	ATTC	2	8	537734	537741	25 %	50 %	0 %	25 %	55820648
11042	NC_006448	A	6	6	537835	537840	100 %	0 %	0 %	0 %	55820648
11043	NC_006448	A	6	6	537901	537906	100 %	0 %	0 %	0 %	55820648
11044	NC_006448	GAA	2	6	537928	537933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820648
11045	NC_006448	AGGA	2	8	537959	537966	50 %	0 %	50 %	0 %	55820648
11046	NC_006448	GTG	2	6	538187	538192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820648
11047	NC_006448	CTT	2	6	538200	538205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820648
11048	NC_006448	GTA	2	6	538237	538242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820648
11049	NC_006448	TGA	2	6	538308	538313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820648
11050	NC_006448	TGA	2	6	538431	538436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820648
11051	NC_006448	AAG	2	6	538466	538471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820648
11052	NC_006448	A	6	6	538571	538576	100 %	0 %	0 %	0 %	55820649
11053	NC_006448	TAC	2	6	538599	538604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820649
11054	NC_006448	ATT	2	6	538642	538647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820649
11055	NC_006448	CTT	2	6	538665	538670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820649
11056	NC_006448	TCG	2	6	538683	538688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820649
11057	NC_006448	ATT	2	6	538747	538752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820649
11058	NC_006448	CAGA	2	8	538759	538766	50 %	0 %	25 %	25 %	55820649
11059	NC_006448	TGT	2	6	538818	538823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820649
11060	NC_006448	AC	3	6	538824	538829	50 %	0 %	0 %	50 %	55820649
11061	NC_006448	TGC	2	6	538989	538994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820649
11062	NC_006448	TGT	2	6	539111	539116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820649
11063	NC_006448	GGC	2	6	539163	539168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55820649
11064	NC_006448	AGAGGA	2	12	539184	539195	50 %	0 %	50 %	0 %	55820649
11065	NC_006448	GTT	2	6	539209	539214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820649
11066	NC_006448	GCT	2	6	539332	539337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820649
11067	NC_006448	ATC	2	6	539446	539451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820649
11068	NC_006448	TAT	2	6	539476	539481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820649
11069	NC_006448	A	6	6	539791	539796	100 %	0 %	0 %	0 %	55820649
11070	NC_006448	GATT	2	8	539846	539853	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_006448	TAA	2	6	539897	539902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_006448	AG	3	6	539937	539942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_006448	ACT	2	6	539981	539986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_006448	AGAC	2	8	540046	540053	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11075	NC_006448	T	6	6	540057	540062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_006448	T	7	7	540118	540124	0 %	100 %	0 %	0 %	55820650
11077	NC_006448	GAG	2	6	540127	540132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820650
11078	NC_006448	ACTA	2	8	540133	540140	50 %	25 %	0 %	25 %	55820650
11079	NC_006448	AGA	2	6	540232	540237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820650
11080	NC_006448	TGA	2	6	540285	540290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820650
11081	NC_006448	CTA	2	6	540306	540311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820650
11082	NC_006448	TGA	2	6	540312	540317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820650
11083	NC_006448	CA	3	6	540325	540330	50 %	0 %	0 %	50 %	55820650
11084	NC_006448	TGG	2	6	540358	540363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820650
11085	NC_006448	TAG	2	6	540365	540370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820650
11086	NC_006448	CT	3	6	540421	540426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11087	NC_006448	AGT	2	6	540461	540466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_006448	ATA	2	6	540502	540507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_006448	A	6	6	540617	540622	100 %	0 %	0 %	0 %	55820651
11090	NC_006448	ATTG	2	8	540649	540656	25 %	50 %	25 %	0 %	55820651
11091	NC_006448	AGC	2	6	540763	540768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820651
11092	NC_006448	CTA	2	6	540826	540831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820651
11093	NC_006448	GAA	3	9	540884	540892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820651
11094	NC_006448	GAA	2	6	540895	540900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820651
11095	NC_006448	GAA	2	6	540932	540937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820651
11096	NC_006448	ATTG	2	8	540991	540998	25 %	50 %	25 %	0 %	55820651
11097	NC_006448	AGA	2	6	541009	541014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820651
11098	NC_006448	TGG	2	6	541018	541023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820651
11099	NC_006448	GAT	2	6	541156	541161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820651
11100	NC_006448	A	6	6	541193	541198	100 %	0 %	0 %	0 %	55820651
11101	NC_006448	GAA	2	6	541226	541231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820651
11102	NC_006448	ACC	2	6	541245	541250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820651
11103	NC_006448	AAG	2	6	541290	541295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820651
11104	NC_006448	TCG	2	6	541339	541344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820651
11105	NC_006448	CCA	2	6	541406	541411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820651
11106	NC_006448	GAA	2	6	541499	541504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820651
11107	NC_006448	ATG	2	6	541604	541609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820651
11108	NC_006448	GAA	3	9	541706	541714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820651
11109	NC_006448	TTC	2	6	541725	541730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820651
11110	NC_006448	CCGTTT	2	12	541774	541785	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	55820651
11111	NC_006448	ATG	2	6	541827	541832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820651
11112	NC_006448	AGC	2	6	541864	541869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820651
11113	NC_006448	TGA	2	6	541873	541878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820651
11114	NC_006448	TAC	2	6	541892	541897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820651
11115	NC_006448	AGC	2	6	541912	541917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820651
11116	NC_006448	GAA	2	6	541967	541972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820651
11117	NC_006448	CTT	2	6	541996	542001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820651
11118	NC_006448	GAA	2	6	542045	542050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820651
11119	NC_006448	TGA	2	6	542061	542066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820651
11120	NC_006448	TTGA	2	8	542111	542118	25 %	50 %	25 %	0 %	55820651
11121	NC_006448	GTG	2	6	542235	542240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820651
11122	NC_006448	TGA	2	6	542254	542259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820651
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11124	NC_006448	A	6	6	542304	542309	100 %	0 %	0 %	0 %	55820651
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11494	NC_006448	GAT	2	6	561107	561112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820668
11495	NC_006448	TGGT	2	8	561171	561178	0 %	50 %	50 %	0 %	55820668
11496	NC_006448	CAAT	2	8	561201	561208	50 %	25 %	0 %	25 %	55820668
11497	NC_006448	GAC	2	6	561218	561223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820668
11498	NC_006448	TACT	2	8	561263	561270	25 %	50 %	0 %	25 %	55820668
11499	NC_006448	TTC	2	6	561348	561353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820668
11500	NC_006448	TCT	2	6	561430	561435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820668

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